MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 58234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014212	GCC	2	6	140806	140811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2502	NC_014212	AGA	2	6	140813	140818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564614
2503	NC_014212	CGG	2	6	140876	140881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2504	NC_014212	CAC	2	6	140898	140903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2505	NC_014212	CGG	2	6	140906	140911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2506	NC_014212	TCGGCC	2	12	140956	140967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297564614
2507	NC_014212	CGT	2	6	140978	140983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2508	NC_014212	CGG	2	6	141110	141115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2509	NC_014212	GCG	2	6	141117	141122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2510	NC_014212	GCGG	2	8	141183	141190	0 %	0 %	75 %	25 %	297564614
2511	NC_014212	ACC	2	6	141217	141222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2512	NC_014212	CGG	2	6	141269	141274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2513	NC_014212	TTC	2	6	141291	141296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564614
2514	NC_014212	GCCC	2	8	141299	141306	0 %	0 %	25 %	75 %	297564614
2515	NC_014212	CCA	2	6	141374	141379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2516	NC_014212	GGGT	2	8	141411	141418	0 %	25 %	75 %	0 %	297564614
2517	NC_014212	GCC	2	6	141442	141447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2518	NC_014212	TGC	2	6	141472	141477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2519	NC_014212	CGG	2	6	141488	141493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2520	NC_014212	CAG	2	6	141507	141512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2521	NC_014212	ACC	2	6	141595	141600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2522	NC_014212	GCG	2	6	141610	141615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2523	NC_014212	CTACCC	2	12	141665	141676	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	297564614
2524	NC_014212	GCG	2	6	141745	141750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2525	NC_014212	AGA	2	6	141791	141796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564614
2526	NC_014212	CGA	2	6	141824	141829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2527	NC_014212	GC	3	6	141912	141917	0 %	0 %	50 %	50 %	297564614
2528	NC_014212	CGG	2	6	141938	141943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2529	NC_014212	TCT	2	6	142091	142096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564614
2530	NC_014212	ACC	3	9	142108	142116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2531	NC_014212	TCG	2	6	142117	142122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2532	NC_014212	CAC	3	9	142125	142133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2533	NC_014212	CTT	2	6	142154	142159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564614
2534	NC_014212	C	6	6	142161	142166	0 %	0 %	0 %	100 %	297564614
2535	NC_014212	GGT	2	6	142272	142277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564614
2536	NC_014212	GCC	2	6	142288	142293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2537	NC_014212	TCA	2	6	142376	142381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564614
2538	NC_014212	CGC	2	6	142396	142401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2539	NC_014212	GCC	2	6	142434	142439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2540	NC_014212	CCA	2	6	142440	142445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2541	NC_014212	CAC	2	6	142446	142451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564614
2542	NC_014212	CAG	2	6	142461	142466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2543	NC_014212	GGC	2	6	142498	142503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564614
2544	NC_014212	CCG	2	6	142525	142530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2545	NC_014212	CAG	3	9	142560	142568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2546	NC_014212	GCA	2	6	142586	142591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2547	NC_014212	TGC	2	6	142633	142638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2548	NC_014212	CGGG	2	8	142665	142672	0 %	0 %	75 %	25 %	297564614
2549	NC_014212	CTT	2	6	142747	142752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564614
2550	NC_014212	CGC	2	6	142754	142759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2551	NC_014212	GTT	2	6	142922	142927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564614
2552	NC_014212	CGT	2	6	142952	142957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564614
2553	NC_014212	CCG	2	6	142985	142990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564614
2554	NC_014212	GTC	2	6	143186	143191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564615
2555	NC_014212	AGG	2	6	143331	143336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564616
2556	NC_014212	GCC	2	6	143357	143362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564616
2557	NC_014212	CCA	2	6	143368	143373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564616
2558	NC_014212	GC	4	8	143408	143415	0 %	0 %	50 %	50 %	297564616
2559	NC_014212	CG	3	6	143432	143437	0 %	0 %	50 %	50 %	297564616
2560	NC_014212	TAA	2	6	143688	143693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297564617
2561	NC_014212	CAT	2	6	143810	143815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564617
2562	NC_014212	CAT	2	6	143846	143851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564617
2563	NC_014212	GTA	2	6	143942	143947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564617
2564	NC_014212	CGAGC	2	10	144013	144022	20 %	0 %	40 %	40 %	297564617
2565	NC_014212	G	6	6	144036	144041	0 %	0 %	100 %	0 %	297564617
2566	NC_014212	TCA	2	6	144070	144075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564617
2567	NC_014212	CAT	2	6	144092	144097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564617
2568	NC_014212	CCCA	2	8	144098	144105	25 %	0 %	0 %	75 %	297564617
2569	NC_014212	CAT	2	6	144134	144139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564617
2570	NC_014212	CCCT	2	8	144337	144344	0 %	25 %	0 %	75 %	297564618
2571	NC_014212	CAG	2	6	144369	144374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564618
2572	NC_014212	CAG	2	6	144381	144386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564618
2573	NC_014212	CAG	2	6	144408	144413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564618
