MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_016112	GATC	2	8	3628181	3628188	25 %	25 %	25 %	25 %	357406448
57003	NC_016112	TCGCCA	2	12	3628202	3628213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357406448
57004	NC_016112	CGAT	2	8	3628240	3628247	25 %	25 %	25 %	25 %	357406448
57005	NC_016112	CTCG	2	8	3628248	3628255	0 %	25 %	25 %	50 %	357406448
57006	NC_016112	CCGC	2	8	3628259	3628266	0 %	0 %	25 %	75 %	357406448
57007	NC_016112	CTT	2	6	3628335	3628340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357406448
57008	NC_016112	GCC	2	6	3628387	3628392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406448
57009	NC_016112	CGAC	2	8	3628420	3628427	25 %	0 %	25 %	50 %	357406448
57010	NC_016112	TCG	2	6	3628501	3628506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406449
57011	NC_016112	TCG	2	6	3628512	3628517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406449
57012	NC_016112	TACC	2	8	3628642	3628649	25 %	25 %	0 %	50 %	357406449
57013	NC_016112	GAC	2	6	3628675	3628680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406449
57014	NC_016112	TGA	2	6	3628764	3628769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406449
57015	NC_016112	GCCA	2	8	3628817	3628824	25 %	0 %	25 %	50 %	357406449
57016	NC_016112	T	6	6	3629018	3629023	0 %	100 %	0 %	0 %	357406449
57017	NC_016112	CCTA	2	8	3629072	3629079	25 %	25 %	0 %	50 %	357406449
57018	NC_016112	TGA	2	6	3629095	3629100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406449
57019	NC_016112	CAT	2	6	3629176	3629181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406449
57020	NC_016112	GC	3	6	3629193	3629198	0 %	0 %	50 %	50 %	357406449
57021	NC_016112	TAA	2	6	3629203	3629208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357406449
57022	NC_016112	CA	3	6	3629247	3629252	50 %	0 %	0 %	50 %	357406449
57023	NC_016112	TCGGC	2	10	3629288	3629297	0 %	20 %	40 %	40 %	357406450
57024	NC_016112	ATA	2	6	3629407	3629412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357406450
57025	NC_016112	CAA	2	6	3629452	3629457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406450
57026	NC_016112	A	6	6	3629530	3629535	100 %	0 %	0 %	0 %	357406450
57027	NC_016112	CAA	2	6	3629566	3629571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406450
57028	NC_016112	ACC	2	6	3629594	3629599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357406450
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57030	NC_016112	CTG	2	6	3629771	3629776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406451
57031	NC_016112	ATAA	2	8	3629810	3629817	75 %	25 %	0 %	0 %	357406451
57032	NC_016112	CTT	2	6	3629949	3629954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357406451
57033	NC_016112	GTT	2	6	3629965	3629970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357406451
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57045	NC_016112	GTC	2	6	3630786	3630791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406452
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57050	NC_016112	TCGG	2	8	3631046	3631053	0 %	25 %	50 %	25 %	357406452
57051	NC_016112	GTCA	2	8	3631261	3631268	25 %	25 %	25 %	25 %	357406452
57052	NC_016112	AT	3	6	3631278	3631283	50 %	50 %	0 %	0 %	357406452
57053	NC_016112	CTG	2	6	3631288	3631293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406452
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57058	NC_016112	AAT	2	6	3631533	3631538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357406452
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57092	NC_016112	T	8	8	3634072	3634079	0 %	100 %	0 %	0 %	357406453
57093	NC_016112	AAAT	2	8	3634171	3634178	75 %	25 %	0 %	0 %	357406453
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57105	NC_016112	GACCG	2	10	3635092	3635101	20 %	0 %	40 %	40 %	357406455
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57116	NC_016112	CAGA	2	8	3635525	3635532	50 %	0 %	25 %	25 %	357406455
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57118	NC_016112	CAA	2	6	3635625	3635630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406455
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57223	NC_016112	A	7	7	3641657	3641663	100 %	0 %	0 %	0 %	357406461
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57231	NC_016112	A	7	7	3641935	3641941	100 %	0 %	0 %	0 %	357406462
57232	NC_016112	CGG	3	9	3641965	3641973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357406462
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57234	NC_016112	A	6	6	3642063	3642068	100 %	0 %	0 %	0 %	357406462
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57354	NC_016112	AGC	2	6	3649038	3649043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406469
57355	NC_016112	GCT	2	6	3649123	3649128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406469
57356	NC_016112	GAT	2	6	3649200	3649205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406469
57357	NC_016112	CAA	2	6	3649325	3649330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406470
57358	NC_016112	T	6	6	3649334	3649339	0 %	100 %	0 %	0 %	357406470
57359	NC_016112	TAA	2	6	3649362	3649367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357406470
