MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 30373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014658	CTT	2	6	19253	19258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136251
502	NC_014658	CT	3	6	19274	19279	0 %	50 %	0 %	50 %	312136251
503	NC_014658	ATTT	2	8	19289	19296	25 %	75 %	0 %	0 %	312136251
504	NC_014658	T	7	7	19319	19325	0 %	100 %	0 %	0 %	312136251
505	NC_014658	GTT	2	6	19360	19365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136251
506	NC_014658	CCG	2	6	19375	19380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312136251
507	NC_014658	TC	3	6	19402	19407	0 %	50 %	0 %	50 %	312136251
508	NC_014658	GAA	2	6	19582	19587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136252
509	NC_014658	A	6	6	19625	19630	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
510	NC_014658	A	6	6	19663	19668	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
511	NC_014658	A	7	7	19672	19678	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
512	NC_014658	TTTC	2	8	19679	19686	0 %	75 %	0 %	25 %	312136252
513	NC_014658	A	7	7	19711	19717	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
514	NC_014658	TA	3	6	19741	19746	50 %	50 %	0 %	0 %	312136252
515	NC_014658	TGA	2	6	19747	19752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136252
516	NC_014658	A	6	6	19752	19757	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
517	NC_014658	CAA	2	6	19807	19812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136252
518	NC_014658	A	6	6	19835	19840	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
519	NC_014658	GATA	2	8	19855	19862	50 %	25 %	25 %	0 %	312136252
520	NC_014658	TCA	2	6	19892	19897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136252
521	NC_014658	GAAG	2	8	19928	19935	50 %	0 %	50 %	0 %	312136252
522	NC_014658	A	6	6	19939	19944	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
523	NC_014658	GTT	3	9	19952	19960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136252
524	NC_014658	CAA	2	6	19989	19994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136252
525	NC_014658	A	6	6	19993	19998	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
526	NC_014658	AGA	2	6	20086	20091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136252
527	NC_014658	A	6	6	20119	20124	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
528	NC_014658	GTG	2	6	20215	20220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136252
529	NC_014658	AT	3	6	20225	20230	50 %	50 %	0 %	0 %	312136252
530	NC_014658	GA	3	6	20235	20240	50 %	0 %	50 %	0 %	312136252
531	NC_014658	TCC	2	6	20275	20280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136252
532	NC_014658	A	7	7	20290	20296	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
533	NC_014658	AAG	2	6	20310	20315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136252
534	NC_014658	AAT	2	6	20323	20328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136252
535	NC_014658	A	6	6	20347	20352	100 %	0 %	0 %	0 %	312136252
536	NC_014658	AAG	2	6	20364	20369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136252
537	NC_014658	TATC	2	8	20381	20388	25 %	50 %	0 %	25 %	312136252
538	NC_014658	ATT	3	9	20463	20471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136252
539	NC_014658	ATC	2	6	20473	20478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136252
540	NC_014658	TAA	2	6	20581	20586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136253
541	NC_014658	T	6	6	20624	20629	0 %	100 %	0 %	0 %	312136253
542	NC_014658	TCC	3	9	20640	20648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136253
543	NC_014658	A	6	6	20679	20684	100 %	0 %	0 %	0 %	312136253
544	NC_014658	AAATA	2	10	20691	20700	80 %	20 %	0 %	0 %	312136253
545	NC_014658	ACT	2	6	20725	20730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136253
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547	NC_014658	A	6	6	20989	20994	100 %	0 %	0 %	0 %	312136254
548	NC_014658	AT	3	6	21063	21068	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
549	NC_014658	AGA	2	6	21091	21096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136254
550	NC_014658	ATT	2	6	21113	21118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136254
551	NC_014658	ATT	2	6	21201	21206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136254
552	NC_014658	AGC	2	6	21230	21235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136254
553	NC_014658	TTA	2	6	21279	21284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136254
554	NC_014658	ATTT	2	8	21339	21346	25 %	75 %	0 %	0 %	312136254
555	NC_014658	AGGAG	2	10	21358	21367	40 %	0 %	60 %	0 %	312136254
556	NC_014658	TAAA	2	8	21372	21379	75 %	25 %	0 %	0 %	312136254
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558	NC_014658	TA	4	8	21450	21457	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
559	NC_014658	GAG	2	6	21472	21477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136254
560	NC_014658	A	6	6	21487	21492	100 %	0 %	0 %	0 %	312136254
561	NC_014658	CTAT	2	8	21513	21520	25 %	50 %	0 %	25 %	312136254
562	NC_014658	AGA	2	6	21545	21550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136254
563	NC_014658	TA	5	10	21632	21641	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
564	NC_014658	CTT	2	6	21657	21662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136254
565	NC_014658	ATTA	2	8	21670	21677	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
566	NC_014658	GA	3	6	21686	21691	50 %	0 %	50 %	0 %	312136254
567	NC_014658	ATT	2	6	21747	21752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136254
568	NC_014658	GAAA	2	8	21785	21792	75 %	0 %	25 %	0 %	312136254
569	NC_014658	T	6	6	21838	21843	0 %	100 %	0 %	0 %	312136254
570	NC_014658	TAAA	2	8	21921	21928	75 %	25 %	0 %	0 %	312136254
571	NC_014658	TAAAAA	2	12	21984	21995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136254
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576	NC_014658	A	7	7	22163	22169	100 %	0 %	0 %	0 %	312136254
577	NC_014658	A	8	8	22181	22188	100 %	0 %	0 %	0 %	312136254
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582	NC_014658	GA	3	6	22384	22389	50 %	0 %	50 %	0 %	312136254
583	NC_014658	ATTTT	2	10	22392	22401	20 %	80 %	0 %	0 %	312136254
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589	NC_014658	AAAGT	2	10	22501	22510	60 %	20 %	20 %	0 %	312136254
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594	NC_014658	A	7	7	22704	22710	100 %	0 %	0 %	0 %	312136255
595	NC_014658	AAAAT	2	10	22712	22721	80 %	20 %	0 %	0 %	312136255
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598	NC_014658	CT	3	6	22769	22774	0 %	50 %	0 %	50 %	312136255
599	NC_014658	TTG	2	6	22793	22798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136255
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603	NC_014658	ATA	2	6	22949	22954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136255
604	NC_014658	GAT	2	6	23011	23016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136255
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606	NC_014658	ATA	2	6	23086	23091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136255
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612	NC_014658	TGT	2	6	23313	23318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136255
613	NC_014658	TGG	2	6	23324	23329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136255
614	NC_014658	GA	3	6	23346	23351	50 %	0 %	50 %	0 %	312136255
615	NC_014658	A	6	6	23392	23397	100 %	0 %	0 %	0 %	312136255
616	NC_014658	A	6	6	23451	23456	100 %	0 %	0 %	0 %	312136255
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621	NC_014658	T	6	6	29180	29185	0 %	100 %	0 %	0 %	312136256
622	NC_014658	ATT	2	6	29198	29203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136256
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629	NC_014658	TAA	2	6	29392	29397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136256
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631	NC_014658	TA	3	6	29418	29423	50 %	50 %	0 %	0 %	312136256
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633	NC_014658	ATT	2	6	29567	29572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136256
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