MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-02 chromosome

Total Repeats: 135996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016947	GCC	2	6	87	92	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
2	NC_016947	CAC	2	6	98	103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752014
3	NC_016947	GCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
4	NC_016947	TCG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752014
5	NC_016947	CTG	2	6	183	188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752014
6	NC_016947	AGC	2	6	198	203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
7	NC_016947	GCC	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
8	NC_016947	ACA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379752014
9	NC_016947	CGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
10	NC_016947	CGG	2	6	340	345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752014
11	NC_016947	CGA	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
12	NC_016947	CGC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
13	NC_016947	CGA	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
14	NC_016947	CGC	2	6	497	502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
15	NC_016947	CCG	2	6	518	523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
16	NC_016947	CG	3	6	606	611	0 %	0 %	50 %	50 %	379752014
17	NC_016947	TGC	2	6	661	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752014
18	NC_016947	CGC	2	6	668	673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
19	NC_016947	TCA	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379752014
20	NC_016947	CGA	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
21	NC_016947	CGACGT	2	12	800	811	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379752014
22	NC_016947	GCT	2	6	812	817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752014
23	NC_016947	CGA	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
24	NC_016947	AAGG	2	8	846	853	50 %	0 %	50 %	0 %	379752014
25	NC_016947	TTC	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379752014
26	NC_016947	CAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379752014
27	NC_016947	GCC	2	6	929	934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
28	NC_016947	AGC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
29	NC_016947	CGA	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
30	NC_016947	CAG	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752014
31	NC_016947	CCA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752014
32	NC_016947	GCC	2	6	1263	1268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
33	NC_016947	CCG	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752014
34	NC_016947	ACC	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752014
35	NC_016947	GAA	2	6	1296	1301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379752014
36	NC_016947	ACCAC	2	10	1417	1426	40 %	0 %	0 %	60 %	379752014
37	NC_016947	CGCAA	2	10	1438	1447	40 %	0 %	20 %	40 %	379752014
38	NC_016947	GCG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752014
39	NC_016947	CAC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752014
40	NC_016947	CGA	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
41	NC_016947	GTGG	2	8	2151	2158	0 %	25 %	75 %	0 %	379752015
42	NC_016947	GAA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379752015
43	NC_016947	CGGTGC	2	12	2183	2194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379752015
44	NC_016947	TGC	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752015
45	NC_016947	CGA	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
46	NC_016947	CCG	2	6	2489	2494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752015
47	NC_016947	GAC	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
48	NC_016947	GGT	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379752015
49	NC_016947	GCC	2	6	2605	2610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752015
50	NC_016947	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752015
51	NC_016947	GCC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752015
52	NC_016947	GCA	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
53	NC_016947	GCT	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752015
54	NC_016947	GCCG	2	8	2865	2872	0 %	0 %	50 %	50 %	379752015
55	NC_016947	CCG	2	6	2879	2884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752015
56	NC_016947	CGA	2	6	2888	2893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
57	NC_016947	CGA	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
58	NC_016947	GGCCG	2	10	3016	3025	0 %	0 %	60 %	40 %	379752015
59	NC_016947	AAG	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379752015
60	NC_016947	CGAT	2	8	3038	3045	25 %	25 %	25 %	25 %	379752015
61	NC_016947	ACG	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
62	NC_016947	GAC	3	9	3178	3186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752015
63	NC_016947	CCGGG	2	10	3197	3206	0 %	0 %	60 %	40 %	379752015
64	NC_016947	CCGA	2	8	3223	3230	25 %	0 %	25 %	50 %	379752015
65	NC_016947	GCC	2	6	3463	3468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752016
66	NC_016947	ACG	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752016
67	NC_016947	CGC	2	6	3531	3536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752016
68	NC_016947	GGGC	2	8	3538	3545	0 %	0 %	75 %	25 %	379752016
69	NC_016947	GCA	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752016
70	NC_016947	GC	3	6	3606	3611	0 %	0 %	50 %	50 %	379752016
71	NC_016947	GTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379752016
72	NC_016947	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752016
73	NC_016947	CGC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752016
74	NC_016947	CGA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752016
75	NC_016947	CGGC	2	8	3700	3707	0 %	0 %	50 %	50 %	379752016
76	NC_016947	GGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752016
77	NC_016947	GTGC	2	8	3718	3725	0 %	25 %	50 %	25 %	379752016
78	NC_016947	TGC	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752016
79	NC_016947	GC	3	6	3779	3784	0 %	0 %	50 %	50 %	379752016
80	NC_016947	CTG	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752016
81	NC_016947	CGC	2	6	3981	3986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752016
82	NC_016947	CGG	2	6	3999	4004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752016
83	NC_016947	GGTC	2	8	4086	4093	0 %	25 %	50 %	25 %	379752016
84	NC_016947	GAC	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752016
85	NC_016947	GCCA	2	8	4147	4154	25 %	0 %	25 %	50 %	379752016
86	NC_016947	CGC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752016
87	NC_016947	GC	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	379752016
88	NC_016947	CGA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752016
89	NC_016947	GTT	2	6	4233	4238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379752016
90	NC_016947	CGA	2	6	4242	4247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752016
91	NC_016947	GCGCC	2	10	4275	4284	0 %	0 %	40 %	60 %	379752016
