MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014002	TGGA	2	8	164	171	25 %	25 %	50 %	0 %	294494691
2	NC_014002	ATAA	2	8	290	297	75 %	25 %	0 %	0 %	294494691
3	NC_014002	ACAGGT	2	12	365	376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294494691
4	NC_014002	ATC	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494691
5	NC_014002	AATGT	2	10	441	450	40 %	40 %	20 %	0 %	294494691
6	NC_014002	T	7	7	558	564	0 %	100 %	0 %	0 %	294494691
7	NC_014002	TTA	3	9	600	608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494691
8	NC_014002	TGA	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
9	NC_014002	GAT	2	6	647	652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
10	NC_014002	GAG	2	6	776	781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494691
11	NC_014002	ATG	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
12	NC_014002	GAT	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
13	NC_014002	TGA	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494691
14	NC_014002	AGA	2	6	978	983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494691
15	NC_014002	GAA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494691
16	NC_014002	CAGG	2	8	1006	1013	25 %	0 %	50 %	25 %	294494691
17	NC_014002	A	6	6	1020	1025	100 %	0 %	0 %	0 %	294494691
18	NC_014002	GCTC	2	8	1078	1085	0 %	25 %	25 %	50 %	294494691
19	NC_014002	TGC	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494691
20	NC_014002	TAA	2	6	1108	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494691
21	NC_014002	GGTA	2	8	1268	1275	25 %	25 %	50 %	0 %	294494691
22	NC_014002	GCTG	2	8	1357	1364	0 %	25 %	50 %	25 %	294494691
23	NC_014002	AT	3	6	1452	1457	50 %	50 %	0 %	0 %	294494692
24	NC_014002	ACA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494692
25	NC_014002	GAT	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494692
26	NC_014002	TTC	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494692
27	NC_014002	CTG	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494692
28	NC_014002	TAG	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494692
29	NC_014002	CTT	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494692
30	NC_014002	CAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494692
31	NC_014002	T	7	7	1737	1743	0 %	100 %	0 %	0 %	294494692
32	NC_014002	CCCA	2	8	1956	1963	25 %	0 %	0 %	75 %	294494692
33	NC_014002	ATT	2	6	1992	1997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494692
34	NC_014002	TCTTT	2	10	2163	2172	0 %	80 %	0 %	20 %	294494693
35	NC_014002	CAA	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494693
36	NC_014002	ATCA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	294494693
37	NC_014002	GAT	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
38	NC_014002	TGA	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
39	NC_014002	GAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494693
40	NC_014002	AT	3	6	2444	2449	50 %	50 %	0 %	0 %	294494693
41	NC_014002	TGAG	2	8	2488	2495	25 %	25 %	50 %	0 %	294494693
42	NC_014002	GGTAT	2	10	2580	2589	20 %	40 %	40 %	0 %	294494693
43	NC_014002	ATGA	2	8	2670	2677	50 %	25 %	25 %	0 %	294494693
44	NC_014002	TGA	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
45	NC_014002	A	6	6	2772	2777	100 %	0 %	0 %	0 %	294494693
46	NC_014002	TTTCA	2	10	2840	2849	20 %	60 %	0 %	20 %	294494693
47	NC_014002	GGTA	2	8	2996	3003	25 %	25 %	50 %	0 %	294494693
48	NC_014002	CAGGA	2	10	3010	3019	40 %	0 %	40 %	20 %	294494693
49	NC_014002	AGT	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
50	NC_014002	GAT	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494693
51	NC_014002	TC	3	6	3350	3355	0 %	50 %	0 %	50 %	294494693
52	NC_014002	GCA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494693
53	NC_014002	GATC	2	8	3410	3417	25 %	25 %	25 %	25 %	294494693
54	NC_014002	GGT	2	6	3566	3571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494693
55	NC_014002	TGC	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494693
56	NC_014002	TTA	2	6	3663	3668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494694
57	NC_014002	ATTA	2	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	294494694
58	NC_014002	AGGA	2	8	3766	3773	50 %	0 %	50 %	0 %	294494694
59	NC_014002	CTG	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494694
60	NC_014002	AAT	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494694
61	NC_014002	AGA	2	6	4079	4084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494694
62	NC_014002	AGTA	2	8	4100	4107	50 %	25 %	25 %	0 %	294494694
63	NC_014002	ATT	2	6	4377	4382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494694
64	NC_014002	ATGCC	2	10	4435	4444	20 %	20 %	20 %	40 %	294494694
