MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 37647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015676	CCA	2	6	87686	87691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476040
1502	NC_015676	ACA	2	6	87760	87765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476040
1503	NC_015676	TAA	2	6	87944	87949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476040
1504	NC_015676	TGTAT	2	10	87955	87964	20 %	60 %	20 %	0 %	336476040
1505	NC_015676	TC	3	6	87987	87992	0 %	50 %	0 %	50 %	336476040
1506	NC_015676	TTC	2	6	87996	88001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476040
1507	NC_015676	CAA	2	6	88013	88018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476040
1508	NC_015676	CAA	2	6	88226	88231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476040
1509	NC_015676	AAT	2	6	88248	88253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476040
1510	NC_015676	CTG	2	6	88293	88298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476040
1511	NC_015676	AT	3	6	88315	88320	50 %	50 %	0 %	0 %	336476040
1512	NC_015676	TCA	2	6	88321	88326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476040
1513	NC_015676	CAT	2	6	88346	88351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476040
1514	NC_015676	AGG	2	6	88359	88364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476040
1515	NC_015676	CCT	2	6	88397	88402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476040
1516	NC_015676	ACAG	2	8	88440	88447	50 %	0 %	25 %	25 %	336476040
1517	NC_015676	T	7	7	88460	88466	0 %	100 %	0 %	0 %	336476040
1518	NC_015676	T	7	7	88501	88507	0 %	100 %	0 %	0 %	336476040
1519	NC_015676	ATA	2	6	88683	88688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476041
1520	NC_015676	ATG	2	6	88689	88694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476041
1521	NC_015676	TAA	2	6	88905	88910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476041
1522	NC_015676	CAGA	2	8	88942	88949	50 %	0 %	25 %	25 %	336476041
1523	NC_015676	TTG	2	6	89070	89075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476041
1524	NC_015676	GGT	2	6	89078	89083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476041
1525	NC_015676	CTG	2	6	89130	89135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476041
1526	NC_015676	AAT	2	6	89143	89148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476041
1527	NC_015676	TTCT	2	8	89240	89247	0 %	75 %	0 %	25 %	336476041
1528	NC_015676	TAT	2	6	89291	89296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476041
1529	NC_015676	A	6	6	89300	89305	100 %	0 %	0 %	0 %	336476041
1530	NC_015676	TA	3	6	89355	89360	50 %	50 %	0 %	0 %	336476042
1531	NC_015676	GAA	2	6	89485	89490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476042
1532	NC_015676	TGCA	2	8	89503	89510	25 %	25 %	25 %	25 %	336476042
1533	NC_015676	GTT	2	6	89520	89525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476042
1534	NC_015676	GAA	2	6	89638	89643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476042
1535	NC_015676	AT	3	6	89666	89671	50 %	50 %	0 %	0 %	336476042
1536	NC_015676	GA	3	6	89680	89685	50 %	0 %	50 %	0 %	336476042
1537	NC_015676	AT	3	6	89692	89697	50 %	50 %	0 %	0 %	336476042
1538	NC_015676	ATG	2	6	89761	89766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476042
1539	NC_015676	TGA	2	6	89998	90003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476042
1540	NC_015676	AAG	2	6	90053	90058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476042
1541	NC_015676	T	6	6	90160	90165	0 %	100 %	0 %	0 %	336476043
1542	NC_015676	TTTC	2	8	90319	90326	0 %	75 %	0 %	25 %	336476043
1543	NC_015676	GTT	2	6	90344	90349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476043
1544	NC_015676	GA	3	6	90350	90355	50 %	0 %	50 %	0 %	336476043
1545	NC_015676	GGA	2	6	90387	90392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336476043
1546	NC_015676	TCA	2	6	90417	90422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476043
1547	NC_015676	GTA	2	6	90473	90478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476043
1548	NC_015676	GCT	2	6	90552	90557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476043
1549	NC_015676	CCG	2	6	90570	90575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336476043
1550	NC_015676	AT	3	6	90622	90627	50 %	50 %	0 %	0 %	336476043
1551	NC_015676	AGA	2	6	90670	90675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336476043
1552	NC_015676	T	6	6	90680	90685	0 %	100 %	0 %	0 %	336476043
1553	NC_015676	CT	3	6	90694	90699	0 %	50 %	0 %	50 %	336476043
1554	NC_015676	CAA	2	6	90727	90732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476043
1555	NC_015676	T	6	6	90786	90791	0 %	100 %	0 %	0 %	336476043
1556	NC_015676	CCA	2	6	90825	90830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336476043
1557	NC_015676	T	8	8	90833	90840	0 %	100 %	0 %	0 %	336476043
1558	NC_015676	CTG	2	6	90909	90914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476043
1559	NC_015676	CTG	2	6	90937	90942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476043
1560	NC_015676	CAT	2	6	90964	90969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476043
1561	NC_015676	GATACA	2	12	91023	91034	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336476043
1562	NC_015676	TGC	2	6	91037	91042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476043
1563	NC_015676	GT	3	6	91097	91102	0 %	50 %	50 %	0 %	336476043
1564	NC_015676	AGGC	2	8	91131	91138	25 %	0 %	50 %	25 %	336476043
1565	NC_015676	TTG	2	6	91159	91164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336476043
1566	NC_015676	ATC	2	6	91241	91246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476044
