MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_011832	CAA	2	6	2535126	2535131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852965
47003	NC_011832	TCC	2	6	2535138	2535143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852965
47004	NC_011832	GAAC	2	8	2535194	2535201	50 %	0 %	25 %	25 %	219852965
47005	NC_011832	GAAT	2	8	2535234	2535241	50 %	25 %	25 %	0 %	219852965
47006	NC_011832	GATCA	2	10	2535242	2535251	40 %	20 %	20 %	20 %	219852965
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47008	NC_011832	GA	3	6	2536611	2536616	50 %	0 %	50 %	0 %	219852966
47009	NC_011832	TCAAA	2	10	2536617	2536626	60 %	20 %	0 %	20 %	219852966
47010	NC_011832	GTC	3	9	2536678	2536686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852966
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47012	NC_011832	GTG	2	6	2536705	2536710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852966
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47017	NC_011832	CTG	2	6	2536820	2536825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852966
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47116	NC_011832	ATC	2	6	2542904	2542909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852972
47117	NC_011832	AGC	2	6	2542928	2542933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852972
47118	NC_011832	CGG	2	6	2543007	2543012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852972
47119	NC_011832	GGA	2	6	2543061	2543066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852972
47120	NC_011832	TCA	2	6	2543109	2543114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852972
47121	NC_011832	GATC	2	8	2543127	2543134	25 %	25 %	25 %	25 %	219852972
47122	NC_011832	ACCGG	2	10	2543138	2543147	20 %	0 %	40 %	40 %	219852972
47123	NC_011832	T	6	6	2543207	2543212	0 %	100 %	0 %	0 %	219852972
47124	NC_011832	TCG	2	6	2543292	2543297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852972
47125	NC_011832	TCCG	2	8	2543428	2543435	0 %	25 %	25 %	50 %	219852972
47126	NC_011832	GCT	2	6	2543444	2543449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852972
47127	NC_011832	GTA	2	6	2543543	2543548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852972
47128	NC_011832	TCT	2	6	2543600	2543605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852973
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47132	NC_011832	CGA	2	6	2543722	2543727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852973
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47134	NC_011832	ACCG	2	8	2543796	2543803	25 %	0 %	25 %	50 %	219852973
47135	NC_011832	CGC	2	6	2543819	2543824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852973
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47143	NC_011832	CGA	2	6	2544247	2544252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852973
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47217	NC_011832	GAG	2	6	2547828	2547833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852977
47218	NC_011832	GCT	2	6	2547878	2547883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852977
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47222	NC_011832	CGG	2	6	2548061	2548066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852977
47223	NC_011832	CTGTAC	2	12	2548191	2548202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219852977
47224	NC_011832	ATC	2	6	2548221	2548226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852977
47225	NC_011832	CAA	2	6	2548274	2548279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852977
47226	NC_011832	ACAGA	2	10	2548419	2548428	60 %	0 %	20 %	20 %	219852978
47227	NC_011832	GGA	2	6	2548583	2548588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852978
47228	NC_011832	TCG	2	6	2548612	2548617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852978
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47230	NC_011832	GGCC	2	8	2548670	2548677	0 %	0 %	50 %	50 %	219852978
47231	NC_011832	GAC	2	6	2548712	2548717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852978
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47314	NC_011832	GATCC	2	10	2553290	2553299	20 %	20 %	20 %	40 %	219852982
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47340	NC_011832	TGG	2	6	2554597	2554602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852984
47341	NC_011832	GTTGAT	2	12	2554649	2554660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219852984
47342	NC_011832	GTC	2	6	2554700	2554705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852984
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47344	NC_011832	CGA	2	6	2554780	2554785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852984
47345	NC_011832	CGT	3	9	2554945	2554953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852984
47346	NC_011832	CGA	2	6	2554990	2554995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852984
47347	NC_011832	GAT	2	6	2555039	2555044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852984
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47350	NC_011832	GAT	2	6	2555105	2555110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852984
47351	NC_011832	GTC	2	6	2555237	2555242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852984
47352	NC_011832	CTG	2	6	2555290	2555295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852984
47353	NC_011832	TGA	2	6	2555341	2555346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852984
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47457	NC_011832	GAT	2	6	2560835	2560840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852989
47458	NC_011832	AGC	2	6	2560888	2560893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852989
47459	NC_011832	CAGAT	2	10	2561078	2561087	40 %	20 %	20 %	20 %	219852990
47460	NC_011832	C	6	6	2561172	2561177	0 %	0 %	0 %	100 %	219852990
47461	NC_011832	GA	4	8	2561194	2561201	50 %	0 %	50 %	0 %	219852990
47462	NC_011832	CTG	2	6	2561254	2561259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852990
47463	NC_011832	CCA	2	6	2561279	2561284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852990
47464	NC_011832	C	7	7	2561292	2561298	0 %	0 %	0 %	100 %	219852990
47465	NC_011832	CAT	2	6	2561360	2561365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852990
47466	NC_011832	ATCAC	2	10	2561437	2561446	40 %	20 %	0 %	40 %	219852990
47467	NC_011832	TCA	2	6	2561455	2561460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852990
47468	NC_011832	TGA	2	6	2561561	2561566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852990
47469	NC_011832	AGC	2	6	2561626	2561631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852990
47470	NC_011832	CTT	2	6	2561637	2561642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852990
47471	NC_011832	TCA	2	6	2561648	2561653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852990
47472	NC_011832	TCC	2	6	2562033	2562038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852991
47473	NC_011832	CAG	2	6	2562056	2562061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852991
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47475	NC_011832	ACC	2	6	2562081	2562086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852991
47476	NC_011832	AATC	2	8	2562130	2562137	50 %	25 %	0 %	25 %	219852991
47477	NC_011832	TC	3	6	2562183	2562188	0 %	50 %	0 %	50 %	219852991
47478	NC_011832	TCA	2	6	2562850	2562855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852992
47479	NC_011832	TGC	2	6	2562885	2562890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852992
47480	NC_011832	GA	3	6	2563044	2563049	50 %	0 %	50 %	0 %	219852992
47481	NC_011832	TGA	2	6	2563092	2563097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852992
47482	NC_011832	GA	3	6	2563125	2563130	50 %	0 %	50 %	0 %	219852992
47483	NC_011832	GAG	2	6	2563149	2563154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852992
47484	NC_011832	AGA	2	6	2563159	2563164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852992
47485	NC_011832	AGA	2	6	2563183	2563188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852992
47486	NC_011832	AAT	2	6	2563216	2563221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852992
47487	NC_011832	GGA	2	6	2563241	2563246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852992
47488	NC_011832	ATCCAG	2	12	2563287	2563298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219852992
47489	NC_011832	CTT	2	6	2563786	2563791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852993
47490	NC_011832	CTGA	2	8	2563805	2563812	25 %	25 %	25 %	25 %	219852993
47491	NC_011832	TCT	2	6	2563839	2563844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852993
47492	NC_011832	TTGG	2	8	2563859	2563866	0 %	50 %	50 %	0 %	219852993
47493	NC_011832	GAT	2	6	2564148	2564153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852994
47494	NC_011832	CGGA	2	8	2564199	2564206	25 %	0 %	50 %	25 %	219852994
47495	NC_011832	GTC	2	6	2564220	2564225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852994
47496	NC_011832	CAG	2	6	2564328	2564333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852994
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