MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_011832	CAGTC	2	10	2244700	2244709	20 %	20 %	20 %	40 %	219852702
41502	NC_011832	TCA	2	6	2244723	2244728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852702
41503	NC_011832	GCT	2	6	2244755	2244760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852702
41504	NC_011832	GAT	2	6	2244806	2244811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
41505	NC_011832	TGA	2	6	2244823	2244828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
41506	NC_011832	GGC	2	6	2244872	2244877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852702
41507	NC_011832	GGT	2	6	2244899	2244904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852702
41508	NC_011832	CAG	2	6	2244917	2244922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852702
41509	NC_011832	TGA	2	6	2245030	2245035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
41510	NC_011832	GC	3	6	2245087	2245092	0 %	0 %	50 %	50 %	219852702
41511	NC_011832	CAG	2	6	2245094	2245099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852702
41512	NC_011832	CAT	2	6	2245132	2245137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852702
41513	NC_011832	CAT	2	6	2245139	2245144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852702
41514	NC_011832	AGA	2	6	2245168	2245173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852702
41515	NC_011832	GAT	2	6	2245238	2245243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
41516	NC_011832	ACCG	2	8	2245250	2245257	25 %	0 %	25 %	50 %	219852702
41517	NC_011832	GAA	2	6	2245280	2245285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852702
41518	NC_011832	GAG	2	6	2245300	2245305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852702
41519	NC_011832	TGAAA	2	10	2245317	2245326	60 %	20 %	20 %	0 %	219852702
41520	NC_011832	A	7	7	2245324	2245330	100 %	0 %	0 %	0 %	219852702
41521	NC_011832	CGA	2	6	2245423	2245428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852702
41522	NC_011832	CAC	2	6	2245439	2245444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852702
41523	NC_011832	GGA	2	6	2245450	2245455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852702
41524	NC_011832	TGA	2	6	2245474	2245479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
41525	NC_011832	AGCG	2	8	2245532	2245539	25 %	0 %	50 %	25 %	219852702
41526	NC_011832	ATCG	2	8	2246025	2246032	25 %	25 %	25 %	25 %	219852703
41527	NC_011832	ATC	2	6	2246033	2246038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852703
41528	NC_011832	TGA	2	6	2246140	2246145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852703
41529	NC_011832	TCA	2	6	2246178	2246183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852703
41530	NC_011832	GCACT	2	10	2246198	2246207	20 %	20 %	20 %	40 %	219852703
41531	NC_011832	AGA	2	6	2246217	2246222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852703
41532	NC_011832	GA	3	6	2246235	2246240	50 %	0 %	50 %	0 %	219852703
41533	NC_011832	AAG	2	6	2246303	2246308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852703
41534	NC_011832	ACC	2	6	2246351	2246356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852703
41535	NC_011832	GAA	2	6	2246368	2246373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852703
41536	NC_011832	AAC	2	6	2246463	2246468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852703
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41539	NC_011832	ACG	2	6	2246752	2246757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852704
41540	NC_011832	CAGC	2	8	2246834	2246841	25 %	0 %	25 %	50 %	219852704
41541	NC_011832	ACG	2	6	2246878	2246883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852704
41542	NC_011832	CTC	2	6	2246961	2246966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852704
41543	NC_011832	ATC	2	6	2247033	2247038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852704
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41546	NC_011832	TC	4	8	2247127	2247134	0 %	50 %	0 %	50 %	219852704
41547	NC_011832	GCA	3	9	2247155	2247163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852704
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41549	NC_011832	GA	3	6	2247265	2247270	50 %	0 %	50 %	0 %	219852704
41550	NC_011832	CGC	2	6	2247278	2247283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852704
41551	NC_011832	GCA	2	6	2247294	2247299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852704
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41553	NC_011832	CCA	2	6	2247334	2247339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852704
41554	NC_011832	ACA	2	6	2247348	2247353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852704
41555	NC_011832	CGT	2	6	2247362	2247367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852704
41556	NC_011832	TGA	2	6	2247413	2247418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852704
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41561	NC_011832	CAT	2	6	2247536	2247541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852704
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41565	NC_011832	CCT	2	6	2247923	2247928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852705
41566	NC_011832	GTT	2	6	2247939	2247944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852705
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41593	NC_011832	TTCT	2	8	2249098	2249105	0 %	75 %	0 %	25 %	219852705
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41598	NC_011832	CTGC	2	8	2249332	2249339	0 %	25 %	25 %	50 %	219852705
41599	NC_011832	GAA	2	6	2249574	2249579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852706
41600	NC_011832	GA	3	6	2249593	2249598	50 %	0 %	50 %	0 %	219852706
41601	NC_011832	CAT	2	6	2249663	2249668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852706
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41603	NC_011832	A	8	8	2249769	2249776	100 %	0 %	0 %	0 %	219852706
