MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 58767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	TTG	2	6	109	114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
2	NC_016751	GAAG	2	8	119	126	50 %	0 %	50 %	0 %	374339023
3	NC_016751	AAAT	2	8	151	158	75 %	25 %	0 %	0 %	374339023
4	NC_016751	TAA	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
5	NC_016751	TTCT	2	8	304	311	0 %	75 %	0 %	25 %	374339023
6	NC_016751	A	6	6	312	317	100 %	0 %	0 %	0 %	374339023
7	NC_016751	TGT	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
8	NC_016751	ATT	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
9	NC_016751	AAT	2	6	492	497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
10	NC_016751	TA	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	374339023
11	NC_016751	TTA	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
12	NC_016751	TAA	2	6	572	577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
13	NC_016751	TATG	2	8	608	615	25 %	50 %	25 %	0 %	374339023
14	NC_016751	CAG	2	6	619	624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339023
15	NC_016751	ATGA	2	8	633	640	50 %	25 %	25 %	0 %	374339023
16	NC_016751	ATG	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
17	NC_016751	AGA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
18	NC_016751	GATG	2	8	668	675	25 %	25 %	50 %	0 %	374339023
19	NC_016751	A	6	6	695	700	100 %	0 %	0 %	0 %	374339023
20	NC_016751	TTA	2	6	711	716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
21	NC_016751	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
22	NC_016751	ATT	2	6	785	790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
23	NC_016751	ATT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
24	NC_016751	GAA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
25	NC_016751	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
26	NC_016751	GTT	2	6	888	893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
27	NC_016751	A	7	7	912	918	100 %	0 %	0 %	0 %	374339023
28	NC_016751	TA	3	6	961	966	50 %	50 %	0 %	0 %	374339023
29	NC_016751	GAT	2	6	972	977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
30	NC_016751	GTT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
31	NC_016751	ATA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
32	NC_016751	GAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
33	NC_016751	AG	3	6	1148	1153	50 %	0 %	50 %	0 %	374339023
34	NC_016751	AGAA	2	8	1239	1246	75 %	0 %	25 %	0 %	374339023
35	NC_016751	A	6	6	1286	1291	100 %	0 %	0 %	0 %	374339023
36	NC_016751	TTG	2	6	1327	1332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
37	NC_016751	AGA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
38	NC_016751	TGA	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
39	NC_016751	AAG	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
40	NC_016751	GAA	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
41	NC_016751	A	6	6	1525	1530	100 %	0 %	0 %	0 %	374339024
42	NC_016751	TCT	2	6	1541	1546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
43	NC_016751	T	7	7	1567	1573	0 %	100 %	0 %	0 %	374339024
44	NC_016751	T	6	6	1578	1583	0 %	100 %	0 %	0 %	374339024
45	NC_016751	ATA	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339024
46	NC_016751	TGA	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339024
47	NC_016751	CAG	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339024
48	NC_016751	CAT	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339024
49	NC_016751	T	6	6	1680	1685	0 %	100 %	0 %	0 %	374339024
50	NC_016751	TATT	2	8	1761	1768	25 %	75 %	0 %	0 %	374339024
51	NC_016751	A	7	7	1789	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	374339024
52	NC_016751	TAA	2	6	1801	1806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339024
53	NC_016751	TTC	2	6	1807	1812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
54	NC_016751	AT	3	6	1834	1839	50 %	50 %	0 %	0 %	374339024
55	NC_016751	TTC	2	6	1866	1871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
56	NC_016751	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
57	NC_016751	AT	3	6	1916	1921	50 %	50 %	0 %	0 %	374339024
58	NC_016751	T	6	6	1951	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	374339024
59	NC_016751	AAAT	2	8	1957	1964	75 %	25 %	0 %	0 %	374339024
60	NC_016751	CAG	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339024
61	NC_016751	T	7	7	2004	2010	0 %	100 %	0 %	0 %	374339024
62	NC_016751	AAGA	2	8	2137	2144	75 %	0 %	25 %	0 %	374339025
63	NC_016751	AG	3	6	2156	2161	50 %	0 %	50 %	0 %	374339025
64	NC_016751	GAA	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339025
65	NC_016751	A	6	6	2209	2214	100 %	0 %	0 %	0 %	374339025
66	NC_016751	TCC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374339025
67	NC_016751	AT	3	6	2233	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	374339025
68	NC_016751	TAA	2	6	2265	2270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339025
69	NC_016751	ATAA	2	8	2300	2307	75 %	25 %	0 %	0 %	374339025
70	NC_016751	ATTTC	2	10	2310	2319	20 %	60 %	0 %	20 %	374339025
71	NC_016751	AGA	2	6	2345	2350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339025
