MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter marburgensis str. Marburg plasmid pMTBMA4

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014409	AAG	2	6	116	121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304315533
2	NC_014409	TAG	2	6	180	185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
3	NC_014409	TCA	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315533
4	NC_014409	CA	3	6	248	253	50 %	0 %	0 %	50 %	304315533
5	NC_014409	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
6	NC_014409	GAT	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
7	NC_014409	TCC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
8	NC_014409	ATG	2	6	381	386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
9	NC_014409	TCC	2	6	429	434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
10	NC_014409	AGGTG	2	10	439	448	20 %	20 %	60 %	0 %	304315533
11	NC_014409	AGG	2	6	457	462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
12	NC_014409	ATG	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
13	NC_014409	TGA	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
14	NC_014409	TAT	2	6	621	626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315533
15	NC_014409	CCA	2	6	664	669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315533
16	NC_014409	AG	3	6	736	741	50 %	0 %	50 %	0 %	304315533
17	NC_014409	TCC	2	6	804	809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
18	NC_014409	TGA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
19	NC_014409	ATG	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
20	NC_014409	TCC	2	6	894	899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
21	NC_014409	ACACC	2	10	910	919	40 %	0 %	0 %	60 %	304315533
22	NC_014409	AGG	2	6	930	935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
23	NC_014409	GGA	2	6	1039	1044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
24	NC_014409	CAG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304315533
25	NC_014409	AGG	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
26	NC_014409	GATG	2	8	1105	1112	25 %	25 %	50 %	0 %	304315533
27	NC_014409	TCA	2	6	1140	1145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315533
28	NC_014409	AGG	3	9	1292	1300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
29	NC_014409	ATC	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315533
30	NC_014409	TGA	2	6	1459	1464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
31	NC_014409	TA	3	6	1467	1472	50 %	50 %	0 %	0 %	304315533
32	NC_014409	GAT	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
33	NC_014409	CAA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315533
34	NC_014409	TTG	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315533
35	NC_014409	A	7	7	1820	1826	100 %	0 %	0 %	0 %	304315533
36	NC_014409	ATA	3	9	1905	1913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315533
37	NC_014409	TGT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315533
38	NC_014409	CCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
39	NC_014409	TA	3	6	2019	2024	50 %	50 %	0 %	0 %	304315533
40	NC_014409	TCC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
41	NC_014409	A	7	7	2190	2196	100 %	0 %	0 %	0 %	304315533
42	NC_014409	TTA	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304315533
43	NC_014409	GTGG	2	8	2210	2217	0 %	25 %	75 %	0 %	304315533
44	NC_014409	TGA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
45	NC_014409	GAT	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315533
46	NC_014409	AC	3	6	2301	2306	50 %	0 %	0 %	50 %	304315533
47	NC_014409	GAG	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
48	NC_014409	AGG	2	6	2324	2329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315533
49	NC_014409	CTC	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315533
50	NC_014409	CGG	2	6	2483	2488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304315533
51	NC_014409	G	7	7	2506	2512	0 %	0 %	100 %	0 %	304315533
52	NC_014409	GGGA	2	8	2609	2616	25 %	0 %	75 %	0 %	304315534
53	NC_014409	CCA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315534
54	NC_014409	GAT	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304315534
55	NC_014409	GAG	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315534
56	NC_014409	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315534
57	NC_014409	GAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315534
58	NC_014409	AGG	2	6	2852	2857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304315534
59	NC_014409	TGG	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304315534
60	NC_014409	TTG	2	6	2941	2946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315535
61	NC_014409	CAA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315535
62	NC_014409	TCA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315535
63	NC_014409	TCA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315535
64	NC_014409	TTC	2	6	3156	3161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304315535
65	NC_014409	ATC	2	6	3186	3191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304315535
66	NC_014409	TCC	2	6	3216	3221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	304315535
67	NC_014409	TAA	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304315535
68	NC_014409	ACC	3	9	3258	3266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315535
69	NC_014409	A	7	7	3275	3281	100 %	0 %	0 %	0 %	304315535
70	NC_014409	A	7	7	3285	3291	100 %	0 %	0 %	0 %	304315535
71	NC_014409	A	7	7	3295	3301	100 %	0 %	0 %	0 %	304315535
72	NC_014409	A	7	7	3363	3369	100 %	0 %	0 %	0 %	304315535
73	NC_014409	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304315536
74	NC_014409	GTT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304315536
75	NC_014409	CCA	2	6	4077	4082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	304315536
76	NC_014409	AC	3	6	4113	4118	50 %	0 %	0 %	50 %	304315536
77	NC_014409	GT	3	6	4357	4362	0 %	50 %	50 %	0 %	304315536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.