MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 51287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015416	AGC	2	6	117888	117893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506418
2002	NC_015416	TC	4	8	117905	117912	0 %	50 %	0 %	50 %	330506418
2003	NC_015416	AAT	2	6	117934	117939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506418
2004	NC_015416	AT	3	6	118012	118017	50 %	50 %	0 %	0 %	330506418
2005	NC_015416	TCC	3	9	118025	118033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506418
2006	NC_015416	CAA	2	6	118085	118090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506418
2007	NC_015416	TATGA	2	10	118218	118227	40 %	40 %	20 %	0 %	330506419
2008	NC_015416	TGT	2	6	118255	118260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506419
2009	NC_015416	ATA	2	6	118303	118308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506419
2010	NC_015416	TGC	2	6	118331	118336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506419
2011	NC_015416	CTGA	2	8	118350	118357	25 %	25 %	25 %	25 %	330506419
2012	NC_015416	TCC	2	6	118414	118419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506419
2013	NC_015416	GAT	2	6	118458	118463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506419
2014	NC_015416	GAC	2	6	118479	118484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506419
2015	NC_015416	TC	3	6	118532	118537	0 %	50 %	0 %	50 %	330506419
2016	NC_015416	AG	3	6	118667	118672	50 %	0 %	50 %	0 %	330506419
2017	NC_015416	TGGC	2	8	118738	118745	0 %	25 %	50 %	25 %	330506419
2018	NC_015416	GCA	2	6	118755	118760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506419
2019	NC_015416	GGA	2	6	118811	118816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506419
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2021	NC_015416	TGA	2	6	118889	118894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506419
2022	NC_015416	GCC	2	6	118905	118910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506419
2023	NC_015416	TCGAT	2	10	118921	118930	20 %	40 %	20 %	20 %	330506419
2024	NC_015416	TCA	2	6	118993	118998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506419
2025	NC_015416	CGT	2	6	119114	119119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506419
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2027	NC_015416	GAAT	2	8	119327	119334	50 %	25 %	25 %	0 %	330506420
2028	NC_015416	CAGC	2	8	119358	119365	25 %	0 %	25 %	50 %	330506420
2029	NC_015416	TA	3	6	119385	119390	50 %	50 %	0 %	0 %	330506420
2030	NC_015416	CAT	2	6	119448	119453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506420
2031	NC_015416	TC	3	6	119464	119469	0 %	50 %	0 %	50 %	330506420
2032	NC_015416	CTG	2	6	119488	119493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506420
2033	NC_015416	GAGAG	2	10	119516	119525	40 %	0 %	60 %	0 %	330506420
2034	NC_015416	TCG	2	6	119572	119577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506420
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2036	NC_015416	TC	3	6	119634	119639	0 %	50 %	0 %	50 %	330506420
2037	NC_015416	GAT	2	6	119656	119661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506420
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2039	NC_015416	GAATA	2	10	119752	119761	60 %	20 %	20 %	0 %	330506420
2040	NC_015416	CGA	2	6	119772	119777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506420
2041	NC_015416	GAA	2	6	119794	119799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506420
2042	NC_015416	GTCGG	2	10	119815	119824	0 %	20 %	60 %	20 %	330506420
2043	NC_015416	CAG	2	6	119844	119849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506420
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2045	NC_015416	AGG	2	6	119902	119907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506420
2046	NC_015416	ACTGC	2	10	119924	119933	20 %	20 %	20 %	40 %	330506420
2047	NC_015416	ATCTTC	2	12	119991	120002	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330506420
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2049	NC_015416	GCC	2	6	120111	120116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506421
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2051	NC_015416	AG	3	6	120164	120169	50 %	0 %	50 %	0 %	330506421
2052	NC_015416	TCC	2	6	120172	120177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506421
2053	NC_015416	CAT	2	6	120260	120265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506421
2054	NC_015416	TGC	2	6	120366	120371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506421
2055	NC_015416	CCGG	2	8	120402	120409	0 %	0 %	50 %	50 %	330506421
2056	NC_015416	AGG	2	6	120418	120423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506421
2057	NC_015416	GAC	2	6	120881	120886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506422
2058	NC_015416	TTCA	2	8	120894	120901	25 %	50 %	0 %	25 %	330506422
2059	NC_015416	TGG	2	6	120911	120916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506422
