MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014658	CT	3	6	516664	516669	0 %	50 %	0 %	50 %	312136761
13002	NC_014658	T	6	6	516674	516679	0 %	100 %	0 %	0 %	312136761
13003	NC_014658	ATG	2	6	516711	516716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136761
13004	NC_014658	TAC	2	6	516728	516733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136761
13005	NC_014658	AAC	2	6	516738	516743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136761
13006	NC_014658	TTA	2	6	516745	516750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136761
13007	NC_014658	ATT	2	6	516810	516815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136761
13008	NC_014658	AATA	2	8	516906	516913	75 %	25 %	0 %	0 %	312136761
13009	NC_014658	CCA	2	6	516930	516935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136761
13010	NC_014658	ATT	2	6	516953	516958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136761
13011	NC_014658	CAAGAA	2	12	516970	516981	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312136761
13012	NC_014658	TGC	2	6	517016	517021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136761
13013	NC_014658	AAC	2	6	517022	517027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136761
13014	NC_014658	CCAT	2	8	517045	517052	25 %	25 %	0 %	50 %	312136761
13015	NC_014658	AACAGC	2	12	517073	517084	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312136761
13016	NC_014658	AG	3	6	517096	517101	50 %	0 %	50 %	0 %	312136761
13017	NC_014658	T	6	6	517129	517134	0 %	100 %	0 %	0 %	312136761
13018	NC_014658	AGA	2	6	517164	517169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136761
13019	NC_014658	TTA	3	9	517177	517185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136761
13020	NC_014658	TAT	2	6	517190	517195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136761
13021	NC_014658	T	6	6	517199	517204	0 %	100 %	0 %	0 %	312136761
13022	NC_014658	ATT	2	6	517228	517233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136762
13023	NC_014658	TTC	2	6	517273	517278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136762
13024	NC_014658	TAA	2	6	517314	517319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136762
13025	NC_014658	TCA	2	6	517333	517338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136762
13026	NC_014658	ACA	3	9	517366	517374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136762
13027	NC_014658	TTA	2	6	517489	517494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136762
13028	NC_014658	ATCC	2	8	517508	517515	25 %	25 %	0 %	50 %	312136762
13029	NC_014658	CAT	2	6	517523	517528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136762
13030	NC_014658	ATG	2	6	517690	517695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136762
13031	NC_014658	CTG	2	6	518271	518276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13032	NC_014658	CAAT	2	8	518286	518293	50 %	25 %	0 %	25 %	312136763
13033	NC_014658	ATT	2	6	518306	518311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13034	NC_014658	CTG	2	6	518388	518393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13035	NC_014658	CTG	2	6	518418	518423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13036	NC_014658	CAG	2	6	518427	518432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13037	NC_014658	GCT	2	6	518438	518443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13038	NC_014658	CAC	2	6	518460	518465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136763
13039	NC_014658	TTG	2	6	518508	518513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
13040	NC_014658	GTT	2	6	518597	518602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
13041	NC_014658	GTT	2	6	518630	518635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
13042	NC_014658	GCA	2	6	518663	518668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13043	NC_014658	T	6	6	518669	518674	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13044	NC_014658	TA	4	8	518680	518687	50 %	50 %	0 %	0 %	312136763
13045	NC_014658	GATG	2	8	518843	518850	25 %	25 %	50 %	0 %	312136763
13046	NC_014658	GCT	2	6	518867	518872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13047	NC_014658	GTAA	2	8	518873	518880	50 %	25 %	25 %	0 %	312136763
13048	NC_014658	ATG	2	6	518888	518893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136763
13049	NC_014658	TGT	2	6	518946	518951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
13050	NC_014658	AGGTG	2	10	519005	519014	20 %	20 %	60 %	0 %	312136763
13051	NC_014658	CAA	2	6	519042	519047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
13052	NC_014658	TTA	2	6	519050	519055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13053	NC_014658	CAC	2	6	519069	519074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136763
13054	NC_014658	CCTT	2	8	519080	519087	0 %	50 %	0 %	50 %	312136763
13055	NC_014658	CAT	2	6	519088	519093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13056	NC_014658	TTG	2	6	519148	519153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
13057	NC_014658	ATT	2	6	519161	519166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13058	NC_014658	CTG	2	6	519174	519179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13059	NC_014658	ATA	2	6	519187	519192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
13060	NC_014658	CCA	2	6	519218	519223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136763
13061	NC_014658	CCG	2	6	519251	519256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312136763
13062	NC_014658	ATC	2	6	519271	519276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13063	NC_014658	CTA	2	6	519308	519313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13064	NC_014658	TTC	2	6	519343	519348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13065	NC_014658	AAAT	2	8	519349	519356	75 %	25 %	0 %	0 %	312136763
13066	NC_014658	TA	3	6	519413	519418	50 %	50 %	0 %	0 %	312136763
13067	NC_014658	GGT	2	6	519497	519502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136763
13068	NC_014658	T	6	6	519541	519546	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13069	NC_014658	ATTT	2	8	519606	519613	25 %	75 %	0 %	0 %	312136763
