MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 37647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015676	CTG	2	6	233279	233284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476156
4002	NC_015676	TGG	3	9	233288	233296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476156
4003	NC_015676	CTG	2	6	233345	233350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476156
4004	NC_015676	GGA	2	6	233457	233462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476156
4005	NC_015676	TTG	2	6	233483	233488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476156
4006	NC_015676	GAG	2	6	233539	233544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476156
4007	NC_015676	CAA	2	6	233574	233579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476156
4008	NC_015676	TTG	2	6	233651	233656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476156
4009	NC_015676	GAT	2	6	233668	233673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476156
4010	NC_015676	GCA	2	6	233912	233917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476157
4011	NC_015676	GGA	2	6	234023	234028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476157
4012	NC_015676	GAT	2	6	234151	234156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476157
4013	NC_015676	CTG	2	6	234167	234172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476157
4014	NC_015676	CCA	2	6	234180	234185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476157
4015	NC_015676	TCA	2	6	234221	234226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476157
4016	NC_015676	CTG	3	9	234296	234304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476157
4017	NC_015676	ATC	2	6	234409	234414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476158
4018	NC_015676	AT	3	6	234474	234479	50 %	50 %	0 %	0 %	336476158
4019	NC_015676	CCTGCA	2	12	234487	234498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336476158
4020	NC_015676	TC	3	6	234534	234539	0 %	50 %	0 %	50 %	336476158
4021	NC_015676	CTT	2	6	234552	234557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476158
4022	NC_015676	TGA	2	6	234593	234598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476158
4023	NC_015676	ATT	3	9	235049	235057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476159
4024	NC_015676	T	6	6	235063	235068	0 %	100 %	0 %	0 %	336476159
4025	NC_015676	CTTA	2	8	235114	235121	25 %	50 %	0 %	25 %	336476159
4026	NC_015676	T	7	7	235169	235175	0 %	100 %	0 %	0 %	336476159
4027	NC_015676	ATC	2	6	235195	235200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476159
4028	NC_015676	ATCATA	2	12	235264	235275	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336476159
4029	NC_015676	ATT	2	6	235310	235315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476159
4030	NC_015676	GCA	2	6	235559	235564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476160
4031	NC_015676	T	6	6	235599	235604	0 %	100 %	0 %	0 %	336476160
4032	NC_015676	TGG	2	6	235622	235627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476160
4033	NC_015676	AGA	2	6	235675	235680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476160
4034	NC_015676	ATG	2	6	235696	235701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476160
4035	NC_015676	CAC	2	6	235706	235711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476160
4036	NC_015676	GCC	2	6	235764	235769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336476160
4037	NC_015676	CGC	2	6	235787	235792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336476160
4038	NC_015676	TC	3	6	235952	235957	0 %	50 %	0 %	50 %	336476160
4039	NC_015676	T	7	7	236179	236185	0 %	100 %	0 %	0 %	336476160
4040	NC_015676	TCC	2	6	236262	236267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476161
4041	NC_015676	CA	3	6	236354	236359	50 %	0 %	0 %	50 %	336476161
4042	NC_015676	CTG	2	6	236362	236367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476161
4043	NC_015676	TC	3	6	236407	236412	0 %	50 %	0 %	50 %	336476161
4044	NC_015676	CAA	2	6	236422	236427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476161
4045	NC_015676	CT	3	6	236434	236439	0 %	50 %	0 %	50 %	336476161
4046	NC_015676	CTT	2	6	236468	236473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476161
4047	NC_015676	CCTGG	2	10	236503	236512	0 %	20 %	40 %	40 %	336476161
4048	NC_015676	AT	3	6	236522	236527	50 %	50 %	0 %	0 %	336476161
4049	NC_015676	CTG	2	6	236696	236701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476161
4050	NC_015676	CTT	2	6	236705	236710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476161
4051	NC_015676	ACC	2	6	236756	236761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476161
4052	NC_015676	ACA	2	6	236880	236885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476161
4053	NC_015676	TGCA	2	8	236927	236934	25 %	25 %	25 %	25 %	336476161
4054	NC_015676	TGTCAT	2	12	236972	236983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336476161
4055	NC_015676	TCC	2	6	237089	237094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476161
4056	NC_015676	CTGT	2	8	237131	237138	0 %	50 %	25 %	25 %	336476161
4057	NC_015676	GTT	2	6	237183	237188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476161
4058	NC_015676	GTT	2	6	237212	237217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476161
4059	NC_015676	TCC	3	9	237359	237367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476161
4060	NC_015676	GTT	2	6	237476	237481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476161
4061	NC_015676	TTC	2	6	237530	237535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476161
4062	NC_015676	TCA	2	6	237724	237729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476161
4063	NC_015676	ATCA	2	8	237806	237813	50 %	25 %	0 %	25 %	336476161
4064	NC_015676	GAT	2	6	237825	237830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476161
4065	NC_015676	ATA	2	6	237921	237926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476161
4066	NC_015676	TCA	2	6	237994	237999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476162
4067	NC_015676	ATCA	2	8	238014	238021	50 %	25 %	0 %	25 %	336476162
4068	NC_015676	TTC	2	6	238024	238029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476162
4069	NC_015676	ACA	2	6	238084	238089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476162
4070	NC_015676	GCA	2	6	238090	238095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476162
4071	NC_015676	TAC	2	6	238101	238106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476162
4072	NC_015676	AGC	2	6	238246	238251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476162
4073	NC_015676	TC	3	6	238268	238273	0 %	50 %	0 %	50 %	336476162
