MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 30316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_015435	GGAA	2	8	1527815	1527822	50 %	0 %	50 %	0 %	330835533
25002	NC_015435	ATG	2	6	1527938	1527943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835533
25003	NC_015435	TTA	2	6	1527949	1527954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835533
25004	NC_015435	TAC	2	6	1528087	1528092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835533
25005	NC_015435	CTT	3	9	1528131	1528139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835533
25006	NC_015435	GTG	2	6	1528148	1528153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835533
25007	NC_015435	ACG	2	6	1528154	1528159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835533
25008	NC_015435	AGTT	2	8	1528274	1528281	25 %	50 %	25 %	0 %	330835533
25009	NC_015435	TAA	2	6	1528295	1528300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835533
25010	NC_015435	GGA	2	6	1528332	1528337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835533
25011	NC_015435	AG	3	6	1528342	1528347	50 %	0 %	50 %	0 %	330835533
25012	NC_015435	GTT	2	6	1528357	1528362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835533
25013	NC_015435	TGA	2	6	1528401	1528406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835533
25014	NC_015435	AGA	2	6	1528458	1528463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835533
25015	NC_015435	GGAGA	2	10	1528464	1528473	40 %	0 %	60 %	0 %	330835533
25016	NC_015435	GA	3	6	1528481	1528486	50 %	0 %	50 %	0 %	330835533
25017	NC_015435	TC	3	6	1528601	1528606	0 %	50 %	0 %	50 %	330835534
25018	NC_015435	TTC	2	6	1528649	1528654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835534
25019	NC_015435	TAT	2	6	1528772	1528777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835534
25020	NC_015435	ATC	2	6	1528829	1528834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835534
25021	NC_015435	GATA	2	8	1528914	1528921	50 %	25 %	25 %	0 %	330835534
25022	NC_015435	ATAA	2	8	1528979	1528986	75 %	25 %	0 %	0 %	330835534
25023	NC_015435	GAG	2	6	1528996	1529001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835534
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25025	NC_015435	CT	3	6	1529154	1529159	0 %	50 %	0 %	50 %	330835534
25026	NC_015435	TCC	2	6	1529312	1529317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835534
25027	NC_015435	GAT	2	6	1529630	1529635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835535
25028	NC_015435	AAG	2	6	1529650	1529655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835535
25029	NC_015435	GCT	2	6	1529728	1529733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835535
25030	NC_015435	GA	3	6	1529753	1529758	50 %	0 %	50 %	0 %	330835535
25031	NC_015435	TTC	2	6	1529792	1529797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835535
25032	NC_015435	TCA	2	6	1529801	1529806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835535
25033	NC_015435	AGTG	2	8	1529881	1529888	25 %	25 %	50 %	0 %	330835535
25034	NC_015435	AG	3	6	1529905	1529910	50 %	0 %	50 %	0 %	330835535
25035	NC_015435	GAAGA	2	10	1529936	1529945	60 %	0 %	40 %	0 %	330835535
25036	NC_015435	TC	3	6	1529948	1529953	0 %	50 %	0 %	50 %	330835535
25037	NC_015435	AGA	2	6	1529985	1529990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835535
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25041	NC_015435	GA	3	6	1530215	1530220	50 %	0 %	50 %	0 %	330835535
25042	NC_015435	AAGGGC	2	12	1530248	1530259	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330835535
25043	NC_015435	AG	3	6	1530273	1530278	50 %	0 %	50 %	0 %	330835535
25044	NC_015435	CGT	2	6	1530280	1530285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835535
25045	NC_015435	AG	3	6	1530362	1530367	50 %	0 %	50 %	0 %	330835535
25046	NC_015435	CAGG	2	8	1530374	1530381	25 %	0 %	50 %	25 %	330835535
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25049	NC_015435	ATCT	2	8	1530707	1530714	25 %	50 %	0 %	25 %	330835535
25050	NC_015435	TGA	2	6	1530874	1530879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835535
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25052	NC_015435	CAA	2	6	1531132	1531137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835536
25053	NC_015435	TCA	2	6	1531140	1531145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835536
25054	NC_015435	TAG	2	6	1531147	1531152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835536
25055	NC_015435	AG	3	6	1531231	1531236	50 %	0 %	50 %	0 %	330835536
25056	NC_015435	TCAC	2	8	1531318	1531325	25 %	25 %	0 %	50 %	330835536
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25058	NC_015435	AAGG	2	8	1531492	1531499	50 %	0 %	50 %	0 %	330835536
25059	NC_015435	AG	3	6	1531513	1531518	50 %	0 %	50 %	0 %	330835536
25060	NC_015435	GAA	2	6	1531675	1531680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835536
25061	NC_015435	GATA	2	8	1531717	1531724	50 %	25 %	25 %	0 %	330835536
25062	NC_015435	TGAAC	2	10	1531738	1531747	40 %	20 %	20 %	20 %	330835536
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25083	NC_015435	TC	3	6	1532792	1532797	0 %	50 %	0 %	50 %	330835537
25084	NC_015435	CTC	3	9	1532795	1532803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835537
