MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis GDL-1 chromosome

Total Repeats: 19900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016829	GAA	2	6	3	8	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
2	NC_016829	T	7	7	23	29	0 %	100 %	0 %	0 %	378835507
3	NC_016829	ATA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
4	NC_016829	ATT	2	6	71	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
5	NC_016829	TGA	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835507
6	NC_016829	AAT	2	6	99	104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
7	NC_016829	T	7	7	114	120	0 %	100 %	0 %	0 %	378835507
8	NC_016829	AAT	2	6	156	161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
9	NC_016829	AAT	2	6	175	180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
10	NC_016829	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	378835507
11	NC_016829	AATG	2	8	206	213	50 %	25 %	25 %	0 %	378835507
12	NC_016829	TTA	2	6	217	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
13	NC_016829	A	7	7	253	259	100 %	0 %	0 %	0 %	378835507
14	NC_016829	ACT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835507
15	NC_016829	TTC	2	6	339	344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835507
16	NC_016829	AAC	2	6	391	396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
17	NC_016829	TAAC	2	8	401	408	50 %	25 %	0 %	25 %	378835507
18	NC_016829	TAA	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
19	NC_016829	TTC	2	6	522	527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835507
20	NC_016829	GAA	2	6	582	587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
21	NC_016829	CATT	2	8	600	607	25 %	50 %	0 %	25 %	378835507
22	NC_016829	ACA	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
23	NC_016829	A	6	6	646	651	100 %	0 %	0 %	0 %	378835507
24	NC_016829	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
25	NC_016829	TGA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835507
26	NC_016829	TAA	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
27	NC_016829	CAA	2	6	743	748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
28	NC_016829	ATC	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835507
29	NC_016829	GGT	2	6	835	840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378835507
30	NC_016829	GAA	2	6	844	849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
31	NC_016829	TTA	2	6	854	859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
32	NC_016829	AGA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
33	NC_016829	T	6	6	912	917	0 %	100 %	0 %	0 %	378835507
34	NC_016829	T	6	6	987	992	0 %	100 %	0 %	0 %	378835507
35	NC_016829	A	6	6	1003	1008	100 %	0 %	0 %	0 %	378835507
36	NC_016829	T	7	7	1048	1054	0 %	100 %	0 %	0 %	378835507
37	NC_016829	AG	3	6	1095	1100	50 %	0 %	50 %	0 %	378835507
38	NC_016829	ATA	2	6	1150	1155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835507
39	NC_016829	GAA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
40	NC_016829	ATT	2	6	1169	1174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
41	NC_016829	AGA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
42	NC_016829	AT	3	6	1238	1243	50 %	50 %	0 %	0 %	378835507
43	NC_016829	ATT	2	6	1324	1329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835507
44	NC_016829	CAA	2	6	1338	1343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835507
45	NC_016829	GAAAGA	2	12	1356	1367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
46	NC_016829	A	6	6	1403	1408	100 %	0 %	0 %	0 %	378835507
47	NC_016829	GAAAAA	2	12	1592	1603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835508
48	NC_016829	GAAA	2	8	1619	1626	75 %	0 %	25 %	0 %	378835508
49	NC_016829	TTCAAA	2	12	1639	1650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378835508
50	NC_016829	AGG	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378835508
51	NC_016829	ATT	3	9	1672	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
52	NC_016829	AAG	2	6	1687	1692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
53	NC_016829	A	6	6	1831	1836	100 %	0 %	0 %	0 %	378835508
54	NC_016829	ATTAA	2	10	1901	1910	60 %	40 %	0 %	0 %	378835508
55	NC_016829	ATG	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835508
56	NC_016829	TAA	2	6	1962	1967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835508
57	NC_016829	GCAA	2	8	1973	1980	50 %	0 %	25 %	25 %	378835508
58	NC_016829	A	6	6	1996	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	378835508
59	NC_016829	A	7	7	2043	2049	100 %	0 %	0 %	0 %	378835508
60	NC_016829	ATT	2	6	2052	2057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
61	NC_016829	TAT	2	6	2058	2063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
62	NC_016829	GTTTAA	2	12	2070	2081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378835508
63	NC_016829	AGA	2	6	2212	2217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
64	NC_016829	AGA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
65	NC_016829	TGA	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835508
66	NC_016829	ACA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835508
67	NC_016829	A	7	7	2338	2344	100 %	0 %	0 %	0 %	378835508
68	NC_016829	GAT	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835508
