MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48003	NC_011832	TCC	2	6	2591932	2591937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853027
48004	NC_011832	ATC	2	6	2591952	2591957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853027
48005	NC_011832	TCCT	2	8	2591994	2592001	0 %	50 %	0 %	50 %	219853027
48006	NC_011832	TCG	2	6	2592058	2592063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853027
48007	NC_011832	GGCC	2	8	2592080	2592087	0 %	0 %	50 %	50 %	219853027
48008	NC_011832	CCG	2	6	2592109	2592114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853027
48009	NC_011832	ATGACG	2	12	2592151	2592162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853027
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48011	NC_011832	TCC	2	6	2592187	2592192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853027
48012	NC_011832	CTG	2	6	2592267	2592272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853027
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48117	NC_011832	GAG	2	6	2597419	2597424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853029
48118	NC_011832	CTC	2	6	2597497	2597502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853029
48119	NC_011832	CGA	2	6	2597506	2597511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853029
48120	NC_011832	TCA	2	6	2597555	2597560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853029
48121	NC_011832	GTT	2	6	2597583	2597588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853029
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48123	NC_011832	TTC	2	6	2597675	2597680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853029
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48217	NC_011832	TGA	2	6	2602767	2602772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48218	NC_011832	GAAT	2	8	2602833	2602840	50 %	25 %	25 %	0 %	219853031
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48220	NC_011832	AGGATC	2	12	2602877	2602888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853031
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48222	NC_011832	CTG	2	6	2602961	2602966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853031
48223	NC_011832	TCT	2	6	2602995	2603000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853031
48224	NC_011832	TAG	2	6	2603012	2603017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48225	NC_011832	GTTT	2	8	2603095	2603102	0 %	75 %	25 %	0 %	219853031
48226	NC_011832	TGA	2	6	2603142	2603147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48227	NC_011832	GAAT	2	8	2603208	2603215	50 %	25 %	25 %	0 %	219853031
48228	NC_011832	AGGATC	2	12	2603252	2603263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853031
48229	NC_011832	CTG	2	6	2603336	2603341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853031
48230	NC_011832	TCT	2	6	2603370	2603375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853031
48231	NC_011832	TGA	2	6	2603400	2603405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48232	NC_011832	TTCAG	2	10	2603477	2603486	20 %	40 %	20 %	20 %	219853031
48233	NC_011832	ATGC	2	8	2603490	2603497	25 %	25 %	25 %	25 %	219853031
48234	NC_011832	TGA	2	6	2603517	2603522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48235	NC_011832	GAAT	2	8	2603583	2603590	50 %	25 %	25 %	0 %	219853031
48236	NC_011832	AGGATC	2	12	2603627	2603638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853031
48237	NC_011832	CGG	2	6	2603663	2603668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853031
48238	NC_011832	T	6	6	2603683	2603688	0 %	100 %	0 %	0 %	219853031
48239	NC_011832	GAA	2	6	2603769	2603774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853031
48240	NC_011832	GAT	2	6	2603779	2603784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48241	NC_011832	A	7	7	2603794	2603800	100 %	0 %	0 %	0 %	219853031
48242	NC_011832	AGCG	2	8	2603866	2603873	25 %	0 %	50 %	25 %	219853031
48243	NC_011832	ATC	2	6	2604001	2604006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853031
48244	NC_011832	CCG	2	6	2604116	2604121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853031
48245	NC_011832	ACGA	2	8	2604175	2604182	50 %	0 %	25 %	25 %	219853031
48246	NC_011832	GAT	2	6	2604252	2604257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48247	NC_011832	CTG	2	6	2604261	2604266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853031
48248	NC_011832	CCCTGC	2	12	2604369	2604380	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219853031
48249	NC_011832	GGAT	2	8	2604399	2604406	25 %	25 %	50 %	0 %	219853031
48250	NC_011832	TAA	2	6	2604430	2604435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853031
48251	NC_011832	CCAT	2	8	2604443	2604450	25 %	25 %	0 %	50 %	219853031
48252	NC_011832	TCA	2	6	2604498	2604503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853031
48253	NC_011832	GAT	2	6	2604524	2604529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853031
48254	NC_011832	GTC	2	6	2604551	2604556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853031
48255	NC_011832	GAG	2	6	2604583	2604588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853031
48256	NC_011832	CTC	2	6	2604955	2604960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853032
48257	NC_011832	ATC	2	6	2604985	2604990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853032
