MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 100029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012207	CCCA	2	8	608799	608806	25 %	0 %	0 %	75 %	224988905
14002	NC_012207	GCT	2	6	608948	608953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988905
14003	NC_012207	GCG	2	6	608977	608982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988905
14004	NC_012207	ACCC	2	8	609004	609011	25 %	0 %	0 %	75 %	224988905
14005	NC_012207	GAT	2	6	609038	609043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988905
14006	NC_012207	ATCGC	2	10	609082	609091	20 %	20 %	20 %	40 %	224988905
14007	NC_012207	CGC	2	6	609113	609118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988905
14008	NC_012207	GC	3	6	609125	609130	0 %	0 %	50 %	50 %	224988905
14009	NC_012207	CCG	2	6	609148	609153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988905
14010	NC_012207	CAC	2	6	609175	609180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988905
14011	NC_012207	ACG	2	6	609190	609195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988905
14012	NC_012207	CCG	2	6	609201	609206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988905
14013	NC_012207	CTG	2	6	609219	609224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988906
14014	NC_012207	CGG	3	9	609246	609254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988906
14015	NC_012207	GC	3	6	609296	609301	0 %	0 %	50 %	50 %	224988906
14016	NC_012207	ACT	2	6	609357	609362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988906
14017	NC_012207	CGG	2	6	609394	609399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988906
14018	NC_012207	GGC	2	6	609536	609541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988906
14019	NC_012207	CAC	2	6	609563	609568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988906
14020	NC_012207	CGG	2	6	609619	609624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988906
14021	NC_012207	CGT	2	6	609638	609643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988906
14022	NC_012207	TCA	2	6	609682	609687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988906
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14024	NC_012207	GCC	2	6	609916	609921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
14025	NC_012207	CAG	2	6	609947	609952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988907
14026	NC_012207	GC	3	6	609976	609981	0 %	0 %	50 %	50 %	224988907
14027	NC_012207	TCG	2	6	610026	610031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
14028	NC_012207	CGG	2	6	610032	610037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988907
14029	NC_012207	CCGA	2	8	610060	610067	25 %	0 %	25 %	50 %	224988907
14030	NC_012207	GCG	2	6	610122	610127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988907
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14032	NC_012207	GGTC	2	8	610206	610213	0 %	25 %	50 %	25 %	224988907
14033	NC_012207	CTT	2	6	610228	610233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988907
14034	NC_012207	GCC	2	6	610286	610291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
14035	NC_012207	AGGC	2	8	610338	610345	25 %	0 %	50 %	25 %	224988907
14036	NC_012207	CTG	2	6	610379	610384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
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14038	NC_012207	TGGC	2	8	610538	610545	0 %	25 %	50 %	25 %	224988907
14039	NC_012207	CGT	2	6	610554	610559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
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14043	NC_012207	GCTG	2	8	610611	610618	0 %	25 %	50 %	25 %	224988907
14044	NC_012207	CGC	2	6	610639	610644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
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14050	NC_012207	GTTC	2	8	610816	610823	0 %	50 %	25 %	25 %	224988907
14051	NC_012207	CAA	2	6	610964	610969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988907
14052	NC_012207	CGT	2	6	611008	611013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
14053	NC_012207	TCG	2	6	611061	611066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
14054	NC_012207	GCC	2	6	611076	611081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
14055	NC_012207	GATG	2	8	611082	611089	25 %	25 %	50 %	0 %	224988907
14056	NC_012207	GCA	2	6	611148	611153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988907
14057	NC_012207	CGA	2	6	611167	611172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988907
14058	NC_012207	CG	3	6	611195	611200	0 %	0 %	50 %	50 %	224988907
14059	NC_012207	GTC	2	6	611389	611394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988908
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14062	NC_012207	GGGCC	2	10	611586	611595	0 %	0 %	60 %	40 %	224988908
14063	NC_012207	CGA	2	6	611661	611666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988908
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14119	NC_012207	GGC	2	6	614386	614391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988912
14120	NC_012207	TGGC	2	8	614409	614416	0 %	25 %	50 %	25 %	224988912
14121	NC_012207	TCG	2	6	614438	614443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
14122	NC_012207	CGG	2	6	614463	614468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988912
14123	NC_012207	TGA	5	15	614522	614536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988912
14124	NC_012207	CGA	2	6	614540	614545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988912
14125	NC_012207	GAGTTC	2	12	614572	614583	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224988912
14126	NC_012207	CCA	2	6	614606	614611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988912
14127	NC_012207	TCG	2	6	614612	614617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
14128	NC_012207	GCT	2	6	614652	614657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
14129	NC_012207	CATGG	2	10	614665	614674	20 %	20 %	40 %	20 %	224988912
14130	NC_012207	GC	3	6	614690	614695	0 %	0 %	50 %	50 %	224988912
14131	NC_012207	CTT	2	6	614703	614708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988912
14132	NC_012207	TCT	2	6	614753	614758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988912
14133	NC_012207	AGT	2	6	614775	614780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988912
14134	NC_012207	CGC	2	6	614787	614792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988912
14135	NC_012207	CG	3	6	614827	614832	0 %	0 %	50 %	50 %	224988912