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41615	NC_011832	ACC	2	6	2250146	2250151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
41616	NC_011832	GA	3	6	2250158	2250163	50 %	0 %	50 %	0 %	219852707
41617	NC_011832	AGA	2	6	2250203	2250208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852707
41618	NC_011832	TCC	2	6	2250244	2250249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852707
41619	NC_011832	GCCG	2	8	2250252	2250259	0 %	0 %	50 %	50 %	219852707
41620	NC_011832	GACA	2	8	2250282	2250289	50 %	0 %	25 %	25 %	219852707
41621	NC_011832	CCGG	2	8	2250307	2250314	0 %	0 %	50 %	50 %	219852707
41622	NC_011832	GTG	2	6	2250412	2250417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852707
41623	NC_011832	ACC	2	6	2250486	2250491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
41624	NC_011832	CCA	2	6	2250497	2250502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
41625	NC_011832	TGC	2	6	2250503	2250508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852707
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41628	NC_011832	TGG	2	6	2250688	2250693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852707
41629	NC_011832	T	6	6	2250732	2250737	0 %	100 %	0 %	0 %	219852707
41630	NC_011832	CGA	2	6	2250746	2250751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852707
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41632	NC_011832	GAA	2	6	2250800	2250805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852707
41633	NC_011832	GCA	2	6	2250856	2250861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852707
41634	NC_011832	CTG	2	6	2250921	2250926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852707
41635	NC_011832	AGAGAT	2	12	2250941	2250952	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219852707
41636	NC_011832	CCA	2	6	2250958	2250963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
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41640	NC_011832	AAT	2	6	2251234	2251239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852708
41641	NC_011832	A	6	6	2251278	2251283	100 %	0 %	0 %	0 %	219852708
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41645	NC_011832	GAA	2	6	2251426	2251431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852709
41646	NC_011832	GA	3	6	2251458	2251463	50 %	0 %	50 %	0 %	219852709
41647	NC_011832	C	6	6	2251507	2251512	0 %	0 %	0 %	100 %	219852709
41648	NC_011832	CGAT	2	8	2251568	2251575	25 %	25 %	25 %	25 %	219852709
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41653	NC_011832	ATCG	2	8	2251675	2251682	25 %	25 %	25 %	25 %	219852709
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41663	NC_011832	AG	3	6	2252206	2252211	50 %	0 %	50 %	0 %	219852709
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41717	NC_011832	CCGAT	2	10	2254539	2254548	20 %	20 %	20 %	40 %	219852712
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41719	NC_011832	CCT	2	6	2254567	2254572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852712
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41725	NC_011832	GCT	2	6	2254961	2254966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852712
41726	NC_011832	GCCGTA	2	12	2255030	2255041	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219852712
41727	NC_011832	ATG	2	6	2255052	2255057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852712
41728	NC_011832	CGC	2	6	2255059	2255064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852712
41729	NC_011832	AGG	2	6	2255077	2255082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852712
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41731	NC_011832	GGT	2	6	2255156	2255161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852712
41732	NC_011832	GAG	2	6	2255166	2255171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852712
41733	NC_011832	TCC	2	6	2255190	2255195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852712
41734	NC_011832	CCT	2	6	2255308	2255313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852712
41735	NC_011832	AGC	2	6	2255370	2255375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852712
41736	NC_011832	CTG	2	6	2255381	2255386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852712
41737	NC_011832	C	6	6	2255445	2255450	0 %	0 %	0 %	100 %	219852713
41738	NC_011832	CGAT	2	8	2255453	2255460	25 %	25 %	25 %	25 %	219852713
41739	NC_011832	TCATC	2	10	2255631	2255640	20 %	40 %	0 %	40 %	219852713
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41743	NC_011832	GTC	2	6	2255755	2255760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852713
41744	NC_011832	TCT	2	6	2255784	2255789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852713
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41751	NC_011832	CGA	2	6	2255946	2255951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852713
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41761	NC_011832	TCT	2	6	2256552	2256557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852713
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41765	NC_011832	CTT	2	6	2256661	2256666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852713
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41843	NC_011832	CT	3	6	2260904	2260909	0 %	50 %	0 %	50 %	219852717
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41964	NC_011832	GTC	2	6	2267296	2267301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852725
41965	NC_011832	AG	3	6	2267364	2267369	50 %	0 %	50 %	0 %	219852725
41966	NC_011832	CTG	2	6	2267457	2267462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852725
41967	NC_011832	AT	3	6	2267495	2267500	50 %	50 %	0 %	0 %	219852725
41968	NC_011832	CCAGAG	2	12	2267539	2267550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852725
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