MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 62864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013946	CAC	2	6	224161	224166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294655
4502	NC_013946	GAT	2	6	224278	224283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294655
4503	NC_013946	TGT	2	6	224310	224315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294655
4504	NC_013946	GTG	2	6	224357	224362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294655
4505	NC_013946	CAG	2	6	224389	224394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294655
4506	NC_013946	GGCCTG	2	12	224431	224442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291294655
4507	NC_013946	CCG	2	6	224580	224585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294655
4508	NC_013946	GCA	2	6	224637	224642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294655
4509	NC_013946	CAG	2	6	224725	224730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294655
4510	NC_013946	CGG	2	6	224780	224785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294655
4511	NC_013946	GCCAGG	2	12	224807	224818	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291294655
4512	NC_013946	CGG	2	6	224845	224850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294656
4513	NC_013946	GAT	2	6	224856	224861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294656
4514	NC_013946	GAGG	2	8	224907	224914	25 %	0 %	75 %	0 %	291294656
4515	NC_013946	CTG	2	6	224916	224921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294656
4516	NC_013946	GGTC	2	8	225002	225009	0 %	25 %	50 %	25 %	291294656
4517	NC_013946	TGC	2	6	225031	225036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294656
4518	NC_013946	GCT	2	6	225044	225049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294656
4519	NC_013946	G	6	6	225059	225064	0 %	0 %	100 %	0 %	291294656
4520	NC_013946	CCA	2	6	225074	225079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294656
4521	NC_013946	GTGG	2	8	225135	225142	0 %	25 %	75 %	0 %	291294656
4522	NC_013946	CAC	2	6	225150	225155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294656
4523	NC_013946	GAT	2	6	225192	225197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294656
4524	NC_013946	GCG	2	6	225198	225203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294656
4525	NC_013946	GGT	2	6	225222	225227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294656
4526	NC_013946	ACC	2	6	225244	225249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294656
4527	NC_013946	CAC	2	6	225261	225266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294656
4528	NC_013946	GGGCCA	2	12	225272	225283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291294656
4529	NC_013946	GCC	2	6	225290	225295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294656
4530	NC_013946	GGT	2	6	225357	225362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294656
4531	NC_013946	CCT	2	6	225455	225460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294656
4532	NC_013946	GGC	2	6	225477	225482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294656
4533	NC_013946	GCA	2	6	225545	225550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294656
4534	NC_013946	GGT	2	6	225576	225581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294656
4535	NC_013946	CAG	2	6	225603	225608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294656
4536	NC_013946	CCA	2	6	225656	225661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294656
4537	NC_013946	AGGGCC	2	12	225758	225769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291294657
4538	NC_013946	C	6	6	225780	225785	0 %	0 %	0 %	100 %	291294657
4539	NC_013946	TCA	2	6	225833	225838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294657
4540	NC_013946	CCG	2	6	225885	225890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294657
4541	NC_013946	GCA	2	6	226020	226025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294657
4542	NC_013946	GCT	2	6	226112	226117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294657
4543	NC_013946	GCA	2	6	226119	226124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294657
4544	NC_013946	T	6	6	226129	226134	0 %	100 %	0 %	0 %	291294657
4545	NC_013946	GTG	3	9	226196	226204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294657
4546	NC_013946	CG	3	6	226240	226245	0 %	0 %	50 %	50 %	291294657
4547	NC_013946	TCG	2	6	226274	226279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294657
4548	NC_013946	AGTA	2	8	226289	226296	50 %	25 %	25 %	0 %	291294657
4549	NC_013946	A	6	6	226433	226438	100 %	0 %	0 %	0 %	291294658
4550	NC_013946	CG	3	6	226473	226478	0 %	0 %	50 %	50 %	291294658
4551	NC_013946	CAA	2	6	226486	226491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294658
4552	NC_013946	GTACGA	2	12	226492	226503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291294658
4553	NC_013946	TGC	2	6	226536	226541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294658
4554	NC_013946	CAT	2	6	226618	226623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294658
4555	NC_013946	CCAC	2	8	226629	226636	25 %	0 %	0 %	75 %	291294658
4556	NC_013946	GTG	3	9	226652	226660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294658
4557	NC_013946	TGG	2	6	226680	226685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294658
4558	NC_013946	GGC	2	6	226703	226708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294658
4559	NC_013946	ATC	2	6	226718	226723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294658
4560	NC_013946	GTG	2	6	226727	226732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294658
4561	NC_013946	CTT	2	6	226807	226812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294658
4562	NC_013946	CAG	2	6	226922	226927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294658
4563	NC_013946	CGA	2	6	227129	227134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294659
4564	NC_013946	GGC	2	6	227159	227164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294659
4565	NC_013946	GGA	2	6	227180	227185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294659
4566	NC_013946	GAC	2	6	227193	227198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294659
4567	NC_013946	CGA	2	6	227249	227254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294659
4568	NC_013946	GAG	2	6	227265	227270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294659
4569	NC_013946	GGC	2	6	227355	227360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294659
4570	NC_013946	TGG	2	6	227421	227426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294659
4571	NC_013946	GCC	2	6	227446	227451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294659
4572	NC_013946	GCC	2	6	227519	227524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294660
4573	NC_013946	CCA	2	6	227530	227535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294660
4574	NC_013946	CGGT	2	8	227583	227590	0 %	25 %	50 %	25 %	291294660
4575	NC_013946	CAG	2	6	227594	227599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294660
4576	NC_013946	AGCA	2	8	227673	227680	50 %	0 %	25 %	25 %	291294660
