MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015574	GTT	3	9	850013	850021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987005
13502	NC_015574	ACA	2	6	850024	850029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987005
13503	NC_015574	GCT	2	6	850124	850129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987005
13504	NC_015574	AGCA	2	8	850135	850142	50 %	0 %	25 %	25 %	333987005
13505	NC_015574	AGTA	2	8	850144	850151	50 %	25 %	25 %	0 %	333987005
13506	NC_015574	AAT	2	6	850181	850186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987005
13507	NC_015574	AGT	2	6	850231	850236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987005
13508	NC_015574	TAC	2	6	850268	850273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987005
13509	NC_015574	CAGA	2	8	850331	850338	50 %	0 %	25 %	25 %	333987005
13510	NC_015574	GTG	2	6	850349	850354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987005
13511	NC_015574	ACA	2	6	850499	850504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987005
13512	NC_015574	CTACAA	2	12	850575	850586	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333987005
13513	NC_015574	CTACAA	2	12	850596	850607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333987005
13514	NC_015574	CTACAA	2	12	850632	850643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333987005
13515	NC_015574	CAGC	2	8	850722	850729	25 %	0 %	25 %	50 %	333987005
13516	NC_015574	CAG	2	6	850731	850736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987005
13517	NC_015574	CAG	3	9	850803	850811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987005
13518	NC_015574	TCA	2	6	850817	850822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987005
13519	NC_015574	ACAGC	2	10	850836	850845	40 %	0 %	20 %	40 %	333987005
13520	NC_015574	TCA	2	6	850850	850855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987005
13521	NC_015574	ACA	2	6	850923	850928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987005
13522	NC_015574	TGT	2	6	850929	850934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987005
13523	NC_015574	GTT	2	6	850977	850982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987005
13524	NC_015574	T	6	6	851462	851467	0 %	100 %	0 %	0 %	333987006
13525	NC_015574	TCA	2	6	851484	851489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987006
13526	NC_015574	ATT	2	6	851582	851587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987006
13527	NC_015574	AC	3	6	851677	851682	50 %	0 %	0 %	50 %	333987006
13528	NC_015574	AG	3	6	851706	851711	50 %	0 %	50 %	0 %	333987006
13529	NC_015574	TCT	2	6	851714	851719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987006
13530	NC_015574	GAG	2	6	851739	851744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987006
13531	NC_015574	AAC	2	6	851751	851756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987006
13532	NC_015574	GGA	2	6	851786	851791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987006
13533	NC_015574	TAT	2	6	851792	851797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987006
13534	NC_015574	GAA	2	6	851802	851807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987006
13535	NC_015574	ACTT	2	8	851854	851861	25 %	50 %	0 %	25 %	333987006
13536	NC_015574	T	6	6	851880	851885	0 %	100 %	0 %	0 %	333987006
13537	NC_015574	ATTTAT	2	12	851933	851944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987006
13538	NC_015574	A	7	7	852010	852016	100 %	0 %	0 %	0 %	333987006
13539	NC_015574	TAA	2	6	852083	852088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987006
13540	NC_015574	GAT	2	6	852090	852095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987006
13541	NC_015574	CACAG	2	10	852205	852214	40 %	0 %	20 %	40 %	333987006
13542	NC_015574	TCA	2	6	852292	852297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987006
13543	NC_015574	CAA	2	6	852299	852304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987006
13544	NC_015574	GTG	2	6	852351	852356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987006
13545	NC_015574	AAC	2	6	852362	852367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987006
13546	NC_015574	TCT	2	6	852371	852376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333987006
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13548	NC_015574	ATTT	2	8	852479	852486	25 %	75 %	0 %	0 %	333987006
13549	NC_015574	GAAA	2	8	852678	852685	75 %	0 %	25 %	0 %	333987006
13550	NC_015574	TCC	2	6	852728	852733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987006
13551	NC_015574	ATTT	2	8	852735	852742	25 %	75 %	0 %	0 %	333987006
13552	NC_015574	A	6	6	852768	852773	100 %	0 %	0 %	0 %	333987006
13553	NC_015574	TAA	2	6	852796	852801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987006
