MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 100125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016804	TCA	2	6	245785	245790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769951
5502	NC_016804	GCA	2	6	245806	245811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5503	NC_016804	GTG	2	6	245847	245852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769951
5504	NC_016804	CAG	2	6	245855	245860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5505	NC_016804	ACC	2	6	245865	245870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769951
5506	NC_016804	CG	3	6	245966	245971	0 %	0 %	50 %	50 %	378769951
5507	NC_016804	CTT	2	6	245984	245989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769951
5508	NC_016804	CCG	2	6	246114	246119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769951
5509	NC_016804	ATCGCC	2	12	246120	246131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378769951
5510	NC_016804	TGC	2	6	246133	246138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5511	NC_016804	CTC	2	6	246239	246244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769951
5512	NC_016804	CGG	2	6	246269	246274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769951
5513	NC_016804	ATG	3	9	246336	246344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769951
5514	NC_016804	GCG	2	6	246354	246359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769951
5515	NC_016804	TCA	2	6	246376	246381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769951
5516	NC_016804	GGC	2	6	246470	246475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769951
5517	NC_016804	AGC	2	6	246654	246659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5518	NC_016804	CGACG	2	10	246671	246680	20 %	0 %	40 %	40 %	378769951
5519	NC_016804	CCG	2	6	246688	246693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769951
5520	NC_016804	CGG	2	6	246712	246717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769951
5521	NC_016804	AAC	2	6	246792	246797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769951
5522	NC_016804	ATG	2	6	246885	246890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769951
5523	NC_016804	GC	3	6	246895	246900	0 %	0 %	50 %	50 %	378769951
5524	NC_016804	CGG	2	6	246937	246942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769951
5525	NC_016804	CGC	2	6	246949	246954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769951
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5529	NC_016804	GTT	2	6	247121	247126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769951
5530	NC_016804	GTC	3	9	247136	247144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769951
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5532	NC_016804	CGG	2	6	247186	247191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769951
5533	NC_016804	CTG	2	6	247259	247264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5534	NC_016804	TCG	2	6	247278	247283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769951
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5536	NC_016804	GTC	2	6	247307	247312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769951
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5542	NC_016804	CGA	2	6	247749	247754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769952
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5544	NC_016804	GCG	2	6	247889	247894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769952
5545	NC_016804	TCG	2	6	247913	247918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769952
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5550	NC_016804	CGGC	2	8	248167	248174	0 %	0 %	50 %	50 %	378769952
5551	NC_016804	TCA	3	9	248346	248354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769952
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5555	NC_016804	GCA	2	6	248474	248479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769953
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5557	NC_016804	GGTC	2	8	248558	248565	0 %	25 %	50 %	25 %	378769953
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5602	NC_016804	GCGGT	2	10	250223	250232	0 %	20 %	60 %	20 %	378769954
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5742	NC_016804	ACG	3	9	255889	255897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769958
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5744	NC_016804	GGC	3	9	256071	256079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769958
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5855	NC_016804	CCG	2	6	261274	261279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769963
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5857	NC_016804	TCA	3	9	261374	261382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769963
5858	NC_016804	GGCCA	2	10	261421	261430	20 %	0 %	40 %	40 %	378769963
5859	NC_016804	GGCT	2	8	261445	261452	0 %	25 %	50 %	25 %	378769963
5860	NC_016804	CGTC	2	8	261481	261488	0 %	25 %	25 %	50 %	378769963
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5866	NC_016804	CGAT	2	8	261814	261821	25 %	25 %	25 %	25 %	378769963
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5983	NC_016804	CAG	2	6	266932	266937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769969
5984	NC_016804	AGCG	2	8	266942	266949	25 %	0 %	50 %	25 %	378769969
5985	NC_016804	CG	3	6	266966	266971	0 %	0 %	50 %	50 %	378769969
5986	NC_016804	TCTGC	2	10	267030	267039	0 %	40 %	20 %	40 %	378769970
5987	NC_016804	TGC	2	6	267049	267054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769970
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5991	NC_016804	GTC	2	6	267315	267320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769970
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5997	NC_016804	GTCGA	2	10	267450	267459	20 %	20 %	40 %	20 %	378769970
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5999	NC_016804	AGCG	2	8	267546	267553	25 %	0 %	50 %	25 %	378769970
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