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2061	NC_015416	AGT	2	6	121007	121012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506422
2062	NC_015416	ACCC	2	8	121066	121073	25 %	0 %	0 %	75 %	330506422
2063	NC_015416	AGGG	2	8	121092	121099	25 %	0 %	75 %	0 %	330506422
2064	NC_015416	TGA	2	6	121148	121153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506422
2065	NC_015416	GAT	2	6	121191	121196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506422
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2067	NC_015416	TGA	2	6	121283	121288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506422
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2070	NC_015416	ATT	2	6	121462	121467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506422
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2074	NC_015416	ATA	3	9	121757	121765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506423
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2084	NC_015416	TCGA	2	8	122404	122411	25 %	25 %	25 %	25 %	330506424
2085	NC_015416	GA	4	8	122410	122417	50 %	0 %	50 %	0 %	330506424
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2099	NC_015416	ACA	2	6	124234	124239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506426
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2106	NC_015416	ACCA	2	8	124662	124669	50 %	0 %	0 %	50 %	330506426
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2108	NC_015416	CT	3	6	124748	124753	0 %	50 %	0 %	50 %	330506426
2109	NC_015416	GGC	2	6	124787	124792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506426
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2112	NC_015416	TGA	2	6	124934	124939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506426
2113	NC_015416	CAA	2	6	125063	125068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330506426
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2116	NC_015416	CATG	2	8	125352	125359	25 %	25 %	25 %	25 %	330506427
2117	NC_015416	AT	3	6	125401	125406	50 %	50 %	0 %	0 %	330506427
2118	NC_015416	ACT	2	6	125420	125425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506427
2119	NC_015416	ATG	2	6	125525	125530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506427
2120	NC_015416	C	7	7	125569	125575	0 %	0 %	0 %	100 %	330506427
2121	NC_015416	A	8	8	125601	125608	100 %	0 %	0 %	0 %	330506427
2122	NC_015416	GAC	2	6	125632	125637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506427
2123	NC_015416	GTG	2	6	125644	125649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506427
2124	NC_015416	CAG	2	6	125670	125675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506427
2125	NC_015416	GAAT	2	8	125705	125712	50 %	25 %	25 %	0 %	330506427
2126	NC_015416	GCT	2	6	125717	125722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506427
2127	NC_015416	GAG	2	6	125743	125748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506427
2128	NC_015416	ACTCT	2	10	125775	125784	20 %	40 %	0 %	40 %	330506427
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2131	NC_015416	CTG	2	6	125860	125865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506427
2132	NC_015416	GTG	2	6	125875	125880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506427
2133	NC_015416	TGC	2	6	125979	125984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506427
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2150	NC_015416	GAC	2	6	126485	126490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506428
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2155	NC_015416	TGG	2	6	126849	126854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506428
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2220	NC_015416	GACCC	2	10	131149	131158	20 %	0 %	20 %	60 %	330506434
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2227	NC_015416	T	6	6	131275	131280	0 %	100 %	0 %	0 %	330506434
2228	NC_015416	TTA	2	6	131493	131498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506434
2229	NC_015416	CT	3	6	131527	131532	0 %	50 %	0 %	50 %	330506435
2230	NC_015416	AT	3	6	131543	131548	50 %	50 %	0 %	0 %	330506435
2231	NC_015416	TAT	3	9	131546	131554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506435
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2233	NC_015416	GCTGC	2	10	131589	131598	0 %	20 %	40 %	40 %	330506435
2234	NC_015416	AT	3	6	131683	131688	50 %	50 %	0 %	0 %	330506435
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2236	NC_015416	GACC	2	8	132001	132008	25 %	0 %	25 %	50 %	330506436
2237	NC_015416	CTTCCA	2	12	132010	132021	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330506436
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2239	NC_015416	ATG	2	6	132093	132098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506436
2240	NC_015416	GCAT	2	8	132150	132157	25 %	25 %	25 %	25 %	330506436
