MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_011832	TGA	2	6	2371933	2371938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852805
44002	NC_011832	TCGA	2	8	2371980	2371987	25 %	25 %	25 %	25 %	219852805
44003	NC_011832	TCA	2	6	2372137	2372142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852805
44004	NC_011832	TCG	2	6	2372176	2372181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852805
44005	NC_011832	CCT	3	9	2372186	2372194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852805
44006	NC_011832	TGC	2	6	2372231	2372236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852805
44007	NC_011832	AG	3	6	2372246	2372251	50 %	0 %	50 %	0 %	219852805
44008	NC_011832	TCATCT	2	12	2372296	2372307	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219852805
44009	NC_011832	TCA	2	6	2372353	2372358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852805
44010	NC_011832	TC	3	6	2372363	2372368	0 %	50 %	0 %	50 %	219852805
44011	NC_011832	C	6	6	2372368	2372373	0 %	0 %	0 %	100 %	219852805
44012	NC_011832	ATC	2	6	2372433	2372438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852805
44013	NC_011832	TCAC	2	8	2372934	2372941	25 %	25 %	0 %	50 %	219852806
44014	NC_011832	CGC	2	6	2372977	2372982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852806
44015	NC_011832	TCA	2	6	2373011	2373016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852806
44016	NC_011832	CCA	2	6	2373042	2373047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852806
44017	NC_011832	CGC	2	6	2373096	2373101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852806
44018	NC_011832	TCC	2	6	2373179	2373184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852806
44019	NC_011832	TCG	2	6	2373185	2373190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44020	NC_011832	ACCCTG	2	12	2373203	2373214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219852806
44021	NC_011832	AGG	2	6	2373248	2373253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852806
44022	NC_011832	AG	3	6	2373268	2373273	50 %	0 %	50 %	0 %	219852806
44023	NC_011832	GA	4	8	2373364	2373371	50 %	0 %	50 %	0 %	219852806
44024	NC_011832	CTG	2	6	2373404	2373409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44025	NC_011832	ATC	2	6	2373410	2373415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852806
44026	NC_011832	GAT	2	6	2373427	2373432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852806
44027	NC_011832	CCGA	2	8	2373434	2373441	25 %	0 %	25 %	50 %	219852806
44028	NC_011832	CGT	2	6	2373454	2373459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44029	NC_011832	TCGG	2	8	2373485	2373492	0 %	25 %	50 %	25 %	219852806
44030	NC_011832	G	7	7	2373499	2373505	0 %	0 %	100 %	0 %	219852806
44031	NC_011832	GTT	2	6	2373553	2373558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852806
44032	NC_011832	ATG	2	6	2373572	2373577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852806
44033	NC_011832	CCT	2	6	2373594	2373599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852806
44034	NC_011832	CTG	2	6	2373658	2373663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44035	NC_011832	CCA	2	6	2373735	2373740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852806
44036	NC_011832	GGT	2	6	2373759	2373764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852806
44037	NC_011832	GAT	2	6	2373799	2373804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852806
44038	NC_011832	TCG	2	6	2373917	2373922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44039	NC_011832	GCGG	2	8	2373924	2373931	0 %	0 %	75 %	25 %	219852806
44040	NC_011832	GTG	2	6	2373932	2373937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852806
44041	NC_011832	TTC	2	6	2373983	2373988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852806
44042	NC_011832	TGG	2	6	2374023	2374028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852806
44043	NC_011832	TTCA	2	8	2374078	2374085	25 %	50 %	0 %	25 %	219852806
44044	NC_011832	CTG	2	6	2374180	2374185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44045	NC_011832	GC	3	6	2374213	2374218	0 %	0 %	50 %	50 %	219852806
44046	NC_011832	ATA	2	6	2374276	2374281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852806
44047	NC_011832	TG	3	6	2374412	2374417	0 %	50 %	50 %	0 %	219852806
44048	NC_011832	GGT	2	6	2374420	2374425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852806
44049	NC_011832	ATC	2	6	2374444	2374449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852806
44050	NC_011832	GCT	2	6	2374479	2374484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44051	NC_011832	TTC	2	6	2374562	2374567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852806
44052	NC_011832	GAA	2	6	2374579	2374584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852806
44053	NC_011832	GTC	2	6	2374585	2374590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
44054	NC_011832	AG	3	6	2374711	2374716	50 %	0 %	50 %	0 %	219852806
44055	NC_011832	CGAT	2	8	2374722	2374729	25 %	25 %	25 %	25 %	219852806
