MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_011832	G	6	6	2171773	2171778	0 %	0 %	100 %	0 %	219852645
40002	NC_011832	GCC	2	6	2171783	2171788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852645
40003	NC_011832	CGC	2	6	2171865	2171870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852645
40004	NC_011832	GAA	2	6	2171874	2171879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852645
40005	NC_011832	ATC	2	6	2171980	2171985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852645
40006	NC_011832	GCCG	2	8	2172015	2172022	0 %	0 %	50 %	50 %	219852645
40007	NC_011832	GGA	2	6	2172042	2172047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852645
40008	NC_011832	CGA	2	6	2172059	2172064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852645
40009	NC_011832	GTC	2	6	2172106	2172111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852645
40010	NC_011832	GGA	2	6	2172120	2172125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852645
40011	NC_011832	GGGA	2	8	2172151	2172158	25 %	0 %	75 %	0 %	219852645
40012	NC_011832	GAACG	2	10	2172192	2172201	40 %	0 %	40 %	20 %	219852645
40013	NC_011832	CGA	2	6	2172237	2172242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852645
40014	NC_011832	TCC	2	6	2172248	2172253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852645
40015	NC_011832	AGG	2	6	2172269	2172274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852645
40016	NC_011832	GCGGAG	2	12	2172315	2172326	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	219852645
40017	NC_011832	TAC	2	6	2172342	2172347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852646
40018	NC_011832	GGA	2	6	2172379	2172384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852646
40019	NC_011832	CGT	2	6	2172389	2172394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852646
40020	NC_011832	GCT	2	6	2172398	2172403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852646
40021	NC_011832	GCCG	2	8	2172410	2172417	0 %	0 %	50 %	50 %	219852646
40022	NC_011832	TCG	2	6	2172430	2172435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852646
40023	NC_011832	TCA	2	6	2172478	2172483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852646
40024	NC_011832	CCTCG	2	10	2172509	2172518	0 %	20 %	20 %	60 %	219852646
40025	NC_011832	GGGCG	2	10	2172527	2172536	0 %	0 %	80 %	20 %	219852646
40026	NC_011832	CTG	2	6	2172537	2172542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852646
40027	NC_011832	TCA	2	6	2172628	2172633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852646
40028	NC_011832	CGA	2	6	2172691	2172696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852646
40029	NC_011832	GGA	2	6	2172791	2172796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852646
40030	NC_011832	GAT	2	6	2172824	2172829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852646
40031	NC_011832	CTT	2	6	2172842	2172847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852646
40032	NC_011832	CTG	2	6	2172984	2172989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852646
40033	NC_011832	GTC	2	6	2173002	2173007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852646
40034	NC_011832	ATC	2	6	2173008	2173013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852646
40035	NC_011832	TGCA	2	8	2173020	2173027	25 %	25 %	25 %	25 %	219852646
40036	NC_011832	GGA	2	6	2173036	2173041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852646
40037	NC_011832	GAG	2	6	2173051	2173056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852646
40038	NC_011832	ATT	2	6	2173263	2173268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852647
40039	NC_011832	T	6	6	2173267	2173272	0 %	100 %	0 %	0 %	219852647
40040	NC_011832	ATT	2	6	2173452	2173457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852647
40041	NC_011832	ACA	2	6	2173458	2173463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852647
40042	NC_011832	CTG	2	6	2173537	2173542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852647
40043	NC_011832	A	6	6	2173613	2173618	100 %	0 %	0 %	0 %	219852647
40044	NC_011832	ATCG	2	8	2173967	2173974	25 %	25 %	25 %	25 %	219852648
40045	NC_011832	CGG	2	6	2173990	2173995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852648
40046	NC_011832	CTC	2	6	2174129	2174134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852648
40047	NC_011832	CTG	2	6	2174153	2174158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852648
40048	NC_011832	GAT	2	6	2174171	2174176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852648
40049	NC_011832	GAT	2	6	2174186	2174191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852648
40050	NC_011832	AGC	2	6	2174223	2174228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852648
40051	NC_011832	ATG	2	6	2174235	2174240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852648
40052	NC_011832	GATA	2	8	2174254	2174261	50 %	25 %	25 %	0 %	219852648
40053	NC_011832	ATT	2	6	2174273	2174278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852648
40054	NC_011832	GTT	2	6	2174305	2174310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852649
40055	NC_011832	CCA	2	6	2174321	2174326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852649
40056	NC_011832	TTC	3	9	2174332	2174340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852649
