MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	AAT	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403389
2	NC_016112	AAC	2	6	171	176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403389
3	NC_016112	TTC	2	6	203	208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403389
4	NC_016112	TTA	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
5	NC_016112	CAT	2	6	312	317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403389
6	NC_016112	A	6	6	390	395	100 %	0 %	0 %	0 %	357403389
7	NC_016112	A	6	6	441	446	100 %	0 %	0 %	0 %	357403389
8	NC_016112	TAA	2	6	464	469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403389
9	NC_016112	ATTT	2	8	473	480	25 %	75 %	0 %	0 %	357403389
10	NC_016112	CCAA	2	8	505	512	50 %	0 %	0 %	50 %	357403389
11	NC_016112	AGGCA	2	10	551	560	40 %	0 %	40 %	20 %	357403389
12	NC_016112	TTA	2	6	570	575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
13	NC_016112	ATGC	2	8	612	619	25 %	25 %	25 %	25 %	357403389
14	NC_016112	ACA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403389
15	NC_016112	CGAT	2	8	721	728	25 %	25 %	25 %	25 %	357403389
16	NC_016112	GAG	2	6	748	753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403389
17	NC_016112	T	6	6	783	788	0 %	100 %	0 %	0 %	357403389
18	NC_016112	AAG	2	6	808	813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403389
19	NC_016112	T	6	6	816	821	0 %	100 %	0 %	0 %	357403389
20	NC_016112	GTT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403389
21	NC_016112	A	7	7	844	850	100 %	0 %	0 %	0 %	357403389
22	NC_016112	GAAA	2	8	884	891	75 %	0 %	25 %	0 %	357403389
23	NC_016112	TCG	2	6	892	897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403389
24	NC_016112	A	6	6	990	995	100 %	0 %	0 %	0 %	357403389
25	NC_016112	ATG	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403389
26	NC_016112	ACG	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403389
27	NC_016112	CAC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403389
28	NC_016112	AAG	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403389
29	NC_016112	A	6	6	1207	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	357403389
30	NC_016112	TCG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403389
31	NC_016112	CAC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403389
32	NC_016112	TAAT	2	8	1378	1385	50 %	50 %	0 %	0 %	357403389
33	NC_016112	CCT	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403389
34	NC_016112	ATT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
35	NC_016112	AT	3	6	1663	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	357403390
36	NC_016112	GCA	2	6	1699	1704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403390
37	NC_016112	A	6	6	1722	1727	100 %	0 %	0 %	0 %	357403390
38	NC_016112	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403390
39	NC_016112	CGA	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403390
40	NC_016112	CTGC	2	8	1985	1992	0 %	25 %	25 %	50 %	357403390
41	NC_016112	ATC	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
42	NC_016112	A	6	6	2060	2065	100 %	0 %	0 %	0 %	357403390
43	NC_016112	A	6	6	2073	2078	100 %	0 %	0 %	0 %	357403390
44	NC_016112	T	6	6	2082	2087	0 %	100 %	0 %	0 %	357403390
45	NC_016112	TAT	2	6	2111	2116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
46	NC_016112	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
47	NC_016112	GAT	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403390
48	NC_016112	TAA	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403390
49	NC_016112	AAT	2	6	2339	2344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403390
50	NC_016112	TCA	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
51	NC_016112	TTA	2	6	2441	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
52	NC_016112	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403390
53	NC_016112	GAA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403390
54	NC_016112	GAA	3	9	2564	2572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403390
55	NC_016112	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403390
56	NC_016112	ATT	2	6	2699	2704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
57	NC_016112	AATTT	2	10	3291	3300	40 %	60 %	0 %	0 %	357403391
58	NC_016112	ATTC	2	8	3344	3351	25 %	50 %	0 %	25 %	357403391
59	NC_016112	CA	3	6	3377	3382	50 %	0 %	0 %	50 %	357403391
60	NC_016112	GGGC	2	8	3446	3453	0 %	0 %	75 %	25 %	357403391
61	NC_016112	GCA	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403391
62	NC_016112	TGCT	2	8	3538	3545	0 %	50 %	25 %	25 %	357403391
63	NC_016112	ATTG	2	8	3563	3570	25 %	50 %	25 %	0 %	357403391
64	NC_016112	AGA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403391
65	NC_016112	CTTGG	2	10	3662	3671	0 %	40 %	40 %	20 %	357403391
66	NC_016112	CAAA	2	8	3713	3720	75 %	0 %	0 %	25 %	357403391
67	NC_016112	TCCA	2	8	3732	3739	25 %	25 %	0 %	50 %	357403391
68	NC_016112	AAT	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403391
69	NC_016112	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403391
70	NC_016112	GAT	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403391
71	NC_016112	CG	3	6	4024	4029	0 %	0 %	50 %	50 %	357403391
72	NC_016112	ATT	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403391
73	NC_016112	GAT	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403391
74	NC_016112	CTG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403391
75	NC_016112	CAT	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
76	NC_016112	GTG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403392
77	NC_016112	TCGA	2	8	4488	4495	25 %	25 %	25 %	25 %	357403392
78	NC_016112	AAG	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
79	NC_016112	TTA	2	6	4531	4536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403392
80	NC_016112	ATG	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
81	NC_016112	GAC	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
82	NC_016112	TCA	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
83	NC_016112	TGC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
