MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_011832	CTG	2	6	2399051	2399056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852835
44502	NC_011832	CGG	2	6	2399120	2399125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852835
44503	NC_011832	C	6	6	2399162	2399167	0 %	0 %	0 %	100 %	219852835
44504	NC_011832	ACC	2	6	2399225	2399230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852835
44505	NC_011832	CAGG	2	8	2399239	2399246	25 %	0 %	50 %	25 %	219852835
44506	NC_011832	TGG	2	6	2399310	2399315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852835
44507	NC_011832	AGG	2	6	2399384	2399389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852835
44508	NC_011832	CAG	2	6	2399396	2399401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852835
44509	NC_011832	TGA	2	6	2399415	2399420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852835
44510	NC_011832	CAG	2	6	2399468	2399473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852835
44511	NC_011832	TGG	2	6	2399523	2399528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852835
44512	NC_011832	TCCG	2	8	2399557	2399564	0 %	25 %	25 %	50 %	219852835
44513	NC_011832	GAA	2	6	2399629	2399634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852835
44514	NC_011832	GGT	2	6	2399659	2399664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852835
44515	NC_011832	CTG	2	6	2399668	2399673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852835
44516	NC_011832	GAT	2	6	2399674	2399679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852835
44517	NC_011832	CAG	2	6	2399732	2399737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852835
44518	NC_011832	TCG	2	6	2399802	2399807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852835
44519	NC_011832	GGA	2	6	2399821	2399826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852835
44520	NC_011832	AT	3	6	2399831	2399836	50 %	50 %	0 %	0 %	219852835
44521	NC_011832	CAGG	2	8	2399851	2399858	25 %	0 %	50 %	25 %	219852835
44522	NC_011832	ATC	2	6	2399876	2399881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852835
44523	NC_011832	GGT	2	6	2399898	2399903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852835
44524	NC_011832	TCA	2	6	2399928	2399933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852835
44525	NC_011832	ATC	2	6	2400011	2400016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852836
44526	NC_011832	GCA	2	6	2400045	2400050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852836
44527	NC_011832	CGC	2	6	2400055	2400060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852836
44528	NC_011832	CA	3	6	2400094	2400099	50 %	0 %	0 %	50 %	219852836
44529	NC_011832	ACA	2	6	2400102	2400107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852836
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44531	NC_011832	CTG	2	6	2400314	2400319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852836
44532	NC_011832	GGA	2	6	2400334	2400339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852836
44533	NC_011832	CGG	2	6	2400372	2400377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852836
44534	NC_011832	ACG	2	6	2400388	2400393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852836
44535	NC_011832	CGG	2	6	2400428	2400433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852836
44536	NC_011832	GGA	2	6	2400439	2400444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852836
44537	NC_011832	TGAC	2	8	2400474	2400481	25 %	25 %	25 %	25 %	219852836
44538	NC_011832	AGA	2	6	2400561	2400566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852836
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44540	NC_011832	CTT	2	6	2400577	2400582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852836
44541	NC_011832	TTC	2	6	2400602	2400607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852836
44542	NC_011832	ATC	2	6	2400617	2400622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852836
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44544	NC_011832	CTG	2	6	2400674	2400679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852836
44545	NC_011832	GGC	2	6	2400700	2400705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852836
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44547	NC_011832	CTA	2	6	2400802	2400807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852836
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44550	NC_011832	GAA	2	6	2400868	2400873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852836
44551	NC_011832	AG	3	6	2400929	2400934	50 %	0 %	50 %	0 %	219852836
44552	NC_011832	CAG	2	6	2400980	2400985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852836
44553	NC_011832	TCG	2	6	2401014	2401019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852836
44554	NC_011832	CAC	2	6	2401042	2401047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852836
44555	NC_011832	CTG	2	6	2401098	2401103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852837
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44558	NC_011832	CGA	2	6	2401226	2401231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852837
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44561	NC_011832	CAC	2	6	2401304	2401309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852837
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44585	NC_011832	GCCG	2	8	2402226	2402233	0 %	0 %	50 %	50 %	219852837
44586	NC_011832	GTCG	2	8	2402246	2402253	0 %	25 %	50 %	25 %	219852837
44587	NC_011832	CAG	2	6	2402268	2402273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852837
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44590	NC_011832	CTC	2	6	2402379	2402384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852837
