MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD07

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011890	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915116
2	NC_011890	GCCCTC	2	12	145	156	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220915116
3	NC_011890	ATCG	2	8	214	221	25 %	25 %	25 %	25 %	220915116
4	NC_011890	GCCG	2	8	232	239	0 %	0 %	50 %	50 %	220915116
5	NC_011890	GGA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915116
6	NC_011890	GCG	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
7	NC_011890	GGC	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
8	NC_011890	CG	3	6	426	431	0 %	0 %	50 %	50 %	220915116
9	NC_011890	GGC	2	6	438	443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
10	NC_011890	GCCG	2	8	467	474	0 %	0 %	50 %	50 %	220915116
11	NC_011890	CGC	2	6	488	493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915116
12	NC_011890	GCC	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915116
13	NC_011890	CGG	2	6	536	541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
14	NC_011890	CGGG	2	8	649	656	0 %	0 %	75 %	25 %	220915116
15	NC_011890	TCG	2	6	1185	1190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915117
16	NC_011890	GCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915117
17	NC_011890	GAAT	2	8	1289	1296	50 %	25 %	25 %	0 %	220915117
18	NC_011890	CCG	2	6	1320	1325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915117
19	NC_011890	CGG	2	6	2547	2552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915118
20	NC_011890	CTTC	2	8	2618	2625	0 %	50 %	0 %	50 %	220915118
21	NC_011890	GCCC	2	8	2687	2694	0 %	0 %	25 %	75 %	220915118
22	NC_011890	TGT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915118
23	NC_011890	CGGCC	2	10	2760	2769	0 %	0 %	40 %	60 %	220915118
24	NC_011890	CTG	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915118
25	NC_011890	CGC	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915118
26	NC_011890	G	6	6	2868	2873	0 %	0 %	100 %	0 %	220915118
27	NC_011890	C	6	6	3037	3042	0 %	0 %	0 %	100 %	220915119
28	NC_011890	CGT	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
29	NC_011890	GCC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
30	NC_011890	ACC	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915119
31	NC_011890	CGG	3	9	3132	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
32	NC_011890	TCG	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
33	NC_011890	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
34	NC_011890	CAG	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
35	NC_011890	TGCC	2	8	3208	3215	0 %	25 %	25 %	50 %	220915119
36	NC_011890	CCT	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915119
37	NC_011890	TCG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
38	NC_011890	CG	3	6	3348	3353	0 %	0 %	50 %	50 %	220915119
39	NC_011890	GGCA	2	8	3372	3379	25 %	0 %	50 %	25 %	220915119
40	NC_011890	CTG	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
41	NC_011890	CGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
42	NC_011890	CGC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
43	NC_011890	CGC	2	6	3589	3594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
44	NC_011890	TCA	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
45	NC_011890	TTG	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
46	NC_011890	AGC	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
47	NC_011890	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
48	NC_011890	GCA	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
49	NC_011890	GCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
50	NC_011890	TCA	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
51	NC_011890	CGC	2	6	4082	4087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
52	NC_011890	CGGGCA	2	12	4132	4143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915119
53	NC_011890	GCG	2	6	4196	4201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
54	NC_011890	GCC	2	6	4237	4242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
55	NC_011890	TTG	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
56	NC_011890	TCA	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
57	NC_011890	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
58	NC_011890	TGC	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
59	NC_011890	CCGG	2	8	4451	4458	0 %	0 %	50 %	50 %	220915119
60	NC_011890	TGTCGT	2	12	4471	4482	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	220915119
61	NC_011890	GGCG	2	8	4507	4514	0 %	0 %	75 %	25 %	220915119
62	NC_011890	CAT	2	6	4550	4555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
63	NC_011890	TCC	3	9	4593	4601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915119
64	NC_011890	GAT	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915119
65	NC_011890	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
66	NC_011890	CAG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
67	NC_011890	CCA	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915119
68	NC_011890	CCG	3	9	4839	4847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
69	NC_011890	CGC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
70	NC_011890	GAT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915119
71	NC_011890	TCG	2	6	4941	4946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
72	NC_011890	GGGT	2	8	5025	5032	0 %	25 %	75 %	0 %	220915119
73	NC_011890	ACG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
74	NC_011890	TGC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
75	NC_011890	AGC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
76	NC_011890	TGT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
77	NC_011890	CCG	2	6	5120	5125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
78	NC_011890	GCC	2	6	5131	5136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
79	NC_011890	CGG	2	6	5155	5160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
80	NC_011890	CAG	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
81	NC_011890	CGG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
82	NC_011890	CGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
83	NC_011890	GC	3	6	5457	5462	0 %	0 %	50 %	50 %	220915119
84	NC_011890	GGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915120
85	NC_011890	GTC	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915120
86	NC_011890	CGCC	2	8	5997	6004	0 %	0 %	25 %	75 %	220915120
87	NC_011890	GCAC	2	8	6005	6012	25 %	0 %	25 %	50 %	220915120
88	NC_011890	CTC	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915120
89	NC_011890	AGT	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
90	NC_011890	CG	3	6	6151	6156	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
91	NC_011890	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
92	NC_011890	CG	3	6	6274	6279	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
93	NC_011890	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915120
94	NC_011890	TGA	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
95	NC_011890	GCC	2	6	6442	6447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915120
96	NC_011890	CG	3	6	6474	6479	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
97	NC_011890	GGTCAC	2	12	6481	6492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220915120
98	NC_011890	AGG	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915120
99	NC_011890	GC	3	6	6515	6520	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
100	NC_011890	TCA	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915120
101	NC_011890	G	6	6	6594	6599	0 %	0 %	100 %	0 %	220915120
102	NC_011890	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915121
103	NC_011890	GTCC	2	8	6707	6714	0 %	25 %	25 %	50 %	220915121
104	NC_011890	TCA	2	6	6785	6790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915121
105	NC_011890	CCA	2	6	8538	8543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915122
106	NC_011890	ACG	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915122
107	NC_011890	GGC	2	6	8687	8692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915122
108	NC_011890	CGG	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915122
109	NC_011890	CTTC	2	8	8711	8718	0 %	50 %	0 %	50 %	220915122
110	NC_011890	ACA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915122
111	NC_011890	TCG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915122
112	NC_011890	G	6	6	8814	8819	0 %	0 %	100 %	0 %	220915122
113	NC_011890	CGG	2	6	8822	8827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915122
114	NC_011890	G	6	6	8826	8831	0 %	0 %	100 %	0 %	220915122
115	NC_011890	CCCCT	2	10	8839	8848	0 %	20 %	0 %	80 %	220915122
116	NC_011890	GCCAT	2	10	8881	8890	20 %	20 %	20 %	40 %	220915122
117	NC_011890	CGT	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915122

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.