MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_011832	GCC	2	6	2480959	2480964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852909
46003	NC_011832	AGCA	2	8	2480968	2480975	50 %	0 %	25 %	25 %	219852909
46004	NC_011832	CGA	2	6	2481006	2481011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852909
46005	NC_011832	CCAGTC	2	12	2481050	2481061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219852909
46006	NC_011832	AAC	2	6	2481069	2481074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852909
46007	NC_011832	GATGAA	2	12	2481109	2481120	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219852909
46008	NC_011832	TCT	2	6	2481158	2481163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852909
46009	NC_011832	TCA	2	6	2481165	2481170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852909
46010	NC_011832	AAT	2	6	2481184	2481189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852909
46011	NC_011832	CCA	2	6	2481220	2481225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852909
46012	NC_011832	GCCG	2	8	2481238	2481245	0 %	0 %	50 %	50 %	219852909
46013	NC_011832	ATA	2	6	2481260	2481265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852909
46014	NC_011832	ATT	2	6	2482013	2482018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852910
46015	NC_011832	TGA	2	6	2482074	2482079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852910
46016	NC_011832	CGG	2	6	2482082	2482087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852910
46017	NC_011832	TGC	2	6	2482098	2482103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852910
46018	NC_011832	CAG	2	6	2482127	2482132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852910
46019	NC_011832	CAT	2	6	2482169	2482174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852910
46020	NC_011832	CAC	2	6	2482224	2482229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852910
46021	NC_011832	AAGAG	2	10	2482338	2482347	60 %	0 %	40 %	0 %	219852910
46022	NC_011832	CCG	3	9	2482585	2482593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852911
46023	NC_011832	TCGG	2	8	2482605	2482612	0 %	25 %	50 %	25 %	219852911
46024	NC_011832	GAGC	2	8	2482648	2482655	25 %	0 %	50 %	25 %	219852911
46025	NC_011832	CAC	2	6	2482661	2482666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852911
46026	NC_011832	AAC	2	6	2482726	2482731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852911
46027	NC_011832	TCGA	2	8	2482749	2482756	25 %	25 %	25 %	25 %	219852911
46028	NC_011832	GA	3	6	2482755	2482760	50 %	0 %	50 %	0 %	219852911
46029	NC_011832	CTG	2	6	2482784	2482789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852911
46030	NC_011832	TCG	2	6	2482794	2482799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852911
46031	NC_011832	ATCCC	2	10	2482812	2482821	20 %	20 %	0 %	60 %	219852911
46032	NC_011832	GAG	2	6	2482836	2482841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852911
46033	NC_011832	CCGCT	2	10	2482884	2482893	0 %	20 %	20 %	60 %	219852911
46034	NC_011832	ATC	2	6	2482899	2482904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852911
46035	NC_011832	GTC	2	6	2482914	2482919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852911
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46038	NC_011832	CCA	2	6	2483064	2483069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852911
46039	NC_011832	A	8	8	2483069	2483076	100 %	0 %	0 %	0 %	219852911
46040	NC_011832	CCT	2	6	2483134	2483139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852911
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46042	NC_011832	TTC	2	6	2483467	2483472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852912
46043	NC_011832	ATC	2	6	2483475	2483480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852912
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46045	NC_011832	GCC	2	6	2483560	2483565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852912
46046	NC_011832	ATC	2	6	2483721	2483726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852912
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46049	NC_011832	TCTG	2	8	2483764	2483771	0 %	50 %	25 %	25 %	219852912
46050	NC_011832	TGC	2	6	2483887	2483892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852913
46051	NC_011832	TCG	2	6	2483937	2483942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852913
46052	NC_011832	TCA	2	6	2483964	2483969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852913
46053	NC_011832	AAG	2	6	2483996	2484001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852913
46054	NC_011832	GTC	2	6	2484026	2484031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852913
46055	NC_011832	ACC	2	6	2484041	2484046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852913
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46057	NC_011832	G	6	6	2484196	2484201	0 %	0 %	100 %	0 %	219852913
46058	NC_011832	CAC	2	6	2484295	2484300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852913
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46062	NC_011832	CGGC	2	8	2484445	2484452	0 %	0 %	50 %	50 %	219852913
46063	NC_011832	CGA	2	6	2484574	2484579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852913
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46079	NC_011832	CGAT	2	8	2485351	2485358	25 %	25 %	25 %	25 %	219852914
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46085	NC_011832	TCGAT	2	10	2486001	2486010	20 %	40 %	20 %	20 %	219852915
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46088	NC_011832	GGCC	2	8	2486350	2486357	0 %	0 %	50 %	50 %	219852915
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46100	NC_011832	CT	3	6	2486783	2486788	0 %	50 %	0 %	50 %	219852916
46101	NC_011832	TTC	2	6	2486797	2486802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852916
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46112	NC_011832	CAA	2	6	2487363	2487368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852917
