MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015574	TAC	2	6	1016734	1016739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987145
16002	NC_015574	TTCAG	2	10	1016775	1016784	20 %	40 %	20 %	20 %	333987145
16003	NC_015574	A	7	7	1016872	1016878	100 %	0 %	0 %	0 %	333987145
16004	NC_015574	AAT	2	6	1016931	1016936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987145
16005	NC_015574	A	6	6	1016946	1016951	100 %	0 %	0 %	0 %	333987145
16006	NC_015574	AGA	2	6	1016963	1016968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987145
16007	NC_015574	GAT	2	6	1017030	1017035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987145
16008	NC_015574	ATT	2	6	1017054	1017059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987145
16009	NC_015574	TAA	2	6	1017235	1017240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987146
16010	NC_015574	A	6	6	1017244	1017249	100 %	0 %	0 %	0 %	333987146
16011	NC_015574	ATTTTT	2	12	1017349	1017360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333987146
16012	NC_015574	AAT	2	6	1017364	1017369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987146
16013	NC_015574	TTC	2	6	1017384	1017389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987146
16014	NC_015574	A	6	6	1017421	1017426	100 %	0 %	0 %	0 %	333987146
16015	NC_015574	TAT	2	6	1017432	1017437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987146
16016	NC_015574	GAT	2	6	1017593	1017598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987146
16017	NC_015574	G	6	6	1017637	1017642	0 %	0 %	100 %	0 %	333987146
16018	NC_015574	ACC	2	6	1017716	1017721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987146
16019	NC_015574	ACA	2	6	1017726	1017731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987146
16020	NC_015574	TGG	3	9	1017771	1017779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987146
16021	NC_015574	CATC	2	8	1017803	1017810	25 %	25 %	0 %	50 %	333987146
16022	NC_015574	TCA	2	6	1017872	1017877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987146
16023	NC_015574	TGGCCA	2	12	1017924	1017935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333987146
16024	NC_015574	ATT	2	6	1017957	1017962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987146
16025	NC_015574	TGCT	2	8	1017976	1017983	0 %	50 %	25 %	25 %	333987146
16026	NC_015574	TAT	2	6	1018017	1018022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987146
16027	NC_015574	A	7	7	1018105	1018111	100 %	0 %	0 %	0 %	333987146
16028	NC_015574	TA	3	6	1018112	1018117	50 %	50 %	0 %	0 %	333987146
16029	NC_015574	A	6	6	1018121	1018126	100 %	0 %	0 %	0 %	333987146
16030	NC_015574	CTT	2	6	1018132	1018137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987146
16031	NC_015574	GCA	2	6	1018139	1018144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987146
16032	NC_015574	TTC	2	6	1018217	1018222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987146
16033	NC_015574	A	6	6	1018271	1018276	100 %	0 %	0 %	0 %	333987146
16034	NC_015574	TC	3	6	1018299	1018304	0 %	50 %	0 %	50 %	333987146
16035	NC_015574	GCA	2	6	1018352	1018357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987146
16036	NC_015574	ATTA	2	8	1018384	1018391	50 %	50 %	0 %	0 %	333987146
16037	NC_015574	GAAA	2	8	1018394	1018401	75 %	0 %	25 %	0 %	333987146
16038	NC_015574	GGT	2	6	1018501	1018506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987146
16039	NC_015574	CAGCTG	2	12	1018515	1018526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333987146
16040	NC_015574	CAG	2	6	1018533	1018538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987146
16041	NC_015574	ACC	2	6	1018568	1018573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987146
16042	NC_015574	AGTG	2	8	1018633	1018640	25 %	25 %	50 %	0 %	333987146
16043	NC_015574	TTG	2	6	1018641	1018646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987146
16044	NC_015574	CAA	2	6	1018665	1018670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987146
16045	NC_015574	TGG	2	6	1018674	1018679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987146
16046	NC_015574	TA	3	6	1018793	1018798	50 %	50 %	0 %	0 %	333987146
16047	NC_015574	ACG	2	6	1018809	1018814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987146
16048	NC_015574	TTC	2	6	1018826	1018831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987146
16049	NC_015574	ATT	2	6	1018855	1018860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987146
16050	NC_015574	A	6	6	1018895	1018900	100 %	0 %	0 %	0 %	333987146
16051	NC_015574	AT	3	6	1018960	1018965	50 %	50 %	0 %	0 %	333987146
16052	NC_015574	TTC	2	6	1018993	1018998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987146
16053	NC_015574	TGA	2	6	1019026	1019031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987146
16054	NC_015574	CTTT	2	8	1019196	1019203	0 %	75 %	0 %	25 %	333987146
16055	NC_015574	ATA	2	6	1019262	1019267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987146
16056	NC_015574	AT	3	6	1019279	1019284	50 %	50 %	0 %	0 %	333987146
16057	NC_015574	ATT	2	6	1019323	1019328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987146
16058	NC_015574	TA	3	6	1019344	1019349	50 %	50 %	0 %	0 %	333987146
