MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 58234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014212	C	7	7	169023	169029	0 %	0 %	0 %	100 %	297564645
3002	NC_014212	AAC	2	6	169091	169096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564645
3003	NC_014212	CCG	2	6	169170	169175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564645
3004	NC_014212	CAT	2	6	169297	169302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564645
3005	NC_014212	GACC	2	8	169306	169313	25 %	0 %	25 %	50 %	297564645
3006	NC_014212	GCC	2	6	169468	169473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564645
3007	NC_014212	AAG	2	6	169499	169504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564645
3008	NC_014212	G	6	6	169560	169565	0 %	0 %	100 %	0 %	297564645
3009	NC_014212	CGG	2	6	169650	169655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564645
3010	NC_014212	CTG	2	6	169656	169661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564645
3011	NC_014212	GCC	2	6	169763	169768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564645
3012	NC_014212	GATCA	2	10	169861	169870	40 %	20 %	20 %	20 %	297564646
3013	NC_014212	TTG	2	6	169900	169905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564646
3014	NC_014212	GCGG	2	8	169942	169949	0 %	0 %	75 %	25 %	297564646
3015	NC_014212	TGGG	2	8	169952	169959	0 %	25 %	75 %	0 %	297564646
3016	NC_014212	TGG	2	6	169982	169987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564646
3017	NC_014212	GCCC	2	8	170056	170063	0 %	0 %	25 %	75 %	297564646
3018	NC_014212	CGG	2	6	170072	170077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564646
3019	NC_014212	GCCT	2	8	170121	170128	0 %	25 %	25 %	50 %	297564646
3020	NC_014212	TGG	2	6	170144	170149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564646
3021	NC_014212	CGGT	2	8	170200	170207	0 %	25 %	50 %	25 %	297564646
3022	NC_014212	C	6	6	170258	170263	0 %	0 %	0 %	100 %	297564646
3023	NC_014212	GCG	2	6	170267	170272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564646
3024	NC_014212	ATC	2	6	170275	170280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564646
3025	NC_014212	CAG	2	6	170283	170288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564646
3026	NC_014212	T	7	7	170329	170335	0 %	100 %	0 %	0 %	297564646
3027	NC_014212	GAA	2	6	170358	170363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564646
3028	NC_014212	GTAGGT	2	12	170448	170459	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	297564646
3029	NC_014212	TCG	2	6	170500	170505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564646
3030	NC_014212	AGG	2	6	170506	170511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564646
3031	NC_014212	G	6	6	170525	170530	0 %	0 %	100 %	0 %	297564646
3032	NC_014212	CAC	2	6	170565	170570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564646
3033	NC_014212	C	6	6	170578	170583	0 %	0 %	0 %	100 %	297564646
3034	NC_014212	GGC	2	6	170616	170621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564646
3035	NC_014212	TGG	2	6	170638	170643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564646
3036	NC_014212	CAGC	2	8	170651	170658	25 %	0 %	25 %	50 %	297564646
3037	NC_014212	GTA	2	6	170712	170717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564646
3038	NC_014212	CTC	2	6	170730	170735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564646
3039	NC_014212	CAC	2	6	170739	170744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564646
3040	NC_014212	CAG	2	6	170805	170810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564646
3041	NC_014212	AG	3	6	170826	170831	50 %	0 %	50 %	0 %	297564646
3042	NC_014212	GGC	2	6	170888	170893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564646
3043	NC_014212	CTT	2	6	170934	170939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564646
3044	NC_014212	CAG	2	6	170943	170948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564646
3045	NC_014212	GCC	2	6	170964	170969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564646
3046	NC_014212	CCT	2	6	170977	170982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564646
3047	NC_014212	TCACC	2	10	171193	171202	20 %	20 %	0 %	60 %	297564647
3048	NC_014212	CG	3	6	171221	171226	0 %	0 %	50 %	50 %	297564647
3049	NC_014212	CAC	2	6	171387	171392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564648
3050	NC_014212	CGA	2	6	171398	171403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564648
3051	NC_014212	GTC	2	6	171414	171419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564648
3052	NC_014212	TGC	3	9	171660	171668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564648
3053	NC_014212	CGA	2	6	171719	171724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564648
3054	NC_014212	CAC	2	6	172042	172047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564649
3055	NC_014212	TCG	2	6	172084	172089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564649
3056	NC_014212	GGA	2	6	172117	172122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564649
3057	NC_014212	GAG	2	6	172175	172180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564649
3058	NC_014212	GCG	2	6	172210	172215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564649
3059	NC_014212	CCA	2	6	172216	172221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564649
3060	NC_014212	GGA	2	6	172222	172227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564649
3061	NC_014212	TAC	2	6	172250	172255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564649
3062	NC_014212	GTG	2	6	172256	172261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564649
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3064	NC_014212	AAG	2	6	172299	172304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564649
3065	NC_014212	AAG	2	6	172418	172423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564649
3066	NC_014212	CTG	2	6	172490	172495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564649
3067	NC_014212	AAG	2	6	172500	172505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564649
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3069	NC_014212	CAT	2	6	172740	172745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564650
3070	NC_014212	CAG	2	6	172747	172752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564650
3071	NC_014212	TGG	2	6	172853	172858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564650
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3073	NC_014212	CCA	2	6	172934	172939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564650
