MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma suis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 19485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015155	A	6	6	6	11	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
2	NC_015155	AGA	2	6	18	23	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
3	NC_015155	AAG	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
4	NC_015155	TAA	2	6	51	56	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972868
5	NC_015155	GAA	2	6	127	132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
6	NC_015155	TA	3	6	236	241	50 %	50 %	0 %	0 %	325972868
7	NC_015155	T	7	7	272	278	0 %	100 %	0 %	0 %	325972868
8	NC_015155	A	7	7	284	290	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
9	NC_015155	T	6	6	306	311	0 %	100 %	0 %	0 %	325972868
10	NC_015155	A	7	7	317	323	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
11	NC_015155	AAG	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
12	NC_015155	AGA	2	6	396	401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
13	NC_015155	A	6	6	407	412	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
14	NC_015155	AT	3	6	425	430	50 %	50 %	0 %	0 %	325972868
15	NC_015155	A	7	7	446	452	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
16	NC_015155	A	7	7	482	488	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
17	NC_015155	ATT	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972868
18	NC_015155	AAT	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972868
19	NC_015155	A	6	6	540	545	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
20	NC_015155	T	6	6	597	602	0 %	100 %	0 %	0 %	325972868
21	NC_015155	TATT	2	8	606	613	25 %	75 %	0 %	0 %	325972868
22	NC_015155	A	6	6	705	710	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
23	NC_015155	GAAAG	2	10	748	757	60 %	0 %	40 %	0 %	325972868
24	NC_015155	AATT	2	8	758	765	50 %	50 %	0 %	0 %	325972868
25	NC_015155	AAT	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972868
26	NC_015155	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972868
27	NC_015155	AAG	2	6	831	836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
28	NC_015155	A	7	7	844	850	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
29	NC_015155	GAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	25 %	0 %	325972868
30	NC_015155	ATT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972868
31	NC_015155	A	6	6	969	974	100 %	0 %	0 %	0 %	325972868
32	NC_015155	AGA	3	9	982	990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972868
33	NC_015155	TA	3	6	1203	1208	50 %	50 %	0 %	0 %	325972869
34	NC_015155	T	6	6	1238	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	325972869
35	NC_015155	T	6	6	1265	1270	0 %	100 %	0 %	0 %	325972869
36	NC_015155	AGA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
37	NC_015155	TTA	2	6	1294	1299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972869
38	NC_015155	A	6	6	1305	1310	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
39	NC_015155	GAA	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
40	NC_015155	T	6	6	1321	1326	0 %	100 %	0 %	0 %	325972869
41	NC_015155	AAT	2	6	1332	1337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
42	NC_015155	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
43	NC_015155	A	6	6	1445	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
44	NC_015155	GAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
45	NC_015155	A	7	7	1470	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
46	NC_015155	TCT	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972869
47	NC_015155	TAA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
48	NC_015155	GAA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
49	NC_015155	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
50	NC_015155	TTTTGA	2	12	1592	1603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325972869
51	NC_015155	TAA	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
52	NC_015155	TTC	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972869
53	NC_015155	A	6	6	1666	1671	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
54	NC_015155	A	8	8	1709	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
55	NC_015155	AGA	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
56	NC_015155	ATC	2	6	1737	1742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972869
57	NC_015155	TTC	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972869
58	NC_015155	AGA	2	6	1793	1798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
59	NC_015155	T	7	7	1805	1811	0 %	100 %	0 %	0 %	325972869
60	NC_015155	A	8	8	1877	1884	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
61	NC_015155	A	6	6	1898	1903	100 %	0 %	0 %	0 %	325972869
62	NC_015155	AATT	2	8	2003	2010	50 %	50 %	0 %	0 %	325972869
63	NC_015155	TAAA	2	8	2017	2024	75 %	25 %	0 %	0 %	325972869
64	NC_015155	AGAA	2	8	2045	2052	75 %	0 %	25 %	0 %	325972869
65	NC_015155	ATA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
66	NC_015155	AGA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
67	NC_015155	ATA	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
68	NC_015155	AAC	2	6	2227	2232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972869
69	NC_015155	ATA	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
