MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015574	TGATC	2	10	1078300	1078309	20 %	40 %	20 %	20 %	333987209
17002	NC_015574	TTTC	2	8	1078320	1078327	0 %	75 %	0 %	25 %	333987209
17003	NC_015574	CTAT	2	8	1078347	1078354	25 %	50 %	0 %	25 %	333987209
17004	NC_015574	TCA	2	6	1078378	1078383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987209
17005	NC_015574	A	7	7	1078873	1078879	100 %	0 %	0 %	0 %	333987210
17006	NC_015574	GCA	2	6	1078959	1078964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987210
17007	NC_015574	ATAA	2	8	1079053	1079060	75 %	25 %	0 %	0 %	333987210
17008	NC_015574	AAT	2	6	1079146	1079151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987210
17009	NC_015574	GCAAA	2	10	1079220	1079229	60 %	0 %	20 %	20 %	333987210
17010	NC_015574	AAC	2	6	1079299	1079304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987210
17011	NC_015574	CAG	2	6	1079921	1079926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987211
17012	NC_015574	ACT	2	6	1079949	1079954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987211
17013	NC_015574	CATT	2	8	1080070	1080077	25 %	50 %	0 %	25 %	333987211
17014	NC_015574	AGG	2	6	1080080	1080085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987211
17015	NC_015574	T	6	6	1080116	1080121	0 %	100 %	0 %	0 %	333987211
17016	NC_015574	T	7	7	1080143	1080149	0 %	100 %	0 %	0 %	333987211
17017	NC_015574	AGCTTT	2	12	1080461	1080472	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333987212
17018	NC_015574	CTT	2	6	1080475	1080480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987212
17019	NC_015574	TGC	2	6	1080509	1080514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987212
17020	NC_015574	TGG	2	6	1080557	1080562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987212
17021	NC_015574	TCG	2	6	1080576	1080581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987212
17022	NC_015574	CTT	2	6	1080610	1080615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987212
17023	NC_015574	TTG	2	6	1080655	1080660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987212
17024	NC_015574	GCA	2	6	1080666	1080671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987212
17025	NC_015574	TGT	2	6	1080709	1080714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987212
17026	NC_015574	TAC	2	6	1080860	1080865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987213
17027	NC_015574	CAA	2	6	1080896	1080901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987213
17028	NC_015574	TAA	2	6	1080917	1080922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987213
17029	NC_015574	AATC	2	8	1080926	1080933	50 %	25 %	0 %	25 %	333987213
17030	NC_015574	TTC	2	6	1080936	1080941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987213
17031	NC_015574	TGT	2	6	1080944	1080949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987213
17032	NC_015574	CTT	2	6	1080989	1080994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987213
17033	NC_015574	GAG	2	6	1081039	1081044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987213
17034	NC_015574	TGGGT	2	10	1081150	1081159	0 %	40 %	60 %	0 %	333987213
17035	NC_015574	TCT	2	6	1081186	1081191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987213
17036	NC_015574	TCC	2	6	1081335	1081340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987213
17037	NC_015574	T	6	6	1081371	1081376	0 %	100 %	0 %	0 %	333987213
17038	NC_015574	TG	3	6	1081415	1081420	0 %	50 %	50 %	0 %	333987213
17039	NC_015574	AGGATA	2	12	1081421	1081432	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333987213
17040	NC_015574	GTTCA	2	10	1081443	1081452	20 %	40 %	20 %	20 %	333987213
17041	NC_015574	TG	3	6	1081494	1081499	0 %	50 %	50 %	0 %	333987213
17042	NC_015574	GTT	2	6	1081566	1081571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987213
17043	NC_015574	ATT	2	6	1081579	1081584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987213
17044	NC_015574	TTA	2	6	1081736	1081741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987213
17045	NC_015574	TAT	2	6	1081790	1081795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987213
17046	NC_015574	TCC	2	6	1081806	1081811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987213
17047	NC_015574	GAT	2	6	1081821	1081826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987213
17048	NC_015574	TAT	2	6	1081845	1081850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987213
17049	NC_015574	CCTTC	2	10	1081891	1081900	0 %	40 %	0 %	60 %	333987213
17050	NC_015574	AG	3	6	1081903	1081908	50 %	0 %	50 %	0 %	333987213