44056	NC_011832	ATC	2	6	2374983	2374988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852807
44057	NC_011832	GATCCT	2	12	2374991	2375002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219852807
44058	NC_011832	AC	3	6	2375071	2375076	50 %	0 %	0 %	50 %	219852807
44059	NC_011832	CCA	2	6	2375092	2375097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852807
44060	NC_011832	CAG	2	6	2375121	2375126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852807
44061	NC_011832	CAA	2	6	2375158	2375163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852807
44062	NC_011832	TGATC	2	10	2375213	2375222	20 %	40 %	20 %	20 %	219852807
44063	NC_011832	GCG	2	6	2375384	2375389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852808
44064	NC_011832	GAC	2	6	2375472	2375477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852808
44065	NC_011832	GATC	2	8	2375516	2375523	25 %	25 %	25 %	25 %	219852808
44066	NC_011832	CGA	2	6	2375534	2375539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852808
44067	NC_011832	CTG	2	6	2375541	2375546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852808
44068	NC_011832	GA	3	6	2375569	2375574	50 %	0 %	50 %	0 %	219852808
44069	NC_011832	TCC	2	6	2375611	2375616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852808
44070	NC_011832	TCT	2	6	2375653	2375658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852808
44071	NC_011832	GAG	2	6	2375670	2375675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852808
44072	NC_011832	CAG	2	6	2375679	2375684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852808
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44074	NC_011832	CGG	2	6	2375750	2375755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852808
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44077	NC_011832	TACTG	2	10	2375963	2375972	20 %	40 %	20 %	20 %	219852809
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44098	NC_011832	AAG	2	6	2376962	2376967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852809
44099	NC_011832	A	7	7	2377248	2377254	100 %	0 %	0 %	0 %	219852810
44100	NC_011832	CGGC	2	8	2377334	2377341	0 %	0 %	50 %	50 %	219852810
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44103	NC_011832	GCTG	2	8	2377421	2377428	0 %	25 %	50 %	25 %	219852810
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44105	NC_011832	GAG	2	6	2377453	2377458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852810
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44116	NC_011832	GATC	2	8	2378250	2378257	25 %	25 %	25 %	25 %	219852811
44117	NC_011832	ACCG	2	8	2378281	2378288	25 %	0 %	25 %	50 %	219852811
44118	NC_011832	TCG	3	9	2378547	2378555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852811
44119	NC_011832	ATCGCA	2	12	2378570	2378581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219852811
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44123	NC_011832	TCGCC	2	10	2378776	2378785	0 %	20 %	20 %	60 %	219852812
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44128	NC_011832	GTCG	2	8	2379061	2379068	0 %	25 %	50 %	25 %	219852812
44129	NC_011832	GCAT	2	8	2379102	2379109	25 %	25 %	25 %	25 %	219852812
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44219	NC_011832	GTT	2	6	2383481	2383486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852818
44220	NC_011832	GTA	2	6	2383499	2383504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852818
44221	NC_011832	CAT	2	6	2383525	2383530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852818
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44223	NC_011832	TTG	2	6	2383581	2383586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852818
44224	NC_011832	CAT	2	6	2383639	2383644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852818
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44229	NC_011832	CTG	2	6	2384080	2384085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852818
44230	NC_011832	TCGACG	2	12	2384097	2384108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219852818
44231	NC_011832	GGT	2	6	2384140	2384145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852818
44232	NC_011832	CGG	2	6	2384161	2384166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852818
44233	NC_011832	TCG	2	6	2384170	2384175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852818
44234	NC_011832	CA	3	6	2384192	2384197	50 %	0 %	0 %	50 %	219852818
44235	NC_011832	TTC	2	6	2384217	2384222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852818
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44238	NC_011832	CCA	2	6	2384283	2384288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852818
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44243	NC_011832	AG	3	6	2384528	2384533	50 %	0 %	50 %	0 %	219852818
44244	NC_011832	CCCATG	2	12	2384545	2384556	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219852818
44245	NC_011832	AGC	2	6	2384610	2384615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852818