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3083	NC_014212	GCGGG	2	10	173328	173337	0 %	0 %	80 %	20 %	297564650
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3090	NC_014212	T	6	6	173776	173781	0 %	100 %	0 %	0 %	297564651
3091	NC_014212	TTGC	2	8	174046	174053	0 %	50 %	25 %	25 %	297564651
3092	NC_014212	TCT	2	6	174065	174070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564651
3093	NC_014212	A	6	6	174256	174261	100 %	0 %	0 %	0 %	297564651
3094	NC_014212	GGA	2	6	174348	174353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564651
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3097	NC_014212	GA	3	6	174658	174663	50 %	0 %	50 %	0 %	297564652
3098	NC_014212	ACC	2	6	174826	174831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564652
3099	NC_014212	AAAAG	2	10	174848	174857	80 %	0 %	20 %	0 %	297564652
3100	NC_014212	CTGG	2	8	174861	174868	0 %	25 %	50 %	25 %	297564652
3101	NC_014212	CGC	2	6	174885	174890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564652
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3103	NC_014212	TAGAA	2	10	174938	174947	60 %	20 %	20 %	0 %	297564652
3104	NC_014212	AGG	2	6	175006	175011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564652
3105	NC_014212	GAG	2	6	175410	175415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564652
3106	NC_014212	CTG	2	6	175418	175423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564652
3107	NC_014212	TTGT	2	8	175440	175447	0 %	75 %	25 %	0 %	297564652
3108	NC_014212	CCG	2	6	175452	175457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564652
3109	NC_014212	AGG	2	6	175507	175512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564652
3110	NC_014212	GCAG	2	8	175553	175560	25 %	0 %	50 %	25 %	297564652
3111	NC_014212	TACC	2	8	175568	175575	25 %	25 %	0 %	50 %	297564652
3112	NC_014212	ACT	2	6	175579	175584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564652
3113	NC_014212	CCG	2	6	175589	175594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564652
3114	NC_014212	G	6	6	175613	175618	0 %	0 %	100 %	0 %	297564652
3115	NC_014212	GCC	2	6	175706	175711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564652
3116	NC_014212	TGCTA	2	10	175719	175728	20 %	40 %	20 %	20 %	297564652
3117	NC_014212	TCT	2	6	176086	176091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564653
3118	NC_014212	TGG	2	6	176102	176107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564653
3119	NC_014212	CAC	2	6	176115	176120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564653
3120	NC_014212	TTC	2	6	176223	176228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564653
3121	NC_014212	AGCC	2	8	176365	176372	25 %	0 %	25 %	50 %	297564653
3122	NC_014212	GGT	2	6	176391	176396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564653
3123	NC_014212	C	6	6	176410	176415	0 %	0 %	0 %	100 %	297564653
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3229	NC_014212	CCCGA	2	10	183219	183228	20 %	0 %	20 %	60 %	297564660
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3231	NC_014212	GC	3	6	183548	183553	0 %	0 %	50 %	50 %	297564660
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3235	NC_014212	CCCA	2	8	183790	183797	25 %	0 %	0 %	75 %	297564661
3236	NC_014212	CGG	2	6	183818	183823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564661
3237	NC_014212	GAGGTC	2	12	183871	183882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297564661
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3239	NC_014212	C	7	7	183951	183957	0 %	0 %	0 %	100 %	297564661
3240	NC_014212	TGC	2	6	183998	184003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564661
3241	NC_014212	GCGT	2	8	184010	184017	0 %	25 %	50 %	25 %	297564661
3242	NC_014212	TAC	2	6	184030	184035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564661
3243	NC_014212	TTG	2	6	184046	184051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564661
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3245	NC_014212	CGG	2	6	184223	184228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564661
3246	NC_014212	ACG	2	6	184277	184282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564661
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3248	NC_014212	ACG	2	6	184529	184534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564661
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3250	NC_014212	CCT	2	6	184855	184860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564662
3251	NC_014212	GTA	2	6	184880	184885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564662
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3258	NC_014212	CGA	2	6	185212	185217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564662
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3273	NC_014212	TGG	2	6	185890	185895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564663
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3275	NC_014212	GGT	2	6	185924	185929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564663
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3322	NC_014212	TGCC	2	8	187896	187903	0 %	25 %	25 %	50 %	297564664
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3354	NC_014212	AGGG	2	8	189901	189908	25 %	0 %	75 %	0 %	297564666
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3363	NC_014212	G	6	6	190436	190441	0 %	0 %	100 %	0 %	297564666
3364	NC_014212	TGC	2	6	190463	190468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564666
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3489	NC_014212	AGCGA	2	10	199026	199035	40 %	0 %	40 %	20 %	297564673
3490	NC_014212	GAG	2	6	199039	199044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564673
3491	NC_014212	CAAA	2	8	199197	199204	75 %	0 %	0 %	25 %	297564674
3492	NC_014212	GGC	2	6	199322	199327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564674
3493	NC_014212	CCA	2	6	199328	199333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564674
3494	NC_014212	GAT	2	6	199399	199404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564674
3495	NC_014212	GTGG	2	8	199414	199421	0 %	25 %	75 %	0 %	297564674
3496	NC_014212	GTG	2	6	199447	199452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564674
3497	NC_014212	GCA	2	6	199461	199466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564674
3498	NC_014212	CCT	2	6	199491	199496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564674
3499	NC_014212	ATG	2	6	199546	199551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564674
3500	NC_014212	GGA	2	6	199626	199631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564674

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