MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_011832	TCGA	2	8	2317961	2317968	25 %	25 %	25 %	25 %	219852767
43003	NC_011832	TAC	2	6	2317969	2317974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852767
43004	NC_011832	A	6	6	2317987	2317992	100 %	0 %	0 %	0 %	219852767
43005	NC_011832	GCA	2	6	2318032	2318037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852767
43006	NC_011832	CAT	2	6	2318081	2318086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852767
43007	NC_011832	ATG	2	6	2318104	2318109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852767
43008	NC_011832	ATC	2	6	2318119	2318124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852767
43009	NC_011832	TAT	2	6	2318205	2318210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852767
43010	NC_011832	CAAT	2	8	2318227	2318234	50 %	25 %	0 %	25 %	219852767
43011	NC_011832	GAA	2	6	2318409	2318414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852767
43012	NC_011832	TCA	2	6	2318431	2318436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852767
43013	NC_011832	AG	4	8	2318733	2318740	50 %	0 %	50 %	0 %	219852768
43014	NC_011832	CAA	2	6	2318741	2318746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852768
43015	NC_011832	CGA	3	9	2318823	2318831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852768
43016	NC_011832	TGG	2	6	2318842	2318847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852768
43017	NC_011832	CA	3	6	2318923	2318928	50 %	0 %	0 %	50 %	219852768
43018	NC_011832	AT	3	6	2318937	2318942	50 %	50 %	0 %	0 %	219852768
43019	NC_011832	CTGG	2	8	2318970	2318977	0 %	25 %	50 %	25 %	219852768
43020	NC_011832	TAT	2	6	2318995	2319000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852768
43021	NC_011832	A	6	6	2319058	2319063	100 %	0 %	0 %	0 %	219852768
43022	NC_011832	AG	3	6	2319071	2319076	50 %	0 %	50 %	0 %	219852768
43023	NC_011832	CCTAT	2	10	2319105	2319114	20 %	40 %	0 %	40 %	219852768
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43025	NC_011832	CATG	2	8	2319221	2319228	25 %	25 %	25 %	25 %	219852768
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43028	NC_011832	CA	3	6	2319355	2319360	50 %	0 %	0 %	50 %	219852768
43029	NC_011832	GAC	2	6	2319367	2319372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852768
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43031	NC_011832	GGA	2	6	2319420	2319425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852768
43032	NC_011832	GGA	2	6	2319428	2319433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852768
43033	NC_011832	A	6	6	2319475	2319480	100 %	0 %	0 %	0 %	219852768
43034	NC_011832	AATC	2	8	2319504	2319511	50 %	25 %	0 %	25 %	219852769
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43037	NC_011832	GAG	2	6	2319653	2319658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852769
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43092	NC_011832	CAGAT	2	10	2322275	2322284	40 %	20 %	20 %	20 %	219852771
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43101	NC_011832	T	6	6	2322690	2322695	0 %	100 %	0 %	0 %	219852771
43102	NC_011832	A	7	7	2322699	2322705	100 %	0 %	0 %	0 %	219852771
43103	NC_011832	GA	3	6	2322777	2322782	50 %	0 %	50 %	0 %	219852771
43104	NC_011832	C	6	6	2322794	2322799	0 %	0 %	0 %	100 %	219852771
43105	NC_011832	ATC	2	6	2322853	2322858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852771
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43112	NC_011832	CCAT	2	8	2323463	2323470	25 %	25 %	0 %	50 %	219852772
43113	NC_011832	AGAGA	2	10	2323477	2323486	60 %	0 %	40 %	0 %	219852772
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43118	NC_011832	CGA	2	6	2323701	2323706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852772
43119	NC_011832	GAA	2	6	2323753	2323758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852772
43120	NC_011832	TTC	2	6	2323795	2323800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852772
43121	NC_011832	GAAGA	2	10	2323816	2323825	60 %	0 %	40 %	0 %	219852772
43122	NC_011832	T	6	6	2323842	2323847	0 %	100 %	0 %	0 %	219852772
43123	NC_011832	GTAT	2	8	2323871	2323878	25 %	50 %	25 %	0 %	219852772
43124	NC_011832	TACC	2	8	2323920	2323927	25 %	25 %	0 %	50 %	219852772
43125	NC_011832	GATCT	2	10	2323948	2323957	20 %	40 %	20 %	20 %	219852772
43126	NC_011832	AG	3	6	2323970	2323975	50 %	0 %	50 %	0 %	219852772
43127	NC_011832	TA	3	6	2323978	2323983	50 %	50 %	0 %	0 %	219852772
43128	NC_011832	TCA	2	6	2324084	2324089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852772
43129	NC_011832	TTCA	2	8	2324157	2324164	25 %	50 %	0 %	25 %	219852772
43130	NC_011832	GAAT	2	8	2324201	2324208	50 %	25 %	25 %	0 %	219852772
43131	NC_011832	GAT	2	6	2324261	2324266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852772
43132	NC_011832	CCT	2	6	2324377	2324382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852773
43133	NC_011832	CT	3	6	2324389	2324394	0 %	50 %	0 %	50 %	219852773
43134	NC_011832	GAA	2	6	2324398	2324403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852773
43135	NC_011832	CGCT	2	8	2324409	2324416	0 %	25 %	25 %	50 %	219852773
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43137	NC_011832	TC	3	6	2324475	2324480	0 %	50 %	0 %	50 %	219852773
43138	NC_011832	AAATTC	2	12	2324491	2324502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219852773
43139	NC_011832	TCA	2	6	2324539	2324544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852773
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43141	NC_011832	GTT	2	6	2324573	2324578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852773
43142	NC_011832	GAA	2	6	2324635	2324640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852773
43143	NC_011832	GGT	2	6	2324647	2324652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852773
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43145	NC_011832	ATC	2	6	2324720	2324725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852773
43146	NC_011832	A	6	6	2324905	2324910	100 %	0 %	0 %	0 %	219852773
43147	NC_011832	A	6	6	2325130	2325135	100 %	0 %	0 %	0 %	219852773
43148	NC_011832	AT	3	6	2325185	2325190	50 %	50 %	0 %	0 %	219852773
