MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 77118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017026	CGAA	2	8	238425	238432	50 %	0 %	25 %	25 %	383306134
4502	NC_017026	CCG	2	6	238458	238463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306134
4503	NC_017026	GCTC	2	8	238475	238482	0 %	25 %	25 %	50 %	383306134
4504	NC_017026	GTT	2	6	238496	238501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306134
4505	NC_017026	GCG	2	6	238502	238507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306134
4506	NC_017026	ACCA	2	8	238664	238671	50 %	0 %	0 %	50 %	383306135
4507	NC_017026	CCAT	2	8	238682	238689	25 %	25 %	0 %	50 %	383306135
4508	NC_017026	GCC	2	6	238691	238696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4509	NC_017026	AGT	2	6	238712	238717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306135
4510	NC_017026	ATCC	2	8	238722	238729	25 %	25 %	0 %	50 %	383306135
4511	NC_017026	CAGC	2	8	238730	238737	25 %	0 %	25 %	50 %	383306135
4512	NC_017026	CGG	3	9	238742	238750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306135
4513	NC_017026	GCT	2	6	238800	238805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4514	NC_017026	GTC	2	6	238897	238902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4515	NC_017026	GCC	2	6	238916	238921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4516	NC_017026	GCCC	2	8	238932	238939	0 %	0 %	25 %	75 %	383306135
4517	NC_017026	C	7	7	238952	238958	0 %	0 %	0 %	100 %	383306135
4518	NC_017026	GGT	2	6	238968	238973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306135
4519	NC_017026	GCC	2	6	239182	239187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4520	NC_017026	CGC	2	6	239226	239231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4521	NC_017026	GTC	2	6	239238	239243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4522	NC_017026	ACG	2	6	239254	239259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4523	NC_017026	CGGT	2	8	239283	239290	0 %	25 %	50 %	25 %	383306135
4524	NC_017026	CGAC	2	8	239297	239304	25 %	0 %	25 %	50 %	383306135
4525	NC_017026	GCCA	2	8	239317	239324	25 %	0 %	25 %	50 %	383306135
4526	NC_017026	ACC	2	6	239333	239338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306135
4527	NC_017026	ACCAGC	2	12	239374	239385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383306135
4528	NC_017026	ACG	2	6	239389	239394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4529	NC_017026	CACGC	2	10	239422	239431	20 %	0 %	20 %	60 %	383306135
4530	NC_017026	GCGAAC	2	12	239458	239469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4531	NC_017026	GC	4	8	239514	239521	0 %	0 %	50 %	50 %	383306135
4532	NC_017026	TCGA	2	8	239662	239669	25 %	25 %	25 %	25 %	383306135
4533	NC_017026	GGC	3	9	239736	239744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306135
4534	NC_017026	CAG	2	6	239751	239756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4535	NC_017026	TCA	2	6	239759	239764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306135
4536	NC_017026	CAA	2	6	239805	239810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306135
4537	NC_017026	ACCAGC	2	12	239839	239850	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383306135
4538	NC_017026	GTC	2	6	239871	239876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4539	NC_017026	CCG	2	6	239902	239907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4540	NC_017026	GTC	2	6	240030	240035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4541	NC_017026	ACG	2	6	240061	240066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4542	NC_017026	GCG	2	6	240097	240102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306135
4543	NC_017026	CCG	2	6	240133	240138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4544	NC_017026	GC	3	6	240173	240178	0 %	0 %	50 %	50 %	383306135
4545	NC_017026	GGCCGC	2	12	240195	240206	0 %	0 %	50 %	50 %	383306135
4546	NC_017026	GCA	2	6	240245	240250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306135
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4548	NC_017026	AGC	2	6	240295	240300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306135
4549	NC_017026	GCC	2	6	240310	240315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4550	NC_017026	CACC	2	8	240342	240349	25 %	0 %	0 %	75 %	383306135
4551	NC_017026	GCCG	2	8	240385	240392	0 %	0 %	50 %	50 %	383306135
4552	NC_017026	GCC	2	6	240424	240429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4553	NC_017026	ACCGCG	2	12	240487	240498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383306135
4554	NC_017026	ACA	2	6	240584	240589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306135
4555	NC_017026	CGGC	2	8	240636	240643	0 %	0 %	50 %	50 %	383306135
4556	NC_017026	AGT	2	6	240689	240694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306135
4557	NC_017026	TGG	2	6	240749	240754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306135
4558	NC_017026	ACA	2	6	240764	240769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306135
4559	NC_017026	TGA	2	6	240788	240793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306135
4560	NC_017026	GCG	2	6	240829	240834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306135
4561	NC_017026	GCC	2	6	240922	240927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306135
4562	NC_017026	GC	3	6	240941	240946	0 %	0 %	50 %	50 %	383306135
4563	NC_017026	CCGGT	2	10	241092	241101	0 %	20 %	40 %	40 %	383306135
4564	NC_017026	TGGG	2	8	241114	241121	0 %	25 %	75 %	0 %	383306135
4565	NC_017026	TAGC	2	8	241198	241205	25 %	25 %	25 %	25 %	383306135
4566	NC_017026	G	6	6	241214	241219	0 %	0 %	100 %	0 %	383306135
4567	NC_017026	CCAGCG	2	12	241226	241237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383306135
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4570	NC_017026	ACCA	2	8	241393	241400	50 %	0 %	0 %	50 %	383306135
4571	NC_017026	CAT	2	6	241431	241436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306135
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4573	NC_017026	GCC	2	6	241727	241732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306136
4574	NC_017026	GCT	2	6	241738	241743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306136
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4576	NC_017026	ACCA	2	8	241856	241863	50 %	0 %	0 %	50 %	383306136
