MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 41352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_013887	ATA	2	6	238511	238516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191738
5503	NC_013887	ATTTT	2	10	238538	238547	20 %	80 %	0 %	0 %	289191738
5504	NC_013887	TTC	2	6	238570	238575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191738
5505	NC_013887	CAA	2	6	238587	238592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191738
5506	NC_013887	GTT	3	9	238706	238714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191738
5507	NC_013887	AAC	2	6	238720	238725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191738
5508	NC_013887	AAT	2	6	238746	238751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191738
5509	NC_013887	CAA	2	6	238815	238820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191738
5510	NC_013887	T	6	6	238829	238834	0 %	100 %	0 %	0 %	289191738
5511	NC_013887	T	6	6	238926	238931	0 %	100 %	0 %	0 %	289191739
5512	NC_013887	TTA	2	6	238964	238969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191739
5513	NC_013887	CT	3	6	238985	238990	0 %	50 %	0 %	50 %	289191739
5514	NC_013887	AGT	3	9	239022	239030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191739
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5517	NC_013887	ATA	2	6	239168	239173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191739
5518	NC_013887	T	6	6	239197	239202	0 %	100 %	0 %	0 %	289191739
5519	NC_013887	T	6	6	239211	239216	0 %	100 %	0 %	0 %	289191739
5520	NC_013887	TAA	2	6	239229	239234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191739
5521	NC_013887	TTAAT	2	10	239346	239355	40 %	60 %	0 %	0 %	289191739
5522	NC_013887	AAT	2	6	239371	239376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191739
5523	NC_013887	CCT	2	6	239379	239384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191739
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5525	NC_013887	AT	3	6	239528	239533	50 %	50 %	0 %	0 %	289191739
5526	NC_013887	CTAT	2	8	239540	239547	25 %	50 %	0 %	25 %	289191739
5527	NC_013887	TATT	2	8	239559	239566	25 %	75 %	0 %	0 %	289191739
5528	NC_013887	CTC	4	12	239593	239604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191739
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5534	NC_013887	CT	3	6	239819	239824	0 %	50 %	0 %	50 %	289191739
5535	NC_013887	CAG	2	6	239856	239861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191739
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5539	NC_013887	TCC	2	6	239944	239949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191739
5540	NC_013887	CT	3	6	240006	240011	0 %	50 %	0 %	50 %	289191739
5541	NC_013887	ATTTA	2	10	240100	240109	40 %	60 %	0 %	0 %	289191739
5542	NC_013887	AT	3	6	240232	240237	50 %	50 %	0 %	0 %	289191739
5543	NC_013887	T	6	6	240237	240242	0 %	100 %	0 %	0 %	289191739
5544	NC_013887	TAAA	2	8	240252	240259	75 %	25 %	0 %	0 %	289191739
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5547	NC_013887	ATG	2	6	240420	240425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191739
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5554	NC_013887	ATATC	2	10	240806	240815	40 %	40 %	0 %	20 %	289191739
5555	NC_013887	T	6	6	240842	240847	0 %	100 %	0 %	0 %	289191739
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5562	NC_013887	AT	5	10	241113	241122	50 %	50 %	0 %	0 %	289191739
5563	NC_013887	AAC	2	6	241136	241141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191739
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5565	NC_013887	T	6	6	241213	241218	0 %	100 %	0 %	0 %	289191739
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5571	NC_013887	TAC	2	6	241592	241597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191740
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5594	NC_013887	ATTTAA	2	12	242359	242370	50 %	50 %	0 %	0 %	289191742
5595	NC_013887	TCTT	2	8	242382	242389	0 %	75 %	0 %	25 %	289191742
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5601	NC_013887	AG	3	6	242593	242598	50 %	0 %	50 %	0 %	289191742
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5607	NC_013887	ATAA	2	8	242857	242864	75 %	25 %	0 %	0 %	289191742
5608	NC_013887	CTT	2	6	242877	242882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191742
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5610	NC_013887	TTA	2	6	242909	242914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191742
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5612	NC_013887	TA	3	6	242982	242987	50 %	50 %	0 %	0 %	289191742
5613	NC_013887	AAT	2	6	243085	243090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191742
5614	NC_013887	TCTT	2	8	243113	243120	0 %	75 %	0 %	25 %	289191742
5615	NC_013887	T	6	6	243166	243171	0 %	100 %	0 %	0 %	289191742
5616	NC_013887	TA	3	6	243202	243207	50 %	50 %	0 %	0 %	289191742
5617	NC_013887	T	7	7	243230	243236	0 %	100 %	0 %	0 %	289191742
5618	NC_013887	AAGA	2	8	243270	243277	75 %	0 %	25 %	0 %	289191742
5619	NC_013887	AAAAT	3	15	243346	243360	80 %	20 %	0 %	0 %	289191742
5620	NC_013887	CTATAG	2	12	243406	243417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289191743
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5622	NC_013887	TAAA	2	8	243434	243441	75 %	25 %	0 %	0 %	289191743
5623	NC_013887	AAT	2	6	243474	243479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191743
5624	NC_013887	ATT	2	6	243543	243548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191743
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5999	NC_013887	TCC	2	6	257382	257387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191747
6000	NC_013887	TAT	2	6	257406	257411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191747

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