70	NC_015155	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972869
71	NC_015155	GAA	3	9	2307	2315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972869
72	NC_015155	TCA	2	6	2462	2467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972870
73	NC_015155	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972870
74	NC_015155	T	6	6	2542	2547	0 %	100 %	0 %	0 %	325972870
75	NC_015155	ATT	2	6	2567	2572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972870
76	NC_015155	T	6	6	2580	2585	0 %	100 %	0 %	0 %	325972870
77	NC_015155	T	6	6	2597	2602	0 %	100 %	0 %	0 %	325972870
78	NC_015155	AAT	3	9	2670	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972870
79	NC_015155	A	6	6	2693	2698	100 %	0 %	0 %	0 %	325972870
80	NC_015155	GAA	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972870
81	NC_015155	TC	3	6	2805	2810	0 %	50 %	0 %	50 %	325972870
82	NC_015155	TTG	2	6	2846	2851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325972870
83	NC_015155	ATT	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972870
84	NC_015155	AAT	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972870
85	NC_015155	T	6	6	2974	2979	0 %	100 %	0 %	0 %	325972870
86	NC_015155	A	6	6	3027	3032	100 %	0 %	0 %	0 %	325972870
87	NC_015155	AGA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972870
88	NC_015155	CAAT	2	8	3064	3071	50 %	25 %	0 %	25 %	325972870
89	NC_015155	ATTC	2	8	3171	3178	25 %	50 %	0 %	25 %	325972870
90	NC_015155	T	6	6	3235	3240	0 %	100 %	0 %	0 %	325972870
91	NC_015155	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972870
92	NC_015155	AGA	2	6	3269	3274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972870
93	NC_015155	AAGA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	325972871
94	NC_015155	AGA	4	12	3326	3337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
95	NC_015155	TCT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
96	NC_015155	AAG	2	6	3400	3405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
97	NC_015155	AGT	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972871
98	NC_015155	TCT	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
99	NC_015155	GAAAT	2	10	3466	3475	60 %	20 %	20 %	0 %	325972871
100	NC_015155	AAGA	2	8	3504	3511	75 %	0 %	25 %	0 %	325972871
101	NC_015155	TCT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
102	NC_015155	GAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
103	NC_015155	CTA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
104	NC_015155	ATGTAA	2	12	3595	3606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325972871
105	NC_015155	AATT	2	8	3613	3620	50 %	50 %	0 %	0 %	325972871
106	NC_015155	TAAA	2	8	3661	3668	75 %	25 %	0 %	0 %	325972871
107	NC_015155	ATT	2	6	3678	3683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972871
108	NC_015155	A	8	8	3746	3753	100 %	0 %	0 %	0 %	325972871
109	NC_015155	TAT	2	6	3785	3790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972871
110	NC_015155	CTT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972871
111	NC_015155	AGA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
112	NC_015155	AAAGAG	2	12	3849	3860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972871
113	NC_015155	ACT	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
114	NC_015155	TAG	2	6	3898	3903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325972871
115	NC_015155	CTA	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
116	NC_015155	TAAGA	2	10	3950	3959	60 %	20 %	20 %	0 %	325972871
117	NC_015155	A	6	6	3991	3996	100 %	0 %	0 %	0 %	325972871
118	NC_015155	ACA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972871
119	NC_015155	ATT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972871
120	NC_015155	AAT	2	6	4092	4097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972871
121	NC_015155	AG	4	8	4109	4116	50 %	0 %	50 %	0 %	325972871
122	NC_015155	ATGG	2	8	4209	4216	25 %	25 %	50 %	0 %	325972871
123	NC_015155	CTA	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
124	NC_015155	A	6	6	4252	4257	100 %	0 %	0 %	0 %	325972871
125	NC_015155	CAT	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325972871
126	NC_015155	GTTT	2	8	4312	4319	0 %	75 %	25 %	0 %	325972871
127	NC_015155	ATAA	2	8	4351	4358	75 %	25 %	0 %	0 %	325972871
128	NC_015155	AAG	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
129	NC_015155	CTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972872
130	NC_015155	A	6	6	4456	4461	100 %	0 %	0 %	0 %	325972872
131	NC_015155	AAC	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325972872
132	NC_015155	ATT	2	6	4502	4507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325972872
133	NC_015155	TAA	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972872
134	NC_015155	AGA	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325972872
135	NC_015155	A	6	6	4609	4614	100 %	0 %	0 %	0 %	325972872
136	NC_015155	TAA	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325972872
137	NC_015155	TCC	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325972872
138	NC_015155	TTTC	2	8	4715	4722	0 %	75 %	0 %	25 %	325972872
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140	NC_015155	TTC	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325972872
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