65	NC_014002	GAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494694
66	NC_014002	A	6	6	4729	4734	100 %	0 %	0 %	0 %	294494695
67	NC_014002	AAGGG	2	10	4756	4765	40 %	0 %	60 %	0 %	294494695
68	NC_014002	ACC	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494695
69	NC_014002	C	7	7	5017	5023	0 %	0 %	0 %	100 %	294494695
70	NC_014002	TGCTTG	2	12	5114	5125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294494695
71	NC_014002	TTAC	2	8	5149	5156	25 %	50 %	0 %	25 %	294494695
72	NC_014002	GGT	2	6	5218	5223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494695
73	NC_014002	CAG	2	6	5242	5247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494695
74	NC_014002	GAA	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494695
75	NC_014002	CAT	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494695
76	NC_014002	TGC	2	6	5478	5483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494695
77	NC_014002	GGACCT	2	12	5499	5510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294494695
78	NC_014002	TGA	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494695
79	NC_014002	CTG	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494695
80	NC_014002	ACA	2	6	5696	5701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494695
81	NC_014002	GGC	2	6	5896	5901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494695
82	NC_014002	TTG	2	6	5903	5908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494695
83	NC_014002	GTA	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
84	NC_014002	CT	3	6	6055	6060	0 %	50 %	0 %	50 %	294494696
85	NC_014002	AC	3	6	6297	6302	50 %	0 %	0 %	50 %	294494696
86	NC_014002	ATA	2	6	6352	6357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494696
87	NC_014002	CAGA	2	8	6432	6439	50 %	0 %	25 %	25 %	294494696
88	NC_014002	TA	3	6	6515	6520	50 %	50 %	0 %	0 %	294494696
89	NC_014002	GAG	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494696
90	NC_014002	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
91	NC_014002	CAT	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494696
92	NC_014002	GAT	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
93	NC_014002	TGG	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494696
94	NC_014002	TAC	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494696
95	NC_014002	GCAG	2	8	6906	6913	25 %	0 %	50 %	25 %	294494696
96	NC_014002	ATT	2	6	6919	6924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494696
97	NC_014002	TGA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494696
98	NC_014002	CAAG	2	8	7099	7106	50 %	0 %	25 %	25 %	294494696
99	NC_014002	CGC	2	6	7129	7134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494696
100	NC_014002	AGC	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494696
101	NC_014002	AGGA	2	8	7334	7341	50 %	0 %	50 %	0 %	294494696
102	NC_014002	CTAT	2	8	7475	7482	25 %	50 %	0 %	25 %	294494696
103	NC_014002	GGGA	2	8	7483	7490	25 %	0 %	75 %	0 %	294494696
104	NC_014002	GAA	2	6	7549	7554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494696
105	NC_014002	AAC	2	6	7669	7674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494697
106	NC_014002	T	6	6	7705	7710	0 %	100 %	0 %	0 %	294494697
107	NC_014002	A	6	6	7737	7742	100 %	0 %	0 %	0 %	294494697
108	NC_014002	CGC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494697
109	NC_014002	TTCTTG	2	12	7885	7896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294494697
110	NC_014002	ATTT	2	8	7916	7923	25 %	75 %	0 %	0 %	294494697
111	NC_014002	CTCC	2	8	8042	8049	0 %	25 %	0 %	75 %	294494698
112	NC_014002	TCC	2	6	8068	8073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494698
113	NC_014002	AGGAT	2	10	8222	8231	40 %	20 %	40 %	0 %	294494698
114	NC_014002	CA	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	294494698
115	NC_014002	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494698
116	NC_014002	AATGG	2	10	8274	8283	40 %	20 %	40 %	0 %	294494698
117	NC_014002	ATG	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494698
118	NC_014002	TCCGG	2	10	8341	8350	0 %	20 %	40 %	40 %	294494698
119	NC_014002	ATC	2	6	8358	8363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494698
120	NC_014002	ACC	2	6	8590	8595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494698
121	NC_014002	GGGAT	2	10	8658	8667	20 %	20 %	60 %	0 %	294494698
122	NC_014002	GGT	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494698
123	NC_014002	TGC	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494698
124	NC_014002	CTC	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494698
125	NC_014002	GAT	2	6	9044	9049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
