MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 100125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016804	GTCG	2	8	606948	606955	0 %	25 %	50 %	25 %	378770265
14003	NC_016804	ATG	2	6	606965	606970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378770265
14004	NC_016804	TCG	2	6	607097	607102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770265
14005	NC_016804	CG	3	6	607109	607114	0 %	0 %	50 %	50 %	378770265
14006	NC_016804	CGT	2	6	607171	607176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770265
14007	NC_016804	GCGG	2	8	607188	607195	0 %	0 %	75 %	25 %	378770265
14008	NC_016804	GAC	2	6	607261	607266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770265
14009	NC_016804	CCGGG	2	10	607295	607304	0 %	0 %	60 %	40 %	378770266
14010	NC_016804	GGT	2	6	607418	607423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378770266
14011	NC_016804	CTG	3	9	607452	607460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770266
14012	NC_016804	CGA	2	6	607462	607467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770266
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14014	NC_016804	GCG	2	6	607505	607510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770266
14015	NC_016804	CG	4	8	607509	607516	0 %	0 %	50 %	50 %	378770266
14016	NC_016804	CGG	2	6	607562	607567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770266
14017	NC_016804	TGA	2	6	607712	607717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378770267
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14019	NC_016804	ATCG	2	8	607767	607774	25 %	25 %	25 %	25 %	378770267
14020	NC_016804	GCG	2	6	607812	607817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770267
14021	NC_016804	TGG	2	6	607822	607827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378770267
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14039	NC_016804	GGCG	2	8	608405	608412	0 %	0 %	75 %	25 %	378770267
14040	NC_016804	GGCTG	2	10	608422	608431	0 %	20 %	60 %	20 %	378770267
14041	NC_016804	GC	3	6	608441	608446	0 %	0 %	50 %	50 %	378770267
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14052	NC_016804	GCT	2	6	608930	608935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770267
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14121	NC_016804	ACG	2	6	612351	612356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14122	NC_016804	CGT	2	6	612357	612362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14123	NC_016804	TCC	2	6	612364	612369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378770271
14124	NC_016804	GTTG	2	8	612402	612409	0 %	50 %	50 %	0 %	378770271
14125	NC_016804	TGC	2	6	612503	612508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14126	NC_016804	GTC	2	6	612514	612519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14127	NC_016804	TGC	2	6	612543	612548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14128	NC_016804	ACG	2	6	612555	612560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14129	NC_016804	AGC	2	6	612626	612631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770271
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14131	NC_016804	C	6	6	612641	612646	0 %	0 %	0 %	100 %	378770271
14132	NC_016804	ACC	2	6	612651	612656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378770271
14133	NC_016804	GCA	2	6	612705	612710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14134	NC_016804	TCG	2	6	612713	612718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770271
14135	NC_016804	CCG	2	6	612740	612745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770271
14136	NC_016804	GCC	2	6	612772	612777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770271
14137	NC_016804	ACC	2	6	612788	612793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378770271
14138	NC_016804	CCT	2	6	612810	612815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378770271
14139	NC_016804	CAT	2	6	612856	612861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378770271
14140	NC_016804	GGC	2	6	612923	612928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770271
14141	NC_016804	GCC	2	6	612965	612970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770271
14142	NC_016804	GCT	2	6	613003	613008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770271
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14144	NC_016804	GCC	2	6	613040	613045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770271
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14148	NC_016804	CGG	2	6	613133	613138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770271
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14151	NC_016804	CGA	2	6	613503	613508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770272
14152	NC_016804	CGT	2	6	613536	613541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770272
14153	NC_016804	CCG	2	6	613575	613580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770272
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14155	NC_016804	CGG	2	6	613617	613622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770272
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14157	NC_016804	CGA	2	6	613653	613658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770272
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14162	NC_016804	TCGAC	2	10	614001	614010	20 %	20 %	20 %	40 %	378770273
14163	NC_016804	GTC	2	6	614016	614021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770273
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14168	NC_016804	GCC	3	9	614314	614322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770274
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14174	NC_016804	CGA	2	6	614522	614527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770274
14175	NC_016804	GAGTTC	2	12	614554	614565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378770274
14176	NC_016804	CCA	2	6	614588	614593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378770274
14177	NC_016804	TCG	2	6	614594	614599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770274
14178	NC_016804	GCT	2	6	614634	614639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770274
14179	NC_016804	CATGG	2	10	614647	614656	20 %	20 %	40 %	20 %	378770274
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14182	NC_016804	TCT	2	6	614735	614740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378770274
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14184	NC_016804	CGC	2	6	614769	614774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770274
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14186	NC_016804	GGT	2	6	614823	614828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378770274
14187	NC_016804	TCT	2	6	614843	614848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378770274
14188	NC_016804	TCG	2	6	614849	614854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770274
14189	NC_016804	GATCA	2	10	614956	614965	40 %	20 %	20 %	20 %	378770274
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14197	NC_016804	GC	3	6	615373	615378	0 %	0 %	50 %	50 %	378770274
14198	NC_016804	CTG	2	6	615397	615402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770274
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14201	NC_016804	GCC	2	6	615514	615519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770275
14202	NC_016804	GCT	2	6	615524	615529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770275
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14209	NC_016804	GTACG	2	10	615720	615729	20 %	20 %	40 %	20 %	378770275
14210	NC_016804	GCG	2	6	615740	615745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770275
14211	NC_016804	AGCC	2	8	615777	615784	25 %	0 %	25 %	50 %	378770275
14212	NC_016804	AGCC	2	8	615830	615837	25 %	0 %	25 %	50 %	378770275
14213	NC_016804	GCA	2	6	615971	615976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770276
14214	NC_016804	CG	3	6	616008	616013	0 %	0 %	50 %	50 %	378770276
14215	NC_016804	CGG	2	6	616056	616061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770276
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14220	NC_016804	GAT	2	6	616191	616196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378770276
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14225	NC_016804	GCT	2	6	616427	616432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770276
14226	NC_016804	GAC	2	6	616498	616503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770276
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14229	NC_016804	CAG	2	6	616624	616629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770276
14230	NC_016804	CGC	2	6	616656	616661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770276
14231	NC_016804	GTC	2	6	616696	616701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378770276
14232	NC_016804	GCCCGG	2	12	616704	616715	0 %	0 %	50 %	50 %	378770276
14233	NC_016804	GC	3	6	616731	616736	0 %	0 %	50 %	50 %	378770276
14234	NC_016804	CCG	2	6	616742	616747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378770276
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14236	NC_016804	TGA	2	6	616778	616783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378770276
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14238	NC_016804	TGA	2	6	616859	616864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378770276
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14476	NC_016804	GCA	3	9	624823	624831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378770284
14477	NC_016804	GGT	2	6	624843	624848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378770284
14478	NC_016804	GGT	2	6	624870	624875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378770284
14479	NC_016804	TGG	2	6	624878	624883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378770284
14480	NC_016804	G	7	7	624900	624906	0 %	0 %	100 %	0 %	378770284
14481	NC_016804	CGG	2	6	624908	624913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770284
14482	NC_016804	CGG	2	6	624917	624922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378770284
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14484	NC_016804	TCAA	2	8	624930	624937	50 %	25 %	0 %	25 %	378770284
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