MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_011832	ACC	2	6	2507919	2507924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852936
46503	NC_011832	AG	3	6	2507937	2507942	50 %	0 %	50 %	0 %	219852936
46504	NC_011832	CTT	2	6	2507963	2507968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852936
46505	NC_011832	CAG	2	6	2507975	2507980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852936
46506	NC_011832	TCA	2	6	2507998	2508003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852936
46507	NC_011832	CGG	2	6	2508180	2508185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852936
46508	NC_011832	CCA	2	6	2508209	2508214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852936
46509	NC_011832	ATCG	2	8	2508257	2508264	25 %	25 %	25 %	25 %	219852936
46510	NC_011832	TGGCA	2	10	2508366	2508375	20 %	20 %	40 %	20 %	219852936
46511	NC_011832	TGAAT	2	10	2508441	2508450	40 %	40 %	20 %	0 %	219852936
46512	NC_011832	TCG	2	6	2508524	2508529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852937
46513	NC_011832	TTCG	2	8	2508552	2508559	0 %	50 %	25 %	25 %	219852937
46514	NC_011832	CTT	2	6	2508586	2508591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852937
46515	NC_011832	TGA	2	6	2508603	2508608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852937
46516	NC_011832	ATG	2	6	2508632	2508637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852937
46517	NC_011832	CTT	2	6	2508654	2508659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852937
46518	NC_011832	GGA	2	6	2508700	2508705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852938
46519	NC_011832	CCG	2	6	2508726	2508731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852938
46520	NC_011832	GGC	2	6	2508779	2508784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852938
46521	NC_011832	CGA	2	6	2508805	2508810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852938
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46524	NC_011832	CTGCC	2	10	2508898	2508907	0 %	20 %	20 %	60 %	219852938
46525	NC_011832	TCAG	2	8	2509005	2509012	25 %	25 %	25 %	25 %	219852938
46526	NC_011832	CT	3	6	2509028	2509033	0 %	50 %	0 %	50 %	219852938
46527	NC_011832	CGC	2	6	2509042	2509047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852938
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46532	NC_011832	CTCC	2	8	2509495	2509502	0 %	25 %	0 %	75 %	219852938
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46535	NC_011832	CGG	2	6	2509664	2509669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852938
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46553	NC_011832	TG	4	8	2510669	2510676	0 %	50 %	50 %	0 %	219852939
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46599	NC_011832	TA	3	6	2513541	2513546	50 %	50 %	0 %	0 %	219852940
46600	NC_011832	ACG	2	6	2513580	2513585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852940
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46617	NC_011832	GGA	2	6	2515483	2515488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852941
46618	NC_011832	CACC	2	8	2515517	2515524	25 %	0 %	0 %	75 %	219852941
46619	NC_011832	ACC	2	6	2515574	2515579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852941
46620	NC_011832	CGT	2	6	2515623	2515628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852941
46621	NC_011832	ACC	2	6	2515708	2515713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852941
46622	NC_011832	TCGC	2	8	2515801	2515808	0 %	25 %	25 %	50 %	219852941
46623	NC_011832	CAA	2	6	2515823	2515828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852941
46624	NC_011832	ACC	2	6	2515834	2515839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852941
46625	NC_011832	CTC	2	6	2515897	2515902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852941
46626	NC_011832	TCCC	2	8	2515933	2515940	0 %	25 %	0 %	75 %	219852941
46627	NC_011832	GAA	2	6	2515956	2515961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852941
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46629	NC_011832	GA	3	6	2516078	2516083	50 %	0 %	50 %	0 %	219852941
46630	NC_011832	TCCAA	2	10	2516203	2516212	40 %	20 %	0 %	40 %	219852941
46631	NC_011832	ACGGGG	2	12	2516249	2516260	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219852941
46632	NC_011832	TCT	2	6	2516285	2516290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852941
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46634	NC_011832	CAAC	2	8	2516388	2516395	50 %	0 %	0 %	50 %	219852941
46635	NC_011832	CCT	3	9	2516722	2516730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852942
46636	NC_011832	TGA	2	6	2516747	2516752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852942
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46638	NC_011832	ACA	2	6	2517431	2517436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852943
46639	NC_011832	CTG	2	6	2517487	2517492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852943
46640	NC_011832	TGG	2	6	2517494	2517499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852943
46641	NC_011832	GCAG	2	8	2517501	2517508	25 %	0 %	50 %	25 %	219852943
