MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 77118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017026	TCG	2	6	25487	25492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305960
502	NC_017026	TCAA	2	8	25525	25532	50 %	25 %	0 %	25 %	383305960
503	NC_017026	GAGC	2	8	25553	25560	25 %	0 %	50 %	25 %	383305960
504	NC_017026	CAC	2	6	27080	27085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305961
505	NC_017026	CAG	2	6	27128	27133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305961
506	NC_017026	CGC	2	6	27169	27174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305961
507	NC_017026	GCA	2	6	27187	27192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305961
508	NC_017026	CGT	2	6	27193	27198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305961
509	NC_017026	GCC	2	6	27233	27238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305961
510	NC_017026	GCT	2	6	27307	27312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305961
511	NC_017026	GCG	2	6	27384	27389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305961
512	NC_017026	CGT	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305961
513	NC_017026	CGGC	2	8	27623	27630	0 %	0 %	50 %	50 %	383305962
514	NC_017026	GGC	2	6	27681	27686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305962
515	NC_017026	CA	3	6	27743	27748	50 %	0 %	0 %	50 %	383305962
516	NC_017026	GCC	2	6	27786	27791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305962
517	NC_017026	CGC	2	6	27816	27821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305962
518	NC_017026	CGC	2	6	27852	27857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305962
519	NC_017026	CCG	2	6	27882	27887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305962
520	NC_017026	GTC	2	6	27898	27903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305962
521	NC_017026	CGA	2	6	27992	27997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305962
522	NC_017026	TC	3	6	28023	28028	0 %	50 %	0 %	50 %	383305962
523	NC_017026	GCC	2	6	28063	28068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305962
524	NC_017026	CCGG	2	8	28109	28116	0 %	0 %	50 %	50 %	383305962
525	NC_017026	CG	3	6	28148	28153	0 %	0 %	50 %	50 %	383305962
526	NC_017026	GC	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	383305962
527	NC_017026	GTC	2	6	28215	28220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305962
528	NC_017026	TCGGCG	2	12	28250	28261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383305962
529	NC_017026	CGA	2	6	28263	28268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305962
530	NC_017026	GC	3	6	28307	28312	0 %	0 %	50 %	50 %	383305962
531	NC_017026	TCG	2	6	28331	28336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305962
532	NC_017026	ACG	2	6	28355	28360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305962
533	NC_017026	GCA	2	6	28371	28376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305962
534	NC_017026	TCA	2	6	28412	28417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305963
535	NC_017026	CAC	2	6	28460	28465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305963
536	NC_017026	CTG	2	6	28479	28484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305963
537	NC_017026	GGC	2	6	28553	28558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305963
538	NC_017026	CTG	2	6	28567	28572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305963
539	NC_017026	TCA	2	6	28600	28605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305963
540	NC_017026	CGG	2	6	28635	28640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305963
541	NC_017026	CGA	2	6	28658	28663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305963
542	NC_017026	GCTC	2	8	28665	28672	0 %	25 %	25 %	50 %	383305963
543	NC_017026	ACC	2	6	28677	28682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305963
544	NC_017026	CGT	2	6	28725	28730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305963
545	NC_017026	GC	4	8	28742	28749	0 %	0 %	50 %	50 %	383305963
546	NC_017026	CGA	2	6	28773	28778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305963
547	NC_017026	ACG	2	6	28784	28789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305963
548	NC_017026	GGC	2	6	28796	28801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305963
549	NC_017026	TGCG	2	8	28804	28811	0 %	25 %	50 %	25 %	383305963
550	NC_017026	CGC	2	6	28901	28906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305963
551	NC_017026	CAC	2	6	29018	29023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305963
552	NC_017026	CCGG	2	8	29069	29076	0 %	0 %	50 %	50 %	383305963
553	NC_017026	CAA	2	6	29123	29128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305963
554	NC_017026	TCG	2	6	29134	29139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305963
555	NC_017026	CAA	2	6	29183	29188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305963
556	NC_017026	GGCAA	2	10	29316	29325	40 %	0 %	40 %	20 %	383305964
557	NC_017026	ACG	2	6	29327	29332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305964
558	NC_017026	GC	3	6	29375	29380	0 %	0 %	50 %	50 %	383305964
559	NC_017026	CGTC	2	8	29400	29407	0 %	25 %	25 %	50 %	383305964
560	NC_017026	CG	3	6	29437	29442	0 %	0 %	50 %	50 %	383305964
561	NC_017026	GGATCA	2	12	29448	29459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383305964
562	NC_017026	AGC	2	6	29516	29521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305964
563	NC_017026	GTC	2	6	29536	29541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305964
564	NC_017026	GCC	3	9	29542	29550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305964
565	NC_017026	CACG	2	8	29760	29767	25 %	0 %	25 %	50 %	383305965
566	NC_017026	ACCG	2	8	29841	29848	25 %	0 %	25 %	50 %	383305965
567	NC_017026	GGT	2	6	29859	29864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305965
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569	NC_017026	AGC	2	6	29997	30002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305965
570	NC_017026	GTC	2	6	30046	30051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305965
571	NC_017026	CGATC	2	10	30142	30151	20 %	20 %	20 %	40 %	383305965
572	NC_017026	CCGG	2	8	30160	30167	0 %	0 %	50 %	50 %	383305965
573	NC_017026	CG	3	6	30168	30173	0 %	0 %	50 %	50 %	383305965
574	NC_017026	GGT	2	6	30219	30224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305965
575	NC_017026	GCC	2	6	30268	30273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305965
576	NC_017026	GTCG	2	8	30336	30343	0 %	25 %	50 %	25 %	383305965
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581	NC_017026	CGT	2	6	30503	30508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305965
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583	NC_017026	CTG	2	6	30616	30621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305965
584	NC_017026	CGA	2	6	30657	30662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305965
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587	NC_017026	CGA	2	6	30747	30752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305965
588	NC_017026	CGA	2	6	30794	30799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305965
589	NC_017026	CGC	2	6	30849	30854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305965
590	NC_017026	GGC	3	9	30864	30872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305965
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592	NC_017026	CCCG	2	8	30958	30965	0 %	0 %	25 %	75 %	383305965
593	NC_017026	GT	3	6	30986	30991	0 %	50 %	50 %	0 %	383305965
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598	NC_017026	ACG	2	6	31301	31306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305966
599	NC_017026	GCT	2	6	31371	31376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305966
600	NC_017026	CAG	2	6	31399	31404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305966
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603	NC_017026	CAT	2	6	31500	31505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305966
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607	NC_017026	CGAC	2	8	31767	31774	25 %	0 %	25 %	50 %	383305967
608	NC_017026	GCT	2	6	31798	31803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305967
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614	NC_017026	CTC	2	6	32152	32157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383305969
615	NC_017026	CAC	2	6	32167	32172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305969
616	NC_017026	CCG	2	6	32217	32222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305969
617	NC_017026	ACG	2	6	32283	32288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305969
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619	NC_017026	AGA	3	9	32338	32346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305969
620	NC_017026	CCGCGC	2	12	32359	32370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305969
621	NC_017026	GCGTC	2	10	32380	32389	0 %	20 %	40 %	40 %	383305969
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623	NC_017026	CGG	2	6	32461	32466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305969
624	NC_017026	GACAC	2	10	32477	32486	40 %	0 %	20 %	40 %	383305969
625	NC_017026	GCCG	2	8	32494	32501	0 %	0 %	50 %	50 %	383305969
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627	NC_017026	CCT	2	6	32584	32589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383305969
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