MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 1217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012970	GATC	2	8	365	372	25 %	25 %	25 %	25 %	254003129
2	NC_012970	TCA	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
3	NC_012970	TCA	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
4	NC_012970	ACT	2	6	495	500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
5	NC_012970	GAT	2	6	600	605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003129
6	NC_012970	TGTT	2	8	622	629	0 %	75 %	25 %	0 %	254003129
7	NC_012970	TG	3	6	653	658	0 %	50 %	50 %	0 %	254003129
8	NC_012970	GCA	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003129
9	NC_012970	CAT	2	6	723	728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003129
10	NC_012970	TC	3	6	928	933	0 %	50 %	0 %	50 %	254003129
11	NC_012970	CAG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003129
12	NC_012970	ACTATG	2	12	1071	1082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254003129
13	NC_012970	CGG	2	6	1123	1128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003129
14	NC_012970	GAA	2	6	1212	1217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003129
15	NC_012970	AGT	2	6	1225	1230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003129
16	NC_012970	T	6	6	1267	1272	0 %	100 %	0 %	0 %	254003129
17	NC_012970	TCT	2	6	1274	1279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003129
18	NC_012970	ACA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003129
19	NC_012970	CTT	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003129
20	NC_012970	GGAT	2	8	1415	1422	25 %	25 %	50 %	0 %	254003129
21	NC_012970	AAG	2	6	1458	1463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003129
22	NC_012970	CTG	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003130
23	NC_012970	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003130
24	NC_012970	TCT	2	6	1691	1696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003130
25	NC_012970	TGT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003131
26	NC_012970	TTG	2	6	1949	1954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003131
27	NC_012970	AACC	2	8	2033	2040	50 %	0 %	0 %	50 %	254003131
28	NC_012970	GAT	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
29	NC_012970	TCA	2	6	2100	2105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003131
30	NC_012970	TAAA	2	8	2190	2197	75 %	25 %	0 %	0 %	254003131
31	NC_012970	ACT	2	6	2198	2203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003131
32	NC_012970	GTT	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003131
33	NC_012970	TGTATT	2	12	2264	2275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	254003131
34	NC_012970	TAT	2	6	2281	2286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003131
35	NC_012970	AGG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003131
36	NC_012970	ATG	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
37	NC_012970	GAGATT	2	12	2407	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
38	NC_012970	GCA	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003131
39	NC_012970	AACT	2	8	2564	2571	50 %	25 %	0 %	25 %	254003131
40	NC_012970	GTA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
41	NC_012970	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003131
42	NC_012970	AGT	2	6	2824	2829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003131
43	NC_012970	TGC	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003131
44	NC_012970	TCTT	2	8	3208	3215	0 %	75 %	0 %	25 %	254003132
45	NC_012970	TC	3	6	3268	3273	0 %	50 %	0 %	50 %	254003132
46	NC_012970	TC	3	6	3513	3518	0 %	50 %	0 %	50 %	254003133
47	NC_012970	GA	3	6	3581	3586	50 %	0 %	50 %	0 %	254003133
48	NC_012970	GAAT	2	8	3592	3599	50 %	25 %	25 %	0 %	254003133
49	NC_012970	A	7	7	4150	4156	100 %	0 %	0 %	0 %	254003134
50	NC_012970	A	6	6	4195	4200	100 %	0 %	0 %	0 %	254003134
51	NC_012970	GCTGAA	2	12	4475	4486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254003134
52	NC_012970	A	7	7	4498	4504	100 %	0 %	0 %	0 %	254003134
53	NC_012970	ATTC	2	8	4524	4531	25 %	50 %	0 %	25 %	254003134
54	NC_012970	ACT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003134
55	NC_012970	AC	3	6	4574	4579	50 %	0 %	0 %	50 %	254003134
56	NC_012970	TAC	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003134
57	NC_012970	TGG	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003134
58	NC_012970	AGTTC	2	10	4864	4873	20 %	40 %	20 %	20 %	254003134
59	NC_012970	ATTG	2	8	4921	4928	25 %	50 %	25 %	0 %	254003134
60	NC_012970	TTG	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003134