4074	NC_015676	GTA	2	6	238468	238473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476162
4075	NC_015676	AGA	2	6	238484	238489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476162
4076	NC_015676	TGG	2	6	238517	238522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476162
4077	NC_015676	TCC	2	6	238537	238542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476162
4078	NC_015676	TTCATT	2	12	238578	238589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	336476162
4079	NC_015676	AAG	2	6	238611	238616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476162
4080	NC_015676	TCC	2	6	238626	238631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476162
4081	NC_015676	CTT	2	6	238719	238724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476162
4082	NC_015676	GAA	2	6	238728	238733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476162
4083	NC_015676	ACA	2	6	238804	238809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476162
4084	NC_015676	T	6	6	238822	238827	0 %	100 %	0 %	0 %	336476162
4085	NC_015676	GCA	2	6	238843	238848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476162
4086	NC_015676	CAG	2	6	239018	239023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476162
4087	NC_015676	TTG	2	6	239122	239127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476162
4088	NC_015676	ATGC	2	8	239137	239144	25 %	25 %	25 %	25 %	336476162
4089	NC_015676	CA	3	6	239195	239200	50 %	0 %	0 %	50 %	336476162
4090	NC_015676	ACA	2	6	239221	239226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476162
4091	NC_015676	TTTGCT	2	12	239436	239447	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	336476163
4092	NC_015676	GCTG	2	8	239509	239516	0 %	25 %	50 %	25 %	336476163
4093	NC_015676	TTC	2	6	239605	239610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476163
4094	NC_015676	TGGAA	2	10	240229	240238	40 %	20 %	40 %	0 %	336476164
4095	NC_015676	TC	3	6	240249	240254	0 %	50 %	0 %	50 %	336476164
4096	NC_015676	CCA	2	6	240408	240413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476164
4097	NC_015676	ATG	2	6	240438	240443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476164
4098	NC_015676	GA	3	6	240458	240463	50 %	0 %	50 %	0 %	336476164
4099	NC_015676	GCAGG	2	10	240528	240537	20 %	0 %	60 %	20 %	336476164
4100	NC_015676	TGA	3	9	240562	240570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476164
4101	NC_015676	CTT	2	6	240575	240580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476164
4102	NC_015676	CATG	2	8	240667	240674	25 %	25 %	25 %	25 %	336476164
4103	NC_015676	GAG	2	6	240780	240785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476164
4104	NC_015676	ATT	2	6	240807	240812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476164
4105	NC_015676	TAT	2	6	241800	241805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476165
4106	NC_015676	GT	3	6	241907	241912	0 %	50 %	50 %	0 %	336476165
4107	NC_015676	ATG	2	6	242018	242023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476165
4108	NC_015676	GAT	2	6	242101	242106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476165
4109	NC_015676	GGATGC	2	12	242133	242144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336476165
4110	NC_015676	GTA	2	6	242146	242151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476165
4111	NC_015676	ATA	2	6	242180	242185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476165
4112	NC_015676	GTA	2	6	242189	242194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476165
4113	NC_015676	TGAAG	2	10	242397	242406	40 %	20 %	40 %	0 %	336476165
4114	NC_015676	TGA	2	6	242637	242642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476165
4115	NC_015676	GGT	2	6	242688	242693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476165
4116	NC_015676	ATG	2	6	242768	242773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476165
4117	NC_015676	ACC	2	6	242786	242791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476165
4118	NC_015676	TAC	2	6	242841	242846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476165
4119	NC_015676	AAT	2	6	243019	243024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476165
4120	NC_015676	ACA	2	6	243093	243098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476165
4121	NC_015676	TGA	2	6	243186	243191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476165
4122	NC_015676	TAT	2	6	243208	243213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476165
4123	NC_015676	ATT	2	6	243411	243416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476166
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4153	NC_015676	GAT	2	6	245004	245009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476167
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4230	NC_015676	TGA	2	6	250035	250040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476174
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4234	NC_015676	AC	3	6	250150	250155	50 %	0 %	0 %	50 %	336476174
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4237	NC_015676	TGA	2	6	250350	250355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476174
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4239	NC_015676	AACC	2	8	250608	250615	50 %	0 %	0 %	50 %	336476175
4240	NC_015676	GGT	2	6	250702	250707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476175
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4361	NC_015676	AGA	2	6	257670	257675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476181
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4363	NC_015676	GAT	2	6	257848	257853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476181
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4489	NC_015676	TTAT	2	8	264959	264966	25 %	75 %	0 %	0 %	336476187
4490	NC_015676	TCA	2	6	265018	265023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476187
4491	NC_015676	GA	3	6	265033	265038	50 %	0 %	50 %	0 %	336476187
4492	NC_015676	TA	3	6	265059	265064	50 %	50 %	0 %	0 %	336476187
4493	NC_015676	ATA	2	6	265120	265125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476187
4494	NC_015676	ATC	2	6	265140	265145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476187
4495	NC_015676	T	6	6	265164	265169	0 %	100 %	0 %	0 %	336476187
4496	NC_015676	CAGTT	2	10	265191	265200	20 %	40 %	20 %	20 %	336476187
4497	NC_015676	TGG	2	6	265210	265215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476187
4498	NC_015676	TAT	2	6	265219	265224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476187
4499	NC_015676	TA	4	8	265227	265234	50 %	50 %	0 %	0 %	336476187
4500	NC_015676	TCG	2	6	270624	270629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476188

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