MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 37647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015676	A	7	7	28240	28246	100 %	0 %	0 %	0 %	336475985
502	NC_015676	GGA	2	6	28276	28281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475985
503	NC_015676	GGC	2	6	28464	28469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475985
504	NC_015676	AAAG	2	8	28481	28488	75 %	0 %	25 %	0 %	336475985
505	NC_015676	CAGA	2	8	28498	28505	50 %	0 %	25 %	25 %	336475985
506	NC_015676	GCT	2	6	28558	28563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475985
507	NC_015676	A	6	6	28566	28571	100 %	0 %	0 %	0 %	336475985
508	NC_015676	CAA	2	6	28598	28603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475985
509	NC_015676	AGA	2	6	28621	28626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475985
510	NC_015676	AGG	2	6	28634	28639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475985
511	NC_015676	TCT	2	6	28728	28733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475985
512	NC_015676	GTT	2	6	28819	28824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475985
513	NC_015676	TTG	2	6	28886	28891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475985
514	NC_015676	GCA	2	6	28942	28947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475985
515	NC_015676	CA	3	6	29209	29214	50 %	0 %	0 %	50 %	336475986
516	NC_015676	GAA	2	6	29269	29274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475986
517	NC_015676	CT	3	6	29284	29289	0 %	50 %	0 %	50 %	336475986
518	NC_015676	AAT	2	6	29367	29372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475986
519	NC_015676	AGA	2	6	29376	29381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475986
520	NC_015676	A	6	6	29695	29700	100 %	0 %	0 %	0 %	336475987
521	NC_015676	AGATG	2	10	29716	29725	40 %	20 %	40 %	0 %	336475987
522	NC_015676	TG	3	6	29724	29729	0 %	50 %	50 %	0 %	336475987
523	NC_015676	ACCCTG	2	12	29735	29746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336475987
524	NC_015676	CACT	2	8	29781	29788	25 %	25 %	0 %	50 %	336475987
525	NC_015676	GCA	2	6	29808	29813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475987
526	NC_015676	T	7	7	29826	29832	0 %	100 %	0 %	0 %	336475987
527	NC_015676	TTC	2	6	29933	29938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475987
528	NC_015676	ATC	2	6	29967	29972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475987
529	NC_015676	TCC	2	6	30060	30065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475988
530	NC_015676	TTA	2	6	30146	30151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475988
531	NC_015676	TCA	2	6	30187	30192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
532	NC_015676	GAAG	2	8	30214	30221	50 %	0 %	50 %	0 %	336475988
533	NC_015676	T	7	7	30413	30419	0 %	100 %	0 %	0 %	336475988
534	NC_015676	CAA	2	6	30584	30589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475988
535	NC_015676	TGC	2	6	30605	30610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475988
536	NC_015676	GGC	2	6	30626	30631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475988
537	NC_015676	GTGAG	2	10	30737	30746	20 %	20 %	60 %	0 %	336475988
538	NC_015676	TGA	2	6	30788	30793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475988
539	NC_015676	CTG	2	6	30795	30800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475988
540	NC_015676	GA	3	6	30809	30814	50 %	0 %	50 %	0 %	336475988
541	NC_015676	T	7	7	30825	30831	0 %	100 %	0 %	0 %	336475988
542	NC_015676	AGG	2	6	30867	30872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475988
543	NC_015676	ATC	2	6	30946	30951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
544	NC_015676	AG	3	6	31005	31010	50 %	0 %	50 %	0 %	336475988
545	NC_015676	AGT	2	6	31015	31020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475988
546	NC_015676	AT	3	6	31057	31062	50 %	50 %	0 %	0 %	336475988
547	NC_015676	TCC	2	6	31075	31080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475988
548	NC_015676	TGCA	2	8	31199	31206	25 %	25 %	25 %	25 %	336475988
549	NC_015676	CTGCAT	2	12	31207	31218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336475988
550	NC_015676	ATGGT	2	10	31388	31397	20 %	40 %	40 %	0 %	336475988
551	NC_015676	A	6	6	31422	31427	100 %	0 %	0 %	0 %	336475988
552	NC_015676	GTT	2	6	31437	31442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475988
553	NC_015676	CTG	2	6	31454	31459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475988
554	NC_015676	ATG	2	6	31465	31470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475988
555	NC_015676	CAT	2	6	31536	31541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
556	NC_015676	AGG	2	6	31575	31580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475988
557	NC_015676	TGG	2	6	31588	31593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475988
558	NC_015676	ATC	2	6	31611	31616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475988
559	NC_015676	GCATCT	2	12	31648	31659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336475988
560	NC_015676	AG	3	6	31676	31681	50 %	0 %	50 %	0 %	336475988
561	NC_015676	TCTT	2	8	31751	31758	0 %	75 %	0 %	25 %	336475988
562	NC_015676	GCA	2	6	31783	31788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475988
