MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_016112	ATG	2	6	3504703	3504708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406350
55003	NC_016112	ACG	2	6	3504788	3504793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406350
55004	NC_016112	A	7	7	3504829	3504835	100 %	0 %	0 %	0 %	357406350
55005	NC_016112	CAA	2	6	3504881	3504886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406350
55006	NC_016112	GAT	2	6	3505008	3505013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406350
55007	NC_016112	CGA	2	6	3505058	3505063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406350
55008	NC_016112	ACA	2	6	3505067	3505072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406350
55009	NC_016112	T	8	8	3505184	3505191	0 %	100 %	0 %	0 %	357406350
55010	NC_016112	TGA	2	6	3505199	3505204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406350
55011	NC_016112	TGT	2	6	3505230	3505235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357406350
55012	NC_016112	CT	4	8	3506483	3506490	0 %	50 %	0 %	50 %	357406351
55013	NC_016112	GTGC	2	8	3506580	3506587	0 %	25 %	50 %	25 %	357406351
55014	NC_016112	GAT	2	6	3506639	3506644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406351
55015	NC_016112	T	6	6	3506675	3506680	0 %	100 %	0 %	0 %	357406351
55016	NC_016112	ATC	2	6	3506693	3506698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406351
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55018	NC_016112	TCG	2	6	3506794	3506799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406351
55019	NC_016112	CG	4	8	3506798	3506805	0 %	0 %	50 %	50 %	357406351
55020	NC_016112	ATC	2	6	3506855	3506860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406351
55021	NC_016112	CTTTG	2	10	3506867	3506876	0 %	60 %	20 %	20 %	357406351
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55023	NC_016112	TCA	2	6	3507105	3507110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406351
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55025	NC_016112	CAT	2	6	3507155	3507160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406351
55026	NC_016112	A	6	6	3507165	3507170	100 %	0 %	0 %	0 %	357406351
55027	NC_016112	AAT	2	6	3507178	3507183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357406351
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55029	NC_016112	AGC	3	9	3507236	3507244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406351
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55032	NC_016112	A	7	7	3507396	3507402	100 %	0 %	0 %	0 %	357406351
55033	NC_016112	TCA	2	6	3507432	3507437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406351
55034	NC_016112	AATA	2	8	3507492	3507499	75 %	25 %	0 %	0 %	357406351
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55036	NC_016112	GTAA	2	8	3507584	3507591	50 %	25 %	25 %	0 %	357406351
55037	NC_016112	ATG	2	6	3507765	3507770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406351
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55039	NC_016112	TCG	2	6	3508058	3508063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406352
55040	NC_016112	GTCGAT	2	12	3508193	3508204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357406352
55041	NC_016112	ACG	2	6	3508205	3508210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406352
55042	NC_016112	TAA	2	6	3508301	3508306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357406352
55043	NC_016112	CGG	2	6	3508342	3508347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357406352
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55049	NC_016112	GC	3	6	3508645	3508650	0 %	0 %	50 %	50 %	357406352
55050	NC_016112	ACA	2	6	3508668	3508673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406352
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55052	NC_016112	GCC	2	6	3508744	3508749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406352
55053	NC_016112	CTTT	2	8	3508857	3508864	0 %	75 %	0 %	25 %	357406352
55054	NC_016112	CAA	2	6	3508873	3508878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406352
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55057	NC_016112	GCCG	2	8	3509029	3509036	0 %	0 %	50 %	50 %	357406352
55058	NC_016112	CGC	2	6	3509073	3509078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406352
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55061	NC_016112	CGC	3	9	3509154	3509162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406352
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55100	NC_016112	TGCA	2	8	3511488	3511495	25 %	25 %	25 %	25 %	357406353
55101	NC_016112	CG	3	6	3511539	3511544	0 %	0 %	50 %	50 %	357406353
55102	NC_016112	CG	3	6	3511638	3511643	0 %	0 %	50 %	50 %	357406353
55103	NC_016112	CGA	2	6	3511660	3511665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406353
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55115	NC_016112	CGC	2	6	3512588	3512593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406354
55116	NC_016112	GCC	2	6	3512605	3512610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406354
55117	NC_016112	ATC	2	6	3512618	3512623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406354
55118	NC_016112	CAT	2	6	3512799	3512804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406354
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55120	NC_016112	GTC	2	6	3512822	3512827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406354
55121	NC_016112	GGC	2	6	3512845	3512850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357406354
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55153	NC_016112	TA	3	6	3514533	3514538	50 %	50 %	0 %	0 %	357406356
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55199	NC_016112	A	6	6	3517534	3517539	100 %	0 %	0 %	0 %	357406358
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55219	NC_016112	CA	3	6	3518536	3518541	50 %	0 %	0 %	50 %	357406360
55220	NC_016112	C	6	6	3518544	3518549	0 %	0 %	0 %	100 %	357406360
55221	NC_016112	TCA	2	6	3518593	3518598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406360
55222	NC_016112	CGAT	2	8	3518648	3518655	25 %	25 %	25 %	25 %	357406360
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55227	NC_016112	CAAT	2	8	3519199	3519206	50 %	25 %	0 %	25 %	357406360
55228	NC_016112	CATC	2	8	3519209	3519216	25 %	25 %	0 %	50 %	357406360
55229	NC_016112	CCT	2	6	3519450	3519455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357406361
55230	NC_016112	CTT	2	6	3519542	3519547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357406361
55231	NC_016112	GAC	2	6	3519549	3519554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406361