1567	NC_015676	T	6	6	91292	91297	0 %	100 %	0 %	0 %	336476044
1568	NC_015676	TGG	2	6	91302	91307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336476044
1569	NC_015676	CTC	2	6	91353	91358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476044
1570	NC_015676	ACA	2	6	91361	91366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476044
1571	NC_015676	GCA	3	9	91367	91375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476044
1572	NC_015676	CA	3	6	91413	91418	50 %	0 %	0 %	50 %	336476044
1573	NC_015676	TGA	2	6	91440	91445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336476044
1574	NC_015676	TCCATT	2	12	91463	91474	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	336476044
1575	NC_015676	CAA	2	6	91515	91520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476044
1576	NC_015676	AT	3	6	91564	91569	50 %	50 %	0 %	0 %	336476045
1577	NC_015676	A	6	6	91574	91579	100 %	0 %	0 %	0 %	336476045
1578	NC_015676	TA	3	6	91709	91714	50 %	50 %	0 %	0 %	336476045
1579	NC_015676	TATT	2	8	91723	91730	25 %	75 %	0 %	0 %	336476045
1580	NC_015676	CTG	2	6	91762	91767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476045
1581	NC_015676	A	6	6	91851	91856	100 %	0 %	0 %	0 %	336476045
1582	NC_015676	CAA	2	6	91873	91878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476045
1583	NC_015676	TA	3	6	91879	91884	50 %	50 %	0 %	0 %	336476045
1584	NC_015676	CTG	2	6	91894	91899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476045
1585	NC_015676	TGGC	2	8	91901	91908	0 %	25 %	50 %	25 %	336476045
1586	NC_015676	AT	3	6	91958	91963	50 %	50 %	0 %	0 %	336476045
1587	NC_015676	CAT	2	6	91966	91971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476045
1588	NC_015676	ATCT	2	8	92122	92129	25 %	50 %	0 %	25 %	336476045
1589	NC_015676	AT	3	6	92145	92150	50 %	50 %	0 %	0 %	336476045
1590	NC_015676	CAT	2	6	92203	92208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476045
1591	NC_015676	CTG	2	6	92209	92214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476045
1592	NC_015676	ATA	2	6	92271	92276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476045
1593	NC_015676	C	6	6	92394	92399	0 %	0 %	0 %	100 %	336476046
1594	NC_015676	CCT	2	6	92404	92409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476046
1595	NC_015676	TTA	2	6	92428	92433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336476046
1596	NC_015676	TCA	2	6	92443	92448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476046
1597	NC_015676	TG	3	6	92451	92456	0 %	50 %	50 %	0 %	336476046
1598	NC_015676	T	7	7	92565	92571	0 %	100 %	0 %	0 %	336476046
1599	NC_015676	GCG	2	6	92687	92692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336476046
1600	NC_015676	CTG	2	6	92809	92814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476046
1601	NC_015676	CAG	2	6	92908	92913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476046
1602	NC_015676	TCA	2	6	92982	92987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476046
1603	NC_015676	TGC	2	6	93008	93013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476046
1604	NC_015676	TCA	2	6	93015	93020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476046
1605	NC_015676	AT	3	6	93028	93033	50 %	50 %	0 %	0 %	336476046
1606	NC_015676	CAA	2	6	93079	93084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476046
1607	NC_015676	CTCC	2	8	93105	93112	0 %	25 %	0 %	75 %	336476046
1608	NC_015676	CTT	2	6	93138	93143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476046
1609	NC_015676	AT	3	6	93171	93176	50 %	50 %	0 %	0 %	336476046
1610	NC_015676	CAT	2	6	93215	93220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476046
1611	NC_015676	CTC	2	6	93349	93354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336476047
1612	NC_015676	ATA	2	6	93365	93370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476047
1613	NC_015676	ACCA	2	8	93425	93432	50 %	0 %	0 %	50 %	336476047
1614	NC_015676	CT	3	6	93522	93527	0 %	50 %	0 %	50 %	336476047
1615	NC_015676	TGC	2	6	93593	93598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476047
1616	NC_015676	CTG	2	6	93599	93604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336476047
1617	NC_015676	GCA	2	6	93606	93611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476047
1618	NC_015676	CAT	2	6	93619	93624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476047
1619	NC_015676	AT	3	6	93712	93717	50 %	50 %	0 %	0 %	336476047
1620	NC_015676	CAG	2	6	93740	93745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476047
1621	NC_015676	AGC	2	6	93845	93850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336476047
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1623	NC_015676	GC	3	6	94245	94250	0 %	0 %	50 %	50 %	336476047
1624	NC_015676	ATAGGA	2	12	94267	94278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	336476047
1625	NC_015676	AAT	2	6	94953	94958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476048
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1627	NC_015676	TCT	2	6	94997	95002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476048
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1997	NC_015676	TCT	2	6	118549	118554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336476070
1998	NC_015676	AAC	2	6	118636	118641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336476070
1999	NC_015676	TCA	2	6	118681	118686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336476070
2000	NC_015676	AAT	2	6	118701	118706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476070

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