MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_014658	TGA	2	6	396662	396667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136638
10003	NC_014658	AT	3	6	396670	396675	50 %	50 %	0 %	0 %	312136638
10004	NC_014658	GTG	2	6	396680	396685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136638
10005	NC_014658	AAGTA	2	10	396726	396735	60 %	20 %	20 %	0 %	312136638
10006	NC_014658	CTC	2	6	396743	396748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136638
10007	NC_014658	AAT	2	6	396805	396810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136639
10008	NC_014658	T	7	7	396843	396849	0 %	100 %	0 %	0 %	312136639
10009	NC_014658	ACTG	2	8	397070	397077	25 %	25 %	25 %	25 %	312136639
10010	NC_014658	T	6	6	397213	397218	0 %	100 %	0 %	0 %	312136639
10011	NC_014658	CTT	2	6	397245	397250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136639
10012	NC_014658	ATT	2	6	397280	397285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136639
10013	NC_014658	CTTC	2	8	397286	397293	0 %	50 %	0 %	50 %	312136639
10014	NC_014658	T	6	6	397474	397479	0 %	100 %	0 %	0 %	312136639
10015	NC_014658	TCT	2	6	397498	397503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136639
10016	NC_014658	GCT	2	6	397541	397546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136639
10017	NC_014658	TTA	2	6	397548	397553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136639
10018	NC_014658	ACC	2	6	397555	397560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136639
10019	NC_014658	T	6	6	397591	397596	0 %	100 %	0 %	0 %	312136639
10020	NC_014658	TTA	2	6	397620	397625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136639
10021	NC_014658	TCA	2	6	397628	397633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136639
10022	NC_014658	CTC	2	6	397638	397643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136639
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10024	NC_014658	CTT	2	6	397677	397682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136639
10025	NC_014658	T	7	7	397702	397708	0 %	100 %	0 %	0 %	312136639
10026	NC_014658	CATATC	2	12	397752	397763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136639
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10032	NC_014658	TCA	2	6	397967	397972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136639
10033	NC_014658	T	7	7	398125	398131	0 %	100 %	0 %	0 %	312136639
10034	NC_014658	ATT	2	6	398140	398145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136639
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10036	NC_014658	GCA	2	6	398213	398218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136639
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10041	NC_014658	GCTCTT	2	12	398315	398326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312136639
10042	NC_014658	T	6	6	398348	398353	0 %	100 %	0 %	0 %	312136639
10043	NC_014658	CAG	2	6	398361	398366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136639
10044	NC_014658	TCT	2	6	398423	398428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136639
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10047	NC_014658	CTT	3	9	398550	398558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136639
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10053	NC_014658	AAGCTG	2	12	398951	398962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312136640
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10056	NC_014658	TGA	2	6	399069	399074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136640
10057	NC_014658	A	8	8	399080	399087	100 %	0 %	0 %	0 %	312136640
10058	NC_014658	GAAA	2	8	399092	399099	75 %	0 %	25 %	0 %	312136640
10059	NC_014658	ATA	4	12	399151	399162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136640
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10061	NC_014658	ATAG	2	8	399265	399272	50 %	25 %	25 %	0 %	312136640
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10085	NC_014658	AAAG	2	8	400143	400150	75 %	0 %	25 %	0 %	312136640
10086	NC_014658	ACAA	2	8	400159	400166	75 %	0 %	0 %	25 %	312136640
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10093	NC_014658	A	6	6	400428	400433	100 %	0 %	0 %	0 %	312136641
10094	NC_014658	GAA	2	6	400446	400451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136641
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10099	NC_014658	GGAAA	2	10	400669	400678	60 %	0 %	40 %	0 %	312136641
10100	NC_014658	T	6	6	400788	400793	0 %	100 %	0 %	0 %	312136641
10101	NC_014658	TTC	2	6	400796	400801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136641
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10104	NC_014658	ATA	2	6	400955	400960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136642
10105	NC_014658	A	6	6	401135	401140	100 %	0 %	0 %	0 %	312136642
10106	NC_014658	A	7	7	401272	401278	100 %	0 %	0 %	0 %	312136642
10107	NC_014658	GAT	2	6	401306	401311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136642
10108	NC_014658	A	8	8	401343	401350	100 %	0 %	0 %	0 %	312136642
10109	NC_014658	TAG	2	6	401376	401381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136642
10110	NC_014658	GATG	2	8	401393	401400	25 %	25 %	50 %	0 %	312136642
10111	NC_014658	GAA	2	6	401414	401419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136642
10112	NC_014658	A	6	6	401444	401449	100 %	0 %	0 %	0 %	312136642
10113	NC_014658	TTC	2	6	401500	401505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136642
10114	NC_014658	TAC	2	6	401509	401514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136642
10115	NC_014658	GAT	2	6	401527	401532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136642
10116	NC_014658	ATA	2	6	401564	401569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136642
10117	NC_014658	TCTG	2	8	401642	401649	0 %	50 %	25 %	25 %	312136642
10118	NC_014658	AT	3	6	401657	401662	50 %	50 %	0 %	0 %	312136642
10119	NC_014658	GAA	2	6	401731	401736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136642
10120	NC_014658	CCT	2	6	401771	401776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136642
10121	NC_014658	TA	3	6	401781	401786	50 %	50 %	0 %	0 %	312136642
10122	NC_014658	TTC	2	6	401789	401794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136642
10123	NC_014658	CTG	2	6	401847	401852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136642
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10125	NC_014658	GACA	2	8	401925	401932	50 %	0 %	25 %	25 %	312136642
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10132	NC_014658	A	7	7	402139	402145	100 %	0 %	0 %	0 %	312136642
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10230	NC_014658	TTTG	2	8	405793	405800	0 %	75 %	25 %	0 %	312136645
10231	NC_014658	AATATC	2	12	405849	405860	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312136645
10232	NC_014658	CAT	2	6	405926	405931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136645
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10234	NC_014658	T	6	6	405999	406004	0 %	100 %	0 %	0 %	312136645
10235	NC_014658	TAC	2	6	406083	406088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136645
10236	NC_014658	TCAA	2	8	406156	406163	50 %	25 %	0 %	25 %	312136645
10237	NC_014658	TCC	2	6	406206	406211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136645
10238	NC_014658	T	8	8	406297	406304	0 %	100 %	0 %	0 %	312136645
10239	NC_014658	AC	3	6	406327	406332	50 %	0 %	0 %	50 %	312136645
10240	NC_014658	TCA	2	6	406355	406360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136645
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10242	NC_014658	GTT	2	6	406432	406437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136645
10243	NC_014658	CAT	2	6	406443	406448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136645
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