16059	NC_015574	TGA	3	9	1019378	1019386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987146
16060	NC_015574	GGA	2	6	1019387	1019392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987147
16061	NC_015574	AACA	2	8	1019404	1019411	75 %	0 %	0 %	25 %	333987147
16062	NC_015574	A	7	7	1019411	1019417	100 %	0 %	0 %	0 %	333987147
16063	NC_015574	TGTT	2	8	1019429	1019436	0 %	75 %	25 %	0 %	333987147
16064	NC_015574	CA	3	6	1019440	1019445	50 %	0 %	0 %	50 %	333987147
16065	NC_015574	CAA	2	6	1019511	1019516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987147
16066	NC_015574	ACC	2	6	1019533	1019538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987147
16067	NC_015574	A	8	8	1019631	1019638	100 %	0 %	0 %	0 %	333987147
16068	NC_015574	GGA	2	6	1019665	1019670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987147
16069	NC_015574	TGT	2	6	1019691	1019696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987147
16070	NC_015574	AGA	2	6	1019731	1019736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987147
16071	NC_015574	GACTGG	2	12	1019761	1019772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333987147
16072	NC_015574	T	6	6	1019872	1019877	0 %	100 %	0 %	0 %	333987147
16073	NC_015574	AGC	2	6	1019926	1019931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987147
16074	NC_015574	A	6	6	1019998	1020003	100 %	0 %	0 %	0 %	333987147
16075	NC_015574	GTT	2	6	1020004	1020009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987147
16076	NC_015574	GAT	2	6	1020088	1020093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987147
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16078	NC_015574	A	6	6	1020127	1020132	100 %	0 %	0 %	0 %	333987147
16079	NC_015574	ATAA	2	8	1020193	1020200	75 %	25 %	0 %	0 %	333987147
16080	NC_015574	GGA	2	6	1020211	1020216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987147
16081	NC_015574	AAC	2	6	1020255	1020260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987147
16082	NC_015574	TAC	2	6	1020262	1020267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987147
16083	NC_015574	TTG	2	6	1020284	1020289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987147
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16085	NC_015574	A	6	6	1020422	1020427	100 %	0 %	0 %	0 %	333987147
16086	NC_015574	GGA	2	6	1020447	1020452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987147
16087	NC_015574	T	7	7	1020730	1020736	0 %	100 %	0 %	0 %	333987148
16088	NC_015574	ATTT	2	8	1020752	1020759	25 %	75 %	0 %	0 %	333987148
16089	NC_015574	TTC	2	6	1020873	1020878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987148
16090	NC_015574	TTCCA	2	10	1020971	1020980	20 %	40 %	0 %	40 %	333987148
16091	NC_015574	AAT	2	6	1020999	1021004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987148
16092	NC_015574	TCA	3	9	1021027	1021035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987148
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16094	NC_015574	CTC	2	6	1021141	1021146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987148
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16096	NC_015574	CAA	2	6	1021204	1021209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987148
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16099	NC_015574	GTT	2	6	1021280	1021285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987148
16100	NC_015574	TGT	2	6	1021339	1021344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987148
16101	NC_015574	T	6	6	1021374	1021379	0 %	100 %	0 %	0 %	333987148
16102	NC_015574	TTC	2	6	1021457	1021462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987148
16103	NC_015574	GTTT	2	8	1021489	1021496	0 %	75 %	25 %	0 %	333987148
16104	NC_015574	TTTG	2	8	1021497	1021504	0 %	75 %	25 %	0 %	333987148
16105	NC_015574	T	6	6	1021558	1021563	0 %	100 %	0 %	0 %	333987148
16106	NC_015574	TCC	2	6	1021656	1021661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987148
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16108	NC_015574	CAT	2	6	1021702	1021707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987148
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16110	NC_015574	TAA	2	6	1021959	1021964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987149
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16113	NC_015574	GGT	2	6	1022055	1022060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987149
16114	NC_015574	T	6	6	1022062	1022067	0 %	100 %	0 %	0 %	333987149
16115	NC_015574	CT	3	6	1022120	1022125	0 %	50 %	0 %	50 %	333987149
16116	NC_015574	TCA	2	6	1022224	1022229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987149
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16118	NC_015574	GCA	2	6	1022272	1022277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987149
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16239	NC_015574	TA	3	6	1028030	1028035	50 %	50 %	0 %	0 %	333987154
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16473	NC_015574	TGA	2	6	1041643	1041648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987174
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