MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_015574	TTC	2	6	1549992	1549997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987630
24502	NC_015574	T	6	6	1550100	1550105	0 %	100 %	0 %	0 %	333987630
24503	NC_015574	TTC	2	6	1550121	1550126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987630
24504	NC_015574	GCATGG	2	12	1550142	1550153	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333987630
24505	NC_015574	T	6	6	1550172	1550177	0 %	100 %	0 %	0 %	333987630
24506	NC_015574	GTA	2	6	1550244	1550249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987630
24507	NC_015574	AAC	2	6	1550478	1550483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987630
24508	NC_015574	CAGG	2	8	1550498	1550505	25 %	0 %	50 %	25 %	333987630
24509	NC_015574	CTT	2	6	1550529	1550534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987630
24510	NC_015574	T	7	7	1550533	1550539	0 %	100 %	0 %	0 %	333987630
24511	NC_015574	GCT	2	6	1550623	1550628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987630
24512	NC_015574	CTT	2	6	1550636	1550641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987630
24513	NC_015574	TTC	2	6	1550754	1550759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987630
24514	NC_015574	GAG	2	6	1551336	1551341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987631
24515	NC_015574	CTT	2	6	1551344	1551349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987631
24516	NC_015574	GTC	2	6	1551360	1551365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987631
24517	NC_015574	ACA	2	6	1551367	1551372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987631
24518	NC_015574	TGT	2	6	1551413	1551418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987631
24519	NC_015574	TTGA	2	8	1551427	1551434	25 %	50 %	25 %	0 %	333987631
24520	NC_015574	AAC	2	6	1551546	1551551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987631
24521	NC_015574	ACA	2	6	1551574	1551579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987631
24522	NC_015574	TCG	2	6	1551610	1551615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987631
24523	NC_015574	GTC	2	6	1551633	1551638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987631
24524	NC_015574	TGC	3	9	1551735	1551743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987631
24525	NC_015574	ATC	2	6	1551769	1551774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987631
24526	NC_015574	CTC	2	6	1551783	1551788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987631
24527	NC_015574	CTA	2	6	1551860	1551865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987631
24528	NC_015574	GT	3	6	1551950	1551955	0 %	50 %	50 %	0 %	333987631
24529	NC_015574	TCG	2	6	1552039	1552044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987631
24530	NC_015574	GT	3	6	1552060	1552065	0 %	50 %	50 %	0 %	333987631
24531	NC_015574	CTG	4	12	1552076	1552087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987631
24532	NC_015574	CTT	2	6	1552097	1552102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987631
24533	NC_015574	CCA	2	6	1552111	1552116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987631
24534	NC_015574	T	8	8	1552154	1552161	0 %	100 %	0 %	0 %	333987631
24535	NC_015574	CCG	2	6	1552162	1552167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333987631
24536	NC_015574	CTT	2	6	1552260	1552265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987631
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24538	NC_015574	CAT	2	6	1552387	1552392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987632
24539	NC_015574	CTT	2	6	1552453	1552458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987632
24540	NC_015574	CAC	2	6	1552600	1552605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987632
24541	NC_015574	TGT	2	6	1552766	1552771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987632
24542	NC_015574	TCA	2	6	1552797	1552802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987632
24543	NC_015574	TAT	2	6	1552868	1552873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987632
24544	NC_015574	AGG	3	9	1552920	1552928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987632
24545	NC_015574	TGT	2	6	1552994	1552999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987632
24546	NC_015574	TCG	2	6	1553088	1553093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987632
24547	NC_015574	GTTG	2	8	1553105	1553112	0 %	50 %	50 %	0 %	333987632
24548	NC_015574	TTC	2	6	1553140	1553145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987632
24549	NC_015574	TGG	3	9	1553171	1553179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987632
24550	NC_015574	TGG	2	6	1553190	1553195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987632
24551	NC_015574	TAT	2	6	1553225	1553230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987632
