MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_011832	CCGG	2	8	2219997	2220004	0 %	0 %	50 %	50 %	219852682
41002	NC_011832	GAA	2	6	2220007	2220012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852682
41003	NC_011832	ATC	2	6	2220031	2220036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852682
41004	NC_011832	TTC	2	6	2220047	2220052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852682
41005	NC_011832	ACC	2	6	2220080	2220085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852682
41006	NC_011832	TGA	2	6	2220090	2220095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852682
41007	NC_011832	TCA	2	6	2220102	2220107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852682
41008	NC_011832	GAT	2	6	2220115	2220120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852682
41009	NC_011832	GAC	2	6	2220130	2220135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852682
41010	NC_011832	GAA	2	6	2220156	2220161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852682
41011	NC_011832	GAT	2	6	2220181	2220186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852682
41012	NC_011832	GAG	2	6	2220211	2220216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852682
41013	NC_011832	CGA	2	6	2220240	2220245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852682
41014	NC_011832	TTG	2	6	2220275	2220280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852682
41015	NC_011832	CGA	2	6	2220306	2220311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852682
41016	NC_011832	GAG	4	12	2220328	2220339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852682
41017	NC_011832	AGA	2	6	2220354	2220359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852682
41018	NC_011832	GA	3	6	2220364	2220369	50 %	0 %	50 %	0 %	219852682
41019	NC_011832	AGAGC	2	10	2220372	2220381	40 %	0 %	40 %	20 %	219852682
41020	NC_011832	C	7	7	2220384	2220390	0 %	0 %	0 %	100 %	219852682
41021	NC_011832	GAG	2	6	2220397	2220402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852682
41022	NC_011832	GAG	2	6	2220406	2220411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852682
41023	NC_011832	TGC	2	6	2220451	2220456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852682
41024	NC_011832	CCG	2	6	2220664	2220669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852683
41025	NC_011832	TGA	2	6	2220712	2220717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852683
41026	NC_011832	TCA	2	6	2220749	2220754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852683
41027	NC_011832	AGC	2	6	2220867	2220872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852683
41028	NC_011832	TGG	2	6	2220925	2220930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852683
41029	NC_011832	TGG	4	12	2220988	2220999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852683
41030	NC_011832	GAC	2	6	2221005	2221010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852683
41031	NC_011832	GA	3	6	2221046	2221051	50 %	0 %	50 %	0 %	219852683
41032	NC_011832	TGA	2	6	2221069	2221074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852683
41033	NC_011832	GGGC	2	8	2221079	2221086	0 %	0 %	75 %	25 %	219852683
41034	NC_011832	TCAT	2	8	2221108	2221115	25 %	50 %	0 %	25 %	219852683
41035	NC_011832	CGA	2	6	2221124	2221129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852683
41036	NC_011832	TCG	2	6	2221156	2221161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852683
41037	NC_011832	CGG	2	6	2221187	2221192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852683
41038	NC_011832	GAT	2	6	2221217	2221222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852683
41039	NC_011832	G	6	6	2221294	2221299	0 %	0 %	100 %	0 %	219852683
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41041	NC_011832	GCCG	2	8	2221349	2221356	0 %	0 %	50 %	50 %	219852684
41042	NC_011832	TCG	3	9	2221385	2221393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852684
41043	NC_011832	GCC	2	6	2221543	2221548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852684
41044	NC_011832	TCC	2	6	2221577	2221582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852684
41045	NC_011832	CGG	2	6	2221596	2221601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852684
41046	NC_011832	GCA	2	6	2221612	2221617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852684
41047	NC_011832	GAG	2	6	2221618	2221623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852684
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41049	NC_011832	A	6	6	2221654	2221659	100 %	0 %	0 %	0 %	219852684
41050	NC_011832	GAA	3	9	2221803	2221811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852684
41051	NC_011832	GTC	2	6	2221828	2221833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852684
41052	NC_011832	TCG	2	6	2221861	2221866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852684
41053	NC_011832	TCA	2	6	2221934	2221939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852684
41054	NC_011832	ACG	2	6	2222051	2222056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852684
41055	NC_011832	TCC	2	6	2222092	2222097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852684
41056	NC_011832	GATCA	2	10	2222112	2222121	40 %	20 %	20 %	20 %	219852685
41057	NC_011832	TCA	3	9	2222119	2222127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852685
41058	NC_011832	CGT	2	6	2222159	2222164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852685
41059	NC_011832	G	6	6	2222177	2222182	0 %	0 %	100 %	0 %	219852685
41060	NC_011832	TCC	2	6	2222211	2222216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852685
41061	NC_011832	CGAT	2	8	2222310	2222317	25 %	25 %	25 %	25 %	219852685
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41064	NC_011832	TCC	2	6	2222356	2222361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852685
41065	NC_011832	CCG	2	6	2222417	2222422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852685
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41082	NC_011832	GA	3	6	2223039	2223044	50 %	0 %	50 %	0 %	219852685
41083	NC_011832	CGAG	2	8	2223049	2223056	25 %	0 %	50 %	25 %	219852685
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41088	NC_011832	C	6	6	2223305	2223310	0 %	0 %	0 %	100 %	219852685
41089	NC_011832	TGC	2	6	2223322	2223327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852685
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41100	NC_011832	GCT	2	6	2224290	2224295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852687
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41105	NC_011832	ACG	2	6	2224634	2224639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852687
41106	NC_011832	GCA	2	6	2224687	2224692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852687
41107	NC_011832	CT	3	6	2224723	2224728	0 %	50 %	0 %	50 %	219852687
41108	NC_011832	GAT	2	6	2224729	2224734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852687
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41112	NC_011832	GAAGA	2	10	2225209	2225218	60 %	0 %	40 %	0 %	219852688
41113	NC_011832	ACTC	2	8	2225225	2225232	25 %	25 %	0 %	50 %	219852688