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40058	NC_011832	CTC	2	6	2174388	2174393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852649
40059	NC_011832	GA	4	8	2174420	2174427	50 %	0 %	50 %	0 %	219852649
40060	NC_011832	GAGATC	2	12	2174436	2174447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219852649
40061	NC_011832	GCC	2	6	2174561	2174566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852649
40062	NC_011832	GCA	2	6	2174567	2174572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852649
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40064	NC_011832	AG	3	6	2174617	2174622	50 %	0 %	50 %	0 %	219852649
40065	NC_011832	GTC	2	6	2174628	2174633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852649
40066	NC_011832	AGT	2	6	2174678	2174683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852649
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40070	NC_011832	GAT	2	6	2174826	2174831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852649
40071	NC_011832	GAG	2	6	2174862	2174867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852649
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40115	NC_011832	GCT	2	6	2176691	2176696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852651
40116	NC_011832	GA	3	6	2176719	2176724	50 %	0 %	50 %	0 %	219852651
40117	NC_011832	CGC	2	6	2176753	2176758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852651
40118	NC_011832	CAC	2	6	2176762	2176767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852651
40119	NC_011832	ATC	2	6	2176783	2176788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852651
40120	NC_011832	GAC	2	6	2176801	2176806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852651
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40122	NC_011832	CGGCAC	2	12	2176869	2176880	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219852651
40123	NC_011832	GCC	2	6	2176883	2176888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852651
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40143	NC_011832	CCGG	2	8	2177705	2177712	0 %	0 %	50 %	50 %	219852652
40144	NC_011832	GGC	2	6	2177722	2177727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852652
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40184	NC_011832	GTCCC	2	10	2179622	2179631	0 %	20 %	20 %	60 %	219852654
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40214	NC_011832	TCT	2	6	2180652	2180657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852654
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40217	NC_011832	TTC	2	6	2180717	2180722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852654
40218	NC_011832	ACATT	2	10	2180790	2180799	40 %	40 %	0 %	20 %	219852654
40219	NC_011832	CG	3	6	2180822	2180827	0 %	0 %	50 %	50 %	219852654
40220	NC_011832	CGG	2	6	2180887	2180892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852654
40221	NC_011832	GAT	2	6	2180902	2180907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852654
40222	NC_011832	TCA	2	6	2180948	2180953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852654
40223	NC_011832	CGT	2	6	2180991	2180996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852654
40224	NC_011832	CTG	2	6	2181258	2181263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852655
40225	NC_011832	ATC	2	6	2181324	2181329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852655
40226	NC_011832	GCA	2	6	2181449	2181454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852655
40227	NC_011832	GGCC	2	8	2181475	2181482	0 %	0 %	50 %	50 %	219852655
40228	NC_011832	CGGA	2	8	2181496	2181503	25 %	0 %	50 %	25 %	219852655
40229	NC_011832	TCT	2	6	2181523	2181528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852655
40230	NC_011832	CCG	2	6	2181583	2181588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852655
40231	NC_011832	GTG	2	6	2181597	2181602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852655
40232	NC_011832	TCG	2	6	2181613	2181618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852655
40233	NC_011832	CTC	2	6	2181624	2181629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852655
40234	NC_011832	GGA	2	6	2181641	2181646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852655
40235	NC_011832	GGA	2	6	2181650	2181655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852655
40236	NC_011832	TCG	2	6	2181703	2181708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852655
40237	NC_011832	CAT	2	6	2181716	2181721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852655
40238	NC_011832	ACC	2	6	2181729	2181734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852655
40239	NC_011832	CTG	2	6	2181738	2181743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852655
40240	NC_011832	ATC	2	6	2181753	2181758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852655
40241	NC_011832	GCC	2	6	2181795	2181800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852655
40242	NC_011832	GCGCT	2	10	2181820	2181829	0 %	20 %	40 %	40 %	219852655
40243	NC_011832	ATC	2	6	2181837	2181842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852655
40244	NC_011832	ATC	3	9	2181846	2181854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852655
40245	NC_011832	TCT	2	6	2181886	2181891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852655