17051	NC_015574	CTG	2	6	1081967	1081972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987213
17052	NC_015574	ATT	2	6	1082011	1082016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987213
17053	NC_015574	TGT	2	6	1082180	1082185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987214
17054	NC_015574	ATC	2	6	1082210	1082215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987214
17055	NC_015574	GAA	2	6	1082229	1082234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987214
17056	NC_015574	TGT	2	6	1082236	1082241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987214
17057	NC_015574	T	6	6	1082300	1082305	0 %	100 %	0 %	0 %	333987214
17058	NC_015574	TGT	2	6	1082386	1082391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987214
17059	NC_015574	GT	3	6	1082411	1082416	0 %	50 %	50 %	0 %	333987214
17060	NC_015574	CAT	2	6	1082432	1082437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987214
17061	NC_015574	TCT	2	6	1082448	1082453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987214
17062	NC_015574	CTT	2	6	1082482	1082487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987214
17063	NC_015574	CAA	2	6	1082503	1082508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987214
17064	NC_015574	TAT	2	6	1082531	1082536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987214
17065	NC_015574	TAAT	2	8	1082538	1082545	50 %	50 %	0 %	0 %	333987214
17066	NC_015574	CTT	2	6	1082722	1082727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987214
17067	NC_015574	AGT	2	6	1082755	1082760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987214
17068	NC_015574	GTCGAA	2	12	1082858	1082869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333987214
17069	NC_015574	CTT	2	6	1082878	1082883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987214
17070	NC_015574	ATC	2	6	1082949	1082954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987214
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17072	NC_015574	ATT	2	6	1083027	1083032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987214
17073	NC_015574	TGT	2	6	1083063	1083068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987214
17074	NC_015574	AAG	2	6	1083079	1083084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987214
17075	NC_015574	TGGG	2	8	1083119	1083126	0 %	25 %	75 %	0 %	333987214
17076	NC_015574	CAC	2	6	1083132	1083137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987214
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17083	NC_015574	TTA	2	6	1083489	1083494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987214
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17085	NC_015574	T	6	6	1083527	1083532	0 %	100 %	0 %	0 %	333987214
17086	NC_015574	TCC	2	6	1083542	1083547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987214
17087	NC_015574	ATC	2	6	1083560	1083565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987214
17088	NC_015574	GATT	2	8	1083599	1083606	25 %	50 %	25 %	0 %	333987214
17089	NC_015574	ATG	2	6	1083768	1083773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987215
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17098	NC_015574	AGT	2	6	1084215	1084220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987215
17099	NC_015574	TGCC	2	8	1084249	1084256	0 %	25 %	25 %	50 %	333987215
17100	NC_015574	ATT	2	6	1084337	1084342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987215
17101	NC_015574	CTC	2	6	1084372	1084377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987215
17102	NC_015574	TCC	2	6	1084394	1084399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987215
17103	NC_015574	TAC	2	6	1084421	1084426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987215
17104	NC_015574	T	6	6	1084440	1084445	0 %	100 %	0 %	0 %	333987215
17105	NC_015574	AT	3	6	1084571	1084576	50 %	50 %	0 %	0 %	333987215
17106	NC_015574	T	6	6	1084585	1084590	0 %	100 %	0 %	0 %	333987215
17107	NC_015574	TCC	2	6	1084688	1084693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987215
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17111	NC_015574	TGC	2	6	1084787	1084792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987215
17112	NC_015574	TCC	2	6	1084796	1084801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987215
17113	NC_015574	GTTG	2	8	1084835	1084842	0 %	50 %	50 %	0 %	333987215
17114	NC_015574	CTG	2	6	1084854	1084859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987215
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