46642	NC_011832	GCC	2	6	2517554	2517559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852943
46643	NC_011832	CCGG	2	8	2517663	2517670	0 %	0 %	50 %	50 %	219852943
46644	NC_011832	GCC	2	6	2517677	2517682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852943
46645	NC_011832	AAG	2	6	2517809	2517814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852943
46646	NC_011832	GATC	2	8	2517831	2517838	25 %	25 %	25 %	25 %	219852943
46647	NC_011832	CCA	2	6	2517906	2517911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852943
46648	NC_011832	CGG	2	6	2517930	2517935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852943
46649	NC_011832	ATC	2	6	2517979	2517984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852943
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46652	NC_011832	GGT	2	6	2518176	2518181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852943
46653	NC_011832	TCA	2	6	2518203	2518208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852943
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46676	NC_011832	CCCT	2	8	2519296	2519303	0 %	25 %	0 %	75 %	219852944
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46729	NC_011832	CTC	2	6	2521692	2521697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852946
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46731	NC_011832	CTC	2	6	2521778	2521783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852946
46732	NC_011832	ATCG	2	8	2521794	2521801	25 %	25 %	25 %	25 %	219852946
46733	NC_011832	CTGCCC	2	12	2521805	2521816	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219852946
46734	NC_011832	TCC	2	6	2521823	2521828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852946
46735	NC_011832	CCT	2	6	2521886	2521891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852946
46736	NC_011832	GCGAG	2	10	2521898	2521907	20 %	0 %	60 %	20 %	219852946
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46738	NC_011832	ATC	2	6	2521999	2522004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852946
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46835	NC_011832	TCATC	2	10	2526014	2526023	20 %	40 %	0 %	40 %	219852951
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46842	NC_011832	TCCAT	2	10	2526325	2526334	20 %	40 %	0 %	40 %	219852951
46843	NC_011832	TGC	3	9	2526342	2526350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852951
46844	NC_011832	GA	3	6	2526400	2526405	50 %	0 %	50 %	0 %	219852951
46845	NC_011832	ATCG	2	8	2526417	2526424	25 %	25 %	25 %	25 %	219852951
46846	NC_011832	GCT	2	6	2526431	2526436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852951
46847	NC_011832	TCTGC	2	10	2526491	2526500	0 %	40 %	20 %	40 %	219852951
46848	NC_011832	ATC	2	6	2526501	2526506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852951
46849	NC_011832	TCG	2	6	2526514	2526519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852951
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46851	NC_011832	CT	3	6	2526589	2526594	0 %	50 %	0 %	50 %	219852951
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46853	NC_011832	AAT	2	6	2526663	2526668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852951
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46870	NC_011832	TA	3	6	2527636	2527641	50 %	50 %	0 %	0 %	219852955
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46942	NC_011832	CTG	2	6	2531623	2531628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852961
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46950	NC_011832	ACC	2	6	2532252	2532257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852962
46951	NC_011832	GA	3	6	2532265	2532270	50 %	0 %	50 %	0 %	219852962
46952	NC_011832	GTA	2	6	2532276	2532281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852962
46953	NC_011832	GTACGG	2	12	2532302	2532313	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219852962
46954	NC_011832	GGT	2	6	2532329	2532334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852962
46955	NC_011832	GTC	2	6	2532372	2532377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852962
46956	NC_011832	CGGG	2	8	2532447	2532454	0 %	0 %	75 %	25 %	219852962
46957	NC_011832	CGA	2	6	2532457	2532462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852962
46958	NC_011832	GTG	3	9	2532504	2532512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852962
46959	NC_011832	GAG	2	6	2532541	2532546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852962
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46961	NC_011832	CTGA	2	8	2532649	2532656	25 %	25 %	25 %	25 %	219852962
46962	NC_011832	GGA	2	6	2532659	2532664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852962
46963	NC_011832	GTG	2	6	2532693	2532698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852962
46964	NC_011832	GAT	2	6	2532773	2532778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852962
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46989	NC_011832	CAA	2	6	2534326	2534331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852964
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