2241	NC_015416	CAGC	2	8	132193	132200	25 %	0 %	25 %	50 %	330506436
2242	NC_015416	CTG	2	6	132247	132252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506436
2243	NC_015416	T	6	6	132321	132326	0 %	100 %	0 %	0 %	330506437
2244	NC_015416	TC	3	6	132420	132425	0 %	50 %	0 %	50 %	330506437
2245	NC_015416	CTTC	2	8	132434	132441	0 %	50 %	0 %	50 %	330506437
2246	NC_015416	GCC	2	6	132533	132538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506438
2247	NC_015416	GATCG	2	10	132569	132578	20 %	20 %	40 %	20 %	330506438
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2352	NC_015416	TCGA	2	8	137932	137939	25 %	25 %	25 %	25 %	330506444
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2355	NC_015416	CGAT	2	8	138145	138152	25 %	25 %	25 %	25 %	330506444
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2359	NC_015416	TCCT	2	8	138301	138308	0 %	50 %	0 %	50 %	330506444
2360	NC_015416	CTT	2	6	138327	138332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506444
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2363	NC_015416	TGC	2	6	138437	138442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506444
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2366	NC_015416	TGC	2	6	138509	138514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506444
2367	NC_015416	CCT	2	6	138531	138536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506444
2368	NC_015416	AGC	2	6	138600	138605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506444
2369	NC_015416	TGC	2	6	138608	138613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506444
2370	NC_015416	TTA	2	6	138899	138904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506445
2371	NC_015416	ATCGC	2	10	138906	138915	20 %	20 %	20 %	40 %	330506445
2372	NC_015416	CCT	2	6	139170	139175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506445
2373	NC_015416	CTC	2	6	139199	139204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506445
2374	NC_015416	TGC	2	6	139273	139278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506445
2375	NC_015416	GAA	2	6	139289	139294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506445
2376	NC_015416	ATG	2	6	139322	139327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506445
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2378	NC_015416	TA	3	6	139387	139392	50 %	50 %	0 %	0 %	330506445
2379	NC_015416	TGC	2	6	139490	139495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506445
2380	NC_015416	ATG	2	6	139823	139828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506446
2381	NC_015416	ACC	2	6	139829	139834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330506446
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2383	NC_015416	GGC	2	6	139890	139895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506446
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2386	NC_015416	GCA	2	6	140062	140067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506446
2387	NC_015416	TCT	2	6	140070	140075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506446
2388	NC_015416	TCAG	2	8	140252	140259	25 %	25 %	25 %	25 %	330506446
2389	NC_015416	ATC	2	6	140276	140281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506446
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2392	NC_015416	GAT	2	6	140419	140424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506446
2393	NC_015416	TCCT	2	8	140549	140556	0 %	50 %	0 %	50 %	330506446
2394	NC_015416	GATC	2	8	140696	140703	25 %	25 %	25 %	25 %	330506446
2395	NC_015416	CAT	2	6	141296	141301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506447
2396	NC_015416	GGC	2	6	141302	141307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506447
2397	NC_015416	GAT	2	6	141362	141367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506447
2398	NC_015416	TCA	2	6	141391	141396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506447
2399	NC_015416	ATG	2	6	141400	141405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506447
2400	NC_015416	GAT	2	6	141452	141457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506447
2401	NC_015416	GAG	2	6	141546	141551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330506447
2402	NC_015416	ATCC	2	8	141567	141574	25 %	25 %	0 %	50 %	330506447
2403	NC_015416	GCA	2	6	141585	141590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506447
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2405	NC_015416	TCC	2	6	141625	141630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506447
2406	NC_015416	TCT	2	6	141668	141673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506447
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2409	NC_015416	GGC	2	6	141822	141827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506447
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2425	NC_015416	CGG	3	9	142430	142438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506447