48258	NC_011832	TGG	2	6	2605136	2605141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853032
48259	NC_011832	GTC	2	6	2605143	2605148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853032
48260	NC_011832	CCT	3	9	2605338	2605346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853032
48261	NC_011832	ATC	2	6	2605357	2605362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853032
48262	NC_011832	CTCTC	2	10	2605520	2605529	0 %	40 %	0 %	60 %	219853032
48263	NC_011832	TTC	2	6	2605549	2605554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853032
48264	NC_011832	CTC	2	6	2605579	2605584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853032
48265	NC_011832	CCA	2	6	2605589	2605594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853032
48266	NC_011832	TCG	2	6	2605622	2605627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853032
48267	NC_011832	CTT	2	6	2605647	2605652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853032
48268	NC_011832	TCA	2	6	2605694	2605699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853032
48269	NC_011832	TGA	3	9	2605757	2605765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853032
48270	NC_011832	GAC	2	6	2605766	2605771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853032
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48272	NC_011832	CGTTC	2	10	2605818	2605827	0 %	40 %	20 %	40 %	219853032
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48274	NC_011832	TCA	2	6	2606123	2606128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853033
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48280	NC_011832	ATCAGA	2	12	2606370	2606381	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219853033
48281	NC_011832	GA	3	6	2606403	2606408	50 %	0 %	50 %	0 %	219853033
48282	NC_011832	GAT	2	6	2606420	2606425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853033
48283	NC_011832	GAA	2	6	2606491	2606496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853033
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48285	NC_011832	GAT	2	6	2606552	2606557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853033
48286	NC_011832	CGAA	2	8	2606621	2606628	50 %	0 %	25 %	25 %	219853033
48287	NC_011832	ACC	2	6	2606629	2606634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853033
48288	NC_011832	CGC	2	6	2606646	2606651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853033
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48291	NC_011832	CGA	2	6	2606729	2606734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853033
48292	NC_011832	CAA	2	6	2606738	2606743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853033
48293	NC_011832	GGC	2	6	2606762	2606767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853033
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48299	NC_011832	AGG	2	6	2607009	2607014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853033
48300	NC_011832	CGG	2	6	2607037	2607042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853033
48301	NC_011832	CAC	2	6	2607043	2607048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853033
48302	NC_011832	CGC	2	6	2607050	2607055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853033
48303	NC_011832	CCG	2	6	2607060	2607065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853033
48304	NC_011832	GATC	2	8	2607094	2607101	25 %	25 %	25 %	25 %	219853033
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48306	NC_011832	CCA	2	6	2607196	2607201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853033
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48308	NC_011832	CCG	2	6	2607652	2607657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853034
48309	NC_011832	CGA	2	6	2607659	2607664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853034
48310	NC_011832	ATC	3	9	2607672	2607680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853034
48311	NC_011832	ACC	2	6	2607729	2607734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853034
48312	NC_011832	CAGAA	2	10	2607880	2607889	60 %	0 %	20 %	20 %	219853034
48313	NC_011832	TCA	2	6	2607895	2607900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853034
48314	NC_011832	AAG	3	9	2607936	2607944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853034
48315	NC_011832	CGAA	2	8	2607977	2607984	50 %	0 %	25 %	25 %	219853034
48316	NC_011832	GAT	2	6	2607987	2607992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853034
48317	NC_011832	CGC	2	6	2608057	2608062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853034
48318	NC_011832	CGA	2	6	2608076	2608081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853034
48319	NC_011832	GCC	2	6	2608108	2608113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853034
48320	NC_011832	TCA	2	6	2608165	2608170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853034
48321	NC_011832	GAG	2	6	2608185	2608190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853034
48322	NC_011832	CGA	2	6	2608207	2608212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853034
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48329	NC_011832	ACCTCG	2	12	2608664	2608675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219853035
48330	NC_011832	CTT	2	6	2608680	2608685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853035
48331	NC_011832	ATG	2	6	2608702	2608707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853035
