MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 100029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012207	CGG	3	9	48540	48548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988427
1002	NC_012207	GCAGC	2	10	48581	48590	20 %	0 %	40 %	40 %	224988427
1003	NC_012207	GTC	2	6	48597	48602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988427
1004	NC_012207	GGC	2	6	48605	48610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988427
1005	NC_012207	TCG	2	6	48640	48645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988427
1006	NC_012207	CCCGA	2	10	48664	48673	20 %	0 %	20 %	60 %	224988427
1007	NC_012207	GCCG	2	8	48686	48693	0 %	0 %	50 %	50 %	224988427
1008	NC_012207	AGC	2	6	48730	48735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988427
1009	NC_012207	AAG	2	6	48862	48867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988427
1010	NC_012207	CGG	2	6	48910	48915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988427
1011	NC_012207	G	6	6	48941	48946	0 %	0 %	100 %	0 %	224988427
1012	NC_012207	TGC	2	6	48949	48954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988427
1013	NC_012207	GT	3	6	49031	49036	0 %	50 %	50 %	0 %	224988428
1014	NC_012207	GC	3	6	49066	49071	0 %	0 %	50 %	50 %	224988428
1015	NC_012207	CGA	2	6	49106	49111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988428
1016	NC_012207	CGG	2	6	49151	49156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988428
1017	NC_012207	CGA	2	6	49179	49184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988428
1018	NC_012207	GCC	2	6	49185	49190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988428
1019	NC_012207	CGT	2	6	49226	49231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988428
1020	NC_012207	CGG	2	6	49303	49308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988428
1021	NC_012207	CGC	2	6	49322	49327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988428
1022	NC_012207	GCT	2	6	49436	49441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988428
1023	NC_012207	CGG	2	6	49442	49447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988428
1024	NC_012207	CGA	2	6	49487	49492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988428
1025	NC_012207	GCG	2	6	49631	49636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988428
1026	NC_012207	TCC	2	6	49648	49653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988428
1027	NC_012207	CGA	2	6	49712	49717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988428
1028	NC_012207	CCG	3	9	49747	49755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988428
1029	NC_012207	GCC	2	6	49782	49787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988428
1030	NC_012207	CAGCG	2	10	49789	49798	20 %	0 %	40 %	40 %	224988428
1031	NC_012207	CAGC	2	8	49871	49878	25 %	0 %	25 %	50 %	224988428
1032	NC_012207	TCG	2	6	49906	49911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988428
1033	NC_012207	GAT	2	6	50010	50015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988429
1034	NC_012207	GC	5	10	50030	50039	0 %	0 %	50 %	50 %	224988429
1035	NC_012207	GTC	2	6	50043	50048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988429
1036	NC_012207	GCT	2	6	50054	50059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988429
1037	NC_012207	CGGG	2	8	50060	50067	0 %	0 %	75 %	25 %	224988429
1038	NC_012207	TCA	2	6	50072	50077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988429
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1040	NC_012207	GCC	2	6	50134	50139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988429
1041	NC_012207	GAT	2	6	50151	50156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988429
1042	NC_012207	GCCG	2	8	50160	50167	0 %	0 %	50 %	50 %	224988429
1043	NC_012207	TCG	2	6	50263	50268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988429
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1046	NC_012207	CGC	2	6	50450	50455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988429
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1048	NC_012207	TCG	2	6	50492	50497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988429
1049	NC_012207	TCA	2	6	50518	50523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988429
1050	NC_012207	CGA	2	6	50525	50530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988429
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1052	NC_012207	TCC	2	6	50653	50658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988429
1053	NC_012207	CCT	2	6	50699	50704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988429
1054	NC_012207	GAC	2	6	50715	50720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988429
1055	NC_012207	GGT	2	6	50748	50753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988429
1056	NC_012207	GTA	2	6	50760	50765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988429
1057	NC_012207	GTT	2	6	50841	50846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988429
1058	NC_012207	CTT	2	6	50886	50891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988429
1059	NC_012207	CGC	2	6	50907	50912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988429
1060	NC_012207	GTC	2	6	50982	50987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988429
1061	NC_012207	GTA	3	9	50994	51002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988429
1062	NC_012207	GCCGAC	2	12	51036	51047	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	224988429
1063	NC_012207	CTCA	2	8	51099	51106	25 %	25 %	0 %	50 %	224988429
1064	NC_012207	CGG	2	6	51179	51184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988430
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1067	NC_012207	CTG	2	6	51295	51300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988430
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1070	NC_012207	CGT	2	6	51425	51430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988430
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1109	NC_012207	CG	3	6	53903	53908	0 %	0 %	50 %	50 %	224988433
1110	NC_012207	AAC	2	6	53919	53924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988433
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1124	NC_012207	GCG	2	6	54330	54335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988433
1125	NC_012207	GCC	2	6	54356	54361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988433
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1129	NC_012207	GCG	2	6	54519	54524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988433
1130	NC_012207	GCC	2	6	54573	54578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988433
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1231	NC_012207	GCGG	2	8	58816	58823	0 %	0 %	75 %	25 %	224988437
1232	NC_012207	AGC	2	6	58828	58833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988437
1233	NC_012207	TCGAGG	2	12	58873	58884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	224988437
1234	NC_012207	CTTCG	2	10	58900	58909	0 %	40 %	20 %	40 %	224988437
1235	NC_012207	CAA	2	6	58928	58933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988437
1236	NC_012207	GCG	2	6	58945	58950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988437
1237	NC_012207	CCGGCG	2	12	58971	58982	0 %	0 %	50 %	50 %	224988437
1238	NC_012207	CAG	2	6	58988	58993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988437
1239	NC_012207	GTTC	2	8	59035	59042	0 %	50 %	25 %	25 %	224988437
1240	NC_012207	GGC	3	9	59043	59051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988437
1241	NC_012207	GCG	2	6	59131	59136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988438
1242	NC_012207	GAA	2	6	59185	59190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988438
1243	NC_012207	AGCG	2	8	59240	59247	25 %	0 %	50 %	25 %	224988438
1244	NC_012207	CG	4	8	59258	59265	0 %	0 %	50 %	50 %	224988438
1245	NC_012207	GCA	2	6	59287	59292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988438
1246	NC_012207	GAA	2	6	59317	59322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988438
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1248	NC_012207	CG	3	6	59495	59500	0 %	0 %	50 %	50 %	224988439
1249	NC_012207	TCG	2	6	59510	59515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988439
1250	NC_012207	CG	3	6	59519	59524	0 %	0 %	50 %	50 %	224988439
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1375	NC_012207	AACC	2	8	64660	64667	50 %	0 %	0 %	50 %	224988443
1376	NC_012207	ACT	2	6	64678	64683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988443
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1495	NC_012207	ACC	2	6	70766	70771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988447
1496	NC_012207	CGACC	2	10	70795	70804	20 %	0 %	20 %	60 %	224988447
1497	NC_012207	ACG	2	6	70806	70811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988447
1498	NC_012207	CCG	2	6	70826	70831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988447
1499	NC_012207	TCG	2	6	70842	70847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988447
1500	NC_012207	CAG	2	6	70853	70858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988447

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