84	NC_016112	CGG	2	6	4649	4654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
85	NC_016112	GAG	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403392
86	NC_016112	CCGA	2	8	4824	4831	25 %	0 %	25 %	50 %	357403392
87	NC_016112	AATT	2	8	4847	4854	50 %	50 %	0 %	0 %	357403392
88	NC_016112	GGC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
89	NC_016112	TAAA	2	8	5032	5039	75 %	25 %	0 %	0 %	357403392
90	NC_016112	AAG	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
91	NC_016112	T	6	6	5143	5148	0 %	100 %	0 %	0 %	357403392
92	NC_016112	AAT	2	6	5157	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403392
93	NC_016112	CGG	2	6	5177	5182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
94	NC_016112	ATCA	2	8	5223	5230	50 %	25 %	0 %	25 %	357403392
95	NC_016112	A	6	6	5256	5261	100 %	0 %	0 %	0 %	357403392
96	NC_016112	CGA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
97	NC_016112	TGA	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
98	NC_016112	CGA	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
99	NC_016112	ATC	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
100	NC_016112	CGG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
101	NC_016112	TCG	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
102	NC_016112	AGA	2	6	5738	5743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
103	NC_016112	CAT	4	12	5822	5833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
104	NC_016112	TTC	2	6	5883	5888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403392
105	NC_016112	ATC	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
106	NC_016112	CTATAT	2	12	5921	5932	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	357403392
107	NC_016112	CCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
108	NC_016112	AAG	2	6	5958	5963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
109	NC_016112	TGC	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
110	NC_016112	CGA	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
111	NC_016112	ACCGC	2	10	6057	6066	20 %	0 %	20 %	60 %	357403392
112	NC_016112	ACG	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
113	NC_016112	AAC	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403392
114	NC_016112	CGA	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
115	NC_016112	ACAAG	2	10	6206	6215	60 %	0 %	20 %	20 %	357403392
116	NC_016112	GGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
117	NC_016112	GCAAA	2	10	6266	6275	60 %	0 %	20 %	20 %	357403392
118	NC_016112	TTC	2	6	6381	6386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403392
119	NC_016112	CCG	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
120	NC_016112	GAT	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
121	NC_016112	A	6	6	6531	6536	100 %	0 %	0 %	0 %	357403392
122	NC_016112	GCC	2	6	6616	6621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
123	NC_016112	CGC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
124	NC_016112	CGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
125	NC_016112	CCGCG	2	10	6699	6708	0 %	0 %	40 %	60 %	357403392
126	NC_016112	GCA	2	6	7263	7268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403393
127	NC_016112	CAT	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403393
128	NC_016112	ATC	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403393
129	NC_016112	TTG	2	6	7389	7394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403393
130	NC_016112	GCA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403393
131	NC_016112	ATCG	2	8	7555	7562	25 %	25 %	25 %	25 %	357403394
132	NC_016112	CGA	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
133	NC_016112	CGC	2	6	7639	7644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403394
134	NC_016112	ACG	3	9	7647	7655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
135	NC_016112	GCATTG	2	12	7658	7669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357403394
136	NC_016112	ACG	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
137	NC_016112	CTG	2	6	7721	7726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403394
138	NC_016112	CCG	2	6	7817	7822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403394
139	NC_016112	CCTCA	2	10	7848	7857	20 %	20 %	0 %	60 %	357403394
140	NC_016112	CAC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403394
141	NC_016112	TGC	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
142	NC_016112	CTG	2	6	8018	8023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
143	NC_016112	TCG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
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145	NC_016112	AGT	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403395
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148	NC_016112	TTGC	2	8	8537	8544	0 %	50 %	25 %	25 %	357403395
149	NC_016112	TTG	2	6	8555	8560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403395
150	NC_016112	CGGT	2	8	8567	8574	0 %	25 %	50 %	25 %	357403395
151	NC_016112	CATG	2	8	8599	8606	25 %	25 %	25 %	25 %	357403395
152	NC_016112	A	6	6	8640	8645	100 %	0 %	0 %	0 %	357403395
153	NC_016112	CAA	2	6	8818	8823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403395
154	NC_016112	CGG	2	6	8878	8883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403395
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156	NC_016112	CCG	2	6	9030	9035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403395
157	NC_016112	ATGAA	2	10	9036	9045	60 %	20 %	20 %	0 %	357403395
158	NC_016112	GAA	2	6	9056	9061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403395
159	NC_016112	TCGG	2	8	9089	9096	0 %	25 %	50 %	25 %	357403395
160	NC_016112	AATC	2	8	9100	9107	50 %	25 %	0 %	25 %	357403395
161	NC_016112	ATT	2	6	9115	9120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403395
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163	NC_016112	TTTA	2	8	9239	9246	25 %	75 %	0 %	0 %	357403396
164	NC_016112	GCG	2	6	9305	9310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403396
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166	NC_016112	TAT	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