55232	NC_016112	T	6	6	3519612	3519617	0 %	100 %	0 %	0 %	357406361
55233	NC_016112	AC	3	6	3519620	3519625	50 %	0 %	0 %	50 %	357406361
55234	NC_016112	TTGA	2	8	3519750	3519757	25 %	50 %	25 %	0 %	357406361
55235	NC_016112	AGC	2	6	3519851	3519856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406361
55236	NC_016112	GAT	2	6	3519858	3519863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406361
55237	NC_016112	A	6	6	3519906	3519911	100 %	0 %	0 %	0 %	357406361
55238	NC_016112	CAT	2	6	3519915	3519920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406361
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55240	NC_016112	TGC	2	6	3520088	3520093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406361
55241	NC_016112	TGT	2	6	3520136	3520141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357406361
55242	NC_016112	ATT	2	6	3520145	3520150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357406361
55243	NC_016112	ATG	2	6	3520195	3520200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406361
55244	NC_016112	A	6	6	3520254	3520259	100 %	0 %	0 %	0 %	357406361
55245	NC_016112	T	6	6	3520373	3520378	0 %	100 %	0 %	0 %	357406361
55246	NC_016112	CAA	2	6	3520565	3520570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406361
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55250	NC_016112	GTA	2	6	3520876	3520881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406362
55251	NC_016112	GTT	2	6	3520928	3520933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357406362
55252	NC_016112	ACG	2	6	3520946	3520951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406362
55253	NC_016112	T	7	7	3521012	3521018	0 %	100 %	0 %	0 %	357406362
55254	NC_016112	TCA	2	6	3521026	3521031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406362
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55256	NC_016112	CGA	2	6	3521120	3521125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406362
55257	NC_016112	GC	3	6	3521210	3521215	0 %	0 %	50 %	50 %	357406362
55258	NC_016112	CTT	2	6	3521261	3521266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357406362
55259	NC_016112	GCC	2	6	3521348	3521353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406362
55260	NC_016112	TCGG	2	8	3521358	3521365	0 %	25 %	50 %	25 %	357406362
55261	NC_016112	AAAAT	2	10	3521383	3521392	80 %	20 %	0 %	0 %	357406362
55262	NC_016112	CTT	2	6	3521450	3521455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357406362
55263	NC_016112	TGA	2	6	3521464	3521469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406362
55264	NC_016112	A	6	6	3521469	3521474	100 %	0 %	0 %	0 %	357406362
55265	NC_016112	GAA	2	6	3521531	3521536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357406362
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55305	NC_016112	CGC	2	6	3523563	3523568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406362
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55314	NC_016112	AC	3	6	3524015	3524020	50 %	0 %	0 %	50 %	357406362
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55320	NC_016112	CAAC	2	8	3524192	3524199	50 %	0 %	0 %	50 %	357406363
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55337	NC_016112	GCAA	2	8	3524927	3524934	50 %	0 %	25 %	25 %	357406364
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55341	NC_016112	AT	3	6	3525097	3525102	50 %	50 %	0 %	0 %	357406364
55342	NC_016112	GCA	2	6	3525119	3525124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406364
55343	NC_016112	A	6	6	3525157	3525162	100 %	0 %	0 %	0 %	357406364
55344	NC_016112	AGATAT	2	12	3525253	3525264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	357406365
55345	NC_016112	T	6	6	3525297	3525302	0 %	100 %	0 %	0 %	357406365
55346	NC_016112	TTTTGA	2	12	3525306	3525317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	357406365
55347	NC_016112	CAA	2	6	3525338	3525343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406365
55348	NC_016112	CCG	2	6	3525377	3525382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406365
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55350	NC_016112	GAT	2	6	3525395	3525400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357406365
55351	NC_016112	A	6	6	3525440	3525445	100 %	0 %	0 %	0 %	357406365
55352	NC_016112	AGA	2	6	3525619	3525624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357406365
55353	NC_016112	A	6	6	3525634	3525639	100 %	0 %	0 %	0 %	357406365
55354	NC_016112	GTC	2	6	3525668	3525673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406365
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55382	NC_016112	CGT	2	6	3527570	3527575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406366
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55387	NC_016112	CT	3	6	3527741	3527746	0 %	50 %	0 %	50 %	357406366
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55451	NC_016112	TCG	2	6	3530832	3530837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406368
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55453	NC_016112	AT	3	6	3530842	3530847	50 %	50 %	0 %	0 %	357406368
55454	NC_016112	ATC	2	6	3530851	3530856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406368
55455	NC_016112	AAC	2	6	3530955	3530960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357406369
55456	NC_016112	CTG	2	6	3531002	3531007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406369
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55467	NC_016112	GCC	2	6	3531579	3531584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406369
55468	NC_016112	CGG	2	6	3531674	3531679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357406369
55469	NC_016112	CGC	2	6	3531700	3531705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406369
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55471	NC_016112	CCG	2	6	3531792	3531797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406369
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55494	NC_016112	GCA	2	6	3533007	3533012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357406369
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55497	NC_016112	GCC	2	6	3533175	3533180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357406369
55498	NC_016112	ATGG	2	8	3533189	3533196	25 %	25 %	50 %	0 %	357406369
55499	NC_016112	TCA	2	6	3533308	3533313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357406369
55500	NC_016112	GTC	2	6	3533545	3533550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357406370

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