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2432	NC_015416	GGC	2	6	143280	143285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506448
2433	NC_015416	GAT	2	6	143311	143316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506448
2434	NC_015416	GCAGG	2	10	143340	143349	20 %	0 %	60 %	20 %	330506448
2435	NC_015416	GGC	2	6	143374	143379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506448
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2438	NC_015416	ATG	2	6	143519	143524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506448
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2440	NC_015416	TGAA	2	8	143618	143625	50 %	25 %	25 %	0 %	330506448
2441	NC_015416	CTC	2	6	143700	143705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330506448
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2444	NC_015416	GTT	2	6	143931	143936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506448
2445	NC_015416	CAT	2	6	143938	143943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506448
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2451	NC_015416	TTG	2	6	144101	144106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330506448
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2458	NC_015416	ATT	2	6	144520	144525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330506449
2459	NC_015416	GAGAGC	2	12	144560	144571	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	330506449
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2461	NC_015416	TC	3	6	144628	144633	0 %	50 %	0 %	50 %	330506449
2462	NC_015416	TGC	2	6	144819	144824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506450
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2464	NC_015416	CAG	2	6	144903	144908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506450
2465	NC_015416	TCCA	2	8	144986	144993	25 %	25 %	0 %	50 %	330506450
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2469	NC_015416	GGCG	2	8	145166	145173	0 %	0 %	75 %	25 %	330506450
2470	NC_015416	TCA	2	6	145177	145182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506450
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2472	NC_015416	ATG	2	6	145216	145221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506450
2473	NC_015416	TAA	2	6	145246	145251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330506450
2474	NC_015416	GCC	2	6	145296	145301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506450
2475	NC_015416	GCA	3	9	145321	145329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506450
2476	NC_015416	ATCTC	2	10	145345	145354	20 %	40 %	0 %	40 %	330506450
2477	NC_015416	ATG	2	6	145381	145386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506450
2478	NC_015416	TGA	2	6	145409	145414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506450
2479	NC_015416	GGT	2	6	145417	145422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330506450
2480	NC_015416	CCTC	2	8	145429	145436	0 %	25 %	0 %	75 %	330506450
2481	NC_015416	TCG	2	6	145448	145453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506450
2482	NC_015416	CGG	2	6	145505	145510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330506450
2483	NC_015416	TGGA	2	8	145567	145574	25 %	25 %	50 %	0 %	330506450
2484	NC_015416	GCC	3	9	145687	145695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506450
2485	NC_015416	ATC	2	6	145779	145784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506450
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2487	NC_015416	CGT	2	6	145874	145879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330506450
2488	NC_015416	CGC	2	6	145886	145891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506450
2489	NC_015416	GCC	2	6	145945	145950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330506450
2490	NC_015416	CAG	2	6	145963	145968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330506450
2491	NC_015416	TCT	2	6	146030	146035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506450
2492	NC_015416	AGACAG	2	12	146229	146240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330506451
2493	NC_015416	AAG	2	6	146245	146250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330506451
2494	NC_015416	CTT	2	6	146260	146265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330506451
2495	NC_015416	ATC	2	6	146302	146307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506451
2496	NC_015416	GAT	3	9	146313	146321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506451
2497	NC_015416	CTCCGT	2	12	146325	146336	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	330506451
2498	NC_015416	CTTT	2	8	146387	146394	0 %	75 %	0 %	25 %	330506451
2499	NC_015416	TGA	2	6	146421	146426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330506451
2500	NC_015416	ATC	2	6	146429	146434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330506451

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