13554	NC_015574	ATCA	2	8	852803	852810	50 %	25 %	0 %	25 %	333987006
13555	NC_015574	T	6	6	852817	852822	0 %	100 %	0 %	0 %	333987006
13556	NC_015574	AGC	2	6	852833	852838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987006
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13558	NC_015574	TAA	2	6	852927	852932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987007
13559	NC_015574	A	7	7	852952	852958	100 %	0 %	0 %	0 %	333987007
13560	NC_015574	TTA	2	6	852962	852967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987007
13561	NC_015574	AGTA	2	8	852976	852983	50 %	25 %	25 %	0 %	333987007
13562	NC_015574	ATC	2	6	853090	853095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987007
13563	NC_015574	AT	3	6	853105	853110	50 %	50 %	0 %	0 %	333987007
13564	NC_015574	A	6	6	853232	853237	100 %	0 %	0 %	0 %	333987007
13565	NC_015574	GGA	2	6	853279	853284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987007
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13569	NC_015574	AGA	2	6	853476	853481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987007
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13573	NC_015574	GCT	2	6	853702	853707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987007
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13575	NC_015574	ATA	2	6	853801	853806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987007
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13580	NC_015574	TGGG	2	8	854213	854220	0 %	25 %	75 %	0 %	333987008
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13592	NC_015574	TCA	2	6	855168	855173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987009
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13594	NC_015574	GTG	2	6	855239	855244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333987009
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13599	NC_015574	TTG	2	6	855497	855502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987009
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13602	NC_015574	AGA	2	6	855795	855800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987009
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13605	NC_015574	TGA	2	6	855960	855965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987009
13606	NC_015574	CAAC	2	8	855977	855984	50 %	0 %	0 %	50 %	333987009
13607	NC_015574	CATT	2	8	856046	856053	25 %	50 %	0 %	25 %	333987009
13608	NC_015574	GAA	2	6	856075	856080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987009
13609	NC_015574	CCA	2	6	856091	856096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333987009
13610	NC_015574	ATA	2	6	856144	856149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987009
13611	NC_015574	ATG	2	6	856150	856155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333987009
13612	NC_015574	AGGA	2	8	856296	856303	50 %	0 %	50 %	0 %	333987009
13613	NC_015574	AGC	2	6	856376	856381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987009
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13616	NC_015574	TAA	2	6	856545	856550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333987009
13617	NC_015574	AGCT	2	8	856574	856581	25 %	25 %	25 %	25 %	333987009
13618	NC_015574	A	6	6	856615	856620	100 %	0 %	0 %	0 %	333987009
13619	NC_015574	CTA	2	6	856928	856933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987010
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13987	NC_015574	TCA	3	9	889448	889456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333987036
13988	NC_015574	CAA	2	6	889466	889471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987036
13989	NC_015574	AAC	2	6	889482	889487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333987036
13990	NC_015574	GGA	2	6	889492	889497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333987036
13991	NC_015574	TTA	2	6	889556	889561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333987036
13992	NC_015574	GTT	2	6	889696	889701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333987036
13993	NC_015574	CGT	2	6	889724	889729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333987036
13994	NC_015574	TCC	2	6	889855	889860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333987036
13995	NC_015574	T	6	6	889892	889897	0 %	100 %	0 %	0 %	333987036
13996	NC_015574	AAGTA	2	10	890143	890152	60 %	20 %	20 %	0 %	333987037
13997	NC_015574	GAA	2	6	890215	890220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333987037
13998	NC_015574	A	6	6	890254	890259	100 %	0 %	0 %	0 %	333987037
13999	NC_015574	GGAA	3	12	890348	890359	50 %	0 %	50 %	0 %	333987037
14000	NC_015574	CAG	2	6	890415	890420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333987037

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