MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 62864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013946	AGC	2	6	51993	51998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1002	NC_013946	GCT	4	12	51999	52010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1003	NC_013946	CTGGG	2	10	52099	52108	0 %	20 %	60 %	20 %	291294464
1004	NC_013946	CG	3	6	52123	52128	0 %	0 %	50 %	50 %	291294464
1005	NC_013946	CTGG	2	8	52134	52141	0 %	25 %	50 %	25 %	291294464
1006	NC_013946	C	6	6	52185	52190	0 %	0 %	0 %	100 %	291294464
1007	NC_013946	CG	3	6	52260	52265	0 %	0 %	50 %	50 %	291294464
1008	NC_013946	CTG	2	6	52303	52308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294464
1009	NC_013946	ATC	2	6	52312	52317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294464
1010	NC_013946	A	6	6	52385	52390	100 %	0 %	0 %	0 %	291294464
1011	NC_013946	G	6	6	52419	52424	0 %	0 %	100 %	0 %	291294464
1012	NC_013946	TTG	2	6	52438	52443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294464
1013	NC_013946	GCG	2	6	52447	52452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294464
1014	NC_013946	GGAT	2	8	52512	52519	25 %	25 %	50 %	0 %	291294464
1015	NC_013946	ACC	2	6	52520	52525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294464
1016	NC_013946	GCTG	2	8	52529	52536	0 %	25 %	50 %	25 %	291294464
1017	NC_013946	GCCCCT	2	12	52578	52589	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	291294464
1018	NC_013946	CCG	2	6	52646	52651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294464
1019	NC_013946	GGGT	2	8	52679	52686	0 %	25 %	75 %	0 %	291294464
1020	NC_013946	GGT	2	6	52710	52715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294464
1021	NC_013946	GGT	2	6	52734	52739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294464
1022	NC_013946	AGCCC	2	10	52760	52769	20 %	0 %	20 %	60 %	291294464
1023	NC_013946	CGG	2	6	52781	52786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294464
1024	NC_013946	GCT	2	6	52794	52799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294464
1025	NC_013946	CCG	2	6	52925	52930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294464
1026	NC_013946	ACCG	2	8	52936	52943	25 %	0 %	25 %	50 %	291294464
1027	NC_013946	AGC	2	6	52961	52966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294464
1028	NC_013946	TGAG	2	8	52985	52992	25 %	25 %	50 %	0 %	291294464
1029	NC_013946	G	6	6	53015	53020	0 %	0 %	100 %	0 %	291294464
1030	NC_013946	CT	3	6	53048	53053	0 %	50 %	0 %	50 %	291294464
1031	NC_013946	GAG	2	6	53092	53097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294464
1032	NC_013946	ACCCAT	2	12	53113	53124	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291294464
1033	NC_013946	GAC	2	6	53131	53136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294464
1034	NC_013946	GGC	2	6	53166	53171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294464
1035	NC_013946	GC	3	6	53170	53175	0 %	0 %	50 %	50 %	291294464
1036	NC_013946	CAC	3	9	53188	53196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294464
1037	NC_013946	CGGG	2	8	53208	53215	0 %	0 %	75 %	25 %	291294464
1038	NC_013946	TGGCC	2	10	53226	53235	0 %	20 %	40 %	40 %	291294464
1039	NC_013946	GCC	2	6	53338	53343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294464
1040	NC_013946	AGC	2	6	53541	53546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294465
1041	NC_013946	GCGGG	2	10	53567	53576	0 %	0 %	80 %	20 %	291294465
1042	NC_013946	AGC	2	6	53679	53684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294465
1043	NC_013946	G	6	6	53709	53714	0 %	0 %	100 %	0 %	291294465
1044	NC_013946	GGT	2	6	53722	53727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294465
1045	NC_013946	GAG	2	6	53759	53764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294465
1046	NC_013946	GCT	2	6	53830	53835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294465
1047	NC_013946	GCA	2	6	53893	53898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294465
1048	NC_013946	G	9	9	53918	53926	0 %	0 %	100 %	0 %	291294465
1049	NC_013946	C	8	8	53944	53951	0 %	0 %	0 %	100 %	291294465
1050	NC_013946	GCC	2	6	53975	53980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294465
1051	NC_013946	CGGTG	2	10	53986	53995	0 %	20 %	60 %	20 %	291294465
1052	NC_013946	CCA	2	6	54030	54035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294465
1053	NC_013946	GGTG	2	8	54073	54080	0 %	25 %	75 %	0 %	291294465
1054	NC_013946	CTG	2	6	54167	54172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294465
1055	NC_013946	C	7	7	54179	54185	0 %	0 %	0 %	100 %	291294465
1056	NC_013946	ACCA	2	8	54186	54193	50 %	0 %	0 %	50 %	291294465
1057	NC_013946	CTG	2	6	54206	54211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294465
1058	NC_013946	CGA	2	6	54320	54325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294466
1059	NC_013946	CGC	3	9	54339	54347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294466
1060	NC_013946	CAC	2	6	54377	54382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294466
1061	NC_013946	GCT	2	6	54407	54412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294466
1062	NC_013946	TCA	2	6	54415	54420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294466
1063	NC_013946	CAA	2	6	54452	54457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294466
1064	NC_013946	GCC	2	6	54480	54485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294466
