MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014658	TAAA	2	8	128219	128226	75 %	25 %	0 %	0 %	312136352
3002	NC_014658	ACC	2	6	128229	128234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136352
3003	NC_014658	A	6	6	128338	128343	100 %	0 %	0 %	0 %	312136352
3004	NC_014658	GCA	2	6	128365	128370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136352
3005	NC_014658	AT	4	8	128382	128389	50 %	50 %	0 %	0 %	312136352
3006	NC_014658	GTA	2	6	128446	128451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136352
3007	NC_014658	TTC	2	6	128523	128528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136352
3008	NC_014658	TTTTAA	2	12	128544	128555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136352
3009	NC_014658	TTA	2	6	128575	128580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136352
3010	NC_014658	AAT	2	6	128607	128612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136352
3011	NC_014658	CCT	2	6	128677	128682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136352
3012	NC_014658	AAT	2	6	128770	128775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136352
3013	NC_014658	GTTG	2	8	128790	128797	0 %	50 %	50 %	0 %	312136352
3014	NC_014658	ATA	2	6	128808	128813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136352
3015	NC_014658	T	7	7	128817	128823	0 %	100 %	0 %	0 %	312136352
3016	NC_014658	GAA	2	6	128869	128874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136352
3017	NC_014658	T	6	6	128889	128894	0 %	100 %	0 %	0 %	312136352
3018	NC_014658	T	6	6	128899	128904	0 %	100 %	0 %	0 %	312136352
3019	NC_014658	CAT	2	6	128943	128948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136352
3020	NC_014658	AGC	2	6	128965	128970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136353
3021	NC_014658	TTTCT	2	10	128983	128992	0 %	80 %	0 %	20 %	312136353
3022	NC_014658	CAA	2	6	129000	129005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136353
3023	NC_014658	TTC	2	6	129016	129021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3024	NC_014658	CCA	2	6	129063	129068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136353
3025	NC_014658	CTA	2	6	129075	129080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136353
3026	NC_014658	CCTG	2	8	129095	129102	0 %	25 %	25 %	50 %	312136353
3027	NC_014658	CTT	2	6	129130	129135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3028	NC_014658	T	6	6	129139	129144	0 %	100 %	0 %	0 %	312136353
3029	NC_014658	T	6	6	129152	129157	0 %	100 %	0 %	0 %	312136353
3030	NC_014658	ATT	2	6	129211	129216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136353
3031	NC_014658	ATC	2	6	129292	129297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136353
3032	NC_014658	TGC	2	6	129307	129312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136353
3033	NC_014658	CCA	2	6	129324	129329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136353
3034	NC_014658	TG	3	6	129351	129356	0 %	50 %	50 %	0 %	312136353
3035	NC_014658	T	7	7	129381	129387	0 %	100 %	0 %	0 %	312136353
3036	NC_014658	AGC	2	6	129388	129393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136353
3037	NC_014658	TCA	2	6	129401	129406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136353
3038	NC_014658	TGT	2	6	129438	129443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136353
3039	NC_014658	TCCA	2	8	129528	129535	25 %	25 %	0 %	50 %	312136353
3040	NC_014658	TCT	2	6	129563	129568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3041	NC_014658	CT	3	6	129580	129585	0 %	50 %	0 %	50 %	312136353
3042	NC_014658	TTC	2	6	129673	129678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3043	NC_014658	CTT	2	6	129690	129695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3044	NC_014658	TGTTC	2	10	129746	129755	0 %	60 %	20 %	20 %	312136353
3045	NC_014658	GCA	2	6	129785	129790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136353
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3048	NC_014658	TTTACT	2	12	129821	129832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136353
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3051	NC_014658	CTT	2	6	129891	129896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3052	NC_014658	T	7	7	129928	129934	0 %	100 %	0 %	0 %	312136353
3053	NC_014658	ACT	2	6	129944	129949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136353
3054	NC_014658	TCT	2	6	129950	129955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3055	NC_014658	TAG	2	6	129972	129977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136353
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3057	NC_014658	GCATG	2	10	130031	130040	20 %	20 %	40 %	20 %	312136353
3058	NC_014658	T	6	6	130075	130080	0 %	100 %	0 %	0 %	312136353
3059	NC_014658	TC	3	6	130224	130229	0 %	50 %	0 %	50 %	312136353
3060	NC_014658	T	6	6	130234	130239	0 %	100 %	0 %	0 %	312136353
3061	NC_014658	CTT	2	6	130242	130247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
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3063	NC_014658	TATTT	2	10	130363	130372	20 %	80 %	0 %	0 %	312136353
3064	NC_014658	TTC	2	6	130387	130392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
