MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 100125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016804	CGCAG	2	10	225113	225122	20 %	0 %	40 %	40 %	378769938
5003	NC_016804	GC	3	6	225162	225167	0 %	0 %	50 %	50 %	378769938
5004	NC_016804	CGG	2	6	225209	225214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769938
5005	NC_016804	GGTCTT	2	12	225218	225229	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378769938
5006	NC_016804	CGGG	2	8	225300	225307	0 %	0 %	75 %	25 %	378769938
5007	NC_016804	GCT	2	6	225308	225313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769938
5008	NC_016804	AGCC	2	8	225325	225332	25 %	0 %	25 %	50 %	378769938
5009	NC_016804	CTG	2	6	225356	225361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769938
5010	NC_016804	GC	3	6	225381	225386	0 %	0 %	50 %	50 %	378769938
5011	NC_016804	GAA	2	6	225477	225482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769938
5012	NC_016804	CTC	2	6	225483	225488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769938
5013	NC_016804	GCC	2	6	225562	225567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769938
5014	NC_016804	CG	3	6	225586	225591	0 %	0 %	50 %	50 %	378769938
5015	NC_016804	TTC	2	6	225643	225648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769938
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5018	NC_016804	GCT	2	6	225707	225712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769938
5019	NC_016804	TCG	2	6	225721	225726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769938
5020	NC_016804	GCTC	2	8	225746	225753	0 %	25 %	25 %	50 %	378769938
5021	NC_016804	ATG	2	6	225829	225834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769938
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5033	NC_016804	TCG	2	6	226405	226410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769938
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5059	NC_016804	GTC	2	6	227700	227705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769939
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5075	NC_016804	CCGGG	2	10	228182	228191	0 %	0 %	60 %	40 %	378769939
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5120	NC_016804	GGC	2	6	229850	229855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769939
5121	NC_016804	GCT	2	6	229871	229876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769939
5122	NC_016804	CGT	2	6	229891	229896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769939
5123	NC_016804	CGG	2	6	229900	229905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769939
5124	NC_016804	GTG	2	6	229927	229932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769939
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5132	NC_016804	CTG	3	9	230412	230420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769939
5133	NC_016804	GTG	2	6	230460	230465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769939
5134	NC_016804	CACCCT	2	12	230474	230485	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378769939
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5151	NC_016804	GCC	2	6	231575	231580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769940
5152	NC_016804	TGC	2	6	231606	231611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769940
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5154	NC_016804	CGCA	2	8	231725	231732	25 %	0 %	25 %	50 %	378769940
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5157	NC_016804	TGG	2	6	231904	231909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769941
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5163	NC_016804	GCT	2	6	232106	232111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769941
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5168	NC_016804	GCG	2	6	232248	232253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769941
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5225	NC_016804	CGA	2	6	234618	234623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769942
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5228	NC_016804	CTGCG	2	10	234772	234781	0 %	20 %	40 %	40 %	378769943
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5233	NC_016804	GCCC	2	8	235043	235050	0 %	0 %	25 %	75 %	378769943
5234	NC_016804	CGA	2	6	235112	235117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769943
5235	NC_016804	CG	3	6	235121	235126	0 %	0 %	50 %	50 %	378769943
5236	NC_016804	GCGG	2	8	235164	235171	0 %	0 %	75 %	25 %	378769943
5237	NC_016804	TCG	3	9	235186	235194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769943
5238	NC_016804	CCA	2	6	235197	235202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769943
5239	NC_016804	GCCGTC	2	12	235215	235226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378769943
5240	NC_016804	TCG	2	6	235243	235248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769943
5241	NC_016804	CCG	2	6	235288	235293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769943
5242	NC_016804	GGC	2	6	235299	235304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769943
5243	NC_016804	TCG	2	6	235306	235311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769943
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5245	NC_016804	GTA	2	6	235380	235385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769943
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5247	NC_016804	GTC	2	6	235500	235505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769943
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5273	NC_016804	CAGC	3	12	236642	236653	25 %	0 %	25 %	50 %	378769943
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5313	NC_016804	GGC	2	6	237955	237960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769945
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5324	NC_016804	GCTC	2	8	238569	238576	0 %	25 %	25 %	50 %	378769946
5325	NC_016804	GTT	2	6	238590	238595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769946
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5330	NC_016804	CCAT	2	8	238775	238782	25 %	25 %	0 %	50 %	378769947
5331	NC_016804	GCC	2	6	238784	238789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769947
5332	NC_016804	AGT	2	6	238805	238810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769947
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5334	NC_016804	CAGC	2	8	238823	238830	25 %	0 %	25 %	50 %	378769947
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5340	NC_016804	C	7	7	239045	239051	0 %	0 %	0 %	100 %	378769947
5341	NC_016804	GGT	2	6	239061	239066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769947
5342	NC_016804	GCC	2	6	239275	239280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769947
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5345	NC_016804	ACG	2	6	239347	239352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769947
5346	NC_016804	CGGT	2	8	239376	239383	0 %	25 %	50 %	25 %	378769947
5347	NC_016804	CGAC	2	8	239390	239397	25 %	0 %	25 %	50 %	378769947
5348	NC_016804	GCCA	2	8	239410	239417	25 %	0 %	25 %	50 %	378769947
5349	NC_016804	ACC	2	6	239426	239431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769947
5350	NC_016804	ACCAGC	2	12	239467	239478	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378769947
5351	NC_016804	ACG	2	6	239482	239487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769947
5352	NC_016804	CACGC	2	10	239515	239524	20 %	0 %	20 %	60 %	378769947
5353	NC_016804	GCGAAC	2	12	239551	239562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769947
5354	NC_016804	GC	4	8	239607	239614	0 %	0 %	50 %	50 %	378769947
5355	NC_016804	TCGA	2	8	239755	239762	25 %	25 %	25 %	25 %	378769947
5356	NC_016804	GGC	3	9	239829	239837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769947
5357	NC_016804	CAG	2	6	239844	239849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769947
5358	NC_016804	TCA	2	6	239852	239857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769947
5359	NC_016804	CAA	2	6	239898	239903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769947
5360	NC_016804	ACCAGC	2	12	239932	239943	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378769947
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5482	NC_016804	CG	3	6	245224	245229	0 %	0 %	50 %	50 %	378769951
5483	NC_016804	CCAGC	2	10	245236	245245	20 %	0 %	20 %	60 %	378769951
5484	NC_016804	GGA	2	6	245253	245258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378769951
5485	NC_016804	TCG	2	6	245295	245300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5486	NC_016804	CAG	2	6	245364	245369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5487	NC_016804	AGC	2	6	245379	245384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5488	NC_016804	TCA	2	6	245386	245391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769951
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5490	NC_016804	CAG	3	9	245429	245437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
5491	NC_016804	CGC	2	6	245438	245443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769951
5492	NC_016804	TCA	3	9	245467	245475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769951
5493	NC_016804	CGA	2	6	245503	245508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
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5496	NC_016804	ATG	2	6	245535	245540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769951
5497	NC_016804	CCT	2	6	245572	245577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769951
5498	NC_016804	GAT	2	6	245663	245668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769951
5499	NC_016804	CGA	2	6	245734	245739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769951
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