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25100	NC_015435	AACG	2	8	1534115	1534122	50 %	0 %	25 %	25 %	330835538
25101	NC_015435	GGA	2	6	1534130	1534135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835538
25102	NC_015435	GGTA	2	8	1534172	1534179	25 %	25 %	50 %	0 %	330835538
25103	NC_015435	GGT	2	6	1534194	1534199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835538
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25105	NC_015435	ATC	2	6	1534285	1534290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835538
25106	NC_015435	A	6	6	1534436	1534441	100 %	0 %	0 %	0 %	330835538
25107	NC_015435	ATA	2	6	1534458	1534463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835538
25108	NC_015435	GGAA	2	8	1534467	1534474	50 %	0 %	50 %	0 %	330835538
25109	NC_015435	TTA	2	6	1534480	1534485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835538
25110	NC_015435	CAG	2	6	1534541	1534546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835538
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25113	NC_015435	CAC	2	6	1534733	1534738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835538
25114	NC_015435	ACT	2	6	1534813	1534818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835538
25115	NC_015435	GA	3	6	1534839	1534844	50 %	0 %	50 %	0 %	330835538
25116	NC_015435	TTA	2	6	1534914	1534919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835538
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25118	NC_015435	GA	3	6	1535087	1535092	50 %	0 %	50 %	0 %	330835538
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25230	NC_015435	GT	3	6	1540601	1540606	0 %	50 %	50 %	0 %	330835543
25231	NC_015435	ATGA	2	8	1540615	1540622	50 %	25 %	25 %	0 %	330835543
25232	NC_015435	TTA	2	6	1540647	1540652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835543
25233	NC_015435	AG	4	8	1540743	1540750	50 %	0 %	50 %	0 %	330835543
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25352	NC_015435	TCC	2	6	1547450	1547455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835548
25353	NC_015435	CCTC	2	8	1547534	1547541	0 %	25 %	0 %	75 %	330835548
25354	NC_015435	TCT	2	6	1547543	1547548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835548
25355	NC_015435	CCT	2	6	1547695	1547700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835548
25356	NC_015435	TAT	2	6	1547730	1547735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835548
25357	NC_015435	GTA	2	6	1547836	1547841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835548
25358	NC_015435	CAA	2	6	1547861	1547866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835548
25359	NC_015435	TC	3	6	1547915	1547920	0 %	50 %	0 %	50 %	330835548
25360	NC_015435	T	6	6	1547950	1547955	0 %	100 %	0 %	0 %	330835548
25361	NC_015435	CTG	2	6	1548066	1548071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835548
25362	NC_015435	CTT	2	6	1548146	1548151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835549
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25367	NC_015435	TCC	2	6	1548551	1548556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835550
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25372	NC_015435	CCCTTC	2	12	1548756	1548767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835550
25373	NC_015435	GGC	2	6	1548881	1548886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835550
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25383	NC_015435	CCT	2	6	1549296	1549301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835550
25384	NC_015435	AG	3	6	1549308	1549313	50 %	0 %	50 %	0 %	330835550
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25391	NC_015435	GCG	2	6	1550313	1550318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835551
25392	NC_015435	GCCGGT	2	12	1550334	1550345	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330835551
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25421	NC_015435	TGG	2	6	1551845	1551850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835553
25422	NC_015435	TAA	2	6	1551900	1551905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835553
25423	NC_015435	ACG	2	6	1551963	1551968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835553
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25425	NC_015435	ATG	2	6	1552010	1552015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835553
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25428	NC_015435	ATG	2	6	1552169	1552174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835553
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25433	NC_015435	TGAC	2	8	1552302	1552309	25 %	25 %	25 %	25 %	330835553
25434	NC_015435	GACG	2	8	1552324	1552331	25 %	0 %	50 %	25 %	330835553
25435	NC_015435	TAA	2	6	1552386	1552391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835553
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25439	NC_015435	GGA	2	6	1552518	1552523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835553
25440	NC_015435	GCTA	2	8	1552549	1552556	25 %	25 %	25 %	25 %	330835553
25441	NC_015435	GAG	2	6	1552604	1552609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835553
25442	NC_015435	CCCTT	2	10	1552735	1552744	0 %	40 %	0 %	60 %	330835554