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46117	NC_011832	AGA	2	6	2487564	2487569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852917
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46233	NC_011832	TTG	2	6	2493034	2493039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852923
46234	NC_011832	GAT	2	6	2493123	2493128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852923
46235	NC_011832	CGG	2	6	2493183	2493188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852923
46236	NC_011832	GTG	2	6	2493325	2493330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852923
46237	NC_011832	TGG	2	6	2493347	2493352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852923
46238	NC_011832	GCC	2	6	2493357	2493362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852923
46239	NC_011832	CGA	2	6	2493461	2493466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852923
46240	NC_011832	TCG	2	6	2493469	2493474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852923
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46244	NC_011832	CGA	2	6	2493647	2493652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852923
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46252	NC_011832	TGA	2	6	2494139	2494144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852923
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46255	NC_011832	CTT	2	6	2494233	2494238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852923
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46259	NC_011832	GGT	2	6	2494452	2494457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852923
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46262	NC_011832	ATCG	2	8	2494669	2494676	25 %	25 %	25 %	25 %	219852924
46263	NC_011832	ATGCC	2	10	2494682	2494691	20 %	20 %	20 %	40 %	219852924
46264	NC_011832	CAT	2	6	2494749	2494754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852924
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46266	NC_011832	TTC	2	6	2494909	2494914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852924
46267	NC_011832	CTT	2	6	2494921	2494926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852924
46268	NC_011832	TCG	2	6	2494931	2494936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852924
46269	NC_011832	CTG	2	6	2495025	2495030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852924
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46278	NC_011832	TCCA	2	8	2495473	2495480	25 %	25 %	0 %	50 %	219852925
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46282	NC_011832	GAT	2	6	2495588	2495593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852925
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46284	NC_011832	GAT	2	6	2495654	2495659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852925
46285	NC_011832	ATG	2	6	2495683	2495688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852925
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46291	NC_011832	CTACG	2	10	2495895	2495904	20 %	20 %	20 %	40 %	219852925
46292	NC_011832	GGC	2	6	2495924	2495929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852925
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46318	NC_011832	CG	3	6	2497199	2497204	0 %	0 %	50 %	50 %	219852927
46319	NC_011832	TTG	2	6	2497211	2497216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852927
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46323	NC_011832	GACCC	2	10	2497474	2497483	20 %	0 %	20 %	60 %	219852927
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46328	NC_011832	CAGGA	2	10	2497587	2497596	40 %	0 %	40 %	20 %	219852927
46329	NC_011832	CAT	2	6	2497665	2497670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852927
46330	NC_011832	TCG	2	6	2497688	2497693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852927
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46332	NC_011832	ATC	2	6	2497753	2497758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852927
46333	NC_011832	TCA	2	6	2497766	2497771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852927
46334	NC_011832	GCA	2	6	2497774	2497779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852927
46335	NC_011832	GCT	2	6	2497809	2497814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852927
46336	NC_011832	CCTAAA	2	12	2497826	2497837	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219852927
46337	NC_011832	CG	3	6	2498344	2498349	0 %	0 %	50 %	50 %	219852928
46338	NC_011832	TCG	2	6	2498356	2498361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852928
46339	NC_011832	GATG	2	8	2498365	2498372	25 %	25 %	50 %	0 %	219852928
46340	NC_011832	CTG	2	6	2498382	2498387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852928
46341	NC_011832	ATC	2	6	2498556	2498561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852928
46342	NC_011832	CGG	2	6	2498570	2498575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852928
46343	NC_011832	GAATGC	2	12	2498606	2498617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219852928
46344	NC_011832	GACCC	2	10	2498619	2498628	20 %	0 %	20 %	60 %	219852928
46345	NC_011832	GGT	2	6	2498658	2498663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852928
46346	NC_011832	GCTC	2	8	2498669	2498676	0 %	25 %	25 %	50 %	219852928
46347	NC_011832	ATC	2	6	2498691	2498696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852928
46348	NC_011832	GGATC	2	10	2498734	2498743	20 %	20 %	40 %	20 %	219852928
46349	NC_011832	GATC	2	8	2498788	2498795	25 %	25 %	25 %	25 %	219852928
46350	NC_011832	ATC	2	6	2498811	2498816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852928
46351	NC_011832	TGG	2	6	2498860	2498865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852928
46352	NC_011832	ATC	2	6	2498877	2498882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852928