14136	NC_012207	GGT	2	6	614841	614846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988912
14137	NC_012207	TCT	2	6	614861	614866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988912
14138	NC_012207	TCG	2	6	614867	614872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
14139	NC_012207	GATCA	2	10	614974	614983	40 %	20 %	20 %	20 %	224988912
14140	NC_012207	CGT	2	6	614991	614996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
14141	NC_012207	CGC	2	6	615063	615068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988912
14142	NC_012207	AGG	2	6	615074	615079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988912
14143	NC_012207	GTG	2	6	615145	615150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988912
14144	NC_012207	CATGG	2	10	615168	615177	20 %	20 %	40 %	20 %	224988912
14145	NC_012207	TCG	2	6	615214	615219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
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14147	NC_012207	GC	3	6	615391	615396	0 %	0 %	50 %	50 %	224988912
14148	NC_012207	CTG	2	6	615415	615420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
14149	NC_012207	CAC	2	6	615453	615458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988912
14150	NC_012207	TCG	2	6	615504	615509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988913
14151	NC_012207	GCC	2	6	615532	615537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988913
14152	NC_012207	GCT	2	6	615542	615547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988913
14153	NC_012207	GCC	2	6	615558	615563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988913
14154	NC_012207	GCC	2	6	615577	615582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988913
14155	NC_012207	GCG	2	6	615614	615619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988913
14156	NC_012207	CCG	2	6	615630	615635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988913
14157	NC_012207	TTC	2	6	615648	615653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988913
14158	NC_012207	CGCC	2	8	615694	615701	0 %	0 %	25 %	75 %	224988913
14159	NC_012207	GTACG	2	10	615738	615747	20 %	20 %	40 %	20 %	224988913
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14162	NC_012207	AGCC	2	8	615848	615855	25 %	0 %	25 %	50 %	224988913
14163	NC_012207	GCA	2	6	615989	615994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988914
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14165	NC_012207	CGG	2	6	616074	616079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988914
14166	NC_012207	CGG	2	6	616106	616111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988914
14167	NC_012207	GGC	2	6	616114	616119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988914
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14175	NC_012207	GCT	2	6	616445	616450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988914
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14188	NC_012207	TGA	2	6	616877	616882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988914
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14197	NC_012207	GGCA	2	8	617127	617134	25 %	0 %	50 %	25 %	224988914
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14201	NC_012207	CATGC	2	10	617224	617233	20 %	20 %	20 %	40 %	224988914
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14210	NC_012207	GCC	3	9	617487	617495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988915
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14236	NC_012207	GAC	2	6	618242	618247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988916
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14238	NC_012207	GT	3	6	618354	618359	0 %	50 %	50 %	0 %	224988916
14239	NC_012207	ACA	2	6	618384	618389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988916
14240	NC_012207	TCA	2	6	618411	618416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988916
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14242	NC_012207	CGG	2	6	618543	618548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988916
14243	NC_012207	GCTG	2	8	618565	618572	0 %	25 %	50 %	25 %	224988916
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14350	NC_012207	GCT	2	6	622356	622361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988920
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14354	NC_012207	GCT	2	6	622502	622507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988920
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14357	NC_012207	CGA	2	6	622809	622814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988920
14358	NC_012207	TGC	2	6	622883	622888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988920
14359	NC_012207	CGG	2	6	622901	622906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988920
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14363	NC_012207	GTC	2	6	623083	623088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988920
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14476	NC_012207	CGGC	2	8	625618	625625	0 %	0 %	50 %	50 %	224988922
14477	NC_012207	GCG	2	6	625630	625635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988922
14478	NC_012207	CGG	2	6	625640	625645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988922
14479	NC_012207	CAC	2	6	625735	625740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988923
14480	NC_012207	GGC	2	6	625744	625749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988923
14481	NC_012207	GTC	2	6	625811	625816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988923
14482	NC_012207	GCC	2	6	625847	625852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988923
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14484	NC_012207	CAG	2	6	625921	625926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988923
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14488	NC_012207	CG	3	6	626002	626007	0 %	0 %	50 %	50 %	224988923
14489	NC_012207	CCGA	2	8	626008	626015	25 %	0 %	25 %	50 %	224988923
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14497	NC_012207	GCC	2	6	626540	626545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988923
14498	NC_012207	TCG	3	9	626549	626557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988923
14499	NC_012207	GCG	2	6	626558	626563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988923
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