MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014658	GAA	4	12	560675	560686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136799
14002	NC_014658	A	6	6	560685	560690	100 %	0 %	0 %	0 %	312136799
14003	NC_014658	GTT	2	6	560720	560725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136799
14004	NC_014658	TTGC	2	8	560735	560742	0 %	50 %	25 %	25 %	312136799
14005	NC_014658	A	7	7	560827	560833	100 %	0 %	0 %	0 %	312136800
14006	NC_014658	AAAT	2	8	560847	560854	75 %	25 %	0 %	0 %	312136800
14007	NC_014658	AGC	2	6	560877	560882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136800
14008	NC_014658	GCAGAA	2	12	560893	560904	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312136800
14009	NC_014658	GCT	2	6	560926	560931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136800
14010	NC_014658	AAAAG	2	10	560941	560950	80 %	0 %	20 %	0 %	312136800
14011	NC_014658	AG	4	8	560973	560980	50 %	0 %	50 %	0 %	312136800
14012	NC_014658	AGA	2	6	561036	561041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136800
14013	NC_014658	CATT	2	8	561069	561076	25 %	50 %	0 %	25 %	312136800
14014	NC_014658	ACT	2	6	561117	561122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136800
14015	NC_014658	AAT	2	6	561156	561161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136800
14016	NC_014658	A	7	7	561194	561200	100 %	0 %	0 %	0 %	312136800
14017	NC_014658	A	7	7	561202	561208	100 %	0 %	0 %	0 %	312136800
14018	NC_014658	GTAT	2	8	561211	561218	25 %	50 %	25 %	0 %	312136800
14019	NC_014658	AGAT	2	8	561324	561331	50 %	25 %	25 %	0 %	312136800
14020	NC_014658	TG	3	6	561332	561337	0 %	50 %	50 %	0 %	312136800
14021	NC_014658	GCA	2	6	561370	561375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136800
14022	NC_014658	A	6	6	561382	561387	100 %	0 %	0 %	0 %	312136800
14023	NC_014658	TAAA	2	8	561398	561405	75 %	25 %	0 %	0 %	312136800
14024	NC_014658	AGT	2	6	561604	561609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136800
14025	NC_014658	AGAA	2	8	561642	561649	75 %	0 %	25 %	0 %	312136800
14026	NC_014658	AAT	2	6	561700	561705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136800
14027	NC_014658	TTC	2	6	561735	561740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136800
14028	NC_014658	AGAA	2	8	561744	561751	75 %	0 %	25 %	0 %	312136800
14029	NC_014658	AGA	2	6	561999	562004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136800
14030	NC_014658	GAA	2	6	562036	562041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136800
14031	NC_014658	CA	3	6	562063	562068	50 %	0 %	0 %	50 %	312136800
14032	NC_014658	GTT	2	6	562145	562150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136801
14033	NC_014658	T	6	6	562166	562171	0 %	100 %	0 %	0 %	312136801
14034	NC_014658	AAT	2	6	562226	562231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136801
14035	NC_014658	ATA	2	6	562276	562281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136801
14036	NC_014658	ATT	2	6	562312	562317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136801
14037	NC_014658	AATA	2	8	562402	562409	75 %	25 %	0 %	0 %	312136801
14038	NC_014658	ATG	2	6	562428	562433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136801
14039	NC_014658	ATT	2	6	562463	562468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136801
14040	NC_014658	TAA	2	6	562476	562481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136801
14041	NC_014658	A	6	6	562537	562542	100 %	0 %	0 %	0 %	312136801
14042	NC_014658	CCTG	2	8	562556	562563	0 %	25 %	25 %	50 %	312136801
14043	NC_014658	ACA	2	6	562593	562598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136801
14044	NC_014658	ATTTA	2	10	562621	562630	40 %	60 %	0 %	0 %	312136801
14045	NC_014658	AAC	2	6	562741	562746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136801
14046	NC_014658	TAT	2	6	562761	562766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136801
14047	NC_014658	TAA	2	6	562795	562800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136801
14048	NC_014658	ACA	2	6	562804	562809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136801
14049	NC_014658	ATA	2	6	562810	562815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136801
14050	NC_014658	AT	4	8	562898	562905	50 %	50 %	0 %	0 %	312136801
14051	NC_014658	A	6	6	562916	562921	100 %	0 %	0 %	0 %	312136801
14052	NC_014658	ATA	2	6	562932	562937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136801
14053	NC_014658	AATGA	2	10	562946	562955	60 %	20 %	20 %	0 %	312136801
14054	NC_014658	CCA	2	6	562963	562968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136801
14055	NC_014658	T	6	6	562973	562978	0 %	100 %	0 %	0 %	312136801