24552	NC_015574	TGC	2	6	1553249	1553254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987632
24553	NC_015574	GTT	2	6	1553280	1553285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987632
24554	NC_015574	CAA	2	6	1553287	1553292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987632
24555	NC_015574	TC	3	6	1553374	1553379	0 %	50 %	0 %	50 %	333987632
24556	NC_015574	CT	3	6	1553391	1553396	0 %	50 %	0 %	50 %	333987632
24557	NC_015574	ATT	2	6	1553424	1553429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987632
24558	NC_015574	TG	3	6	1553443	1553448	0 %	50 %	50 %	0 %	333987632
24559	NC_015574	CTTAC	2	10	1553505	1553514	20 %	40 %	0 %	40 %	333987632
24560	NC_015574	GTC	2	6	1553537	1553542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987632
24561	NC_015574	TAT	2	6	1553546	1553551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987632
24562	NC_015574	GTGAAT	2	12	1553603	1553614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987632
24563	NC_015574	CGT	2	6	1553650	1553655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987632
24564	NC_015574	CGG	2	6	1553668	1553673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333987632
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24566	NC_015574	TAT	2	6	1553711	1553716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987632
24567	NC_015574	T	6	6	1553749	1553754	0 %	100 %	0 %	0 %	333987633
24568	NC_015574	TAT	2	6	1553800	1553805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987633
24569	NC_015574	CTT	2	6	1553922	1553927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987633
24570	NC_015574	TAA	2	6	1553929	1553934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987633
24571	NC_015574	TGC	2	6	1553980	1553985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987633
24572	NC_015574	TCC	2	6	1554004	1554009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987633
24573	NC_015574	GAT	2	6	1554011	1554016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987633
24574	NC_015574	GGT	3	9	1554099	1554107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987633
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24577	NC_015574	TCT	2	6	1554267	1554272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987633
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24584	NC_015574	ATT	2	6	1554599	1554604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987633
24585	NC_015574	TTC	2	6	1554620	1554625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987633
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24588	NC_015574	T	7	7	1554711	1554717	0 %	100 %	0 %	0 %	333987633
24589	NC_015574	T	6	6	1554780	1554785	0 %	100 %	0 %	0 %	333987633
24590	NC_015574	T	9	9	1554798	1554806	0 %	100 %	0 %	0 %	333987634
24591	NC_015574	T	7	7	1554849	1554855	0 %	100 %	0 %	0 %	333987634
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24595	NC_015574	TAT	2	6	1555116	1555121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987634
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24598	NC_015574	T	6	6	1555215	1555220	0 %	100 %	0 %	0 %	333987634
24599	NC_015574	AT	3	6	1555242	1555247	50 %	50 %	0 %	0 %	333987634
24600	NC_015574	T	6	6	1555255	1555260	0 %	100 %	0 %	0 %	333987634
24601	NC_015574	ACA	2	6	1555264	1555269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987634
24602	NC_015574	ATG	2	6	1555271	1555276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987634
24603	NC_015574	TTC	2	6	1555342	1555347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987634
24604	NC_015574	T	8	8	1555378	1555385	0 %	100 %	0 %	0 %	333987634
24605	NC_015574	TTC	3	9	1555392	1555400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987634
24606	NC_015574	T	6	6	1555409	1555414	0 %	100 %	0 %	0 %	333987634
24607	NC_015574	TAT	2	6	1555470	1555475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987634
24608	NC_015574	ATG	2	6	1555487	1555492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987634
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24610	NC_015574	CTT	2	6	1556549	1556554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987635
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24612	NC_015574	CCA	4	12	1556644	1556655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987635
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24614	NC_015574	T	9	9	1556780	1556788	0 %	100 %	0 %	0 %	333987635
24615	NC_015574	T	8	8	1556793	1556800	0 %	100 %	0 %	0 %	333987635
24616	NC_015574	CAT	2	6	1556816	1556821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987635
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24732	NC_015574	TTG	2	6	1564605	1564610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987646
24733	NC_015574	ACCTGG	2	12	1564618	1564629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333987646
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