72	NC_016751	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339025
73	NC_016751	TGT	2	6	2391	2396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339025
74	NC_016751	A	7	7	2413	2419	100 %	0 %	0 %	0 %	374339025
75	NC_016751	AT	3	6	2485	2490	50 %	50 %	0 %	0 %	374339025
76	NC_016751	TGT	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339025
77	NC_016751	AT	4	8	2533	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	374339025
78	NC_016751	AAGAG	2	10	2581	2590	60 %	0 %	40 %	0 %	374339025
79	NC_016751	GA	3	6	2625	2630	50 %	0 %	50 %	0 %	374339025
80	NC_016751	TGT	2	6	2635	2640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339025
81	NC_016751	TTTG	2	8	2642	2649	0 %	75 %	25 %	0 %	374339025
82	NC_016751	ATGT	2	8	2724	2731	25 %	50 %	25 %	0 %	374339025
83	NC_016751	TGC	2	6	2782	2787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374339025
84	NC_016751	AATT	2	8	2811	2818	50 %	50 %	0 %	0 %	374339025
85	NC_016751	TAA	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339025
86	NC_016751	GCT	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374339026
87	NC_016751	ATTT	2	8	2916	2923	25 %	75 %	0 %	0 %	374339026
88	NC_016751	T	6	6	2921	2926	0 %	100 %	0 %	0 %	374339026
89	NC_016751	AAG	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339026
90	NC_016751	TCT	2	6	2944	2949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339026
91	NC_016751	TTGG	2	8	2962	2969	0 %	50 %	50 %	0 %	374339026
92	NC_016751	T	7	7	3017	3023	0 %	100 %	0 %	0 %	374339026
93	NC_016751	TA	3	6	3036	3041	50 %	50 %	0 %	0 %	374339026
94	NC_016751	T	6	6	3113	3118	0 %	100 %	0 %	0 %	374339026
95	NC_016751	TCC	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374339027
96	NC_016751	T	6	6	3192	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	374339027
97	NC_016751	TAA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
98	NC_016751	TTG	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339027
99	NC_016751	GTTTT	2	10	3315	3324	0 %	80 %	20 %	0 %	374339027
100	NC_016751	T	6	6	3321	3326	0 %	100 %	0 %	0 %	374339027
101	NC_016751	TAA	2	6	3336	3341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
102	NC_016751	T	7	7	3351	3357	0 %	100 %	0 %	0 %	374339027
103	NC_016751	T	6	6	3361	3366	0 %	100 %	0 %	0 %	374339027
104	NC_016751	AT	3	6	3374	3379	50 %	50 %	0 %	0 %	374339027
105	NC_016751	AAT	2	6	3381	3386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
106	NC_016751	TAT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339027
107	NC_016751	TCA	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339027
108	NC_016751	ATTTTG	2	12	3426	3437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374339027
109	NC_016751	A	6	6	3463	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	374339027
110	NC_016751	A	8	8	3523	3530	100 %	0 %	0 %	0 %	374339027
111	NC_016751	T	6	6	3553	3558	0 %	100 %	0 %	0 %	374339027
112	NC_016751	AAT	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
113	NC_016751	TA	3	6	3607	3612	50 %	50 %	0 %	0 %	374339027
114	NC_016751	TAT	2	6	3670	3675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339027
115	NC_016751	TTA	2	6	3771	3776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339027
116	NC_016751	AATCTA	2	12	3807	3818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374339027
117	NC_016751	CAC	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374339027
118	NC_016751	ACA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374339028
119	NC_016751	GCC	2	6	3902	3907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374339028
120	NC_016751	AAG	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339028
121	NC_016751	AAC	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374339028
122	NC_016751	GGT	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374339028
123	NC_016751	ATT	2	6	4050	4055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339028
124	NC_016751	T	8	8	4081	4088	0 %	100 %	0 %	0 %	374339028
125	NC_016751	TTC	2	6	4118	4123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339028
126	NC_016751	GAAT	2	8	4188	4195	50 %	25 %	25 %	0 %	374339028
127	NC_016751	GCC	2	6	4250	4255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374339028
128	NC_016751	T	6	6	4265	4270	0 %	100 %	0 %	0 %	374339028
129	NC_016751	CAT	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339028
130	NC_016751	ATT	2	6	4317	4322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339028
131	NC_016751	TA	3	6	4342	4347	50 %	50 %	0 %	0 %	374339029
132	NC_016751	ATC	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339029
133	NC_016751	TTGT	2	8	4380	4387	0 %	75 %	25 %	0 %	374339029
134	NC_016751	CT	3	6	4444	4449	0 %	50 %	0 %	50 %	374339029
135	NC_016751	AT	3	6	4476	4481	50 %	50 %	0 %	0 %	374339029
136	NC_016751	CTT	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
137	NC_016751	TTC	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
138	NC_016751	ATA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
139	NC_016751	T	6	6	4589	4594	0 %	100 %	0 %	0 %	374339029
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