57360	NC_016112	T	6	6	3649569	3649574	0 %	100 %	0 %	0 %	357406470
57361	NC_016112	CAT	2	6	3649610	3649615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406470
57362	NC_016112	AAAT	2	8	3649642	3649649	75 %	25 %	0 %	0 %	357406470
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57364	NC_016112	CAT	2	6	3649763	3649768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406470
57365	NC_016112	AGTT	2	8	3649872	3649879	25 %	50 %	25 %	0 %	357406470
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57373	NC_016112	A	6	6	3650368	3650373	100 %	0 %	0 %	0 %	357406472
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57375	NC_016112	TTG	2	6	3650464	3650469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357406472
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57381	NC_016112	GACTCG	2	12	3650668	3650679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357406472
57382	NC_016112	T	7	7	3650859	3650865	0 %	100 %	0 %	0 %	357406472
57383	NC_016112	T	6	6	3651111	3651116	0 %	100 %	0 %	0 %	357406473
57384	NC_016112	TAT	2	6	3651130	3651135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357406473
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57388	NC_016112	CAC	2	6	3651334	3651339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357406473
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57391	NC_016112	GCCG	2	8	3651503	3651510	0 %	0 %	50 %	50 %	357406473
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57445	NC_016112	TTTTTC	2	12	3654568	3654579	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	357406478
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57452	NC_016112	AT	3	6	3654939	3654944	50 %	50 %	0 %	0 %	357406479
57453	NC_016112	TTC	2	6	3654961	3654966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357406479
57454	NC_016112	ACC	2	6	3655007	3655012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357406479
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57456	NC_016112	TAC	2	6	3655132	3655137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406479
57457	NC_016112	TCGC	2	8	3655143	3655150	0 %	25 %	25 %	50 %	357406479
57458	NC_016112	T	6	6	3655261	3655266	0 %	100 %	0 %	0 %	357406479
57459	NC_016112	CGC	2	6	3655302	3655307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406479
57460	NC_016112	T	6	6	3655357	3655362	0 %	100 %	0 %	0 %	357406479
57461	NC_016112	CCA	2	6	3655368	3655373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357406479
57462	NC_016112	T	8	8	3655471	3655478	0 %	100 %	0 %	0 %	357406479
57463	NC_016112	TTC	2	6	3655531	3655536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357406479
57464	NC_016112	CAC	2	6	3655555	3655560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357406479
57465	NC_016112	CCGATT	2	12	3655593	3655604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	357406479
57466	NC_016112	CGA	2	6	3655666	3655671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406479
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57468	NC_016112	T	9	9	3655768	3655776	0 %	100 %	0 %	0 %	357406479
57469	NC_016112	A	6	6	3655986	3655991	100 %	0 %	0 %	0 %	357406480
57470	NC_016112	T	6	6	3656013	3656018	0 %	100 %	0 %	0 %	357406480
57471	NC_016112	CGA	2	6	3656041	3656046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406480
57472	NC_016112	CAAC	2	8	3656053	3656060	50 %	0 %	0 %	50 %	357406480
57473	NC_016112	TTTG	2	8	3656102	3656109	0 %	75 %	25 %	0 %	357406480
57474	NC_016112	A	7	7	3656118	3656124	100 %	0 %	0 %	0 %	357406480
57475	NC_016112	TCG	2	6	3656152	3656157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406480
57476	NC_016112	CAA	2	6	3656158	3656163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406480
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57479	NC_016112	AGC	2	6	3656291	3656296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406480
57480	NC_016112	TTG	2	6	3656489	3656494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357406480
57481	NC_016112	GCA	2	6	3656572	3656577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406480
57482	NC_016112	CCT	2	6	3656595	3656600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357406480
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57490	NC_016112	CTG	2	6	3657208	3657213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406481
57491	NC_016112	CCG	2	6	3657248	3657253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406481
57492	NC_016112	GCA	2	6	3657260	3657265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406481
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57494	NC_016112	TGTT	2	8	3657301	3657308	0 %	75 %	25 %	0 %	357406481
57495	NC_016112	GCT	2	6	3657382	3657387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406481
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57497	NC_016112	TCGG	2	8	3657460	3657467	0 %	25 %	50 %	25 %	357406481
57498	NC_016112	A	6	6	3657494	3657499	100 %	0 %	0 %	0 %	357406481
57499	NC_016112	ATG	2	6	3657593	3657598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406481
57500	NC_016112	CAC	2	6	3657712	3657717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357406481

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