46353	NC_011832	ATC	2	6	2498898	2498903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852928
46354	NC_011832	TTC	2	6	2498907	2498912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852928
46355	NC_011832	GGTCG	2	10	2499161	2499170	0 %	20 %	60 %	20 %	219852929
46356	NC_011832	CAGAA	2	10	2499224	2499233	60 %	0 %	20 %	20 %	219852929
46357	NC_011832	CGG	2	6	2499314	2499319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852929
46358	NC_011832	TGG	2	6	2499385	2499390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852929
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46361	NC_011832	ATG	2	6	2499562	2499567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852929
46362	NC_011832	CCTC	2	8	2499762	2499769	0 %	25 %	0 %	75 %	219852930
46363	NC_011832	TC	3	6	2499768	2499773	0 %	50 %	0 %	50 %	219852930
46364	NC_011832	GATCGT	2	12	2499796	2499807	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219852930
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46367	NC_011832	AGT	2	6	2499904	2499909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852930
46368	NC_011832	TC	3	6	2499921	2499926	0 %	50 %	0 %	50 %	219852930
46369	NC_011832	ACTG	2	8	2499928	2499935	25 %	25 %	25 %	25 %	219852930
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46373	NC_011832	CATT	2	8	2500125	2500132	25 %	50 %	0 %	25 %	219852930
46374	NC_011832	CTA	2	6	2500183	2500188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852930
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46378	NC_011832	GA	3	6	2500429	2500434	50 %	0 %	50 %	0 %	219852930
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46383	NC_011832	CTA	2	6	2500639	2500644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852930
46384	NC_011832	GATC	2	8	2501752	2501759	25 %	25 %	25 %	25 %	219852931
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46455	NC_011832	TCG	2	6	2504926	2504931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852934
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46459	NC_011832	CTGG	2	8	2505234	2505241	0 %	25 %	50 %	25 %	219852935
46460	NC_011832	TCA	2	6	2505266	2505271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852935
46461	NC_011832	CAG	2	6	2505291	2505296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852935
46462	NC_011832	ACC	2	6	2505302	2505307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852935
46463	NC_011832	TTTGC	2	10	2505470	2505479	0 %	60 %	20 %	20 %	219852935
46464	NC_011832	ATG	2	6	2505535	2505540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852935
46465	NC_011832	GAAC	2	8	2505552	2505559	50 %	0 %	25 %	25 %	219852935
46466	NC_011832	CCG	3	9	2505568	2505576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852935
46467	NC_011832	TGG	2	6	2505591	2505596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852935
46468	NC_011832	CGA	2	6	2505602	2505607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852935
46469	NC_011832	GAC	2	6	2505613	2505618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852935
46470	NC_011832	GCA	2	6	2505714	2505719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852935
46471	NC_011832	CGA	2	6	2505740	2505745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852935
46472	NC_011832	CCA	2	6	2505794	2505799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852935
46473	NC_011832	A	6	6	2505802	2505807	100 %	0 %	0 %	0 %	219852935
46474	NC_011832	GTG	2	6	2505841	2505846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852935
46475	NC_011832	AGG	2	6	2505881	2505886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852935
46476	NC_011832	ATC	2	6	2505895	2505900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852935
46477	NC_011832	CGC	2	6	2505906	2505911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852935
46478	NC_011832	CTGAC	2	10	2506010	2506019	20 %	20 %	20 %	40 %	219852935
46479	NC_011832	CGG	2	6	2506041	2506046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852935
46480	NC_011832	CAGG	2	8	2506053	2506060	25 %	0 %	50 %	25 %	219852935
46481	NC_011832	CACC	2	8	2506095	2506102	25 %	0 %	0 %	75 %	219852935
46482	NC_011832	GAG	2	6	2506108	2506113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852935
46483	NC_011832	CCA	2	6	2506146	2506151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852935
46484	NC_011832	GCG	2	6	2506162	2506167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852935
46485	NC_011832	GAT	2	6	2506212	2506217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852935
46486	NC_011832	CTC	2	6	2506300	2506305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852935
46487	NC_011832	G	6	6	2506340	2506345	0 %	0 %	100 %	0 %	219852935
46488	NC_011832	ATG	2	6	2506406	2506411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852935
46489	NC_011832	GAC	2	6	2506465	2506470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852935
46490	NC_011832	GAT	2	6	2506533	2506538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852935
46491	NC_011832	AGA	2	6	2506577	2506582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852935
46492	NC_011832	A	6	6	2506613	2506618	100 %	0 %	0 %	0 %	219852935
46493	NC_011832	CCA	2	6	2506646	2506651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852935
46494	NC_011832	CGG	2	6	2506658	2506663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852935
46495	NC_011832	ACCG	2	8	2507669	2507676	25 %	0 %	25 %	50 %	219852936
46496	NC_011832	GATC	2	8	2507762	2507769	25 %	25 %	25 %	25 %	219852936
46497	NC_011832	ACC	2	6	2507827	2507832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852936
46498	NC_011832	TGC	2	6	2507842	2507847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852936
46499	NC_011832	GCC	2	6	2507856	2507861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852936
46500	NC_011832	GTC	2	6	2507871	2507876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852936

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