43149	NC_011832	TGC	2	6	2325254	2325259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852773
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43151	NC_011832	GAT	2	6	2325315	2325320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852773
43152	NC_011832	AGA	2	6	2325350	2325355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852773
43153	NC_011832	AG	3	6	2325395	2325400	50 %	0 %	50 %	0 %	219852773
43154	NC_011832	T	7	7	2325434	2325440	0 %	100 %	0 %	0 %	219852773
43155	NC_011832	ACC	2	6	2325687	2325692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852774
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43157	NC_011832	ATG	2	6	2325745	2325750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852774
43158	NC_011832	AGTA	2	8	2325779	2325786	50 %	25 %	25 %	0 %	219852774
43159	NC_011832	G	8	8	2325854	2325861	0 %	0 %	100 %	0 %	219852774
43160	NC_011832	ATA	2	6	2325884	2325889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852774
43161	NC_011832	T	6	6	2325907	2325912	0 %	100 %	0 %	0 %	219852774
43162	NC_011832	TCAAC	2	10	2325918	2325927	40 %	20 %	0 %	40 %	219852774
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43222	NC_011832	GCA	2	6	2328522	2328527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852776
43223	NC_011832	C	6	6	2328567	2328572	0 %	0 %	0 %	100 %	219852776
43224	NC_011832	CTC	2	6	2328592	2328597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852776
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43229	NC_011832	AAT	2	6	2328694	2328699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852776
43230	NC_011832	TGAT	2	8	2328756	2328763	25 %	50 %	25 %	0 %	219852776
43231	NC_011832	TTG	2	6	2328916	2328921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852776
43232	NC_011832	CCGG	2	8	2328940	2328947	0 %	0 %	50 %	50 %	219852776
43233	NC_011832	ATC	2	6	2329044	2329049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852776
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43236	NC_011832	TTG	2	6	2329195	2329200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852776
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43352	NC_011832	G	6	6	2335165	2335170	0 %	0 %	100 %	0 %	219852781
43353	NC_011832	AGA	2	6	2335192	2335197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852781
43354	NC_011832	AG	3	6	2335229	2335234	50 %	0 %	50 %	0 %	219852781
43355	NC_011832	GAG	2	6	2335279	2335284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852781
43356	NC_011832	AAT	2	6	2335328	2335333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852782
43357	NC_011832	CTC	2	6	2335404	2335409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852782
43358	NC_011832	ATC	2	6	2335434	2335439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852782
43359	NC_011832	CTG	2	6	2335473	2335478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852782
43360	NC_011832	ATCGC	2	10	2335542	2335551	20 %	20 %	20 %	40 %	219852782
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43363	NC_011832	CGT	2	6	2335673	2335678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852782
43364	NC_011832	GAA	2	6	2335704	2335709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852782
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43468	NC_011832	CCT	2	6	2339968	2339973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852785
43469	NC_011832	TCA	2	6	2339998	2340003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852785
43470	NC_011832	C	6	6	2340282	2340287	0 %	0 %	0 %	100 %	219852785
43471	NC_011832	ACAT	2	8	2340300	2340307	50 %	25 %	0 %	25 %	219852785
43472	NC_011832	TCG	2	6	2340309	2340314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852785
43473	NC_011832	CCCTG	2	10	2340321	2340330	0 %	20 %	20 %	60 %	219852785
43474	NC_011832	ATC	2	6	2340423	2340428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852785
43475	NC_011832	CTT	2	6	2340528	2340533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852786
43476	NC_011832	TCT	2	6	2340572	2340577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852786
43477	NC_011832	CCCTG	2	10	2340605	2340614	0 %	20 %	20 %	60 %	219852786
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43479	NC_011832	AGAGA	2	10	2340819	2340828	60 %	0 %	40 %	0 %	219852786
43480	NC_011832	TC	4	8	2340935	2340942	0 %	50 %	0 %	50 %	219852787
43481	NC_011832	GAG	2	6	2340959	2340964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852787
43482	NC_011832	AGG	2	6	2341149	2341154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852787
43483	NC_011832	GGT	2	6	2341156	2341161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852787
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43485	NC_011832	G	6	6	2341210	2341215	0 %	0 %	100 %	0 %	219852787
43486	NC_011832	GA	3	6	2341237	2341242	50 %	0 %	50 %	0 %	219852787
43487	NC_011832	CGG	2	6	2341255	2341260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852787
43488	NC_011832	ATC	2	6	2341271	2341276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852787
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43490	NC_011832	GAG	2	6	2341307	2341312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852787
43491	NC_011832	GAG	2	6	2341328	2341333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852787
43492	NC_011832	TGA	2	6	2341347	2341352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852787
43493	NC_011832	GCC	2	6	2341370	2341375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852787
43494	NC_011832	AGG	2	6	2341404	2341409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852787
43495	NC_011832	TCG	2	6	2341431	2341436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852787
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43497	NC_011832	GGT	2	6	2341465	2341470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852787
43498	NC_011832	GGCC	2	8	2341471	2341478	0 %	0 %	50 %	50 %	219852787
43499	NC_011832	TCG	2	6	2341479	2341484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852787
43500	NC_011832	GAG	2	6	2341661	2341666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852787

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