4577	NC_017026	TGA	2	6	241866	241871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306136
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4580	NC_017026	CCG	2	6	242059	242064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306136
4581	NC_017026	CGC	2	6	242137	242142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306137
4582	NC_017026	GTC	2	6	242198	242203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306137
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4589	NC_017026	ACC	2	6	242444	242449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306137
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4591	NC_017026	GGC	3	9	242480	242488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306137
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4593	NC_017026	CGG	2	6	242527	242532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306137
4594	NC_017026	AGGC	2	8	242550	242557	25 %	0 %	50 %	25 %	383306137
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4597	NC_017026	CGGC	2	8	242674	242681	0 %	0 %	50 %	50 %	383306137
4598	NC_017026	AGC	2	6	242769	242774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306137
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4606	NC_017026	GGC	2	6	243005	243010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306137
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4608	NC_017026	CGG	2	6	243052	243057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306137
4609	NC_017026	CAG	2	6	243062	243067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306137
4610	NC_017026	ACC	3	9	243130	243138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306137
4611	NC_017026	AGCA	2	8	243203	243210	50 %	0 %	25 %	25 %	383306137
4612	NC_017026	CGA	2	6	243217	243222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306137
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4614	NC_017026	CG	3	6	243259	243264	0 %	0 %	50 %	50 %	383306137
4615	NC_017026	G	6	6	243281	243286	0 %	0 %	100 %	0 %	383306137
4616	NC_017026	GCGG	2	8	243335	243342	0 %	0 %	75 %	25 %	383306137
4617	NC_017026	CGT	2	6	243346	243351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306137
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4622	NC_017026	TTG	2	6	243765	243770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383306138
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4733	NC_017026	TCGCCA	2	12	248767	248778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383306141
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4739	NC_017026	GCAT	2	8	249027	249034	25 %	25 %	25 %	25 %	383306141
4740	NC_017026	TGG	2	6	249042	249047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306141
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4742	NC_017026	CCA	2	6	249233	249238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306142
4743	NC_017026	CCG	2	6	249242	249247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306142
4744	NC_017026	GCC	2	6	249277	249282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306142
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4746	NC_017026	GC	4	8	249337	249344	0 %	0 %	50 %	50 %	383306142
4747	NC_017026	TCG	2	6	249364	249369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306142
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4753	NC_017026	GC	3	6	249569	249574	0 %	0 %	50 %	50 %	383306142
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4772	NC_017026	TGA	2	6	250284	250289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306144
4773	NC_017026	CCGG	2	8	250291	250298	0 %	0 %	50 %	50 %	383306144
4774	NC_017026	TGG	2	6	250310	250315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306144
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4823	NC_017026	CAA	2	6	252225	252230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306145
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4850	NC_017026	ACT	2	6	253355	253360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306145
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4855	NC_017026	ACC	2	6	253537	253542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306145
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4858	NC_017026	CGC	2	6	253599	253604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306145
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4860	NC_017026	TCG	2	6	253682	253687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306145
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4863	NC_017026	TTC	2	6	253838	253843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306146
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4865	NC_017026	CT	3	6	253869	253874	0 %	50 %	0 %	50 %	383306146
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4983	NC_017026	GCCA	2	8	260584	260591	25 %	0 %	25 %	50 %	383306150
4984	NC_017026	GGC	2	6	260619	260624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306150
4985	NC_017026	CTG	3	9	260683	260691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306150
4986	NC_017026	CCG	2	6	260740	260745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306150
4987	NC_017026	CAG	2	6	260757	260762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306150
4988	NC_017026	TGC	2	6	260780	260785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306150
4989	NC_017026	CGG	2	6	260786	260791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306150
4990	NC_017026	G	6	6	260844	260849	0 %	0 %	100 %	0 %	383306150
4991	NC_017026	CGA	3	9	260873	260881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306150
4992	NC_017026	GACC	2	8	260912	260919	25 %	0 %	25 %	50 %	383306150
4993	NC_017026	GAC	2	6	260934	260939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306150
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4996	NC_017026	GCTG	2	8	261138	261145	0 %	25 %	50 %	25 %	383306151
4997	NC_017026	CCG	2	6	261158	261163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306151
4998	NC_017026	TGG	2	6	261240	261245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306151
4999	NC_017026	TCA	3	9	261258	261266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306151
5000	NC_017026	GGCCA	2	10	261305	261314	20 %	0 %	40 %	40 %	383306151

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