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44603	NC_011832	CCGG	2	8	2402988	2402995	0 %	0 %	50 %	50 %	219852837
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44606	NC_011832	CGGG	2	8	2403136	2403143	0 %	0 %	75 %	25 %	219852837
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44615	NC_011832	GAG	2	6	2403698	2403703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852838
44616	NC_011832	CTG	2	6	2403737	2403742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852838
44617	NC_011832	GTG	2	6	2403752	2403757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852838
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44731	NC_011832	TGC	2	6	2410650	2410655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852840
44732	NC_011832	GTCGG	2	10	2410658	2410667	0 %	20 %	60 %	20 %	219852840
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44847	NC_011832	CCT	2	6	2417037	2417042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852844
44848	NC_011832	TCGC	2	8	2417080	2417087	0 %	25 %	25 %	50 %	219852844
44849	NC_011832	TCC	3	9	2417121	2417129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852844
44850	NC_011832	CCG	2	6	2417163	2417168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852844
44851	NC_011832	CTC	2	6	2417183	2417188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852844
44852	NC_011832	CTT	2	6	2417234	2417239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852844
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44860	NC_011832	CGG	2	6	2417585	2417590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852845
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44874	NC_011832	CGA	3	9	2418753	2418761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852846
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44959	NC_011832	CAC	2	6	2423537	2423542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852851
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44961	NC_011832	ATC	2	6	2423575	2423580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852851
44962	NC_011832	TCGA	2	8	2423593	2423600	25 %	25 %	25 %	25 %	219852851
44963	NC_011832	CTC	2	6	2423610	2423615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852851
44964	NC_011832	CCG	2	6	2423702	2423707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852851
44965	NC_011832	CCT	2	6	2423735	2423740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852851
44966	NC_011832	TCT	2	6	2423756	2423761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852851
44967	NC_011832	TTG	2	6	2423779	2423784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852851
44968	NC_011832	TCG	2	6	2423800	2423805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852851
44969	NC_011832	CTCGT	2	10	2423836	2423845	0 %	40 %	20 %	40 %	219852851
44970	NC_011832	CCT	2	6	2423861	2423866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852851
44971	NC_011832	GATCGG	2	12	2423869	2423880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219852851
44972	NC_011832	GCG	2	6	2423950	2423955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852851
44973	NC_011832	ACC	2	6	2423956	2423961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852851
44974	NC_011832	GGC	2	6	2423991	2423996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852851
44975	NC_011832	TGA	2	6	2424047	2424052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852851
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44977	NC_011832	AG	3	6	2424183	2424188	50 %	0 %	50 %	0 %	219852851
44978	NC_011832	CCT	2	6	2424239	2424244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852851
44979	NC_011832	AT	3	6	2424257	2424262	50 %	50 %	0 %	0 %	219852851
44980	NC_011832	GCA	2	6	2424275	2424280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852851
44981	NC_011832	CTG	2	6	2424282	2424287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852851
44982	NC_011832	ATCG	2	8	2424324	2424331	25 %	25 %	25 %	25 %	219852851
44983	NC_011832	CTG	2	6	2424345	2424350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852851
44984	NC_011832	CTG	2	6	2424358	2424363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852851
44985	NC_011832	AGA	2	6	2424552	2424557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852851
44986	NC_011832	GCA	2	6	2424580	2424585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852851
44987	NC_011832	TGT	2	6	2424602	2424607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852851
44988	NC_011832	ATCC	2	8	2424657	2424664	25 %	25 %	0 %	50 %	219852851
44989	NC_011832	CGCCT	2	10	2424703	2424712	0 %	20 %	20 %	60 %	219852851
44990	NC_011832	CGA	2	6	2424758	2424763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852851
44991	NC_011832	GCCT	2	8	2424812	2424819	0 %	25 %	25 %	50 %	219852851
44992	NC_011832	GACG	2	8	2424822	2424829	25 %	0 %	50 %	25 %	219852851
44993	NC_011832	CAT	2	6	2424848	2424853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852851
44994	NC_011832	GAT	2	6	2424869	2424874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852851
44995	NC_011832	AACC	2	8	2424897	2424904	50 %	0 %	0 %	50 %	219852851
44996	NC_011832	TCT	2	6	2424971	2424976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852851
44997	NC_011832	GTT	2	6	2425155	2425160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852851
44998	NC_011832	CGG	2	6	2425190	2425195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852851
44999	NC_011832	GAT	2	6	2425296	2425301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852851
45000	NC_011832	GCCT	2	8	2425349	2425356	0 %	25 %	25 %	50 %	219852851

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