4577	NC_013946	T	7	7	227689	227695	0 %	100 %	0 %	0 %	291294660
4578	NC_013946	CGG	2	6	227698	227703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294660
4579	NC_013946	CAGGCG	2	12	227705	227716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291294660
4580	NC_013946	CG	3	6	227796	227801	0 %	0 %	50 %	50 %	291294660
4581	NC_013946	CCT	2	6	227986	227991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294660
4582	NC_013946	TTCA	2	8	227993	228000	25 %	50 %	0 %	25 %	291294660
4583	NC_013946	ATC	2	6	228009	228014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294660
4584	NC_013946	TGC	2	6	228103	228108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294660
4585	NC_013946	AGG	2	6	228195	228200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294660
4586	NC_013946	TGG	2	6	228205	228210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294660
4587	NC_013946	GCTG	2	8	228239	228246	0 %	25 %	50 %	25 %	291294660
4588	NC_013946	ATC	2	6	228252	228257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294660
4589	NC_013946	CGC	2	6	228286	228291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294660
4590	NC_013946	G	6	6	228371	228376	0 %	0 %	100 %	0 %	291294660
4591	NC_013946	CCCAG	2	10	228388	228397	20 %	0 %	20 %	60 %	291294660
4592	NC_013946	GCG	2	6	228430	228435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294660
4593	NC_013946	TGA	2	6	228457	228462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294660
4594	NC_013946	GGT	2	6	228610	228615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294661
4595	NC_013946	CAG	2	6	228704	228709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294661
4596	NC_013946	GCA	2	6	228721	228726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294661
4597	NC_013946	GGC	2	6	228757	228762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294661
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4599	NC_013946	CTGG	2	8	228802	228809	0 %	25 %	50 %	25 %	291294661
4600	NC_013946	CGC	2	6	228817	228822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294661
4601	NC_013946	G	8	8	228844	228851	0 %	0 %	100 %	0 %	291294661
4602	NC_013946	TGC	2	6	228870	228875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294661
4603	NC_013946	GGC	2	6	228945	228950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294661
4604	NC_013946	GCG	2	6	229095	229100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294662
4605	NC_013946	G	7	7	229100	229106	0 %	0 %	100 %	0 %	291294662
4606	NC_013946	GTG	2	6	229169	229174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294662
4607	NC_013946	GCA	2	6	229191	229196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294662
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4609	NC_013946	CGC	2	6	229213	229218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294662
4610	NC_013946	AGA	2	6	229357	229362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294662
4611	NC_013946	TGGG	2	8	229490	229497	0 %	25 %	75 %	0 %	291294662
4612	NC_013946	CTG	2	6	229505	229510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294662
4613	NC_013946	CGG	2	6	229516	229521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294662
4614	NC_013946	TGC	2	6	229605	229610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294662
4615	NC_013946	A	7	7	229625	229631	100 %	0 %	0 %	0 %	291294662
4616	NC_013946	TGG	2	6	229634	229639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294662
4617	NC_013946	CAG	2	6	229640	229645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294662
4618	NC_013946	CCG	2	6	229651	229656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294662
4619	NC_013946	CAG	2	6	229799	229804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294662
4620	NC_013946	GGC	2	6	229831	229836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294662
4621	NC_013946	CTG	2	6	229868	229873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294662
4622	NC_013946	GCA	2	6	229931	229936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294663
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4624	NC_013946	C	6	6	230053	230058	0 %	0 %	0 %	100 %	291294663
4625	NC_013946	GGC	2	6	230075	230080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294663
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4629	NC_013946	TGG	2	6	230192	230197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294663
4630	NC_013946	TGG	2	6	230201	230206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294663
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4652	NC_013946	TCG	2	6	231135	231140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294664
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4656	NC_013946	GCCC	2	8	231366	231373	0 %	0 %	25 %	75 %	291294664
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4685	NC_013946	G	6	6	233064	233069	0 %	0 %	100 %	0 %	291294666
4686	NC_013946	CCA	2	6	233088	233093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294666
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4739	NC_013946	CGGCG	2	10	235757	235766	0 %	0 %	60 %	40 %	291294670
4740	NC_013946	AAC	2	6	235788	235793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294670
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4980	NC_013946	CCCA	2	8	246655	246662	25 %	0 %	0 %	75 %	291294681
4981	NC_013946	GCT	2	6	246666	246671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294681
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4983	NC_013946	AGC	2	6	246781	246786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294681
4984	NC_013946	CGG	2	6	246802	246807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294681
4985	NC_013946	GCCA	2	8	246831	246838	25 %	0 %	25 %	50 %	291294681
4986	NC_013946	TTGCGG	2	12	246845	246856	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291294681
4987	NC_013946	G	7	7	246883	246889	0 %	0 %	100 %	0 %	291294682
4988	NC_013946	CCA	2	6	246928	246933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294682
4989	NC_013946	GGCCTT	2	12	246956	246967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294682
4990	NC_013946	GAT	2	6	246968	246973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294682
4991	NC_013946	CCA	2	6	246979	246984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294682
4992	NC_013946	TGGCC	2	10	246985	246994	0 %	20 %	40 %	40 %	291294682
4993	NC_013946	GGT	2	6	247019	247024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294682
4994	NC_013946	GTC	2	6	247058	247063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294682
4995	NC_013946	CAC	2	6	247070	247075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294682
4996	NC_013946	G	6	6	247166	247171	0 %	0 %	100 %	0 %	291294682
4997	NC_013946	CTC	2	6	247172	247177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294682
4998	NC_013946	GGCC	2	8	247195	247202	0 %	0 %	50 %	50 %	291294682
4999	NC_013946	C	6	6	247207	247212	0 %	0 %	0 %	100 %	291294682
5000	NC_013946	GCT	2	6	247213	247218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294682

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