61	NC_012970	CGG	2	6	5079	5084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003134
62	NC_012970	GAA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003134
63	NC_012970	GAA	3	9	5179	5187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003134
64	NC_012970	ATC	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003134
65	NC_012970	GCG	2	6	5263	5268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003134
66	NC_012970	CAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003134
67	NC_012970	A	6	6	5332	5337	100 %	0 %	0 %	0 %	254003134
68	NC_012970	TGGGG	2	10	5396	5405	0 %	20 %	80 %	0 %	254003134
69	NC_012970	TGA	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003135
70	NC_012970	TTGC	2	8	5733	5740	0 %	50 %	25 %	25 %	254003135
71	NC_012970	TGC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003135
72	NC_012970	T	6	6	5871	5876	0 %	100 %	0 %	0 %	254003135
73	NC_012970	AAAT	2	8	5981	5988	75 %	25 %	0 %	0 %	254003135
74	NC_012970	AGC	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003136
75	NC_012970	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003136
76	NC_012970	AAT	2	6	6209	6214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003136
77	NC_012970	ATA	2	6	6261	6266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003136
78	NC_012970	AT	3	6	6279	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	254003136
79	NC_012970	ACT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003136
80	NC_012970	TGC	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003136
81	NC_012970	ACT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003136
82	NC_012970	CAC	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003136
83	NC_012970	ACCA	2	8	6510	6517	50 %	0 %	0 %	50 %	254003136
84	NC_012970	TGCT	2	8	6590	6597	0 %	50 %	25 %	25 %	254003136
85	NC_012970	CCT	2	6	6760	6765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254003136
86	NC_012970	GCA	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003136
87	NC_012970	CTT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003136
88	NC_012970	TCCT	2	8	6891	6898	0 %	50 %	0 %	50 %	254003136
89	NC_012970	GAA	2	6	6914	6919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003136
90	NC_012970	AAAGG	2	10	7009	7018	60 %	0 %	40 %	0 %	254003136
91	NC_012970	TGTT	2	8	7036	7043	0 %	75 %	25 %	0 %	254003136
92	NC_012970	TACGT	2	10	7118	7127	20 %	40 %	20 %	20 %	254003137
93	NC_012970	CAT	2	6	7207	7212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003137
94	NC_012970	GA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	50 %	0 %	254003137
95	NC_012970	TGC	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003137
96	NC_012970	AATG	2	8	7256	7263	50 %	25 %	25 %	0 %	254003137
97	NC_012970	GCTT	2	8	7269	7276	0 %	50 %	25 %	25 %	254003137
98	NC_012970	TGA	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003137
99	NC_012970	GCG	2	6	7323	7328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003137
100	NC_012970	TTG	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003137
101	NC_012970	TGCT	3	12	7428	7439	0 %	50 %	25 %	25 %	254003137
102	NC_012970	CAA	2	6	7546	7551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003137
103	NC_012970	TTA	2	6	7575	7580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003137
104	NC_012970	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003137
105	NC_012970	TTTA	2	8	7610	7617	25 %	75 %	0 %	0 %	254003137
106	NC_012970	CTGC	2	8	7621	7628	0 %	25 %	25 %	50 %	254003137
107	NC_012970	TCT	2	6	7672	7677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003137
108	NC_012970	GCC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003137
109	NC_012970	TTC	2	6	7697	7702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003137
110	NC_012970	A	6	6	7918	7923	100 %	0 %	0 %	0 %	254003138
111	NC_012970	CTT	2	6	7988	7993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003138
112	NC_012970	TCA	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003138
113	NC_012970	ATC	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003138
114	NC_012970	GTA	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003138
115	NC_012970	CAG	2	6	8329	8334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003138
116	NC_012970	GCT	2	6	8353	8358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003138
117	NC_012970	CAG	2	6	8482	8487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003138
118	NC_012970	T	6	6	8618	8623	0 %	100 %	0 %	0 %	254003138
119	NC_012970	GCC	2	6	8829	8834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003139
120	NC_012970	TCG	2	6	8927	8932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003139