69	NC_016829	ATT	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835508
70	NC_016829	A	8	8	2373	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	378835508
71	NC_016829	CAA	2	6	2406	2411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835508
72	NC_016829	TTC	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835508
73	NC_016829	AGA	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835508
74	NC_016829	AAT	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835508
75	NC_016829	CAAAA	2	10	2512	2521	80 %	0 %	0 %	20 %	378835508
76	NC_016829	A	6	6	2518	2523	100 %	0 %	0 %	0 %	378835508
77	NC_016829	CAAT	2	8	2583	2590	50 %	25 %	0 %	25 %	378835508
78	NC_016829	T	6	6	2611	2616	0 %	100 %	0 %	0 %	378835508
79	NC_016829	TAA	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835508
80	NC_016829	AAC	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835508
81	NC_016829	AAT	2	6	2710	2715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835509
82	NC_016829	A	8	8	2761	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	378835509
83	NC_016829	T	6	6	2803	2808	0 %	100 %	0 %	0 %	378835509
84	NC_016829	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	378835509
85	NC_016829	AGA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835509
86	NC_016829	GA	3	6	2921	2926	50 %	0 %	50 %	0 %	378835509
87	NC_016829	A	6	6	2942	2947	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
88	NC_016829	T	6	6	2954	2959	0 %	100 %	0 %	0 %	378835510
89	NC_016829	TAG	3	9	2967	2975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
90	NC_016829	AAAC	2	8	3052	3059	75 %	0 %	0 %	25 %	378835510
91	NC_016829	TGG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378835510
92	NC_016829	TAA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835510
93	NC_016829	TGG	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378835510
94	NC_016829	CAG	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378835510
95	NC_016829	AATT	2	8	3258	3265	50 %	50 %	0 %	0 %	378835510
96	NC_016829	AGA	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
97	NC_016829	ATTT	2	8	3353	3360	25 %	75 %	0 %	0 %	378835510
98	NC_016829	GATT	2	8	3372	3379	25 %	50 %	25 %	0 %	378835510
99	NC_016829	ATT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835510
100	NC_016829	ACA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835510
101	NC_016829	GAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
102	NC_016829	TTC	2	6	3622	3627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835510
103	NC_016829	A	6	6	3647	3652	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
104	NC_016829	T	6	6	3664	3669	0 %	100 %	0 %	0 %	378835510
105	NC_016829	GAA	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
106	NC_016829	ATT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835510
107	NC_016829	AAAG	2	8	3806	3813	75 %	0 %	25 %	0 %	378835510
108	NC_016829	T	7	7	3822	3828	0 %	100 %	0 %	0 %	378835510
109	NC_016829	AAG	2	6	4000	4005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
110	NC_016829	A	6	6	4016	4021	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
111	NC_016829	T	6	6	4034	4039	0 %	100 %	0 %	0 %	378835510
112	NC_016829	AATG	2	8	4048	4055	50 %	25 %	25 %	0 %	378835510
113	NC_016829	GAA	2	6	4070	4075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835510
114	NC_016829	GCA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378835510
115	NC_016829	TAG	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
116	NC_016829	AAAAG	2	10	4111	4120	80 %	0 %	20 %	0 %	378835510
117	NC_016829	A	8	8	4126	4133	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
118	NC_016829	TGA	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
119	NC_016829	A	7	7	4295	4301	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
120	NC_016829	A	6	6	4329	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
121	NC_016829	GATA	2	8	4366	4373	50 %	25 %	25 %	0 %	378835510
122	NC_016829	GAAA	2	8	4413	4420	75 %	0 %	25 %	0 %	378835510
123	NC_016829	AAGT	2	8	4425	4432	50 %	25 %	25 %	0 %	378835510
124	NC_016829	AATT	2	8	4452	4459	50 %	50 %	0 %	0 %	378835510
125	NC_016829	AT	3	6	4543	4548	50 %	50 %	0 %	0 %	378835510
126	NC_016829	ATG	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
127	NC_016829	A	6	6	4572	4577	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
128	NC_016829	A	6	6	4622	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	378835510
129	NC_016829	TCTT	2	8	4636	4643	0 %	75 %	0 %	25 %	378835510
130	NC_016829	TGA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835510
131	NC_016829	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378835510
132	NC_016829	TTTA	2	8	4743	4750	25 %	75 %	0 %	0 %	378835510
133	NC_016829	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835511
134	NC_016829	TAA	2	6	4821	4826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835511
135	NC_016829	TGA	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835511
136	NC_016829	AGA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835511
137	NC_016829	GAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835511
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139	NC_016829	TAG	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835511
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