92	NC_016947	CCG	2	6	4325	4330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752016
93	NC_016947	GTC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752016
94	NC_016947	CGG	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752016
95	NC_016947	GC	3	6	4419	4424	0 %	0 %	50 %	50 %	379752016
96	NC_016947	CGG	2	6	4460	4465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752017
97	NC_016947	GAG	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379752017
98	NC_016947	GCG	3	9	4524	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752017
99	NC_016947	CG	4	8	4531	4538	0 %	0 %	50 %	50 %	379752017
100	NC_016947	GCCG	2	8	4551	4558	0 %	0 %	50 %	50 %	379752017
101	NC_016947	CG	3	6	4563	4568	0 %	0 %	50 %	50 %	379752017
102	NC_016947	GTC	2	6	4571	4576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752017
103	NC_016947	GCG	2	6	4601	4606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752017
104	NC_016947	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	379752017
105	NC_016947	GGT	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379752017
106	NC_016947	CCA	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752017
107	NC_016947	GAT	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379752017
108	NC_016947	GTT	2	6	4853	4858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379752017
109	NC_016947	CGC	3	9	4868	4876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752017
110	NC_016947	GTG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379752017
111	NC_016947	GCCG	2	8	4916	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	379752017
112	NC_016947	CGT	2	6	4927	4932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752017
113	NC_016947	CG	3	6	4969	4974	0 %	0 %	50 %	50 %	379752017
114	NC_016947	AGA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379752018
115	NC_016947	CAC	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752018
116	NC_016947	GGT	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379752018
117	NC_016947	CGA	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752018
118	NC_016947	CAA	2	6	5431	5436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379752018
119	NC_016947	CGA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752018
120	NC_016947	CGT	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752018
121	NC_016947	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752018
122	NC_016947	CGG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752018
123	NC_016947	GCG	2	6	5601	5606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752018
124	NC_016947	GGT	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379752018
125	NC_016947	CCA	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752018
126	NC_016947	CAC	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752018
127	NC_016947	ACC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379752018
128	NC_016947	GC	3	6	5822	5827	0 %	0 %	50 %	50 %	379752018
129	NC_016947	CAA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379752018
130	NC_016947	CGA	2	6	5878	5883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752018
131	NC_016947	GAG	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379752018
132	NC_016947	GTC	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752018
133	NC_016947	GTC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752018
134	NC_016947	CCG	2	6	5928	5933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379752018
135	NC_016947	GGC	2	6	5959	5964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752018
136	NC_016947	GCACC	2	10	5992	6001	20 %	0 %	20 %	60 %	379752018
137	NC_016947	CGG	2	6	6013	6018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752018
138	NC_016947	CAG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752018
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141	NC_016947	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752018
142	NC_016947	GC	3	6	6216	6221	0 %	0 %	50 %	50 %	379752018
143	NC_016947	GGT	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379752018
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154	NC_016947	GGGC	2	8	6556	6563	0 %	0 %	75 %	25 %	379752018
155	NC_016947	TGG	2	6	6621	6626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379752018
156	NC_016947	CGGC	2	8	6636	6643	0 %	0 %	50 %	50 %	379752018
157	NC_016947	ATC	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379752018
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159	NC_016947	CAT	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379752018
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164	NC_016947	GCAGC	2	10	6970	6979	20 %	0 %	40 %	40 %	379752018
165	NC_016947	TTG	2	6	7019	7024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379752018
166	NC_016947	AAG	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379752018
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168	NC_016947	GAC	2	6	7061	7066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752018
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176	NC_016947	GAC	2	6	7358	7363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752019
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186	NC_016947	CGG	2	6	7728	7733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752019
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247	NC_016947	ATC	2	6	10085	10090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379752019
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249	NC_016947	ACG	2	6	10110	10115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752019
250	NC_016947	TCGC	2	8	10125	10132	0 %	25 %	25 %	50 %	379752019
251	NC_016947	CGT	3	9	10138	10146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752019
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254	NC_016947	CTT	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379752019
255	NC_016947	TTC	2	6	10298	10303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379752019
256	NC_016947	CG	4	8	10363	10370	0 %	0 %	50 %	50 %	379752019
257	NC_016947	CTG	2	6	10388	10393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752019
258	NC_016947	GAG	2	6	10406	10411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379752019
259	NC_016947	GAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379752019
260	NC_016947	ACG	2	6	10560	10565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752019
261	NC_016947	CTC	2	6	10588	10593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379752019
262	NC_016947	CGA	2	6	10594	10599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752019
263	NC_016947	CTG	3	9	10604	10612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379752019
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265	NC_016947	GC	3	6	10675	10680	0 %	0 %	50 %	50 %	379752019
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385	NC_016947	CAA	2	6	16295	16300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379752026
386	NC_016947	CGG	2	6	16390	16395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752026
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