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44260	NC_011832	GAT	2	6	2385684	2385689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852819
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44331	NC_011832	TCT	2	6	2389966	2389971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852823
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44342	NC_011832	CGG	2	6	2390993	2390998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852825
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44346	NC_011832	TCG	2	6	2391240	2391245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852825
44347	NC_011832	TG	3	6	2391343	2391348	0 %	50 %	50 %	0 %	219852825
44348	NC_011832	TC	3	6	2391420	2391425	0 %	50 %	0 %	50 %	219852825
44349	NC_011832	GGTC	2	8	2391584	2391591	0 %	25 %	50 %	25 %	219852826
44350	NC_011832	CAGTC	2	10	2391609	2391618	20 %	20 %	20 %	40 %	219852826
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44454	NC_011832	CGA	2	6	2396883	2396888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852833
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44461	NC_011832	CGA	2	6	2397092	2397097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852833
44462	NC_011832	CTG	2	6	2397112	2397117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852833
44463	NC_011832	TGGA	2	8	2397128	2397135	25 %	25 %	50 %	0 %	219852833
44464	NC_011832	ATC	2	6	2397190	2397195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852833
44465	NC_011832	CGG	2	6	2397214	2397219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852833
44466	NC_011832	GTGATG	2	12	2397325	2397336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	219852833
44467	NC_011832	CGA	2	6	2397339	2397344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852833
44468	NC_011832	G	6	6	2397394	2397399	0 %	0 %	100 %	0 %	219852833
44469	NC_011832	GAC	2	6	2397463	2397468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852833
44470	NC_011832	TCA	2	6	2397560	2397565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852833
44471	NC_011832	GGC	2	6	2397639	2397644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852833
44472	NC_011832	TGA	2	6	2397743	2397748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852834
44473	NC_011832	GGT	2	6	2397882	2397887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852834
44474	NC_011832	GGT	2	6	2397909	2397914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852834
44475	NC_011832	TCT	2	6	2397964	2397969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852834
44476	NC_011832	CTG	2	6	2398003	2398008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852834
44477	NC_011832	TCG	2	6	2398034	2398039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852834
44478	NC_011832	GGGATC	2	12	2398075	2398086	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219852834
44479	NC_011832	CAC	2	6	2398096	2398101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852834
44480	NC_011832	ACC	2	6	2398171	2398176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852834
44481	NC_011832	CAG	2	6	2398187	2398192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852834
44482	NC_011832	TC	3	6	2398194	2398199	0 %	50 %	0 %	50 %	219852834
44483	NC_011832	ATC	2	6	2398210	2398215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852834
44484	NC_011832	GACCA	2	10	2398219	2398228	40 %	0 %	20 %	40 %	219852834
44485	NC_011832	ATC	2	6	2398246	2398251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852834
44486	NC_011832	GGC	2	6	2398410	2398415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852834
44487	NC_011832	GCT	2	6	2398422	2398427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852834
44488	NC_011832	CAC	2	6	2398458	2398463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852834
44489	NC_011832	CGG	2	6	2398563	2398568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852834
44490	NC_011832	TCT	2	6	2398569	2398574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852834
44491	NC_011832	TCC	2	6	2398604	2398609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852834
44492	NC_011832	GTC	2	6	2398618	2398623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852834
44493	NC_011832	GA	3	6	2398667	2398672	50 %	0 %	50 %	0 %	219852834
44494	NC_011832	GGA	2	6	2398830	2398835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852834
44495	NC_011832	AAG	2	6	2398858	2398863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852834
44496	NC_011832	GAA	2	6	2398894	2398899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852834
44497	NC_011832	CTC	2	6	2398900	2398905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852834
44498	NC_011832	TGA	2	6	2398906	2398911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852834
44499	NC_011832	CTC	2	6	2399024	2399029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852835
44500	NC_011832	ATG	2	6	2399040	2399045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852835

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