1065	NC_013946	GAG	2	6	54570	54575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294466
1066	NC_013946	A	6	6	54717	54722	100 %	0 %	0 %	0 %	291294466
1067	NC_013946	AGA	3	9	54734	54742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294466
1068	NC_013946	ACCTG	2	10	54746	54755	20 %	20 %	20 %	40 %	291294466
1069	NC_013946	GTGA	2	8	54821	54828	25 %	25 %	50 %	0 %	291294467
1070	NC_013946	AGC	2	6	54972	54977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294467
1071	NC_013946	AAGC	2	8	55033	55040	50 %	0 %	25 %	25 %	291294467
1072	NC_013946	GCCCAG	2	12	55058	55069	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291294467
1073	NC_013946	CAA	3	9	55147	55155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294467
1074	NC_013946	TCG	2	6	55161	55166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294467
1075	NC_013946	GCT	2	6	55180	55185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294467
1076	NC_013946	CCA	2	6	55347	55352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294467
1077	NC_013946	CCG	2	6	55387	55392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294467
1078	NC_013946	CAG	2	6	55487	55492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294467
1079	NC_013946	GGT	2	6	55510	55515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294467
1080	NC_013946	CCT	2	6	55524	55529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294467
1081	NC_013946	CAGG	2	8	55625	55632	25 %	0 %	50 %	25 %	291294468
1082	NC_013946	TGC	2	6	55636	55641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294468
1083	NC_013946	GGC	2	6	55698	55703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294468
1084	NC_013946	GTG	2	6	55725	55730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294468
1085	NC_013946	GCG	2	6	55739	55744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294468
1086	NC_013946	GAA	2	6	55755	55760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294468
1087	NC_013946	CACTG	2	10	55769	55778	20 %	20 %	20 %	40 %	291294468
1088	NC_013946	A	6	6	55924	55929	100 %	0 %	0 %	0 %	291294468
1089	NC_013946	CTT	2	6	55970	55975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294468
1090	NC_013946	C	6	6	56307	56312	0 %	0 %	0 %	100 %	291294469
1091	NC_013946	CAA	2	6	56378	56383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294469
1092	NC_013946	CAG	2	6	56415	56420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294469
1093	NC_013946	GCT	2	6	56501	56506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294469
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1095	NC_013946	GCC	2	6	56566	56571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294470
1096	NC_013946	CCT	2	6	56643	56648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294470
1097	NC_013946	GCG	2	6	56662	56667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294470
1098	NC_013946	GTT	2	6	56860	56865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294470
1099	NC_013946	CG	3	6	56936	56941	0 %	0 %	50 %	50 %	291294470
1100	NC_013946	GCC	2	6	56991	56996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294470
1101	NC_013946	G	6	6	57028	57033	0 %	0 %	100 %	0 %	291294470
1102	NC_013946	TTG	2	6	57047	57052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294470
1103	NC_013946	CACCC	2	10	57064	57073	20 %	0 %	0 %	80 %	291294470
1104	NC_013946	C	6	6	57146	57151	0 %	0 %	0 %	100 %	291294470
1105	NC_013946	AGA	2	6	57200	57205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294470
1106	NC_013946	CTC	2	6	57211	57216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294470
1107	NC_013946	ACTT	2	8	57415	57422	25 %	50 %	0 %	25 %	291294471
1108	NC_013946	AGG	2	6	57486	57491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294471
1109	NC_013946	CGA	2	6	57538	57543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294471
1110	NC_013946	CGC	2	6	57565	57570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294471
1111	NC_013946	GAT	2	6	57590	57595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294471
1112	NC_013946	GAT	2	6	57629	57634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294471
1113	NC_013946	CAA	2	6	57668	57673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294472
1114	NC_013946	CCA	2	6	57683	57688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294472
1115	NC_013946	TC	3	6	57731	57736	0 %	50 %	0 %	50 %	291294472
1116	NC_013946	GGT	2	6	57740	57745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294472
1117	NC_013946	GCC	2	6	57830	57835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294472
1118	NC_013946	GCG	2	6	57849	57854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294472
1119	NC_013946	G	6	6	58033	58038	0 %	0 %	100 %	0 %	291294473
1120	NC_013946	AGG	2	6	58062	58067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294473
1121	NC_013946	GAA	2	6	58097	58102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294473
1122	NC_013946	TCC	2	6	58131	58136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294473
1123	NC_013946	CAG	2	6	58151	58156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294473
1124	NC_013946	CGGC	2	8	58173	58180	0 %	0 %	50 %	50 %	291294473
1125	NC_013946	TTG	2	6	58191	58196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294473
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