121	NC_012970	CGC	2	6	8951	8956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003139
122	NC_012970	AGG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003139
123	NC_012970	TTG	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003139
124	NC_012970	GCC	2	6	9096	9101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003139
125	NC_012970	CTT	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003139
126	NC_012970	TTC	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003139
127	NC_012970	TGA	2	6	9283	9288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003139
128	NC_012970	AT	3	6	9414	9419	50 %	50 %	0 %	0 %	254003139
129	NC_012970	TAA	2	6	10412	10417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003140
130	NC_012970	A	6	6	10536	10541	100 %	0 %	0 %	0 %	254003140
131	NC_012970	AAG	2	6	10596	10601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003140
132	NC_012970	TCT	2	6	10698	10703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003141
133	NC_012970	GTA	2	6	10748	10753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003141
134	NC_012970	AT	5	10	10764	10773	50 %	50 %	0 %	0 %	254003141
135	NC_012970	TTTC	2	8	10777	10784	0 %	75 %	0 %	25 %	254003141
136	NC_012970	GTC	2	6	10807	10812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003141
137	NC_012970	TAA	2	6	10962	10967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003141
138	NC_012970	TGAT	2	8	10979	10986	25 %	50 %	25 %	0 %	254003141
139	NC_012970	AAG	2	6	11024	11029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003141
140	NC_012970	AGA	2	6	11080	11085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003141
141	NC_012970	TGC	2	6	11172	11177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
142	NC_012970	GAGCT	2	10	11180	11189	20 %	20 %	40 %	20 %	254003142
143	NC_012970	CGA	2	6	11272	11277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003142
144	NC_012970	TCG	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
145	NC_012970	A	7	7	11309	11315	100 %	0 %	0 %	0 %	254003142
146	NC_012970	TGAA	2	8	11316	11323	50 %	25 %	25 %	0 %	254003142
147	NC_012970	CTG	2	6	11457	11462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
148	NC_012970	ATGGC	2	10	11520	11529	20 %	20 %	40 %	20 %	254003142
149	NC_012970	AG	3	6	11581	11586	50 %	0 %	50 %	0 %	254003142
150	NC_012970	ATG	2	6	11610	11615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003142
151	NC_012970	GAA	2	6	11699	11704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003142
152	NC_012970	GCAA	2	8	11771	11778	50 %	0 %	25 %	25 %	254003142
153	NC_012970	ATG	2	6	11811	11816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003142
154	NC_012970	TGCTGA	2	12	11839	11850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254003142
155	NC_012970	GCG	2	6	11886	11891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003142
156	NC_012970	GGT	2	6	11893	11898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003142
157	NC_012970	TAT	2	6	11974	11979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003142
158	NC_012970	GCT	2	6	11981	11986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003142
159	NC_012970	GAA	2	6	12121	12126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003142
160	NC_012970	ATC	2	6	12283	12288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003143
161	NC_012970	GAC	2	6	12301	12306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
162	NC_012970	ACA	2	6	12333	12338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003143
163	NC_012970	ATTC	2	8	12344	12351	25 %	50 %	0 %	25 %	254003143
164	NC_012970	AT	3	6	12376	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	254003143
165	NC_012970	A	6	6	12426	12431	100 %	0 %	0 %	0 %	254003143
166	NC_012970	CGG	2	6	12471	12476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003143
167	NC_012970	AGA	2	6	12517	12522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003143
168	NC_012970	GCA	2	6	12590	12595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003143
169	NC_012970	CAT	2	6	12637	12642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003143
170	NC_012970	GGT	2	6	12817	12822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003143
171	NC_012970	GA	3	6	12849	12854	50 %	0 %	50 %	0 %	254003143
172	NC_012970	A	6	6	12860	12865	100 %	0 %	0 %	0 %	254003143
173	NC_012970	GGGC	2	8	12878	12885	0 %	0 %	75 %	25 %	254003143
174	NC_012970	TTCC	2	8	12965	12972	0 %	50 %	0 %	50 %	254003143
175	NC_012970	AAT	2	6	13027	13032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003143