14056	NC_014658	CTTT	2	8	562980	562987	0 %	75 %	0 %	25 %	312136801
14057	NC_014658	T	7	7	563049	563055	0 %	100 %	0 %	0 %	312136802
14058	NC_014658	CGA	2	6	563061	563066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136802
14059	NC_014658	ACC	2	6	563084	563089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136802
14060	NC_014658	ATC	2	6	563141	563146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136802
14061	NC_014658	T	6	6	563180	563185	0 %	100 %	0 %	0 %	312136802
14062	NC_014658	TG	3	6	563226	563231	0 %	50 %	50 %	0 %	312136802
14063	NC_014658	T	6	6	563245	563250	0 %	100 %	0 %	0 %	312136802
14064	NC_014658	ATC	2	6	563267	563272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136802
14065	NC_014658	ATT	2	6	563277	563282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136802
14066	NC_014658	CTT	2	6	563290	563295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136802
14067	NC_014658	TAT	2	6	563315	563320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136802
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14071	NC_014658	TAATT	2	10	563587	563596	40 %	60 %	0 %	0 %	312136803
14072	NC_014658	ATC	2	6	563611	563616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136803
14073	NC_014658	A	6	6	563640	563645	100 %	0 %	0 %	0 %	312136803
14074	NC_014658	ATCT	2	8	563700	563707	25 %	50 %	0 %	25 %	312136803
14075	NC_014658	TAAA	2	8	563760	563767	75 %	25 %	0 %	0 %	312136803
14076	NC_014658	ACT	2	6	563805	563810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136803
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14082	NC_014658	TACT	2	8	564032	564039	25 %	50 %	0 %	25 %	312136803
14083	NC_014658	GTA	2	6	564061	564066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136803
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14089	NC_014658	AAG	2	6	564261	564266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136803
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14096	NC_014658	ATA	2	6	564470	564475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136803
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14099	NC_014658	CAAT	2	8	564599	564606	50 %	25 %	0 %	25 %	312136803
14100	NC_014658	T	6	6	564672	564677	0 %	100 %	0 %	0 %	312136804
14101	NC_014658	TTC	2	6	564692	564697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136804
14102	NC_014658	TGTC	2	8	564703	564710	0 %	50 %	25 %	25 %	312136804
14103	NC_014658	CCT	2	6	564711	564716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136804
14104	NC_014658	CAT	2	6	564721	564726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136804
14105	NC_014658	CAA	3	9	564727	564735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136804
14106	NC_014658	CTA	2	6	564751	564756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136804
14107	NC_014658	TTC	2	6	564794	564799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136804
14108	NC_014658	TGT	2	6	564817	564822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136804
14109	NC_014658	TA	3	6	564934	564939	50 %	50 %	0 %	0 %	312136805
14110	NC_014658	TTC	2	6	564977	564982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136805
14111	NC_014658	AG	3	6	564988	564993	50 %	0 %	50 %	0 %	312136805
14112	NC_014658	TAA	2	6	565072	565077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136806
14113	NC_014658	T	6	6	565085	565090	0 %	100 %	0 %	0 %	312136806
14114	NC_014658	CTATC	2	10	565114	565123	20 %	40 %	0 %	40 %	312136806
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14116	NC_014658	AAG	2	6	565166	565171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136806
14117	NC_014658	T	7	7	565220	565226	0 %	100 %	0 %	0 %	312136806
14118	NC_014658	TAA	2	6	565240	565245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136806
14119	NC_014658	TA	4	8	565279	565286	50 %	50 %	0 %	0 %	312136806
14120	NC_014658	TTG	2	6	565297	565302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136806
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14122	NC_014658	AAT	2	6	565390	565395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136806
14123	NC_014658	GAA	2	6	565411	565416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136806
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14147	NC_014658	A	6	6	566661	566666	100 %	0 %	0 %	0 %	312136807
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14203	NC_014658	TACA	2	8	568801	568808	50 %	25 %	0 %	25 %	312136810
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14492	NC_014658	AAT	2	6	578733	578738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136821
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