MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 100029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012207	CGG	2	6	24147	24152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988403
502	NC_012207	GCC	2	6	24160	24165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
503	NC_012207	GCTG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	224988403
504	NC_012207	CGTAGT	2	12	24228	24239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224988403
505	NC_012207	CGGC	2	8	24242	24249	0 %	0 %	50 %	50 %	224988403
506	NC_012207	GAG	2	6	24273	24278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988403
507	NC_012207	GCC	3	9	24325	24333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
508	NC_012207	GCCG	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	224988403
509	NC_012207	CGGG	2	8	24417	24424	0 %	0 %	75 %	25 %	224988403
510	NC_012207	CTC	2	6	24454	24459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988403
511	NC_012207	CCG	2	6	24494	24499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
512	NC_012207	GCC	2	6	24511	24516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
513	NC_012207	GCC	2	6	24535	24540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
514	NC_012207	GCCGG	2	10	24587	24596	0 %	0 %	60 %	40 %	224988403
515	NC_012207	AGG	2	6	24604	24609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988403
516	NC_012207	GCG	2	6	24624	24629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988403
517	NC_012207	C	6	6	24635	24640	0 %	0 %	0 %	100 %	224988403
518	NC_012207	CCTGGT	2	12	24666	24677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988403
519	NC_012207	GCC	2	6	24802	24807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
520	NC_012207	C	6	6	24823	24828	0 %	0 %	0 %	100 %	224988403
521	NC_012207	CCA	2	6	24860	24865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988403
522	NC_012207	GTC	2	6	24895	24900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988403
523	NC_012207	TCG	2	6	24908	24913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988403
524	NC_012207	GCCCCT	2	12	24918	24929	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	224988403
525	NC_012207	CGG	2	6	25024	25029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988403
526	NC_012207	CGA	2	6	25090	25095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988403
527	NC_012207	GAC	2	6	25108	25113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988403
528	NC_012207	ATG	2	6	25235	25240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988403
529	NC_012207	GCC	2	6	25292	25297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
530	NC_012207	GCA	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988403
531	NC_012207	GC	3	6	25901	25906	0 %	0 %	50 %	50 %	224988404
532	NC_012207	CGC	2	6	25924	25929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
533	NC_012207	TTG	2	6	25930	25935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988404
534	NC_012207	CGG	2	6	25956	25961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
535	NC_012207	CGG	2	6	25998	26003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
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540	NC_012207	GCC	2	6	26207	26212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
541	NC_012207	AGC	2	6	26213	26218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988404
542	NC_012207	CGG	2	6	26286	26291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
543	NC_012207	CGG	2	6	26307	26312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
544	NC_012207	CGG	2	6	26340	26345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
545	NC_012207	CG	3	6	26369	26374	0 %	0 %	50 %	50 %	224988404
546	NC_012207	CGA	2	6	26385	26390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988404
547	NC_012207	CCA	2	6	26457	26462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988404
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549	NC_012207	CGG	2	6	26535	26540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
550	NC_012207	AGC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988404
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552	NC_012207	GCG	2	6	26681	26686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
553	NC_012207	CCAA	2	8	26703	26710	50 %	0 %	0 %	50 %	224988404
554	NC_012207	GCC	2	6	26725	26730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
555	NC_012207	CAGC	2	8	26769	26776	25 %	0 %	25 %	50 %	224988404
556	NC_012207	CCG	2	6	26780	26785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
557	NC_012207	CAC	2	6	26857	26862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988404
558	NC_012207	CAC	2	6	27046	27051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988405
559	NC_012207	CAG	2	6	27094	27099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988405
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561	NC_012207	GCA	2	6	27153	27158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988405
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564	NC_012207	GCT	2	6	27273	27278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988405
565	NC_012207	GCG	2	6	27350	27355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988405
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567	NC_012207	CGGC	2	8	27589	27596	0 %	0 %	50 %	50 %	224988406
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569	NC_012207	GTG	2	6	27694	27699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988406
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573	NC_012207	CGC	2	6	27818	27823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988406
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575	NC_012207	GTC	2	6	27864	27869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988406
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579	NC_012207	CCGG	2	8	28075	28082	0 %	0 %	50 %	50 %	224988406
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581	NC_012207	GC	3	6	28120	28125	0 %	0 %	50 %	50 %	224988406
582	NC_012207	GTC	2	6	28181	28186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988406
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585	NC_012207	GC	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	224988406
586	NC_012207	TCG	2	6	28297	28302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988406
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592	NC_012207	GGC	2	6	28519	28524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988407
593	NC_012207	CTG	2	6	28533	28538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988407
594	NC_012207	TCA	2	6	28566	28571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988407
595	NC_012207	CGG	2	6	28601	28606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988407
596	NC_012207	CGA	2	6	28624	28629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988407
597	NC_012207	GCTC	2	8	28631	28638	0 %	25 %	25 %	50 %	224988407
598	NC_012207	ACC	2	6	28643	28648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988407
599	NC_012207	CGT	2	6	28691	28696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988407
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606	NC_012207	CAC	2	6	28983	28988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988407
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608	NC_012207	CAA	2	6	29088	29093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988407
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610	NC_012207	CAA	2	6	29148	29153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988407
611	NC_012207	GGCAA	2	10	29281	29290	40 %	0 %	40 %	20 %	224988408
612	NC_012207	ACG	2	6	29292	29297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988408
613	NC_012207	GC	3	6	29340	29345	0 %	0 %	50 %	50 %	224988408
614	NC_012207	CGTC	2	8	29365	29372	0 %	25 %	25 %	50 %	224988408
615	NC_012207	CG	3	6	29402	29407	0 %	0 %	50 %	50 %	224988408
616	NC_012207	GGATCA	2	12	29413	29424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224988408
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620	NC_012207	CACG	2	8	29725	29732	25 %	0 %	25 %	50 %	224988409
621	NC_012207	ACCG	2	8	29806	29813	25 %	0 %	25 %	50 %	224988409
622	NC_012207	GGT	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988409
623	NC_012207	CGC	2	6	29935	29940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988409
624	NC_012207	AGC	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988409
625	NC_012207	GTC	2	6	30011	30016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988409
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627	NC_012207	CCGG	2	8	30125	30132	0 %	0 %	50 %	50 %	224988409
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