13070	NC_014658	TAT	2	6	519652	519657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13071	NC_014658	TTTA	2	8	519673	519680	25 %	75 %	0 %	0 %	312136763
13072	NC_014658	GCT	2	6	519728	519733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13073	NC_014658	AAG	2	6	519883	519888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136763
13074	NC_014658	GTG	2	6	519897	519902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136763
13075	NC_014658	TCC	2	6	519925	519930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136763
13076	NC_014658	ATG	2	6	519987	519992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136763
13077	NC_014658	CAT	2	6	520002	520007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13078	NC_014658	AC	3	6	520022	520027	50 %	0 %	0 %	50 %	312136763
13079	NC_014658	CTG	2	6	520035	520040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136763
13080	NC_014658	T	6	6	520044	520049	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13081	NC_014658	T	6	6	520056	520061	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13082	NC_014658	TAT	2	6	520128	520133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
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13084	NC_014658	CCA	2	6	520217	520222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136763
13085	NC_014658	TAA	2	6	520270	520275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
13086	NC_014658	ATTT	2	8	520302	520309	25 %	75 %	0 %	0 %	312136763
13087	NC_014658	TTC	2	6	520354	520359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13088	NC_014658	TTA	2	6	520386	520391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13089	NC_014658	ATT	2	6	520405	520410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13090	NC_014658	TAA	2	6	520411	520416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
13091	NC_014658	TTC	2	6	520439	520444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13092	NC_014658	TGT	2	6	520475	520480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136763
13093	NC_014658	ACA	2	6	520509	520514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
13094	NC_014658	GAA	2	6	520517	520522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136763
13095	NC_014658	GCAAT	2	10	520527	520536	40 %	20 %	20 %	20 %	312136763
13096	NC_014658	TTA	2	6	520602	520607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13097	NC_014658	T	6	6	520692	520697	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13098	NC_014658	CAA	2	6	520761	520766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
13099	NC_014658	CTA	2	6	520830	520835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13100	NC_014658	CTT	2	6	520850	520855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13101	NC_014658	TG	3	6	521058	521063	0 %	50 %	50 %	0 %	312136763
13102	NC_014658	AAC	2	6	521071	521076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136763
13103	NC_014658	ATA	2	6	521151	521156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
13104	NC_014658	T	6	6	521186	521191	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13105	NC_014658	CAT	2	6	521271	521276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13106	NC_014658	TTC	2	6	521282	521287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13107	NC_014658	TAT	2	6	521307	521312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13108	NC_014658	TACT	2	8	521313	521320	25 %	50 %	0 %	25 %	312136763
13109	NC_014658	TCAA	2	8	521333	521340	50 %	25 %	0 %	25 %	312136763
13110	NC_014658	TTA	2	6	521358	521363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13111	NC_014658	ATC	2	6	521408	521413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
13112	NC_014658	AT	3	6	521477	521482	50 %	50 %	0 %	0 %	312136763
13113	NC_014658	TTC	2	6	521503	521508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13114	NC_014658	CTT	2	6	521535	521540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13115	NC_014658	T	6	6	521572	521577	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13116	NC_014658	TTC	2	6	521581	521586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136763
13117	NC_014658	T	6	6	521699	521704	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13118	NC_014658	CTAC	2	8	521711	521718	25 %	25 %	0 %	50 %	312136763
13119	NC_014658	TAT	2	6	521755	521760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136763
13120	NC_014658	TGG	2	6	521806	521811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136763
13121	NC_014658	TAA	2	6	521819	521824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136763
13122	NC_014658	T	7	7	521835	521841	0 %	100 %	0 %	0 %	312136763
13123	NC_014658	TA	3	6	521877	521882	50 %	50 %	0 %	0 %	312136763
13124	NC_014658	TCA	2	6	522053	522058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136763
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13126	NC_014658	GAT	2	6	522092	522097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136763
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13229	NC_014658	T	6	6	526198	526203	0 %	100 %	0 %	0 %	312136766
13230	NC_014658	TTCCT	2	10	526269	526278	0 %	60 %	0 %	40 %	312136766
13231	NC_014658	AAT	2	6	526332	526337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136766
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13233	NC_014658	CAT	2	6	526457	526462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136766
13234	NC_014658	CAA	2	6	526490	526495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136766
13235	NC_014658	TTC	2	6	526544	526549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136766
13236	NC_014658	A	7	7	526683	526689	100 %	0 %	0 %	0 %	312136767
13237	NC_014658	AGGA	2	8	526744	526751	50 %	0 %	50 %	0 %	312136767
13238	NC_014658	TGGCA	2	10	526772	526781	20 %	20 %	40 %	20 %	312136767
13239	NC_014658	TA	3	6	526782	526787	50 %	50 %	0 %	0 %	312136767
13240	NC_014658	TTC	2	6	526819	526824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136767
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