126	NC_014002	GGA	2	6	9071	9076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494699
127	NC_014002	TCA	2	6	9135	9140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494699
128	NC_014002	TTG	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494699
129	NC_014002	AGA	2	6	9319	9324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494699
130	NC_014002	TG	3	6	9365	9370	0 %	50 %	50 %	0 %	294494699
131	NC_014002	ATG	2	6	9417	9422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
132	NC_014002	TGA	2	6	9514	9519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
133	NC_014002	TGA	4	12	9553	9564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494699
134	NC_014002	TAC	2	6	9647	9652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494699
135	NC_014002	CAG	2	6	9699	9704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494699
136	NC_014002	CAG	2	6	10134	10139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494700
137	NC_014002	TCT	2	6	10207	10212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494700
138	NC_014002	TAT	2	6	10241	10246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494700
139	NC_014002	A	6	6	10372	10377	100 %	0 %	0 %	0 %	294494700
140	NC_014002	CCAC	2	8	10396	10403	25 %	0 %	0 %	75 %	294494700
141	NC_014002	GCT	3	9	10492	10500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494700
142	NC_014002	CTG	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494700
143	NC_014002	A	7	7	10620	10626	100 %	0 %	0 %	0 %	294494700
144	NC_014002	CAG	2	6	10631	10636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494700
145	NC_014002	TGA	2	6	10705	10710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494700
146	NC_014002	GGT	2	6	10872	10877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494700
147	NC_014002	TGCCAG	2	12	10938	10949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294494700
148	NC_014002	TTTGG	2	10	11023	11032	0 %	60 %	40 %	0 %	294494700
149	NC_014002	TGA	2	6	11173	11178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
150	NC_014002	TGA	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
151	NC_014002	AGG	3	9	11216	11224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494701
152	NC_014002	TCTA	2	8	11242	11249	25 %	50 %	0 %	25 %	294494701
153	NC_014002	TACT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	294494701
154	NC_014002	TGA	2	6	11407	11412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
155	NC_014002	A	7	7	11418	11424	100 %	0 %	0 %	0 %	294494701
156	NC_014002	CCTC	2	8	11532	11539	0 %	25 %	0 %	75 %	294494701
157	NC_014002	CT	3	6	11611	11616	0 %	50 %	0 %	50 %	294494701
158	NC_014002	A	6	6	11653	11658	100 %	0 %	0 %	0 %	294494701
159	NC_014002	CTT	2	6	11709	11714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494701
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161	NC_014002	GAT	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494701
162	NC_014002	CT	3	6	11813	11818	0 %	50 %	0 %	50 %	294494701
163	NC_014002	AGA	2	6	11904	11909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494701
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165	NC_014002	TCT	2	6	12077	12082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494702
166	NC_014002	GAG	2	6	12143	12148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494702
167	NC_014002	AGG	2	6	12155	12160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494702
168	NC_014002	AAT	2	6	12210	12215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494702
169	NC_014002	CA	3	6	12402	12407	50 %	0 %	0 %	50 %	294494702
170	NC_014002	TTC	2	6	12468	12473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494702
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173	NC_014002	TCA	2	6	12827	12832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494702
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175	NC_014002	TGC	2	6	12897	12902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494702
176	NC_014002	CAC	2	6	13002	13007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494703
177	NC_014002	GGT	2	6	13040	13045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494703
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179	NC_014002	GTC	2	6	13126	13131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494703
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254	NC_014002	CAT	2	6	16985	16990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494707
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389	NC_014002	AAT	2	6	26016	26021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494715
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