41114	NC_011832	TCG	2	6	2225246	2225251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852688
41115	NC_011832	TCG	2	6	2225282	2225287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852688
41116	NC_011832	AGA	2	6	2225297	2225302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852688
41117	NC_011832	CT	3	6	2225373	2225378	0 %	50 %	0 %	50 %	219852688
41118	NC_011832	TTC	2	6	2225385	2225390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852688
41119	NC_011832	GGT	2	6	2225397	2225402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852688
41120	NC_011832	ATC	2	6	2225449	2225454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852688
41121	NC_011832	ATG	2	6	2225489	2225494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852688
41122	NC_011832	GGTCT	2	10	2225617	2225626	0 %	40 %	40 %	20 %	219852688
41123	NC_011832	TTCAG	2	10	2225662	2225671	20 %	40 %	20 %	20 %	219852688
41124	NC_011832	ATC	2	6	2225677	2225682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852688
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41139	NC_011832	CCGA	2	8	2226605	2226612	25 %	0 %	25 %	50 %	219852689
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41144	NC_011832	CCG	2	6	2226799	2226804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852689
41145	NC_011832	CCT	2	6	2226852	2226857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
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41152	NC_011832	TCG	2	6	2227031	2227036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852689
41153	NC_011832	TCC	2	6	2227050	2227055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
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41223	NC_011832	ACC	2	6	2230477	2230482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852692
41224	NC_011832	TC	3	6	2230542	2230547	0 %	50 %	0 %	50 %	219852692
41225	NC_011832	ACT	2	6	2230553	2230558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852692
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41230	NC_011832	TGG	2	6	2230850	2230855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852692
41231	NC_011832	GCCG	2	8	2230914	2230921	0 %	0 %	50 %	50 %	219852692
41232	NC_011832	GCT	2	6	2231058	2231063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852692
41233	NC_011832	CAG	2	6	2231092	2231097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852692
41234	NC_011832	AAC	2	6	2231101	2231106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852692
41235	NC_011832	TGA	2	6	2231107	2231112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852692
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41343	NC_011832	CTGC	2	8	2235891	2235898	0 %	25 %	25 %	50 %	219852696
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41347	NC_011832	TC	3	6	2235981	2235986	0 %	50 %	0 %	50 %	219852696
41348	NC_011832	ATC	2	6	2236073	2236078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852696
41349	NC_011832	CT	3	6	2236088	2236093	0 %	50 %	0 %	50 %	219852696
41350	NC_011832	GCA	2	6	2236133	2236138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852696
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41354	NC_011832	TGA	2	6	2236303	2236308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852696
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41356	NC_011832	CT	3	6	2236328	2236333	0 %	50 %	0 %	50 %	219852696
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41461	NC_011832	TCCAC	2	10	2242748	2242757	20 %	20 %	0 %	60 %	219852701
41462	NC_011832	CCT	2	6	2242805	2242810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852701
41463	NC_011832	CTC	2	6	2242911	2242916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852701
41464	NC_011832	GGA	2	6	2242943	2242948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852701
41465	NC_011832	GCC	2	6	2242962	2242967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852701
41466	NC_011832	CTGTC	2	10	2243021	2243030	0 %	40 %	20 %	40 %	219852701
41467	NC_011832	GTC	2	6	2243094	2243099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852701
41468	NC_011832	T	6	6	2243127	2243132	0 %	100 %	0 %	0 %	219852701
41469	NC_011832	GCA	2	6	2243317	2243322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852702
41470	NC_011832	CAC	2	6	2243330	2243335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852702
41471	NC_011832	ACT	2	6	2243459	2243464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852702
41472	NC_011832	CAT	2	6	2243489	2243494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852702
41473	NC_011832	GAT	2	6	2243516	2243521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
41474	NC_011832	CGT	2	6	2243527	2243532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852702
41475	NC_011832	CTC	2	6	2243564	2243569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852702
41476	NC_011832	GTG	2	6	2243574	2243579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852702
41477	NC_011832	CTT	2	6	2243594	2243599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852702
41478	NC_011832	GAA	2	6	2243606	2243611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852702
41479	NC_011832	CTC	3	9	2243612	2243620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852702
41480	NC_011832	TCG	2	6	2243638	2243643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852702
41481	NC_011832	GTT	2	6	2243684	2243689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852702
41482	NC_011832	TCT	2	6	2243716	2243721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852702
41483	NC_011832	CAC	2	6	2243765	2243770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852702
41484	NC_011832	TCATC	2	10	2243809	2243818	20 %	40 %	0 %	40 %	219852702
41485	NC_011832	CAT	2	6	2243965	2243970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852702
41486	NC_011832	CCA	2	6	2243974	2243979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852702
41487	NC_011832	GAA	2	6	2243996	2244001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852702
41488	NC_011832	ATT	2	6	2244014	2244019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852702
41489	NC_011832	TCC	2	6	2244069	2244074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852702
41490	NC_011832	CCT	2	6	2244075	2244080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852702
41491	NC_011832	GTA	2	6	2244135	2244140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
41492	NC_011832	GA	3	6	2244193	2244198	50 %	0 %	50 %	0 %	219852702
41493	NC_011832	CAA	2	6	2244230	2244235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852702
41494	NC_011832	ATC	2	6	2244303	2244308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852702
41495	NC_011832	TGA	2	6	2244337	2244342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852702
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41497	NC_011832	ACC	2	6	2244477	2244482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852702
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41499	NC_011832	CTG	2	6	2244536	2244541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852702
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