MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 41352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013887	CTATC	2	10	257468	257477	20 %	40 %	0 %	40 %	289191747
6002	NC_013887	TTTC	2	8	257543	257550	0 %	75 %	0 %	25 %	289191747
6003	NC_013887	AATT	2	8	257553	257560	50 %	50 %	0 %	0 %	289191747
6004	NC_013887	TCC	2	6	257565	257570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191747
6005	NC_013887	TCA	2	6	257578	257583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191747
6006	NC_013887	AAT	2	6	257621	257626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191747
6007	NC_013887	ACC	2	6	257663	257668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191747
6008	NC_013887	TCG	2	6	257686	257691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191747
6009	NC_013887	TAA	2	6	257730	257735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191747
6010	NC_013887	CAATA	2	10	257760	257769	60 %	20 %	0 %	20 %	289191747
6011	NC_013887	TACAC	2	10	257804	257813	40 %	20 %	0 %	40 %	289191747
6012	NC_013887	TAT	2	6	257972	257977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191748
6013	NC_013887	TTA	2	6	258001	258006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191748
6014	NC_013887	ATT	2	6	258026	258031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191748
6015	NC_013887	GTT	2	6	258069	258074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191748
6016	NC_013887	GTA	2	6	258076	258081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191748
6017	NC_013887	CGA	2	6	258103	258108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191748
6018	NC_013887	ACT	2	6	258162	258167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191748
6019	NC_013887	ACCATC	2	12	258206	258217	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	289191748
6020	NC_013887	AT	3	6	258227	258232	50 %	50 %	0 %	0 %	289191748
6021	NC_013887	CAC	2	6	258246	258251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191748
6022	NC_013887	TGT	2	6	258275	258280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191748
6023	NC_013887	TTGA	2	8	258313	258320	25 %	50 %	25 %	0 %	289191748
6024	NC_013887	TCT	2	6	258388	258393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191748
6025	NC_013887	CAA	2	6	258409	258414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191748
6026	NC_013887	CAT	3	9	258436	258444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191748
6027	NC_013887	TTG	2	6	258529	258534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191748
6028	NC_013887	TATT	2	8	258553	258560	25 %	75 %	0 %	0 %	289191748
6029	NC_013887	ACT	2	6	258606	258611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191748
6030	NC_013887	T	6	6	258693	258698	0 %	100 %	0 %	0 %	289191748
6031	NC_013887	ATT	2	6	258708	258713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191748
6032	NC_013887	TGT	2	6	258716	258721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191748
6033	NC_013887	CTA	2	6	258733	258738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191748
6034	NC_013887	GTTAA	2	10	258780	258789	40 %	40 %	20 %	0 %	289191748
6035	NC_013887	AGT	2	6	258790	258795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191748
6036	NC_013887	CTT	2	6	258874	258879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191748
6037	NC_013887	TGC	2	6	258893	258898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191748
6038	NC_013887	TCA	2	6	258982	258987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191748
6039	NC_013887	AAG	2	6	259167	259172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191748
6040	NC_013887	TTAT	2	8	259194	259201	25 %	75 %	0 %	0 %	289191748
6041	NC_013887	CTG	2	6	259237	259242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191748
6042	NC_013887	CTG	2	6	259246	259251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191748
6043	NC_013887	TTA	2	6	259345	259350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191748
6044	NC_013887	TGTA	2	8	259428	259435	25 %	50 %	25 %	0 %	289191748
6045	NC_013887	AGT	2	6	259499	259504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191748
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6047	NC_013887	TGT	2	6	259531	259536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191748
6048	NC_013887	TGT	2	6	259594	259599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191748
6049	NC_013887	AT	3	6	259608	259613	50 %	50 %	0 %	0 %	289191748
6050	NC_013887	TTATA	2	10	259669	259678	40 %	60 %	0 %	0 %	289191748
6051	NC_013887	ATA	2	6	259685	259690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191748
6052	NC_013887	TACA	2	8	259694	259701	50 %	25 %	0 %	25 %	289191748
6053	NC_013887	TTA	2	6	259750	259755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191748
6054	NC_013887	CTAAT	2	10	260038	260047	40 %	40 %	0 %	20 %	289191749
6055	NC_013887	TTCC	2	8	260058	260065	0 %	50 %	0 %	50 %	289191749
6056	NC_013887	TTA	2	6	260088	260093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191749
6057	NC_013887	CAA	2	6	260118	260123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191749
6058	NC_013887	TGC	2	6	260254	260259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191749
6059	NC_013887	TTATT	2	10	260343	260352	20 %	80 %	0 %	0 %	289191749
6060	NC_013887	ACT	2	6	260396	260401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191749
6061	NC_013887	AT	3	6	260485	260490	50 %	50 %	0 %	0 %	289191749
6062	NC_013887	ATT	2	6	260576	260581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191749
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6065	NC_013887	CAA	2	6	260688	260693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191749
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6069	NC_013887	TTA	2	6	261075	261080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191749
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6073	NC_013887	CTG	2	6	261186	261191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289191749
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6078	NC_013887	CT	3	6	261356	261361	0 %	50 %	0 %	50 %	289191749
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6091	NC_013887	AATA	2	8	262109	262116	75 %	25 %	0 %	0 %	289191750
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6098	NC_013887	CATG	2	8	262462	262469	25 %	25 %	25 %	25 %	289191750
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6107	NC_013887	TC	3	6	262755	262760	0 %	50 %	0 %	50 %	289191750
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6116	NC_013887	TA	3	6	263059	263064	50 %	50 %	0 %	0 %	289191750
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6121	NC_013887	T	6	6	263331	263336	0 %	100 %	0 %	0 %	289191751
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6239	NC_013887	GTT	2	6	268577	268582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191756
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6243	NC_013887	CTATG	2	10	268732	268741	20 %	40 %	20 %	20 %	289191756
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