2574	NC_014212	GCC	2	6	144429	144434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564618
2575	NC_014212	CAT	2	6	144435	144440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564618
2576	NC_014212	GCCGTA	2	12	144441	144452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297564618
2577	NC_014212	CCT	2	6	144610	144615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564619
2578	NC_014212	CTT	2	6	144688	144693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564619
2579	NC_014212	CAC	2	6	144761	144766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564619
2580	NC_014212	GCA	2	6	144775	144780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564619
2581	NC_014212	CCT	2	6	145015	145020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564620
2582	NC_014212	CAT	2	6	145044	145049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564620
2583	NC_014212	CGA	2	6	145067	145072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564620
2584	NC_014212	GCC	2	6	145188	145193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564620
2585	NC_014212	CAT	2	6	145350	145355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564620
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2588	NC_014212	CGGCAG	2	12	145431	145442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297564620
2589	NC_014212	CCA	2	6	145463	145468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564620
2590	NC_014212	CAT	2	6	145506	145511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564620
2591	NC_014212	GCC	2	6	145536	145541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564620
2592	NC_014212	TCA	2	6	145547	145552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564620
2593	NC_014212	GCC	2	6	145590	145595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564620
2594	NC_014212	CAT	3	9	145599	145607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564620
2595	NC_014212	CAG	2	6	145695	145700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564620
2596	NC_014212	GCC	2	6	145734	145739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564620
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2598	NC_014212	CGCAGG	2	12	145816	145827	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297564620
2599	NC_014212	CGG	2	6	145859	145864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564620
2600	NC_014212	AGG	2	6	145963	145968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564620
2601	NC_014212	GGGCA	2	10	145992	146001	20 %	0 %	60 %	20 %	297564620
2602	NC_014212	CCA	3	9	146015	146023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564620
2603	NC_014212	GGT	2	6	146078	146083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564620
2604	NC_014212	CCG	2	6	146096	146101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564620
2605	NC_014212	GGC	2	6	146129	146134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564620
2606	NC_014212	GTC	2	6	146163	146168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564620
2607	NC_014212	G	6	6	146175	146180	0 %	0 %	100 %	0 %	297564620
2608	NC_014212	GTGCAG	2	12	146193	146204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297564620
2609	NC_014212	GTT	2	6	146223	146228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564620
2610	NC_014212	CGCAGG	2	12	146260	146271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297564620
2611	NC_014212	CAG	2	6	146298	146303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564620
2612	NC_014212	GCC	2	6	146316	146321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564620
2613	NC_014212	AGC	2	6	146343	146348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564620
2614	NC_014212	CAACC	2	10	146617	146626	40 %	0 %	0 %	60 %	297564621
2615	NC_014212	GCT	2	6	146643	146648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564621
2616	NC_014212	GCA	2	6	146688	146693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564621
2617	NC_014212	GGGC	2	8	146695	146702	0 %	0 %	75 %	25 %	297564621
2618	NC_014212	ACCT	2	8	146736	146743	25 %	25 %	0 %	50 %	297564621
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2620	NC_014212	GGC	2	6	147047	147052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564621
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2854	NC_014212	GC	3	6	160585	160590	0 %	0 %	50 %	50 %	297564636
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2864	NC_014212	TCA	2	6	160984	160989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564637
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2867	NC_014212	CAT	2	6	161081	161086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564637
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2982	NC_014212	GCC	2	6	167690	167695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564643
2983	NC_014212	TGG	2	6	167743	167748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564643
2984	NC_014212	TGCAAC	2	12	167827	167838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297564643
2985	NC_014212	GGC	2	6	167888	167893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564643
2986	NC_014212	GAT	2	6	168260	168265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564644
2987	NC_014212	CGAGG	2	10	168374	168383	20 %	0 %	60 %	20 %	297564644
2988	NC_014212	CTC	2	6	168400	168405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564644
2989	NC_014212	TTGT	2	8	168426	168433	0 %	75 %	25 %	0 %	297564644
2990	NC_014212	GAG	3	9	168462	168470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564644
2991	NC_014212	GAA	2	6	168474	168479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564644
2992	NC_014212	GAA	2	6	168653	168658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564644
2993	NC_014212	GGT	3	9	168686	168694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564644
2994	NC_014212	TTC	2	6	168729	168734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564644
2995	NC_014212	GAG	2	6	168771	168776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564644
2996	NC_014212	GAT	2	6	168874	168879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564645
2997	NC_014212	CGGTGC	2	12	168930	168941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297564645
2998	NC_014212	ACC	3	9	168957	168965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564645
2999	NC_014212	GGT	2	6	168967	168972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564645
3000	NC_014212	TGG	2	6	168975	168980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564645

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