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40248	NC_011832	G	7	7	2181963	2181969	0 %	0 %	100 %	0 %	219852655
40249	NC_011832	TCT	2	6	2181988	2181993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852655
40250	NC_011832	TCG	2	6	2182003	2182008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852655
40251	NC_011832	CCGCGG	2	12	2182012	2182023	0 %	0 %	50 %	50 %	219852655
40252	NC_011832	CT	3	6	2182060	2182065	0 %	50 %	0 %	50 %	219852655
40253	NC_011832	GTCG	2	8	2182073	2182080	0 %	25 %	50 %	25 %	219852655
40254	NC_011832	CGGC	2	8	2182087	2182094	0 %	0 %	50 %	50 %	219852655
40255	NC_011832	CAC	2	6	2182145	2182150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852655
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40257	NC_011832	GGC	2	6	2182202	2182207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852655
40258	NC_011832	TCG	2	6	2182237	2182242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852655
40259	NC_011832	CGA	2	6	2182267	2182272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852655
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40262	NC_011832	TCT	2	6	2182414	2182419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852655
40263	NC_011832	GTCG	2	8	2182654	2182661	0 %	25 %	50 %	25 %	219852656
40264	NC_011832	TGC	2	6	2182682	2182687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852656
40265	NC_011832	CCGG	2	8	2182688	2182695	0 %	0 %	50 %	50 %	219852656
40266	NC_011832	GCCG	2	8	2182849	2182856	0 %	0 %	50 %	50 %	219852656
40267	NC_011832	GCT	2	6	2182932	2182937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852656
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40284	NC_011832	CGG	2	6	2183661	2183666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852656
40285	NC_011832	TCG	2	6	2183688	2183693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852656
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40289	NC_011832	CGG	2	6	2183910	2183915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852656
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40292	NC_011832	CCGGT	2	10	2184029	2184038	0 %	20 %	40 %	40 %	219852656
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40298	NC_011832	ATC	2	6	2184353	2184358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852656
40299	NC_011832	GTCATC	2	12	2184364	2184375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219852656
40300	NC_011832	GTC	2	6	2184389	2184394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852656
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40303	NC_011832	C	7	7	2184813	2184819	0 %	0 %	0 %	100 %	219852656
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40305	NC_011832	TCG	2	6	2184918	2184923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852656
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40310	NC_011832	CTG	2	6	2185057	2185062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852656
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40331	NC_011832	CGAA	2	8	2186239	2186246	50 %	0 %	25 %	25 %	219852657
40332	NC_011832	TAA	2	6	2186271	2186276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852657
40333	NC_011832	TCG	2	6	2186293	2186298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852657
40334	NC_011832	CGG	2	6	2186363	2186368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852657
40335	NC_011832	CGT	2	6	2186495	2186500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852657
40336	NC_011832	TGAAC	2	10	2186551	2186560	40 %	20 %	20 %	20 %	219852657
40337	NC_011832	CCGG	2	8	2186573	2186580	0 %	0 %	50 %	50 %	219852657
40338	NC_011832	CGGC	2	8	2186605	2186612	0 %	0 %	50 %	50 %	219852657
40339	NC_011832	TCGC	2	8	2186652	2186659	0 %	25 %	25 %	50 %	219852657
40340	NC_011832	CGT	2	6	2186738	2186743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852657
40341	NC_011832	GAACC	2	10	2186798	2186807	40 %	0 %	20 %	40 %	219852657
40342	NC_011832	GCCG	2	8	2186846	2186853	0 %	0 %	50 %	50 %	219852657
40343	NC_011832	GGGGTC	2	12	2186874	2186885	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	219852657
40344	NC_011832	GAT	2	6	2186906	2186911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852657
40345	NC_011832	CAG	2	6	2186930	2186935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852657
40346	NC_011832	CGG	2	6	2186971	2186976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852657
40347	NC_011832	TTC	2	6	2186985	2186990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852657
40348	NC_011832	ATC	2	6	2187027	2187032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852657
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40350	NC_011832	TGG	2	6	2187157	2187162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852657
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40450	NC_011832	GACG	2	8	2191873	2191880	25 %	0 %	50 %	25 %	219852658
40451	NC_011832	CAGC	2	8	2191926	2191933	25 %	0 %	25 %	50 %	219852658
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40453	NC_011832	AG	3	6	2192002	2192007	50 %	0 %	50 %	0 %	219852658
40454	NC_011832	TCAC	2	8	2192009	2192016	25 %	25 %	0 %	50 %	219852658
40455	NC_011832	CGA	2	6	2192074	2192079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852658
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