176	NC_012970	GGT	2	6	13040	13045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003143
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189	NC_012970	TTGC	2	8	13871	13878	0 %	50 %	25 %	25 %	254003143
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194	NC_012970	GAAG	2	8	14186	14193	50 %	0 %	50 %	0 %	254003143
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209	NC_012970	GCTT	2	8	15399	15406	0 %	50 %	25 %	25 %	254003144
210	NC_012970	GGA	2	6	15421	15426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003144
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214	NC_012970	AAAG	2	8	15861	15868	75 %	0 %	25 %	0 %	254003145
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222	NC_012970	CCA	2	6	16342	16347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003146
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231	NC_012970	TCA	2	6	17169	17174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003146
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240	NC_012970	AGGG	2	8	17845	17852	25 %	0 %	75 %	0 %	254003147
241	NC_012970	CCG	2	6	17898	17903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003147
242	NC_012970	TGT	2	6	17922	17927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003147
243	NC_012970	CGTT	2	8	17960	17967	0 %	50 %	25 %	25 %	254003147
244	NC_012970	GGC	2	6	18026	18031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003148
245	NC_012970	AAG	2	6	18065	18070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003148
246	NC_012970	TCA	2	6	18113	18118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003148
247	NC_012970	GAT	2	6	18180	18185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003148
248	NC_012970	CTT	2	6	18241	18246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003148
249	NC_012970	TTGG	2	8	18299	18306	0 %	50 %	50 %	0 %	254003148
250	NC_012970	ATAG	2	8	18337	18344	50 %	25 %	25 %	0 %	254003148
251	NC_012970	AAT	2	6	18355	18360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003148
252	NC_012970	GCTTC	2	10	18370	18379	0 %	40 %	20 %	40 %	254003148
253	NC_012970	CAG	2	6	18625	18630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003148
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255	NC_012970	GGC	2	6	18763	18768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003149
256	NC_012970	T	7	7	18808	18814	0 %	100 %	0 %	0 %	254003149
257	NC_012970	ATGGG	2	10	18829	18838	20 %	20 %	60 %	0 %	254003149
258	NC_012970	ACTT	2	8	18847	18854	25 %	50 %	0 %	25 %	254003149
259	NC_012970	T	6	6	18942	18947	0 %	100 %	0 %	0 %	254003149
260	NC_012970	TA	3	6	18997	19002	50 %	50 %	0 %	0 %	254003149
261	NC_012970	T	7	7	19107	19113	0 %	100 %	0 %	0 %	254003149
262	NC_012970	CAG	2	6	19114	19119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003149
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391	NC_012970	CT	4	8	27525	27532	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
392	NC_012970	ACC	2	6	27535	27540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003162
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394	NC_012970	AAT	2	6	27636	27641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003162
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397	NC_012970	ATTG	2	8	27693	27700	25 %	50 %	25 %	0 %	254003162
398	NC_012970	CT	3	6	27740	27745	0 %	50 %	0 %	50 %	254003162
399	NC_012970	AAG	2	6	27819	27824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003162
400	NC_012970	TGG	2	6	27866	27871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003162
401	NC_012970	GGTA	2	8	27942	27949	25 %	25 %	50 %	0 %	254003162
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411	NC_012970	TTC	2	6	28397	28402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003163
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423	NC_012970	GCA	2	6	29350	29355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003164
424	NC_012970	CCT	2	6	29363	29368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254003164
425	NC_012970	ATC	2	6	29403	29408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003164
426	NC_012970	CTT	2	6	29417	29422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003164
427	NC_012970	GGA	2	6	29458	29463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003164
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498	NC_012970	TAA	2	6	33278	33283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003166
499	NC_012970	ACCTC	2	10	33313	33322	20 %	20 %	0 %	60 %	254003166
500	NC_012970	TC	3	6	33328	33333	0 %	50 %	0 %	50 %	254003166

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