MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 54164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011832	AGC	2	6	168943	168948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3502	NC_011832	AAG	2	6	168964	168969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850827
3503	NC_011832	GCC	2	6	169027	169032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850827
3504	NC_011832	CGA	2	6	169061	169066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3505	NC_011832	GAC	2	6	169089	169094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3506	NC_011832	CTG	2	6	169113	169118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3507	NC_011832	GATCG	2	10	169137	169146	20 %	20 %	40 %	20 %	219850827
3508	NC_011832	AG	3	6	169185	169190	50 %	0 %	50 %	0 %	219850827
3509	NC_011832	AG	3	6	169200	169205	50 %	0 %	50 %	0 %	219850827
3510	NC_011832	ACG	2	6	169268	169273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850827
3511	NC_011832	CGC	2	6	169335	169340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850827
3512	NC_011832	GAG	2	6	169378	169383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850827
3513	NC_011832	AG	3	6	169385	169390	50 %	0 %	50 %	0 %	219850827
3514	NC_011832	ATA	2	6	169465	169470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850827
3515	NC_011832	ACC	2	6	169495	169500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850828
3516	NC_011832	CCAC	2	8	169575	169582	25 %	0 %	0 %	75 %	219850828
3517	NC_011832	CGA	2	6	169597	169602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3518	NC_011832	GGA	2	6	169621	169626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850828
3519	NC_011832	GACC	2	8	169664	169671	25 %	0 %	25 %	50 %	219850828
3520	NC_011832	CAG	4	12	169706	169717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3521	NC_011832	GGA	2	6	169792	169797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850828
3522	NC_011832	CGAT	2	8	169819	169826	25 %	25 %	25 %	25 %	219850828
3523	NC_011832	GAT	2	6	169856	169861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3524	NC_011832	GAA	2	6	169895	169900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3525	NC_011832	TCA	2	6	169912	169917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850828
3526	NC_011832	CAG	2	6	169955	169960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3527	NC_011832	CT	3	6	170009	170014	0 %	50 %	0 %	50 %	219850828
3528	NC_011832	TGC	2	6	170034	170039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3529	NC_011832	GCT	2	6	170047	170052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3530	NC_011832	AGA	2	6	170080	170085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3531	NC_011832	AGA	2	6	170104	170109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3532	NC_011832	TCG	2	6	170113	170118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3533	NC_011832	TCAGCG	2	12	170170	170181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3534	NC_011832	GAC	2	6	170195	170200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3535	NC_011832	GAA	2	6	170225	170230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3536	NC_011832	TCG	2	6	170248	170253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3537	NC_011832	AGA	3	9	170254	170262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3538	NC_011832	ATC	2	6	170298	170303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850828
3539	NC_011832	GAT	2	6	170306	170311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3540	NC_011832	GAA	2	6	170327	170332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3541	NC_011832	GGC	2	6	170351	170356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850828
3542	NC_011832	GAGG	2	8	170366	170373	25 %	0 %	75 %	0 %	219850828
3543	NC_011832	CGC	2	6	170399	170404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850828
3544	NC_011832	GAT	2	6	170444	170449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3545	NC_011832	GAG	2	6	170474	170479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850828
3546	NC_011832	C	6	6	170485	170490	0 %	0 %	0 %	100 %	219850828
3547	NC_011832	CGTT	2	8	170502	170509	0 %	50 %	25 %	25 %	219850828
3548	NC_011832	ATG	2	6	170511	170516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3549	NC_011832	TCA	2	6	170518	170523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850828
3550	NC_011832	GAA	2	6	170525	170530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3551	NC_011832	GAT	2	6	170573	170578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3552	NC_011832	CCT	2	6	170629	170634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850828
3553	NC_011832	CTG	2	6	170697	170702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3554	NC_011832	CTG	2	6	170708	170713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3555	NC_011832	ATCG	2	8	170735	170742	25 %	25 %	25 %	25 %	219850828
3556	NC_011832	CGG	2	6	170747	170752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850828
3557	NC_011832	CAC	2	6	170765	170770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850828
3558	NC_011832	G	6	6	170798	170803	0 %	0 %	100 %	0 %	219850828
3559	NC_011832	CTG	2	6	170816	170821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3560	NC_011832	GCG	2	6	170889	170894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850828
3561	NC_011832	CAG	2	6	170957	170962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3562	NC_011832	GAC	2	6	171011	171016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3563	NC_011832	C	6	6	171026	171031	0 %	0 %	0 %	100 %	219850828
3564	NC_011832	TCGG	2	8	171051	171058	0 %	25 %	50 %	25 %	219850828
3565	NC_011832	GTC	2	6	171113	171118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3566	NC_011832	GCG	2	6	171165	171170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850828
3567	NC_011832	CAG	2	6	171188	171193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850828
3568	NC_011832	TCA	2	6	171232	171237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850828
3569	NC_011832	GAGC	2	8	171283	171290	25 %	0 %	50 %	25 %	219850828
3570	NC_011832	GAG	2	6	171618	171623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850829
3571	NC_011832	TTC	2	6	171666	171671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850829
3572	NC_011832	CGA	2	6	171697	171702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850829
3573	NC_011832	AGA	2	6	171715	171720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850829
3574	NC_011832	CTC	2	6	171723	171728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850829