167	NC_016112	ATT	2	6	9570	9575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
168	NC_016112	ATT	2	6	9597	9602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
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259	NC_016112	GCG	2	6	13751	13756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403398
260	NC_016112	TGATT	2	10	13757	13766	20 %	60 %	20 %	0 %	357403398
261	NC_016112	TGA	2	6	14012	14017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403399
262	NC_016112	GCTT	2	8	14078	14085	0 %	50 %	25 %	25 %	357403399
263	NC_016112	T	6	6	14216	14221	0 %	100 %	0 %	0 %	357403399
264	NC_016112	ACG	2	6	14230	14235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403399
265	NC_016112	CATG	2	8	14241	14248	25 %	25 %	25 %	25 %	357403399
266	NC_016112	CAT	2	6	14286	14291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403399
267	NC_016112	ACTG	2	8	14298	14305	25 %	25 %	25 %	25 %	357403399
268	NC_016112	GGT	2	6	14316	14321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403399
269	NC_016112	ATT	2	6	14382	14387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403399
270	NC_016112	TCAA	2	8	14456	14463	50 %	25 %	0 %	25 %	357403399
271	NC_016112	TGC	2	6	14486	14491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403399
272	NC_016112	AAC	2	6	14522	14527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403399
273	NC_016112	GTC	2	6	14539	14544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403399
274	NC_016112	GCCG	2	8	14553	14560	0 %	0 %	50 %	50 %	357403399
275	NC_016112	GATC	2	8	14685	14692	25 %	25 %	25 %	25 %	357403399
276	NC_016112	GAC	2	6	14704	14709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403399
277	NC_016112	ATC	2	6	14762	14767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403399
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279	NC_016112	GAA	3	9	14899	14907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403399
280	NC_016112	TCAA	2	8	14984	14991	50 %	25 %	0 %	25 %	357403399
281	NC_016112	TGC	2	6	15015	15020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403399
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283	NC_016112	ATT	2	6	15075	15080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403399
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285	NC_016112	TGAG	2	8	15242	15249	25 %	25 %	50 %	0 %	357403399
286	NC_016112	A	6	6	15253	15258	100 %	0 %	0 %	0 %	357403399
287	NC_016112	AT	3	6	15267	15272	50 %	50 %	0 %	0 %	357403399
288	NC_016112	A	6	6	15366	15371	100 %	0 %	0 %	0 %	357403399
289	NC_016112	GCG	2	6	15379	15384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403399
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292	NC_016112	CGACT	2	10	15509	15518	20 %	20 %	20 %	40 %	357403399
293	NC_016112	CGG	2	6	15519	15524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403399
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296	NC_016112	A	6	6	15602	15607	100 %	0 %	0 %	0 %	357403399
297	NC_016112	ATT	2	6	15653	15658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403399
298	NC_016112	T	6	6	15780	15785	0 %	100 %	0 %	0 %	357403399
299	NC_016112	AAG	2	6	15800	15805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403399
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333	NC_016112	GAT	2	6	17680	17685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403401
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339	NC_016112	CGC	2	6	18733	18738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
340	NC_016112	GCA	2	6	18763	18768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
341	NC_016112	A	7	7	18825	18831	100 %	0 %	0 %	0 %	357403402
342	NC_016112	CCA	2	6	18835	18840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403402
343	NC_016112	CCG	2	6	18862	18867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
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362	NC_016112	GCGT	2	8	19793	19800	0 %	25 %	50 %	25 %	357403402
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369	NC_016112	GCTGCC	2	12	20230	20241	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357403402
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371	NC_016112	CGA	2	6	20309	20314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
372	NC_016112	GGTAC	2	10	20335	20344	20 %	20 %	40 %	20 %	357403402
373	NC_016112	TAA	2	6	20409	20414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403402
374	NC_016112	CG	3	6	20435	20440	0 %	0 %	50 %	50 %	357403402
375	NC_016112	ATC	2	6	20461	20466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403402
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377	NC_016112	ACA	2	6	20591	20596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403402
378	NC_016112	GT	3	6	20615	20620	0 %	50 %	50 %	0 %	357403402
379	NC_016112	CAA	2	6	20671	20676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403402
380	NC_016112	GCTG	2	8	20706	20713	0 %	25 %	50 %	25 %	357403402
381	NC_016112	CGAA	2	8	20756	20763	50 %	0 %	25 %	25 %	357403402
382	NC_016112	ACC	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403402
383	NC_016112	GTG	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403402
384	NC_016112	GCG	2	6	20876	20881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403402
385	NC_016112	GGT	2	6	20907	20912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403402
386	NC_016112	CAA	2	6	20916	20921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403402
387	NC_016112	CGG	2	6	20973	20978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403402
388	NC_016112	TCA	3	9	21107	21115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403403
389	NC_016112	AAGG	2	8	21208	21215	50 %	0 %	50 %	0 %	357403403
390	NC_016112	CAAAG	2	10	21283	21292	60 %	0 %	20 %	20 %	357403403
391	NC_016112	TTG	2	6	21354	21359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403404
392	NC_016112	GAA	2	6	21459	21464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403404
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