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3070	NC_014658	T	7	7	130521	130527	0 %	100 %	0 %	0 %	312136353
3071	NC_014658	AAC	2	6	130564	130569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136353
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3073	NC_014658	TAC	2	6	130675	130680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136353
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3081	NC_014658	TCT	2	6	131072	131077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136353
3082	NC_014658	CAG	2	6	131097	131102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136353
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3087	NC_014658	ACT	2	6	131263	131268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136354
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3093	NC_014658	AGC	2	6	131559	131564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136354
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3095	NC_014658	T	7	7	131825	131831	0 %	100 %	0 %	0 %	312136355
3096	NC_014658	T	8	8	131857	131864	0 %	100 %	0 %	0 %	312136355
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3101	NC_014658	T	6	6	131985	131990	0 %	100 %	0 %	0 %	312136355
3102	NC_014658	ATTT	2	8	132040	132047	25 %	75 %	0 %	0 %	312136355
3103	NC_014658	CT	3	6	132060	132065	0 %	50 %	0 %	50 %	312136355
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3106	NC_014658	AT	3	6	132179	132184	50 %	50 %	0 %	0 %	312136355
3107	NC_014658	GTTTT	2	10	132199	132208	0 %	80 %	20 %	0 %	312136355
3108	NC_014658	TCT	2	6	132240	132245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136355
3109	NC_014658	CTT	2	6	132247	132252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136355
3110	NC_014658	GAA	3	9	132309	132317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136355
3111	NC_014658	T	6	6	132357	132362	0 %	100 %	0 %	0 %	312136355
3112	NC_014658	A	6	6	132410	132415	100 %	0 %	0 %	0 %	312136355
3113	NC_014658	TCT	2	6	132430	132435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136355
3114	NC_014658	TGA	2	6	132449	132454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136355
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3119	NC_014658	TA	3	6	132731	132736	50 %	50 %	0 %	0 %	312136356
3120	NC_014658	TAT	2	6	132753	132758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136356
3121	NC_014658	AT	3	6	132778	132783	50 %	50 %	0 %	0 %	312136356
3122	NC_014658	T	6	6	132783	132788	0 %	100 %	0 %	0 %	312136356
3123	NC_014658	GCT	2	6	132808	132813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136356
3124	NC_014658	ATT	2	6	132868	132873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136356
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3153	NC_014658	TA	3	6	134063	134068	50 %	50 %	0 %	0 %	312136357
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3231	NC_014658	T	7	7	136794	136800	0 %	100 %	0 %	0 %	312136359
3232	NC_014658	CCTT	2	8	136801	136808	0 %	50 %	0 %	50 %	312136359
3233	NC_014658	ATC	2	6	136905	136910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136359
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3235	NC_014658	TCT	3	9	137044	137052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136359
3236	NC_014658	TCTA	2	8	137115	137122	25 %	50 %	0 %	25 %	312136359
3237	NC_014658	ACA	2	6	137125	137130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136359
3238	NC_014658	CCTG	2	8	137220	137227	0 %	25 %	25 %	50 %	312136359
3239	NC_014658	ATT	2	6	137422	137427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136359
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3242	NC_014658	A	6	6	137578	137583	100 %	0 %	0 %	0 %	312136360
3243	NC_014658	TAT	2	6	137601	137606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136360
3244	NC_014658	ATT	2	6	137614	137619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136360
3245	NC_014658	GACA	2	8	137648	137655	50 %	0 %	25 %	25 %	312136360
3246	NC_014658	TAT	2	6	137679	137684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136360
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3248	NC_014658	CAA	2	6	137693	137698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136360
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3369	NC_014658	A	7	7	142480	142486	100 %	0 %	0 %	0 %	312136367
3370	NC_014658	TTA	2	6	142537	142542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136367
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3494	NC_014658	TCA	2	6	146889	146894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136375
3495	NC_014658	TAA	2	6	146901	146906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136375
3496	NC_014658	AGA	2	6	146907	146912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136375
3497	NC_014658	TA	3	6	146919	146924	50 %	50 %	0 %	0 %	312136375
3498	NC_014658	AAG	2	6	146986	146991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136375
3499	NC_014658	TGG	2	6	147010	147015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136375
3500	NC_014658	AGG	3	9	147018	147026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136375

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