3575	NC_011832	CT	3	6	171733	171738	0 %	50 %	0 %	50 %	219850829
3576	NC_011832	AGA	2	6	171757	171762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850829
3577	NC_011832	CTG	2	6	171831	171836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850829
3578	NC_011832	TTCG	2	8	171898	171905	0 %	50 %	25 %	25 %	219850829
3579	NC_011832	CAG	2	6	171915	171920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850829
3580	NC_011832	CA	3	6	171940	171945	50 %	0 %	0 %	50 %	219850829
3581	NC_011832	TGA	2	6	171979	171984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850829
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3583	NC_011832	ATC	2	6	172002	172007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850829
3584	NC_011832	GCTC	2	8	172045	172052	0 %	25 %	25 %	50 %	219850829
3585	NC_011832	ACC	2	6	172057	172062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850829
3586	NC_011832	TCT	3	9	172063	172071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850829
3587	NC_011832	CCG	2	6	172077	172082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850829
3588	NC_011832	GGT	2	6	172112	172117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850829
3589	NC_011832	GCT	2	6	172155	172160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850829
3590	NC_011832	CTG	2	6	172186	172191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850829
3591	NC_011832	CGG	2	6	172193	172198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850829
3592	NC_011832	GAG	2	6	172236	172241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850829
3593	NC_011832	AATG	2	8	172261	172268	50 %	25 %	25 %	0 %	219850829
3594	NC_011832	GTC	2	6	172698	172703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850830
3595	NC_011832	CGAA	2	8	172825	172832	50 %	0 %	25 %	25 %	219850830
3596	NC_011832	GCG	2	6	172848	172853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850830
3597	NC_011832	TCGG	2	8	172917	172924	0 %	25 %	50 %	25 %	219850830
3598	NC_011832	AGG	2	6	172966	172971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850830
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3600	NC_011832	GGC	2	6	172982	172987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850830
3601	NC_011832	GCA	2	6	173036	173041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850830
3602	NC_011832	CG	3	6	173135	173140	0 %	0 %	50 %	50 %	219850830
3603	NC_011832	AAG	2	6	173154	173159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850830
3604	NC_011832	TCA	2	6	173195	173200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850830
3605	NC_011832	CAA	2	6	173312	173317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850830
3606	NC_011832	ATC	2	6	173349	173354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850830
3607	NC_011832	CAC	2	6	173358	173363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850830
3608	NC_011832	GAG	2	6	173370	173375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850830
3609	NC_011832	GAT	2	6	173435	173440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850830
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3611	NC_011832	GCT	2	6	173495	173500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850830
3612	NC_011832	TC	4	8	173622	173629	0 %	50 %	0 %	50 %	219850830
3613	NC_011832	GCC	2	6	173739	173744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850830
3614	NC_011832	CGG	2	6	173891	173896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850830
3615	NC_011832	AGG	2	6	173956	173961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850830
3616	NC_011832	ATC	2	6	173976	173981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850830
3617	NC_011832	GATCC	2	10	173982	173991	20 %	20 %	20 %	40 %	219850830
3618	NC_011832	TTTTCA	2	12	174088	174099	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219850831
3619	NC_011832	GCC	2	6	174118	174123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850831
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3621	NC_011832	CCCT	2	8	174155	174162	0 %	25 %	0 %	75 %	219850831
3622	NC_011832	A	7	7	174168	174174	100 %	0 %	0 %	0 %	219850831
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3742	NC_011832	CGG	2	6	179106	179111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850836
3743	NC_011832	CAC	2	6	179122	179127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850836
3744	NC_011832	CGGC	2	8	179132	179139	0 %	0 %	50 %	50 %	219850836
3745	NC_011832	TCT	2	6	179226	179231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850836
3746	NC_011832	TCA	2	6	179232	179237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850836
3747	NC_011832	CCGAT	2	10	179255	179264	20 %	20 %	20 %	40 %	219850836
3748	NC_011832	TTG	2	6	179321	179326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850836
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3755	NC_011832	GTC	2	6	180001	180006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850836
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3764	NC_011832	CAG	2	6	180701	180706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850836
3765	NC_011832	GAC	2	6	180721	180726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850836
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3771	NC_011832	GAT	2	6	181162	181167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850836
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3800	NC_011832	GATCGC	2	12	182289	182300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219850837
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3802	NC_011832	TG	3	6	182350	182355	0 %	50 %	50 %	0 %	219850837
3803	NC_011832	GCA	2	6	182401	182406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850837
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3814	NC_011832	GTC	2	6	182793	182798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850838
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3831	NC_011832	GCAGG	2	10	183334	183343	20 %	0 %	60 %	20 %	219850838
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3834	NC_011832	GAT	2	6	183536	183541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850838
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3838	NC_011832	GGC	3	9	183650	183658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850838
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3843	NC_011832	CGGC	2	8	183823	183830	0 %	0 %	50 %	50 %	219850838
3844	NC_011832	ATC	2	6	183834	183839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850838