25443	NC_015435	TCATC	2	10	1552790	1552799	20 %	40 %	0 %	40 %	330835554
25444	NC_015435	CT	3	6	1552893	1552898	0 %	50 %	0 %	50 %	330835554
25445	NC_015435	TAAC	2	8	1552973	1552980	50 %	25 %	0 %	25 %	330835554
25446	NC_015435	TCC	2	6	1553092	1553097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835554
25447	NC_015435	ACT	2	6	1553104	1553109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835554
25448	NC_015435	AGTCT	2	10	1553165	1553174	20 %	40 %	20 %	20 %	330835554
25449	NC_015435	ATCT	2	8	1553208	1553215	25 %	50 %	0 %	25 %	330835554
25450	NC_015435	AG	3	6	1553304	1553309	50 %	0 %	50 %	0 %	330835554
25451	NC_015435	TCC	2	6	1553344	1553349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835554
25452	NC_015435	AAT	2	6	1553622	1553627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835555
25453	NC_015435	TACC	2	8	1553672	1553679	25 %	25 %	0 %	50 %	330835555
25454	NC_015435	G	7	7	1553701	1553707	0 %	0 %	100 %	0 %	330835555
25455	NC_015435	TAC	2	6	1553797	1553802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835555
25456	NC_015435	TAT	2	6	1553886	1553891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835555
25457	NC_015435	AT	3	6	1553896	1553901	50 %	50 %	0 %	0 %	330835555
25458	NC_015435	CTAC	2	8	1553981	1553988	25 %	25 %	0 %	50 %	330835555
25459	NC_015435	CAT	2	6	1553997	1554002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835555
25460	NC_015435	CCT	2	6	1554132	1554137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835556
25461	NC_015435	TCG	2	6	1554188	1554193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835556
25462	NC_015435	TCT	2	6	1554272	1554277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835556
25463	NC_015435	AAG	2	6	1554329	1554334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835556
25464	NC_015435	TCA	2	6	1554404	1554409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835556
25465	NC_015435	AACG	2	8	1554436	1554443	50 %	0 %	25 %	25 %	330835556
25466	NC_015435	TGT	2	6	1554459	1554464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835556
25467	NC_015435	TAGCC	2	10	1554487	1554496	20 %	20 %	20 %	40 %	330835556
25468	NC_015435	GAT	2	6	1554528	1554533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835556
25469	NC_015435	CTA	2	6	1554534	1554539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835556
25470	NC_015435	CTT	2	6	1554580	1554585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835556
25471	NC_015435	CTC	2	6	1554610	1554615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835556
25472	NC_015435	CTAA	2	8	1554638	1554645	50 %	25 %	0 %	25 %	330835556
25473	NC_015435	TCA	2	6	1554651	1554656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835556
25474	NC_015435	TTA	2	6	1554698	1554703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835556
25475	NC_015435	CTC	2	6	1554745	1554750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835556
25476	NC_015435	TCC	2	6	1554851	1554856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835556
25477	NC_015435	TC	3	6	1554982	1554987	0 %	50 %	0 %	50 %	330835556
25478	NC_015435	AG	3	6	1555310	1555315	50 %	0 %	50 %	0 %	330835557
25479	NC_015435	AG	3	6	1555352	1555357	50 %	0 %	50 %	0 %	330835557
25480	NC_015435	TCT	2	6	1555378	1555383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835557
25481	NC_015435	GTTG	2	8	1555392	1555399	0 %	50 %	50 %	0 %	330835557
25482	NC_015435	GA	3	6	1555461	1555466	50 %	0 %	50 %	0 %	330835557
25483	NC_015435	AG	3	6	1555509	1555514	50 %	0 %	50 %	0 %	330835557
25484	NC_015435	AG	3	6	1555549	1555554	50 %	0 %	50 %	0 %	330835558
25485	NC_015435	GAT	2	6	1555601	1555606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835558
25486	NC_015435	GGA	2	6	1555619	1555624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835558
25487	NC_015435	TTC	2	6	1555656	1555661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835558
25488	NC_015435	TAA	2	6	1555975	1555980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835559
25489	NC_015435	CAT	2	6	1555985	1555990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835559
25490	NC_015435	CTA	3	9	1556050	1556058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835559
25491	NC_015435	ACT	2	6	1556061	1556066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835559
25492	NC_015435	ACC	2	6	1556070	1556075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835559
25493	NC_015435	AGCACT	2	12	1556097	1556108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330835559
25494	NC_015435	CA	3	6	1556141	1556146	50 %	0 %	0 %	50 %	330835559
25495	NC_015435	TACC	2	8	1556233	1556240	25 %	25 %	0 %	50 %	330835559
25496	NC_015435	CTA	2	6	1556246	1556251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835559
25497	NC_015435	GGA	2	6	1556255	1556260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835559
25498	NC_015435	GTG	2	6	1556322	1556327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835559
25499	NC_015435	TAC	2	6	1556330	1556335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835559
25500	NC_015435	GTT	2	6	1556445	1556450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835559

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