563	NC_015676	AAC	2	6	31923	31928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475989
564	NC_015676	TTC	2	6	31954	31959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475989
565	NC_015676	GT	3	6	32020	32025	0 %	50 %	50 %	0 %	336475989
566	NC_015676	ATT	2	6	32183	32188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475989
567	NC_015676	TTC	2	6	32273	32278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475989
568	NC_015676	GGA	2	6	32318	32323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475989
569	NC_015676	AAC	2	6	32333	32338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475989
570	NC_015676	CAC	2	6	32368	32373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475989
571	NC_015676	TCTTGA	2	12	32386	32397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336475989
572	NC_015676	CATA	2	8	32422	32429	50 %	25 %	0 %	25 %	336475989
573	NC_015676	TAT	2	6	32506	32511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475989
574	NC_015676	TGT	2	6	32602	32607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475989
575	NC_015676	TGCG	2	8	32638	32645	0 %	25 %	50 %	25 %	336475989
576	NC_015676	TAC	2	6	32659	32664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475989
577	NC_015676	CTG	2	6	32723	32728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475989
578	NC_015676	CTTT	2	8	32798	32805	0 %	75 %	0 %	25 %	336475989
579	NC_015676	CA	3	6	32807	32812	50 %	0 %	0 %	50 %	336475989
580	NC_015676	GCTGAA	2	12	32831	32842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336475989
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582	NC_015676	TGC	2	6	32872	32877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475989
583	NC_015676	CA	3	6	32964	32969	50 %	0 %	0 %	50 %	336475989
584	NC_015676	TCT	2	6	33058	33063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475989
585	NC_015676	CAT	2	6	33121	33126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475989
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588	NC_015676	TGA	2	6	33213	33218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475989
589	NC_015676	ATC	2	6	33288	33293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475990
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591	NC_015676	CTGG	2	8	33377	33384	0 %	25 %	50 %	25 %	336475990
592	NC_015676	GAT	2	6	33459	33464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475990
593	NC_015676	CTC	2	6	33527	33532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475990
594	NC_015676	GTG	2	6	33538	33543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475990
595	NC_015676	CAG	2	6	33556	33561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475990
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597	NC_015676	GAA	2	6	33679	33684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475990
598	NC_015676	AAGA	2	8	33750	33757	75 %	0 %	25 %	0 %	336475990
599	NC_015676	CTG	2	6	33790	33795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475990
600	NC_015676	TGC	2	6	33808	33813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475990
601	NC_015676	A	6	6	33937	33942	100 %	0 %	0 %	0 %	336475990
602	NC_015676	TGA	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475990
603	NC_015676	TGA	2	6	33999	34004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475990
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606	NC_015676	A	6	6	34212	34217	100 %	0 %	0 %	0 %	336475990
607	NC_015676	TGA	2	6	34236	34241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475990
608	NC_015676	CAA	2	6	34278	34283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475990
609	NC_015676	GGC	2	6	34294	34299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475990
610	NC_015676	TGAT	2	8	34313	34320	25 %	50 %	25 %	0 %	336475990
611	NC_015676	TGG	2	6	34322	34327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475990
612	NC_015676	ATTG	2	8	34345	34352	25 %	50 %	25 %	0 %	336475990
613	NC_015676	T	8	8	34380	34387	0 %	100 %	0 %	0 %	336475991
614	NC_015676	T	6	6	34469	34474	0 %	100 %	0 %	0 %	336475991
615	NC_015676	CT	3	6	34497	34502	0 %	50 %	0 %	50 %	336475991
616	NC_015676	T	6	6	34509	34514	0 %	100 %	0 %	0 %	336475991
617	NC_015676	TCTTT	2	10	34539	34548	0 %	80 %	0 %	20 %	336475991
618	NC_015676	ATAC	2	8	34573	34580	50 %	25 %	0 %	25 %	336475991
619	NC_015676	AT	3	6	34649	34654	50 %	50 %	0 %	0 %	336475991
620	NC_015676	CAG	2	6	34656	34661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475991
621	NC_015676	TAA	2	6	34713	34718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475991
622	NC_015676	CT	3	6	34738	34743	0 %	50 %	0 %	50 %	336475991
623	NC_015676	CTTTC	2	10	34782	34791	0 %	60 %	0 %	40 %	336475991
624	NC_015676	ATG	2	6	34802	34807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475991
625	NC_015676	AAT	2	6	34824	34829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475991
626	NC_015676	CAG	2	6	34843	34848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475991
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884	NC_015676	TAA	2	6	54507	54512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336476004
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