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3846	NC_011832	TGC	2	6	183876	183881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850838
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3849	NC_011832	TCGC	2	8	184023	184030	0 %	25 %	25 %	50 %	219850838
3850	NC_011832	GGC	2	6	184100	184105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850838
3851	NC_011832	TCGGC	2	10	184111	184120	0 %	20 %	40 %	40 %	219850838
3852	NC_011832	TGG	2	6	184168	184173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850838
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3854	NC_011832	CAC	2	6	184238	184243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850838
3855	NC_011832	AGC	2	6	184244	184249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850839
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3857	NC_011832	AGTGG	2	10	184352	184361	20 %	20 %	60 %	0 %	219850839
3858	NC_011832	CAT	2	6	184377	184382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850839
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3860	NC_011832	CCG	2	6	184493	184498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850839
3861	NC_011832	AGGCCG	2	12	184533	184544	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219850839
3862	NC_011832	GAT	2	6	184588	184593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850839
3863	NC_011832	GGA	2	6	184684	184689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850839
3864	NC_011832	TCC	2	6	184690	184695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850839
3865	NC_011832	CGTC	2	8	184710	184717	0 %	25 %	25 %	50 %	219850839
3866	NC_011832	CCT	3	9	184752	184760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850839
3867	NC_011832	ACC	2	6	184877	184882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850839
3868	NC_011832	GAT	2	6	184897	184902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850839
3869	NC_011832	CCGA	2	8	184939	184946	25 %	0 %	25 %	50 %	219850839
3870	NC_011832	TCC	2	6	185021	185026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850839
3871	NC_011832	CTC	2	6	185089	185094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850839
3872	NC_011832	ATC	2	6	185105	185110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850839
3873	NC_011832	CATCG	2	10	185113	185122	20 %	20 %	20 %	40 %	219850839
3874	NC_011832	ATC	2	6	185135	185140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850839
3875	NC_011832	CCG	2	6	185141	185146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850839
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3877	NC_011832	GGT	2	6	185185	185190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850839
3878	NC_011832	TCCC	2	8	185191	185198	0 %	25 %	0 %	75 %	219850839
3879	NC_011832	TCG	2	6	185229	185234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850839
3880	NC_011832	CGCTC	2	10	185248	185257	0 %	20 %	20 %	60 %	219850839
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3882	NC_011832	ATCC	2	8	185280	185287	25 %	25 %	0 %	50 %	219850839
3883	NC_011832	CCT	2	6	185421	185426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850839
3884	NC_011832	ACC	2	6	185435	185440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850839
3885	NC_011832	CTG	2	6	185527	185532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850840
3886	NC_011832	TAC	2	6	185630	185635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850840
3887	NC_011832	TCG	2	6	185774	185779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850841
3888	NC_011832	TGA	2	6	185807	185812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850841
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3890	NC_011832	TCG	2	6	185866	185871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850841
3891	NC_011832	GGA	2	6	185884	185889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850841
3892	NC_011832	ATC	2	6	185938	185943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850841
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3894	NC_011832	TAC	2	6	185981	185986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850841
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3900	NC_011832	TGA	2	6	186439	186444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850841
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3902	NC_011832	TCG	2	6	186478	186483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850841
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3948	NC_011832	ACG	2	6	188545	188550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850843
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3952	NC_011832	ATG	2	6	188656	188661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850843
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3981	NC_011832	ATC	2	6	189769	189774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850844
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3984	NC_011832	ATA	2	6	189889	189894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850845
3985	NC_011832	AAG	2	6	189897	189902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850845
3986	NC_011832	GGT	2	6	190094	190099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850845
3987	NC_011832	ATC	2	6	190122	190127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850845
3988	NC_011832	AGA	2	6	190190	190195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850845
3989	NC_011832	GATC	2	8	190265	190272	25 %	25 %	25 %	25 %	219850845
3990	NC_011832	GTC	2	6	190496	190501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850846
3991	NC_011832	GAC	2	6	190502	190507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850846
3992	NC_011832	CAA	2	6	190510	190515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850846
3993	NC_011832	GAC	2	6	190565	190570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850846
3994	NC_011832	ACC	2	6	190607	190612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850846
3995	NC_011832	AAG	2	6	190626	190631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850846
3996	NC_011832	TG	3	6	190778	190783	0 %	50 %	50 %	0 %	219850846
3997	NC_011832	AAT	2	6	190950	190955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850847
3998	NC_011832	CTT	2	6	191080	191085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850847
3999	NC_011832	CAC	2	6	191139	191144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850847
4000	NC_011832	CGG	2	6	191202	191207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850847

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