48332	NC_011832	CTT	2	6	2608710	2608715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853035
48333	NC_011832	CCT	2	6	2608721	2608726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853035
48334	NC_011832	TCCC	2	8	2608786	2608793	0 %	25 %	0 %	75 %	219853035
48335	NC_011832	GTC	2	6	2608795	2608800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853035
48336	NC_011832	CAT	3	9	2608809	2608817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853035
48337	NC_011832	CTG	2	6	2608825	2608830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853035
48338	NC_011832	TCA	2	6	2608853	2608858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853035
48339	NC_011832	CGA	2	6	2608859	2608864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853035
48340	NC_011832	CCT	2	6	2608887	2608892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853035
48341	NC_011832	GCT	2	6	2608917	2608922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853035
48342	NC_011832	TCGT	2	8	2608930	2608937	0 %	50 %	25 %	25 %	219853035
48343	NC_011832	CTC	2	6	2608972	2608977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853035
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48345	NC_011832	CAT	2	6	2609007	2609012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853035
48346	NC_011832	CCTC	2	8	2609105	2609112	0 %	25 %	0 %	75 %	219853035
48347	NC_011832	TCG	2	6	2609129	2609134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853035
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48460	NC_011832	CGC	2	6	2614960	2614965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853043
48461	NC_011832	TC	4	8	2614974	2614981	0 %	50 %	0 %	50 %	219853043
48462	NC_011832	GAG	2	6	2614986	2614991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853043
48463	NC_011832	GGT	2	6	2615016	2615021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853043
48464	NC_011832	CGG	2	6	2615026	2615031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853043
48465	NC_011832	TCG	2	6	2615035	2615040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853043
48466	NC_011832	GAGTGC	2	12	2615090	2615101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219853043
48467	NC_011832	CGC	2	6	2615123	2615128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853043
48468	NC_011832	GCTCGG	2	12	2615135	2615146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219853043
48469	NC_011832	CTG	2	6	2615150	2615155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853043
48470	NC_011832	CGA	2	6	2615210	2615215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853043
48471	NC_011832	GGTG	2	8	2615308	2615315	0 %	25 %	75 %	0 %	219853043
48472	NC_011832	ATGCC	2	10	2615749	2615758	20 %	20 %	20 %	40 %	219853044
48473	NC_011832	CCA	2	6	2615797	2615802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853044
48474	NC_011832	TGA	2	6	2615828	2615833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853044
48475	NC_011832	TTC	2	6	2615862	2615867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853044
48476	NC_011832	ACG	2	6	2615947	2615952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853044
48477	NC_011832	TCA	2	6	2615953	2615958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853044
48478	NC_011832	GATG	2	8	2615981	2615988	25 %	25 %	50 %	0 %	219853044
48479	NC_011832	T	6	6	2615996	2616001	0 %	100 %	0 %	0 %	219853044
48480	NC_011832	CAA	2	6	2616086	2616091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853044
48481	NC_011832	CCG	2	6	2616161	2616166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853044
48482	NC_011832	CAG	2	6	2616174	2616179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853044
48483	NC_011832	ATC	2	6	2616228	2616233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853044
48484	NC_011832	GATC	2	8	2616395	2616402	25 %	25 %	25 %	25 %	219853044
48485	NC_011832	ATG	2	6	2616418	2616423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853044
48486	NC_011832	A	6	6	2616432	2616437	100 %	0 %	0 %	0 %	219853044
48487	NC_011832	CAA	2	6	2616481	2616486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853044
48488	NC_011832	TCAT	2	8	2616513	2616520	25 %	50 %	0 %	25 %	219853044
48489	NC_011832	AGCC	2	8	2616527	2616534	25 %	0 %	25 %	50 %	219853044
48490	NC_011832	CAG	2	6	2616546	2616551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853044
48491	NC_011832	CGG	2	6	2616604	2616609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853044
48492	NC_011832	AG	3	6	2616611	2616616	50 %	0 %	50 %	0 %	219853044
48493	NC_011832	TCA	2	6	2616676	2616681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853044
48494	NC_011832	GAT	2	6	2616684	2616689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853044
48495	NC_011832	CCA	2	6	2616694	2616699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853044
48496	NC_011832	TGG	2	6	2616721	2616726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853044
48497	NC_011832	ATC	2	6	2616811	2616816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853044
48498	NC_011832	GAA	2	6	2616838	2616843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853044
48499	NC_011832	A	7	7	2616876	2616882	100 %	0 %	0 %	0 %	219853044
48500	NC_011832	GATC	2	8	2616905	2616912	25 %	25 %	25 %	25 %	219853044

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